Biokemi - proteinkemi och enzymteknik Flashcards
vilka domäner består livet av? Vad skiljer dessa domäner åt?
3 domäner. Bakteria , Eukaryota och arkéer.
Bakteria: Encellig, Enkel struktur, cirkulärt DNA
Eukaryota: En-/flercellig, har organeller, kromosomalt DNA, introner/exoner
Arkéer: encellig, enkel struktur, cirkulärt DNA, introner/exoner
Vad består vårat cellmembran av?
Fettsyror/lipidlager, dvs fosfolipider med hydrofoba svansar och hydrofila huvuden, på så sätt kan de hydrofila huvudena binda sig till molekyler som vill komma in i cellen men de hydrofoba svansarna och deras kanalprotein bestämmer om molekylen ska in i cellen eller inte
Hur är gram negativa bakterier uppbyggda? Ge ett exempel på en sån bakterie
De har 3 lager. Ett yttremembran, ett peptidoglykan lager och till sist innerts av cellmembraner ett plasmamembran. E-coli är ett exempel.
Hur är gram positiva uppbyggda? Ge ett exempel på en sådan bakterie.
Yttersta delen av membranet består av peptidoglykan och innanför det finns plasmamembranet. ett exempel är listeria
vilka organeller har en djur cell och vad är deras uppgift?
Ribosomer: skapar proteiner genom att omvandla RNA till en sträng av aminosyror
Nukleotid: dvs cellkärnan, innehåller cellens DNA.
ER: endolplasmatiskt nätverk, membran runt cellkärnan, proteiner mognar till proteiner där genom att ribosomerna sitter på ER
golgiapparaten: protein transporteras i den till sin slutliga destination, de transporteras från cis till trans delen i golgi.
lysosomer: soptunnan i cellen för nedbrutna enzymer. produceras av golgiapparaten.
mitokondrien; diffunderar i cellen och skapar ATP (genomför cellanding)
Vad gör cytoskelettet?
den ger stadga till cellen och gör att den kan bibehålla sin form och transportera sig själv.
Vad betyder peroxisomer?
peroxisomer: oxidativa reaktioner av aminosyror och lipider, de producerar radikaler och väteperoxid som kan skada cellen
Hur lagras proteiner utan att de ska expanderas?
vitrifiering. de chockas genom att läggas in i iskallt vatten.
Vad står 1 Å för och hur många nm är det?
ångström.
1 Å = 0.1 nm
Vilka kvävebaser finns i DNA:t och RNA:t?
A = Adenin (DNA, RNA)
T =tymin (DNA)
C=cytosin (DNA, RNA)
G=guanin (DNA, RNA)
U = Uracil (RNA)
Vad är purine baser?
Adenin och guanin. Dubbel cirklar, dvs femhörnig och 6 hörniga strukturer
vad är pyrimidine baser?
tymin, uracil, cytosin. de har en enkel struktur med 1 sexhörning
Vad är skillnaden på en nukleotid och nukleosid? hur beräknas en nukleutid?
nukleotid beräkning = fosfat(1-3) + socker+bas
nukleotid= består av en kvävehaltig bas som är kovalent kopplad till socker och 1-3 fosfatgrupper
nukleosid= en kvävehaltig bas som är kovalent kopplad till socker, har ingen fosfatgrupp
Hur läses DNA strängar av?
det finns 2 strängar som är antiparallella, de läses av från 5` till 3´.
Hur många bindningar håller ihop de olika kväve baserna med varandra och vilka bindningar är det?
vätebindningar. A och T/U har 2 vätebindningar och C och G har 3.
hur vet man vilken ände av DNA strukturen som är 5´ och 3´ änden?
Hos en dubbelsträngad DNA ser man fosfat grupper och på den sidan där det börjar med en fosfat grupp och de sticker upp på den sidan börjar 5´, eller att det börjar med en fosfat grupp där uppe/nere där är 5´s början
Hur veckas DNA?
DNA veckas först ihop till små band som packas runt histoner sedan packas dessa ihop till kromosomer.
Vad innebär DNA replikation?
DNA replikation = DNA kopieras. DNA polymeras sätter sig på DNA strängen och öppnar upp den, sen läses den igenom och respektive kvävebaser hämtas för att återskapa DNA strängen, det är den första delen av celldelning
vad innebär DNA transkription? vad är ett annat ord för det?
DNA transkription = skapa protein.
det sker genom att RNA polymeras veckar upp DNA och läser av den och hämtar respektive kvävebaser, sedan transporteras detta RNA till ribosomen där den läser av kodonen (3 kvävebaser) och tRNA hämtar respektive antikodon med en animosyra, alla aminosyror kopplas och veckas ihop till ett protein.
annat ord: Central dogma
Vilken aminosyra börjar alla protein med och hur börjar man läsa av sekvensen?
kvävebas gruppen AUG motsvarar aminosyran MET (metionin) som är start kodonet, leta efter AUG i en kvävebas sekvens och börja bilda aminosyrorna efter det. Finns bara ett startkodon så om det inte är MET är det fel.
Hur vet man när man ska stoppa vid en RNA sekvens?
När man läst tre baser som kodar för ett stopp kodon. för att vara helt säker på att man läst rätt också ska antalet kvävebaser man räknat vara delbart på 3, annars är det fel stopp sekvens och man får läsa om eller fortsätta
Vad är “open reading frame”?
det är DNA sekvensen från start till sop kodonet
vad är en läsram (reading frame) och hur många finns det?
det finns 6 st. man kan läsa en dna sekvens på 6 sätt genom att först läsa de 3 första kvävebaserna (ram 1), sedan flytta ett steg och börja från den andra kvävebasen (ram 2) och till sist den tredje kvävebasen (ram 3), ram 4 blir då samma som ram 1 och eftersom dna går åt två håll blir dessa 3 ramar till 6.
Hur är en primärstruktur uppbygd?
består av aminosyrasekvensen