Biokemi og mikrobiologi

Question 1

Mitochodria

Ch1

Answer 1

Powerhouse of the cell - generates most of the chemical energy needed to power the cell’s biochemical reactions

Question 2

ATP

Answer 2

Adenosine triphosphate (ATP) is the source of energy for use and storage at the cellular level.

Question 3

Forklar fermentation

Ch14

Answer 3

• En proces der ikke skal bruge eksterne elektron acceptorer
• ATP er genereret ved substrat-level phosphorylation
• Flere metabolitter ved fermentations produkter

Metabolit er intermediat eller et slutprodukt i en organismes stofskifte

Question 4

Forklar respiration

Ch 14

Answer 4

Respiration er en grundlæggende biologisk proces, der foregår i levende organismer for at omdanne energi fra mad til en form, som cellerne kan bruge. Denne proces kan opdeles i to hovedtyper: ydre (eller ekstern) respiration og indre (eller cellulær) respiration.

Question 5

Næringsstoffer til dyrkning af mikroorganismer opdeles normalt i hvilke grupper?

Answer 5

Mikro- og makronæringsstoffer

Question 6

Hvad står forkortelsen NAD for i biokemi?

Answer 6

Nicotinamid adenine dinucleotide

Dette er et coenzym

Question 7

Hvad er et coenzym?

Answer 7

Et coenzym er et organisk molekyle, der fungerer som en hjælpefaktor for enzymer under biokemiske reaktioner. Coenzymer binder sig midlertidigt til enzymet og deltager i reaktionen ved at bære kemiske grupper mellem forskellige molekyler.

Question 8

Enzymers aktivitet kan analyseres vha. ?

Answer 8

Michaelis-Menten kinetik

Question 9

Citroncyrecluks (citric acid cycle) kaldes også for?

Answer 9

Kreb’s cycklus

Question 10

I redoxreaktioner indgår der altid stoffer som er…

Answer 10

Elektron-doner og -acceptor

Question 11

Hvilket af følgende molekyler inderholder mest energi?
* GDP
* ADP
* AMP
* ATP

Answer 11

Det er ATP

Question 12

Hvor mange hydrogenbindinger er der i en adenin-thymin (A-T) base-parring?

Answer 12

Der er 2

Question 13

Elektrontransportkæden (electron transport chain) er vigtig for?

Answer 13

Dannelsen af ATP

Question 14

I hvilken retning syntesiseres DNA når det kopieres?

Answer 14

fra 5’-enden til 3’ -enden

Question 15

Hvad har DNA polymerasen brug for i starten af DNA syntesen?

Answer 15

En RNA primer

Question 16

Hvad bruger man agar-plader til?

Answer 16

At dyrke mikroorganismer

Question 17

Hvad katalyserer DNA Gyrase (Type II topoisomerase) ?

Answer 17

Supercoiling af DNA

Question 18

I bakterier starter proteinsyntesen med?

Answer 18

N-formyl-methionine

Question 19

Bindingstederne for tRNA på ribosomet hedder?

Answer 19

A, P og E

A-site (aminosyre-site), P-site (peptidyl-site) og E-site (exit-site)

Question 20

Hvilket af følgende stoffer er ikke en aminosyre?
* Cystein
* Methionin
* Lysin
* Riboflavin

Answer 20

Riboflavin

Det er en vandopløselig vitamin B-gruppe, også kendt som vitamin B2

Question 21

Processen hvor DNA kopieres kaldes for?

Answer 21

Replikation

Question 22

Mikroorganismer som vokser anaerobt og ikke kan tåle ilt kaldes?

Anaerob = proces der foregår uden ilt og organisme der kan leve uden ilt

Answer 22

Obligate anaerobe

Question 23

Ved splicing af RNA (primært transkript) fjernes de såkaldte

Answer 23

Introns

Introns er ikke-kodende sekvenser i et gen, der ikke indeholder information til proteinsyntese

Question 24

Ved transkription genkender Sigma-faktoren

Answer 24

En promoter

Promotoren er en sekvens af DNA, der fungerer som bindingssted for RNA-polymeraseenzymet under transkriptionsinitiering

Question 25

Aminosyrene i et protein er sat sammen med

Answer 25

En peptidbinding

Question 26

Følgende enzym skal bruges for at lave komplementært DNA (cDNA) fra et RNA molekyle:
* Revers transkriptase
* Helikase
* cDNAse
* RNA polymerase

Answer 26

Det er Revers transkriptase

Reverse transkriptase er et enzym, der kan syntetisere en DNA-streng baseret på en RNA-templatesekvens

Question 27

Restriktionsenzymer genkender og kan skære i?

Answer 27

DNA

Restriktionsenzymer genkender specifikke DNA-sekvenser, kaldet restriktionssteder eller restriktionssites, og kan skære DNA’et ved disse steder.

Question 28

Hvilke af følgende reagenser er Ikke nødvendig for at lave Polymerase Chain Reaction (PCR)?
* DNA Polymerase
* Deoxyribonukleotider
* Primere
* DNA ligase

Answer 28

Det er DNA ligase

DNA-ligase er et enzym, der normalt bruges til at binde sammen to DNA-ender i DNA-rekombinationsteknikker, men det spiller ingen rolle i PCR-processen

Question 29

Hvad er et “F plasmid” en forkortelse for?

Answer 29

Fertility plasmid

Disse er ringformede DNA-molekyler, der findes i visse bakteriestammer, især Escherichia coli (E. coli). F-plasmidet indeholder gener, der koder for proteiner, der er involveret i dannelsen af seksuel konjugation, hvilket tillader overførsel af plasmidet fra en donorbakterie til en recipientbakterie under visse betingelser

Question 30

Hvilken mikroorganisme bruges oftes til molekylær kloning?

Answer 30

E. Coli

Dens hurtige vækst, velkarakteriserede genom og evne til at optage fremmed DNA gør den til et ideelt værtsorganisme for kloning og manipulation af gener. Derudover er der et bredt udvalg af E. coli-stammer, der er blevet modificeret til at være velegnede til specifikke applikationer inden for molekylærbiologi

Question 31

Hvilken struktur er involveret i genetiske udveksling (konjugering) mellem celler?

Answer 31

Pilus

Dette er en lille udspringende struktur på bakteriens overflade, der tillader overførsel af DNA fra en donorbakterie til en recipientbakterie. Under konjugation dannes en midlertidig fusionskanal mellem donor- og recipientbakterier ved hjælp af pili

Question 32

Den protonmotoriske kraft (Proton motive force) kan bruges til?
* Transport af molekyler ind eller ud af celler
* Cellebevægelse
* Dannelse af ATP
* Alle tre tidligere svar

Answer 32

Det er alle tre tidligere svar

Question 33

Hvilken af følgende faser i den virale livscycklus giver værtscellespecificitet?
* Vedhæftning af virus til celleoverfladen
* Optagelse af virus
* Syntese af virus
* Frigivelse af virus

Answer 33

Vedhæftning af virus til celleoverfladen

Denne fase indebærer, at virussen binder sig specifikt til receptorer på værtscellen, hvilket muliggør infektionen. Receptorerne, som virussen binder sig til, er specifikke for visse celletyper eller værtsorganismer, og denne interaktion bestemmer, hvilke celler eller organismer virussen kan inficere

Question 34

Hvilke af følgende processer kan Ikke ske på et eukaryotisk mRNA molekyle?
* Capping
* Polyadenylering
* Splicing
* Binary fission

Answer 34

Binary fission

Binary fission er en proces, der kun forekommer i prokaryote celler, ikke i eukaryote celler. Derfor er det den eneste proces på denne liste, der ikke kan ske på et eukaryotisk mRNA-molekyle. De andre processer - capping, polyadenylering og splicing - er alle vigtige post-transkriptionelle modifikationer, der forekommer på eukaryotiske mRNA-molekyler

Question 35

Hvad er Capping?

Answer 35

Capping er tilføjelsen af en 7-methylguanosin-kappe til 5’-enden af mRNA

Question 35

Hvad er Polyadenylering?

Answer 35

Polyadenylering er tilføjelsen af en poly-A-hale til 3’-enden af mRNA

Question 36

Hvad er Splicing?

Answer 36

Splicing er fjernelsen af introns og sammensætningen af exons for at danne det modne mRNA

Question 37

Hvilke stoffer bliver forbrugt under fotosyntese (oxygenisk)

Answer 37

CO2 og H20

Question 38

Hvilket af følgende stoffer kan binde opstrømsregionen af et mRNA, der fungerer som en riboswitch, og resulterer i translationel blokering af den nedstrøms proteinkodende sekvens?
* Antisense RNA
* Metabolit
* Peptid
* RNAi

Answer 38

Metabolit

Riboswitches er sekvenser i mRNA-molekyler, der kan binde små molekyler (som metabolitter) og ændre mRNA’s struktur eller stabilitet som respons på denne binding. Når en metabolit binder til riboswitchen, kan den blokere ribosomets adgang til den nedstrøms proteinkodende sekvens, hvilket resulterer i translationel blokering eller andre ændringer i genekspressionen.

Question 39

Hvilket udsagn om virus er rigtigt?
* En virus er en bakterie
* En virus har ribosomer
* En virus indeholder DNA eller RNA
* En virus er en eukaryot

Answer 39

En virus indeholder DNA eller RNA

Virus er ikke bakterier, da de er intracellulære parasitter, der kan inficere både bakterier, eukaryoter og nogle gange også arkæer. Virus har ikke deres egne ribosomer, de udnytter værtscellens ribosomer til proteinsyntese under infektion. Virus er heller ikke eukaryoter; de er meget simplere organismer, der ikke har nogen strukturer eller organeller, som kendetegner eukaryote celler

Question 40

Hvilken taksonomisk gruppe af mikroorganismer er primært ansvarlig for Jordens iltning?

Answer 40

Cyanobakterier

Disse organismer er fotosyntetiske bakterier, der kan udføre oxygenic fotosyntese, hvilket betyder, at de producerer ilt som et biprodukt af deres fotosyntetiske aktivitet

Question 41

Hvilket udsagn er forkert? En bakterie har…
* Ribosomer
* En cellevæg
* En eller to cellemembraner
* En kerne

Answer 41

En kerne

Bakterier er prokaryote organismer, hvilket betyder, at de ikke har en kerne. I stedet har de en enkelt cirkulær DNA-streng, der flyder frit i cellen og er placeret i et område kaldet nucleoid

Question 42

Hvilken kontrolmekanisme er ansvarlig for, at Escherichia Coli bruger glukose som kulstofsubstrat og Ikke inducerer andre pathways?
* Catabolite induction
* Catabolite repression
* Signal transduction
* Stringent respons

Answer 42

Catabolite repression

Catabolite repression er en proces, hvor tilstedeværelsen af et let fordøjeligt kulstofkilde, som glukose, hæmmer ekspressionen af gener involveret i metabolismen af andre kulstofkilder.

Question 43

I E. Coli findes generne for udnyttelse af maltose forskellige steder i kromosomet, men de aktiveres af det samme maltoseaktivatorprotein, hvilket er et eksempel på en/et…?
* Operon
* Regulon
* Riboswitch
* To-komponentsystem

Answer 43

Regulon

En regulon består af flere operoner, der er koordineret af et fælles regulatorisk protein eller et sæt af regulatoriske proteiner. I dette tilfælde aktiveres generne for maltoseudnyttelse forskellige steder i kromosomet af det samme maltoseaktivatorprotein, hvilket betyder, at de er del af en regulon, hvor de koordineres af dette regulatoriske protein.

Question 44

Hvilken gruppe er IKKE et domæne i livets træ (Tree of life)?
* Virus
* Bakterier
* Arkæer (Archaea)
* Svampe

Answer 44

Virus

Question 45

Hvad bruger bakterier en flagel til?

Answer 45

Bevægelse

Question 46

Hvilken type mekanisme er Ikke kendt for at give antibiotikaresistens?
* Ændring af målet for lægemidlet (drug target)
* Fjernelse af cellen via efflux-pumpe
* Forstyrrelse af membranstrukuren
* Enzymatisk inaktivering

Answer 46

Forstyrrelse af membranstrukuren

Antibiotikaresistensmekanismer omfatter normalt ændringer i målet for lægemidlet (f.eks. mutationer i gener, der koder for målproteiner), fjernelse af lægemidlet via efflux-pumper, og enzymatisk inaktivering af antibiotika. Forstyrrelse af membranstrukturen er ikke en almindelig mekanisme for antibiotikaresistens.

Question 47

Hvad er cellemembraner primært opbygget af?

Answer 47

Phosphorlipider

Fosfolipider består af en hydrofobisk (vandafvisende) hale og en hydrofil (vandelskende) hovedgruppe. Disse molekyler arrangerer sig i en dobbelt lagstruktur kaldet lipidbilaget, hvor de hydrofobe haler vender indad mod hinanden, mens de hydrofile hovedgrupper vender udad mod vandige miljøer

Question 48

Hvilken type organismer er svampe?

Answer 48

Eukaryoter

Svampe er en mangfoldig gruppe af organismer, der omfatter alt fra enkle encellede former som gær til komplekse flercellede organismer som skimmelsvampe og svampe. Svampe er heterotrofe organismer, hvilket betyder, at de ikke kan udføre fotosyntese og derfor skal erhverve deres næring fra andre organismer, dødt organisk materiale eller organiske forbindelser i miljøet.

Question 49

Lipopolysaccharider (endotoksiner) findes hvor i en bakterie?
* Cellekernen i eukaryoter
* Golgi apparatet i eukaryoter
* Cellevæggen i gram positive bakterier
* Den ydre cellemembran i gram negative bakterier

Answer 49

Den ydre cellemembran i gram negative bakterier

Lipopolysaccharider (endotoksiner) findes i den ydre cellemembran i gramnegative bakterier. Disse molekyler udgør en vigtig del af cellevæggen hos gramnegative bakterier og bidrager til deres struktur og funktion. Lipopolysaccharider kan udløse en immunrespons hos værten og spille en rolle i patogenicitet.

Question 50

Hvilken af følgende mikroorganismer er kendetegnet ved at have to fotosystemer, som arbejder sammen i strømmen af elektroner?
* Anoxygene fototrofe
* Grønne svovlbakterier
* Cyanobakterier
* Røde svovlbakterier

Answer 50

Cyanobakterier

Cyanobakterier gennemgår oxygenlig fotosyntese, hvor de bruger vand som elektronkilde, frigiver oxygen som biprodukt, og bruger lysenergi til at generere kemisk energi i form af ATP og NADPH gennem de to fotosystemer, fotosystem I og fotosystem II. Denne proces adskiller cyanobakterier fra andre fotosyntetiske mikroorganismer, der muligvis kun har et enkelt fotosystem.

Question 51

De første selvreplikernede systemer jorden indeholdt sandsynligvis hvilken type molekyle som central komponent?
* Polysakkarid
* RNA
* DNA
* Protein

Answer 51

RNA

RNA kan tjene både som informationsmolekyle og som katalytisk molekyle, hvilket gør det til en potentiel kandidat til den første form for genetisk materiale.

Question 52

Hvilket par af stoffer var formodentligt elektrondoner og elektronacceptor i de første mikroorganismer på Jorden?
* NADH / O2
* NADH / Fumarate
* NO2- / O2
* H2 / S0

Answer 52

H2 / S0

Det formodede par af stoffer, der fungerede som elektrondonor og elektronacceptor i de første mikroorganismer på Jorden, er H2 (molekylært hydrogen) som elektrondonor og S0 (elementært svovl) som elektronacceptor. Disse stoffer repræsenterer en mulig tidlig form for anaerob metabolisk proces, hvor mikroorganismer brugte hydrogen som en energikilde og svovl som en terminal elektronacceptor. Dette er en type metabolisme, der stadig findes i dag i nogle bakterier, kendt som sulfatreduktion

Question 53

Hvilken organisme er typisk størst?
* Gram negative bakterier
* Gram positive bakterier
* Archaea
* Eukaryoter

Answer 53

Eukaryoter

Eukaryoter er en bred gruppe af organismer, der omfatter planter, dyr, svampe og protister. Disse organismer har komplekse celler med en kerne og organeller, og de kan variere betydeligt i størrelse, fra mikroskopiske encellede organismer som gær til store flercellede organismer som træer og hvaler. Gramnegative og grampositive bakterier samt archaea er mikroorganismer, der normalt er meget mindre end eukaryoter.

Question 54

Hvilken organisme mener man at mitokondrier oprindeligt har været?
* En bakterie
* En archaea
* En svamp
* En virus

Answer 54

En bakterie

Man mener, at mitokondrier oprindeligt har været en bakterie. Denne teori, kendt som endosymbiontteorien, antyder, at mitokondrier stammer fra en endosymbiotisk forening mellem en tidligere fri levende aerob bakterie, sandsynligvis beslægtet med moderne alfa-proteobakterier, og en forfader til eukaryote celler. Ifølge denne teori blev den aerobe bakterie internaliseret af en primitiv eukaryot celle, hvor den etablerede en symbiotisk relation, der senere udviklede sig til det moderne mitokondrie, som er ansvarligt for energiproduktionen i eukaryote celler.

Question 55

Hvor mange cellemembraner har en gram positiv bakterie?
* 0
* 1
* 2
* 3

Answer 55

1

En grampositiv bakterie har én cellemembran. Grampositive bakterier har en enkelt cellevæg bestående primært af et tykt lag af peptidoglycan og andre molekyler, men de mangler den ydre membran, som findes hos gramnegative bakterier.

Question 56

Hvor mange cellemembraner har en gram negativ bakterie?
* 0
* 1
* 2
* 3

Answer 56

2

En gramnegativ bakterie har to cellemembraner. De består af en indre cellemembran og en ydre cellemembran, som er adskilt af et periplasmisk rum. Den ydre membran indeholder lipopolysaccharider (LPS), mens den indre membran er rig på fosfolipider. Så svaret er 2 cellemembraner.

Question 57

Hvilken af følgende udsagn er ikke en årsag til at rRNA-gener kan bruges til at udlede evolutionære forhold ved fylogenetisk analyse?
* rRNA-gener findes i alle organismer
* rRNA-gener har samme funktion i alle organismer
* rRNA-gener har meget variable sekvenser og ændrer sig hurtigt
* rRNA-gener har tilstrækkelig længde til at være signifikante

Answer 57

rRNA-gener har samme funktion i alle organismer

Selvom rRNA-generne er konservative i mange organismer og har tilstrækkelig længde til at give signifikant information om evolutionære forhold, er det forkert at sige, at de har samme funktion i alle organismer. rRNA fungerer generelt som en strukturel og funktionel komponent af ribosomer, der er ansvarlige for proteinsyntesen. Mens deres grundlæggende funktion er ens, kan der dog være variationer i rRNA-genernes sekvenser og strukturer, afhængigt af organismens evolutionære historie og krav til miljøet.

Question 58

Funktionelle træk kan deles mellem divergerende mikroorganismer på grund af?
* Tab af gener
* Konvergent evolution
* Horisontal genoverførsel
* Alle de foregående svar

Answer 58

Alle de foregående svar

Tab af gener: Divergerende mikroorganismer kan udvikle forskellige funktionelle træk som følge af tab af gener, hvor visse gener går tabt i en stamme, men bevares i en anden, hvilket fører til forskelle i funktionelle egenskaber.

Konvergent evolution: Mikroorganismer, der er udsat for lignende miljømæssige pres, kan udvikle lignende funktionelle træk uafhængigt af hinanden. Dette kaldes konvergent evolution og fører til lignende funktionelle egenskaber i forskellige organismer, selvom de ikke er nært beslægtede.

Horisontal genoverførsel: Horisontal genoverførsel, hvor gener overføres mellem forskellige organismer på tværs af arter eller taxa, kan også føre til deling af funktionelle træk mellem divergerende mikroorganismer. Denne proces tillader udveksling af genetisk materiale og kan resultere i erhvervelse af nye funktioner eller egenskaber.

Question 59

Hvilken type kulstof-kilde bruger autotrofe organismer?
* Sukker
* Aminosyrer
* CO2
* Fedtsyrer

Answer 59

CO2

Question 60

Enzymer katalyserer reaktioner ved at sænke deres:
* Ligevægt
* Ledningsevne
* Reaktionshastighed
* Aktiveringsenergi

Answer 60

Aktiveringsenergi

Aktiveringsenergi er den energi, der kræves for at starte en kemisk reaktion ved at overvinde energihindringerne for reaktionen. Enzymer virker ved at binde til substrater og danne et overgangskompleks, hvilket reducerer den mængde energi, der kræves for at nå den overgangstilstand, hvor reaktionen kan forekomme. Dette sænker den aktiveringsenergi, der kræves for reaktionen, hvilket resulterer i en øget reaktionshastighed.

Question 61

Hvilken co-factor bruges som reduktionsmiddel (elektron doner) i mange biologiske reduktion-oxidation reaktioner (redoc reaktioner)
* ATP
* Ribose
* H2O2
* NADH

Answer 61

NADH

NADH (nicotinamid-adenin-dinukleotid). NADH fungerer som en bærer af elektroner, der kan overføres til andre molekyler under reduktionsreaktioner. Det er en nøglekomponent i cellens energiproduktion, idet det genereres under glykolyse, citronsyrecyklus og oxidativ fosforylering, og det spiller en vigtig rolle i overførslen af elektroner fra substrater til den elektrontransportkæde i mitochondrierne.

Question 62

Hvad kaldes processen hvor DNA-sekvensen i et gen oversættes til et RNA molekyle?
* Transkription
* Replikation
* Rekombination
* Translation

Answer 62

Transkription

Transkription er den første af to hovedprocesser i proteinsyntesen og involverer syntesen af mRNA (messenger RNA) ved at kopiere en DNA-sekvens.

Translation er den proces, hvor mRNA-molekylet oversættes til en sekvens af aminosyrer under proteinsyntesen. Replikation er processen med at kopiere hele DNA-molekylet før celledeling, mens rekombination involverer udveksling af genetisk materiale mellem to DNA-molekyler.

Question 63

Hvilket enzym kan kopiere DNA?
* Helicase
* RNA polymerase
* DNA gyrase
* DNA polymerase

Answer 63

DNA polymerase

DNA polymerase er ansvarlig for at syntetisere en ny DNA-streng ved at tilføje nukleotider til en voksende DNA-kæde under processen med DNA-replikation.

Helicase er ansvarlig for at adskille de to strenge af DNA under replikation, RNA polymerase syntetiserer RNA ved transkription af DNA-templatesekvensen, og DNA gyrase er involveret i DNA-opløsning og supercoiling.

Question 64

Hvilken af følgende type molekyler (målt i ligevægt) er der mest af i en celle?
* DNA
* Protein
* Polysakkarider
* Lipider

Answer 64

Protein

Protein udgør en betydelig del af cellens tørmasse og udfører en lang række funktioner, såsom struktur, katalyse af kemiske reaktioner, transport af molekyler, og regulering af cellulære processer.

Mens DNA er vigtigt for at opretholde cellens genetiske information og styring af cellulære processer, udgør det normalt en mindre del af cellens tørmasse end proteiner. Polysakkarider (såsom glykogen og cellulose) og lipider (såsom fosfolipider, triglycerider) spiller også vigtige roller, men de er normalt i mindre mængder end proteiner i en celle.

Question 65

Hvad kaldes organismer som har den optimale vækst ved lave temperaturer (under ca. 10 C)?
* Superphiles
* Psychrophiles
* Mesophile
* Neutrophiles

Answer 65

Psychrophiles

Disse mikroorganismer er tilpasset til at trives i kolde miljøer og kan have en optimal væksttemperatur så lav som -15 °C. De er almindelige i polare og subpolare regioner, samt i dybhavet og isfrie regioner af havene.

Question 66

Hvor mange forskellige klasser (classes) af enzymer findes der?
* 2
* 12
* 6
* 320

Answer 66

6

Der findes 6 forskellige klasser af enzymer, også kendt som enzymklassifikation ifølge Enzyme Commission (EC). Enzyme Commission (EC) er en international organisation, der klassificerer enzymer ud fra de reaktioner, de katalyserer, og tildeler dem et EC-nummer baseret på deres aktiviteter. De seks hovedklasser er:

1. Oxidoreductaser
2. Transferaser
3. Hydrolaser
4. Lyaser
5. Isomeraser
6. Ligaser

Question 67

Hvad er et kodon (codon)?
* En del af et ribosomalt RNA, som koder for fosforlipider
* Et molekyle, som bliver oxideret i DNA syntesen
* En sekvens af 3 nitrogenbaser, som koder for en aminosyre
* Det område på et tRNA molekyle, som kan binde en aminosyre

Answer 67

En sekvens af 3 nitrogenbaser, som koder for en aminosyre

Et kodon (codon) er en sekvens af tre nitrogenbaser i mRNA, som koder for en specifik aminosyre under proteinsyntesen. Hvert kodon korresponderer med en bestemt aminosyre eller en stop-kodon, der markerer afslutningen på proteinsyntesen. Kodoner er den genetiske kode, der oversætter DNA- eller mRNA-sekvenser til specifikke aminosyrer under translationen.

Question 68

Mikroorganismers vækst i en “batch” kultur opdeles i forskellige faser. Hvilken af følgende faser er ikke en fase i en “batch” kultur?
* Eksponentielle fase
* Stationære fase
* Linære fase
* Dødsfase

Answer 68

Linære fase

I en typisk “batch” kultur opstår vækstkurven normalt i følgende faser:

1. Eksponentiel fase: En hurtig vækstfase, hvor mikroorganismerne vokser eksponentielt.
2. Stationær fase: En fase, hvor væksten stopper, og antallet af levedygtige mikroorganismer forbliver konstant, ofte på grund af udtømning af næringsstoffer eller ophobning af toksiske metabolitter.
3. Dødsfase: En fase, hvor antallet af levedygtige mikroorganismer begynder at falde, normalt på grund af ugunstige miljøforhold eller udtømning af ressourcer.

“Lineær fase” er ikke en typisk fase i vækstkurven og nævnes normalt ikke i forbindelse med vækstkurven for en “batch” kultur.

Question 69

Hvilken af følgende baseparringer er korrekt?
* A-C
* A-T
* G-T
* T-C

Answer 69

A-T

Question 70

I reguleringen af et gens ekspression er en “co-repressor”?
* Et lille molekyle der binder et repressor protein der så slukker for genets ekspression
* Et protein der inhiberer gen ekspression
* Et RNA mokekyle der blokerer for translation
* Et stykke af DNA’et hvortil en repressor binder

Answer 70

Et lille molekyle der binder et repressor protein der så slukker for genets ekspression

Når repressoren binder til operatoren, forhindrer den RNA-polymerase i at binde til promotoren og starte transkriptionen, hvilket resulterer i nedsat eller slukket genekspression.

Question 71

Hvad er en operon?
* Et protein der aktiverer et gens ekspression
* En samling gener under fælles gen regulering
* En del af RNA’et vortil ribosomet binder
* Et stykke DNA der binder RNA polymerase

Answer 71

En samling gener under fælles gen regulering

En operon er en samling af gener, der findes på samme strækning af DNA og er under fælles genregulering. Disse gener består typisk af en strukturel gen, der koder for et protein, samt regulatoriske elementer, såsom en operatør og en promotor. Operatøren er et stykke DNA-sekvens, hvor en repressor eller en aktivator kan binde for at regulere transkriptionen af de tilknyttede gener. Promotoren er stedet, hvor RNA-polymerase binder for at starte transkriptionen af de tilknyttede gener

Question 72

Hvad er respons regulatorens rolle i signal transduction?
* At blive phosphoryleret af sensor kinasen og derefter påvirke cellen fx. via genregulering
* At registrere eksterne signaler og derefter phosphorylere senor kinasen
* At methylere sensorkinasen så dens sensitivitet æændres
* At dephosphorylere proteiner således at tranductionen nulstilles

Answer 72

At blive phosphoryleret af sensor kinasen og derefter påvirke cellen fx. via genregulering

Responseregulatoren spiller typisk en rolle i signaltransduktion ved at blive phosphoryleret af sensor kinase og derefter påvirke cellen, fx via genregulering.

Her er forklaringen på denne proces:

1. Sensor kinasen registrerer et eksternt signal, som f.eks. tilstedeværelsen af et bestemt stof eller ændringer i miljøforholdene.
2. Sensor kinasen bliver derefter aktiveret og phosphorylerer responseregulatoren.
3. Den phosphorylerede responseregulator fungerer derefter som en transkriptionsfaktor, der kan binde til DNA og regulere ekspressionen af gener, der er involveret i responsen på det eksterne signal.

Question 73

F1

Hvad består en prokaryot celle af?

Answer 73

• Celle væg
• Cytoplasmatisk membran
• Nukleotid
• Cytoplasma
• Plasmid
• Ribosomer

Prokaryote celle kan være bakterier eller archaea

Question 74

F1

Hvad består en eukaryot af?

Answer 74

• Cellevæg (dog ikke alle der har det)
• Cytoplasmatisk membran
• Nuklear membran
• Nukleus = Cellekerne
• Ribosomer
• endoplasmatisk reticulum
• cytoplasma
• Golgi compleks
• Organeller

Organeller er enheder inde i cellen som kan noget specielt.

Mennesker og svampe er eukaryoter - mest simpel eukayote er en gær-celle

Question 75

F1

Nævn egenskaber som alle celler har

Answer 75

• Struktur = Alle celler har en cytoplasmisk membran, et cytoplasma, et genome lavet af DNA og ribosomer
• Metabolisme = Har kodet DNA til at lave RNA og protein. Alle celler optager næringsstoffer, omdanner dem, holder på energien og smider rester ud.
• Vækst = information fra DNA bliver konverteret til protein som laver arbejde. Proteiner bruges til at omdanne næringsstoffer fra omgivelserne til nye celler
• Evolution = Mutationer i DNA kan give nye celler med nye egenskaber. Det er sådan det fylogenetiske træ udvikles

Virus har ikke ribosomer = den er ikke ”levende”

Det fylogenetiske træ er ligesom livets træ bare for celler. Der var en stamcelle som splittede til to osv

Question 76

F1

Hvad siger er S/V ratio om en celle?

S/V = Surface to Volume

Answer 76

• Små celler har større overflade areal i forhold til celle volumen og har derfor større S/V ratio end større celler.
• Når celle størrelse forøges så mindskes S/V ratioen
• S/V ratioen siger noget om vækstrate og form på cellen. Når celle-størrelsen mindskes vil S/V ratioen forøges og det betyder at små celler kan udveksle nærringstoffer of affald hurtigere end større celler - det gør at små celler er mere effektive.

S/V = Surface to Volume

Question 77

F1

Hvad findes der er af celle-morphologier?

Her skal der forståes: Hvordan kan cellerne se ud

Answer 77

• Coccus (Kugler)
• Rod (Stænger)
• Spririllum (Buede stænger)
• Spirochete ( bølgede stænger)
• Budding and appendaged (liger balloner)
• Filamentous (små strenge - ”filament”)

Se evt slide 20 i forelæsning 1 for visuel hjælp

Question 78

F1

Hvad betyder LUCA?

I forhold til mikrobiel evolution

Answer 78

Last Universal Common Ancestor

Den seneste organisme som alle nulevende organismer på jorden nedstammer fra. Hermed er den sidste fælles forfader den mest sene fælles forfader af alt nulevende liv på jorden

Question 79

F1

Hvad betyder det når man taler ’hvid-’, ’rød-’, ’grøn-’ og ’blå bioteknologi’?

Answer 79

Hvid bioteknologi = Industrielle processor (fermentering og enzym reaktioner)

Rød bioteknologi = Medicinsk proces

Grøn bioteknologi = landbrugs proces
(modificere afgrøder)

Blå bioteknologi = Marine og undervandsprocesser

Question 80

F2

Hvad er biomolekyler overordnet?

Answer 80

Små organiske molekyler (primære og sekundære metabolitter) og macromolekyler (fx proteiner, nukleinsyrer, polysakkarider, lipider) som produceres af organismer.

Question 81

F2

Forklar metabolitter, både sekundære og primære

Answer 81

Metabolitter er intermediater/produkter i en metabolsk reaktion

Primære metabolitter kræves for at organismen kan vokse fx aminosyrer

Sekundære produceres og kræves under bestemte betingelser for overlevelse, fx hvis den udsættes for stress.

Question 82

F2

Hvad er macromolekyler

Answer 82

Det er polymere, så det består af repeterbare enheder. Fx er et protein (polypeptid) sammensat af en række aminosyrer og DNA er sammensat af nukleotider

Question 83

F2

Forklar kovalente bindinger, hydrogenbindinger, van der waals kræfter, ionbindinger og hydrofobisk interaktion

Answer 83

Kovalent: stærk binding hvor elektroner deles mellem atomer.
Hydrogenbinding: svag binding som dannes mellem hydrogen og mere elektronegative atomer
Van der Waals: svage kræfter som opstår når atomer er tæt sammen
Ionbindinger: svage interaktioner i vandige opløsninger som er pH afhængige
Hydrofobiske interaktioner: når ikke-polære molekyler interagerer tæt i polært miljø.

Question 84

F2

Hvad er forskellen mellem polære og upolære egenskaber

Answer 84

Polære har ofte en permanent dipol, de er hydrofile og opløses i vand, hvorimod upolære er hydrofobe.

Question 85

F2

Hvor stor andel af tørvægten i en celle består af macromolekyler, og hvilken del er der mest af?

Answer 85

95% er macromolekyler, hvor størstedelen er protein (55%).

Der er mindst DNA (3.1%) og næstmest RNA (20.5%)

Question 86

F2

Hvad er nukleinsyre og hvad består de af

Answer 86

Det er RNA og DNA, der er langt mere RNA end DNA i cellen vægtmæssigt. Nukleinsyrer består af nukleotider

Question 87

F2

Forklar lipider, tegn evt overordnet struktur

Answer 87

Polære, de har en hydrofil og en hydrofob ende. Fungerer som membrane backbones og som opbevaring af energi.

Se slide 29-30 i powerpoint 2 for tegning af simple og complexe lipider

Question 88

F2

Aminosyrer har chirale centre, så de har to stereoisomerer. Er det D eller L aminosyrer som organismer anvender?

Answer 88

Det er L

Huskeregel: L=Life

Question 89

F2

Hvor mange aminosyrer koder DNA for?

Answer 89

20 (22)

De sidste to (fra 20 til 22) er specielle og opfører sig ikke som de andre, derfor har han dem i parentes.

Question 90

F2

Hvad består et nukleotid af og hvad danner flere nukletoider til sammen? (tegn gerne)

Answer 90

En fosfat gruppe (på plads nr 3 eller 5 på pentosen), en pentose (ribose i RNA og deoxyribose i DNA) og en nitrogenbase på plads nr 1. Sammensat danner de nukleinsyrer (DNA eller RNA)

se slide 20, Powerpoint 2

Question 91

F2

Hvilke baser er pyrimidinbaser og hvilke er purine, og hvilke baser danner basepar.

Answer 91

Pyrimidine er cytosine, thymin og uracil

Purine er adenine og guanine.

Baseparene er cytosine og guanine, og thymine (uracil) og adenine.

Question 92

F2

Nævn de to typer af basepar i DNA og hvor mange hydrogenbindinger de danner.

Answer 92

Cytosine og guanine danner tre hydrogenbindinger, thymine og adenine danner to hydrogenbindinger.

Question 93

F2

Hvad er polysaccarider sammensat af og hvilke bindinger har de?

Answer 93

Carbohydrater bestående af mange monosaccharider sammensat af glykosid bindinger.
De kan være mellem carbon 1 og 4 eller mellem carbon 1 og 6.

Kaldes oligosaccarhid når der er flere monosaccahrider end 2.

Question 94

F2

Har en sommerfuglelarve og den vokse sommerfugl samme DNA? Forklar.

Answer 94

Deres DNA vil være ens, men det er forskelligt hvilke gener som udtrykkes i henholdsvis larven og sommerfuglen. Hvis den fx har 15.000 gener, så er det ikke alle som viser sig. Deres proteinsammensætning er forskellige, derfor ser de forskellige ud. Andre gener aktiveres når det bliver en sommerfugl.

Question 95

F3

Forklar den katabolistiske vej (katabolisme)

Answer 95

En exergonisk reaktion, hvori celler udvinder ATP, som energi, ved at transformere reaktanter til produkter.

Side 112 i bogen

Question 96

F5

Hvad er slim laget og kapslens funktion?

Answer 96

• Beskytte og vedhæftning til overflader
• Forhindre dehydrering
• Udvikle og vedligeholde biofilm

Slim lag = slim der flyder ud fra cellen og omringer den.
Kapsel = et ydre lag der har små “brønde”. Dvs. Laget er ujævnt.

Question 97

F5

Hvad er fimbriae, pili og hami?

Answer 97

• Pili = tynde protein filamenter der stikker ud af celler (lidt ligesom flagella)
• Fimbrae = korte pili
• Hami = små “hooks” der kan hjælpe med vedhæftning til overflader

Question 98

F5

Hvad er “gas vesicles”?

Answer 98

• Små “rum” i cellen, som indeholder luft eller en blanding af dinitrogen, carbondioxid og dihydrogen.
• Er vigtige for akvatisk fotosyntetiske microorganismer, da de spiller en rolle vedrørende opdrift.

Question 99

F5

Hvad er magnetosomers rolle?

Answer 99

Et navigations system, som tillader bakterier at navigere indenfor et magnetfelt.

Question 100

F5

Hvad er en endospore?

Answer 100

En struktur der produceres af specifikke bakterier, sådan de kan overlever barske betingelser.

Er typisk udløst ved mangel på næringsstoffer.

Er nemme at fordele gennem vind, vand eller dyr.

Question 101

F5

Hvad er en flagella?

Answer 101

Lange, tynde vedhæng, der hjælper bakterier og archaea med at svømme

Question 102

F5

Hvilke to måder kan de flagelleret celler bevæge sig på?

Answer 102

• “Peritrichously” = bevæger sig i lige linje
• “Polarly” = bevæger sig hurtigere og snurrer mere rundt.

Se svt. Slide 19 F5

Question 103

F5

Hvad er “archaella”?

Answer 103

Har samme funktion som flagella, men er mindre og mere simple end bakteriel flagella. Svømmer typisk langsommere.

Question 104

F5

Hvilke måder kan mikrober svømme på?

Answer 104

“Twitching” og “gliding”

• Twitching” = en udvigelse af pili, efterfulgt af en fastgørelse, og så en tilbagetrækning.
• “Gliding” = kontinuer bevægelse, gælder kun for bakterier

Se evt. Slide 23 F5

Question 105

F5

Hvad betyder ordet “taxis”?

Answer 105

Det er en instrueret bevægelse, som respons til en kemisk eller fysisk stimulering.

• Chemotaxis: respons til kemekalier
• Phototaxis: repsons til lys
• Hydrotacis: respons til vand
• Osv.

Question 106

F5

Hvad er en eukaryotisk celle?

Answer 106

• En mere complex og større celle, en prokaryotiske celler.
• Indeholder en nucleus og andre organeller.

Slide 32 F5

Question 107

F5

Hvad er en nucleus?

Answer 107

Indeholder chomosomer samt nucleolus.

Nucleolus=område for ribosomal RNA syntese.

Question 108

F5

Hvad er mitose?

Answer 108

Processen hvorved eukaryotiske celler opdeler sig i flere dele. Består af 4 faser.

Diploid celler har to kopier hvorimod haploid celler kun har en.

Question 109

F5

Hvad er de fire faser af mitosen?

Answer 109

• Profase: her bliver kromosomerne synlige og kernelegement opløses.
• Metafase: kromosomerne arngeres i midten af cellen
• Anafase: de trækkes mod hver sin ende af cellen
• Telefase: to nye celler dannes

Slide 24 F5

Question 110

F5

Hvad er miose?

Answer 110

En specialiserede form for opdeling, som opstår i 2 celledelinger. Er involverede i produktionen af kønsceller.

Question 111

F5

Hvad er cellens mitrokondrier?

Answer 111

Cellens kraftværk–> den genererer ATP til oxidation af organiske stoffer.

Question 112

F5

Mitrokondriernes struktur

Answer 112

Består af “cistae” og “matrix”

“cristae” som er folded interne membraner, der indeholder transport proteiner som regulerer passagen af f.eks. ATP. Består også af “matrix” som indeholder enzymer til oxidation af organiske forbindelser. Slide 36 F5

Question 113

F5

Hvad er kloroplaster?

Answer 113

Organeller fundet i fototrofe eukaryoter. Området hvor fotosyntese finder sted.

Har en dobbelt mambran, “stroma” som indeholder RuBisCO, samt “thylakoider” som indeholder klorofyl og ATP syntetiske komponenter.

Question 114

F6

Hvordan er ATP syntesen anderledes for fermentering i forhold til respiration?

Answer 114

Fermentering bruger fosforylering på substrat-niveau, altså ved at benytte et energirigt intermediat, hvor respiration bruger oxidativ fosforylering, altså “proton motive force”

Question 115

F6

Hvor meget ATP bliver brugt i glycolyse?

Tæl ikke hvor meget man får ud af det med. Kun hvor meget der “tilsættes”.

Answer 115

2 ATP

Der bliver brugt 1 ATP, hvor det går fra glukose til glukose 6-P, ved hjælp af enzymet hexokinase. Der bliver brugt 1 ATP, hvor det går fra fruktose 6-P til fruktose 1,6-P, ved hjælp af enzymet fosfofruktokinase (phosphofructokinase).

Question 116

F6

Hvad bruges til at splitte intermediatet med 6 carbonatomer i glykolysen til to molekyler med 3 carbonatomer i hver?

Answer 116

Et enzym.

Det specifikke enzym er aldolase.

Question 117

F6

Hvad hedder processen der sker når NAD+ og CoA bruges med pyruvat til at få Acetyl-CoA, NADH og CO2 i krebs cyklussen?

Answer 117

Decarboxylering.

Se evt krebs/citronsyre/TCA cyklussen.

Question 118

F6

Acetyl-CoA dannes gennem glukose i krebs cyklussen. Hvad bruges Acetyl-CoA til?

Answer 118

Det er absolut nødvendigt for biosyntesen af fedtsyrer.

Det er derfor sukker kan omdannes til fedt.

Question 119

F6

Hvad har disse oxidation-reduktionsenzymer tilfælles?
- NADH dehydrogenase
- Flavoproteiner
- Jern-svovl proteiner
- Cytokromer

Answer 119

De er alle involverede i elektron transport.

Question 120

F6

Hvad hedder det når elektron transport forårsager at indersiden af cellemembranen bliver elektrisk negativ og basisk, mens ydersiden af cellemembranen bliver elektrisk positivt og surt?

Answer 120

The proton motive force.

Når der sker elektron transport bliver flere protoner løssluppet udenfor membranen.

Question 121

F6

Hvad får man mest ATP ud af, respiration eller fermentering?

Answer 121

Respiration.

Question 122

F6

Hvor meget ATP får man i alt fra aerob respiration?

Answer 122

38 ATP i alt

Glykolyse(8 ATP):
- 2 ATP fra substrat-niveau fosforylering.
- 2 NADH = 6 ATP fra oxidativ fosforylering
Krebs cyklussen(15 ATP * 2):
(Der fås 2 pyruvat fra glykolysen, der skal derfor ganges med 2, da den sker to gange)
- 1 GTP = 1 ATP fra substrat-niveau fosforylering
- 4 NADH = 12 ATP fra oxidativ fosforylering
- 1 FADH2 = 2 ATP fra oxidativ fosforylering

Question 123

F6

Ud over at producere mere energi, hvorfor er aerob respiration bedre for cellen end fermentering?

Answer 123

Fermentering danner fermenteringsprodukter, som ethanol, der i høje koncentrationer slår cellen ihjel. Dette dannes ikke ved aerob respiration.

Question 124

F6

Nævn så mange fermenteringsprodukter som du kan.

Answer 124

Alle følgende svar er korrekte:
- Ethanol
- Lactic acid / mælkesyre
- Propionisk syre
- Blandende syrer
- Smørsyre / butansyre
- Butanol

Der er kun taget fra slides, så det KAN være mangelfuldt.

Question 125

F6

I forhold til respiration og fermentering, hvad står CAC for?

Answer 125

Citric acid cycle.

Dette er krebscyklussen, citronsyrecyklussen og TCA-cyklussen.

Question 126

F7

Hvad består en celle mest af i makromolekyle composit?

Answer 126

Protein (55%)

Question 127

F7

Hvad er koncentrationen af micronutrients?

Også kendt som ”sporstoffer”

Answer 127

C < 0,1 mM

Question 128

F7

Hvilket macronutrient består cellen mest af (dry matter)?

Answer 128

Carbon (50%)

Question 129

F7

Hvilke to almene klasser af culture media findes?

Answer 129

Defined media
Complex media

Defined media: præcis kemisk sammensætning er kendt.

Complex media: composed of digests of chemically undefined substances (e.g., yeast and mat extracts).

Question 130

F7

Hvad er enriched media?

Answer 130

Består af complex media plus yderligere nutrients (serum, blod).

Question 131

F7

Hvad er selective media?

Answer 131

Består af forbindelser, der selektivt hindrer væksts af nogle mikrober men ikke af andre.

Question 132

F7

Hvad er differential media?

Answer 132

Har en indicator, ofte farve, der dekterer partikulære kemiske reactioners forekomst under væksts.

Question 133

F7

Hvilke begrænsninger er der ved tællening af mikroper?

Answer 133

• Der kan ikke ses forskel på døde og levende celler.
• Små celler kan overses.
• Cell suspension af lav densitet (<106 cells/mL) er svære at tælle.
• Bevægelige celler skal immobiliseres.
  Debris i prøven kan ses som celler

Debris: Andet i prøven end det man vil se.
Andre partikler kontra celler

Question 134

F7

Hvordan bestemmes koloni-dannelse unit (CFU)?

Answer 134

Protokol:
- Fordel celler fra en kultur ud på en agar plade med de rette nærringsstoffer.
- Tæl antallet af kolonier og sammenlign med kontrollen.

Question 135

F7

Hvordan formes en koloni?

Answer 135

En koloni er formet fra en deling af en single celle og består af 10^6 - 10^9 celler (kloner).

Question 136

F8

Hvad er ”viable cell counts” (plate counts), og hvilke to metoder benytes som oftest?

Answer 136

Hvad er ”viable cell counts” (plate counts), og hvilke to metoder benytes som oftest? Viable cell counts: målning af liv, reproduktion af population.
- Spread-plate metode
- Pout plate metode

Se F8, slide 13 for illustration af de to metoder.

Question 137

F8

Hvilken metode kan benyttes til at fortynde prøven, så cellerne fordeler sig, og derved kan tælles?

Answer 137

Serial dilution

Se F8, slide 14

Question 138

F7

Hvorfor kan der ses flere organismer ved direkte mirkoskopi af naturlige prøver, som dem der udvindes på plader? (The great plate anomaly)

Answer 138

• Mikroskopisk metoder tæller døde celler, hvorimod ”viable” metoder gør ikke.
• Forskellige organismer har enorme forskellige krav for vækst.

Her er fx optical density en måde.

Question 139

F7

Hvordan defineres vækst?

Answer 139

Stigning i antallet af celler.

Question 140

F8

Hvad er binary fission?

Answer 140

Celle deling, efterfulgt af en forstørrelse af cellen til det dobbelte af dens minimum størrelse.

Se figur 4.8, F8 slide 19

Question 141

F7

Hvad er generation time (g)?

Answer 141

Den tid det kræver for mikrobiale celler at duble i antal.

Question 142

F7

Hvad sker der under deling af en celle?

Answer 142

Hver datter celle modtager et kromosom og tilstrækkelige kopier af alle andre celler bestanddele for at eksistere som en uafhængig celle.

Question 143

F7

Ved single replication fork, hvilken af følgende metoder tager da længst tid om at ske?
- Doubling time
- Chromosome replication

Answer 143

Doubling time

Question 144

F7

Hvad er en batch kultur?

Answer 144

Hvad er en batch kultur? Et lukket system med en mikrobiel struktur af en fast volumen.

Question 145

F7

En typisk vækst kurve for en population af celle vækst i et lukket system er karakteriseret ved fire faser, hvilke?

Answer 145

Lag fase, exponential fase, stationary fase, døds fase.

Se figur 4.10, F7, slide 22.

Question 146

F7

Er det muligt at kontrollere vækst parameterne i en batch kultur?

Answer 146

Nej, det er umuligt, da miljøet i kulturen konstant ændrer sig grundet cellernes vækst.

Question 147

F7

Hvad er eksponentiel vækst og hvad sker der her?

Answer 147

Vækst af en microbiel population, hvor antallet af celler (og masse) dobles inden for et specifikt tids interval.
Under eksponentiel vækst, væksten i antallet af celler er i begyndelsen langsom, men stiger ved en hurtigere rate.

Question 148

F9

Forklar Kontinuert Kultur, herunder chemostat

I forhold til en bioreaktor i industrien

Answer 148

Kontinuerlig kultur er et åbent system hvor den mikrobielle kultur har et fast volumen.

Chemostat er mest alm. Type, kulturens vokserate og populations densitet kan kontrolleres uafhængigt og samtidigt.

Der tilsættes normalt base, da det bliver mere surt når cellerne producere deres produkter

Question 149

F9

Hvad er biofilm og hvorfor opstår de?

Answer 149

Årsagen til at celler vokser i biofilm er hvis de er et sted med gode forhold, så kan de forblive der, ved at danne en biofilm.

De producerer den ved at lave lange kæder af polysakkarider. Cellerne vokser i lag, så de danner et matrix. Der er dog en grænse for hvor tykt det kan være, normalt maks et par milimeter, da de inderste celler skal kunne få nok næring.

Overfladen vil føles slimet på fx en sten hvis den er dækket af biofilm.

Question 150

F9

Forklar typer af cell division i bakterier (binary fission, budding), tegn meget gerne.

Answer 150

Binær fission er mest normalt, her øges volumen hvorefter den deles i to datter celler, de er ens størrelse.

Ved budding bliver produkterne ikke ens. Simpel budding er, hvor cellen laver en udposning og kopierer genomet over i udposningen, som derefter frastødes. Mor og datter dannes. Budding kan også være via en hyphae, hvor der dannes en lang kæde celler.

Se slide 4, Powerpoint 9 for tegning

Question 151

F9

Forklar overordnet temperaturens påvirkning på en celle. Tegn gerne den tilhørende kurve, med growthrate på y-akse og temperatur på x-akse.

Answer 151

Ved minimum temperatur bliver membranen gele-agtig, så transport over membranen er for langsom til at cellen kan vokse, derfor er vokseraten i minimum. Ved stigende temperaturer så øges reaktionshastighederne og ved maks vokserate når den højest mulige temperatur hvorefter stigende temperatur leder til protein denaturering - thermal lysis hvor membranen ødelægges og cellen dør.

Se slide 6, powerpoint 9 for grafen

Question 152

F9

Forklar den specielle egenskab i forhold til habitat ved henholdsvis phychrophiler, mesophiler, thermophiler og hyperthermophiler.

Det er grupper af celler

Answer 152

Phychrophiler lever ved lave temperaturer, mesophiler lever ved middeltemeratur, thermophiler lever ved høje temperaturer og hyperthermophiler er ved meget høje temperaturer

Question 153

F9

Forklar hvordan psychrophiler overlever i kolde miljøer

Answer 153

De er mere fleksible, da de har flere alpha-helixer end beta-sheets (ifm. DNA), de har polære og mindre hydrofobiske aminosyrer, generelt mindre interaktion i cellen. De har højt umættede og kortkædede fedtsyrer i cytoplasma membranen - øger stabilitet

Question 154

F9

Forklar hvordan thermophiler overlever i varme miljøer

Answer 154

Øget antal ionbindinger mellem basiske og sure aminosyrer, og flere hydrofobiske interaktioner, som modvirker at det udfoldes i cyteplasmen.
Danner bestemte opløste stoffer som hjælper med at stabilisere proteinerne

Bakterier har cytoplasma membran som består af lipider med mættede fedtsyrer og archaea har et enkelt lipidlag frem for et dobbeltlag.

Question 155

F9

Hvad hedder de grupper af celler som lever i neutral pH, sur pH og basisk pH

Det er de engelske navne

Answer 155

Neutrofiler (lever mellem pH 6 og 8), acidofiler (lever bedst under pH 6), alkalifiler (vokser bedst ved høj pH over 9)

pH indeni cellerne er tæt på netural.
Nogle alkaliphiler anvender natirum motive force frem for proton motive force for at undgå neutralisering af protoner.

Question 156

F9

Hvad er halohpiler (samt forskel mellem de eksteme halophiler og de halotolerante), osmophiler og xerophiler?

Det er relateret til deres levemiljø

Answer 156

Halophiler lever bedst med reduceret vand potentiale, så der er højere salt niveau. Extreme halophiler skal have 15-30% NaCl for at vokse, halotolerante kan vokse selvom der er salt, men de vokser bedst uden salt.
Osmophiler lever bedst når der er højt sukkerindhold, og xerophiler gror i meget tørre miljøer.

Question 157

F9

Forklar forskel på aerober og anaerober samt hvad fakulative organismer, aerotolerante anaerober og microaerophiler er.

Answer 157

• Aerober kræver ilt for at overleve, anaerober kræver ikke ilt og det kan dræbe dem.
• Fakultative organismer kan leve med og uden oxygen
• aerotolerante anaerober kan tolerere oxygen og vokse der men bruger ikke ilten
• microaerofiler kan kun bruge oxygen når det er i små mængder.

Question 158

F9

I fbm. Kontrol af microbiel growth, beskriv sterilisation, inhibition, dekontaminering og disinfektion

Answer 158

• sterilisation: dræber/fjerner alle levende organismer, kan være via varme
• inhibition: forhindrer celler i at vokse
• dekontaminering: gør, at ens objekt er sikkert at bruge men der vil stadig være mikroorganismer
• disinfection: går efter pathogener, så ikke alle mikroorganismer påvirkes

Question 159

F9

Nævn typer af microbial kontrollering, evt 3.

(der er oplistet 6 i alt)

Answer 159

sterilisation, inhibition, dekontaminering, stråling, filtrering og disinfektion

Question 160

F9

Hvad er forskellen på følgende antimikrobielle agenter (til at kontollere bakterier)
- Bacteriostatic
- Bacteriocidal
- Bacteriolytic

Answer 160

• Bacteriostatic forhindrer dem i at gro, men dræber dem ikke.
• Bacteriocical dræber cellerne
• Bacteriolytic dræber dem ved “cell lysis” - cellemembranen nedbrydes

Se evt graf side 24, powerpoint 9

Question 161

Hvad star MIC for?

I forhold til control af celler

Answer 161

Minimum inhibitory concentration (den mængde antimikrobiel agent der skal bruges til at stoppe en organisme fra at vokse). Mængden varierer med temp, pH osv.

Question 162

F4

Hvordan virker lys mikroskopi?

Answer 162

En lyskilde oplyser mikroorganismen/prøven nedefra, og bliver optisk forstørret med linser/glas.

For visualisering, se F4 slide 6

Question 163

F4

Hvad er det mest simple og mest anvendte teknik, i forhold til mikroskopi?

Answer 163

Bright-field mikroskopi

Question 164

F4

Hvorfor ønsker man at bruge ’Bright-field mikroskopi’?

Answer 164

For at visualisere celler, på baggrund af kontraster og farver.

Forskellige farver opnås da lys absorberes forskelligt, ved forskellige bølgelængder.
Kontraster opstår alt efter om lyset absorberes eller reflekteres.

Question 165

F4

Hvad kan man gøre for at øge kontraster i forbindelse med mikroskopi? Og hvordan virker dette?

Answer 165

Ved at bruge basic stain (farvestof). Stains virker ved at binde sig til negativt ladet komponenter (celle vægge, nukleinsyre, acidic polysakkarider). Dette er en uspecifik stain, da den farver alt der er negativt ladet, og ikke et specifikt mål.

Question 166

F4

Hvordan afviger differential stains sig fra basic stain?

Answer 166

Differential stains, er teknikker hvor der farves noget selektivt.

Et eksempel på dette er gram farvning, hvor kun 1 celletype bliver farvet.

Question 167

F4

Hvilke tre trin er der i forbindelse med at ’staine’ en prøve?

Answer 167

1 Forbered prøven. Dette gøres ved at sprede den ønskede kultur tyndt ud over en plade, og lade pladen lufttørre.
2 Varmebehandling og staining. Pladen skal føres gennem en flamme, inden der påføres stain (farvestof) til pladen. Det overskydende farvestof skylles af, og pladen tørres.
3 Mikroskopi

Question 168

F4

Hvad er en ulempe ved stain teknikken?

Answer 168

Ved at bruge stain, dræber man ofte cellerne.

Question 169

F4

Hvad er fordelene ved brug af den optiske teknik ’Phase contrast’ mikroskopi?

Answer 169

Forbedre kontrasten af prøven uden at skulle bruge stains.
Giver mulighed for at kunne observere levende prøver.

Question 170

F4

Den optiske teknik ’Dark field’ mikroskopi, er særlig god til at undersøge hvad?

Answer 170

Til at undersøge celleres bevægelser (motillity)

Question 171

F4

Ved gramfarvning kan resultatet enten være gram positiv eller gram negativ. Hvad ’bestemmer’ om cellen er positiv eller negativ?

Answer 171

Opbygningen af celle væggen, afgør om cellen vil være gram positiv eller gram negativ.
En gram negativ celle har en ydre membrane, mens en gram positivs celle yderste lag er peptidoglycan.

Question 172

F4

Hvad bruges fluorescence mikroskopi til?

Answer 172

Til at visualisere prøver der fluorescerer, enten naturligt eller pga. stain med fluorescerende farvestof.

Question 173

F4

Hvad er hovedformålet med differential interference contrast (DIC) mikroskopi og confocal scanning laser microscopy (CSLM)?

Answer 173

At kunne give et 3D perspektiv af celle strukturer.

Question 174

F4

Hvordan differentiere elektron mikroskopi sig fra andre typer af mikroskopi?

Answer 174

Der benyttes elektroner, i stedet for synligt lys (fotoner) til at danne billeder af celler og strukturer.

Question 175

F4

Hvad beskriver ’Tree of Life’? Og på hvilke informationer kan ’træet’ blive tegnet?

Answer 175

Den evolutionære historie af alle organismer, som kan blive skematiseret ud fra rRNA-analyser.

Question 176

F4

Hvad er formålet af ’cell envelope’?

Answer 176

At afgrænse cellen, i form af en lag struktur (membran og cellevæg). Det er essentielt for at bevare funktionerne af cellen.

Question 177

F4

Hvad er cytoplasmic membran, og hvilke celletyper har denne struktur?

Answer 177

Cytoplasma membranen er en tynd struktur, der omringer cellens cytoplasma. Alle levende celler har denne struktur.

Question 178

F4

Hvilke funktioner har cytoplasma membranen?

Answer 178

• Er en barriere til omgivelserne
• Aktiv transport over membranen
• Stedet for proton motive force generes og frigives.

Question 179

F4

Hvordan er cytoplasma membranen opbygget for bakterier og eukaryoter?

Answer 179

Membranen er typisk opbygget af et dobbeltlag phospholipid. Phospholipiderne vender så ’hovederne’ er ud mod omgivelserne.

Phospholipid består af en ’hale’ og et ’hoved’. Halen er fedt syre, og derfor er det hydrofobisk. Hovedet er glycerol + phosphat og er derfor hydrofilt.

Question 180

F4

Hvordan adskiller cytoplasma membranen for arkæer sig fra bakterier og eukaryoter?

Answer 180

Hos arkæer er der ether bindinger mellem lipiderne, mens det er ester bindinger hos pro- og eukaryoter.

Question 181

F4

Hvilke former for transport er der over cytoplasma membraner?

Answer 181

• Simple transport
• Aktiv transport (ABC)
• Group translocation

ABC står for ATP Binding Cassette

Question 182

F4

Hvad er simple transport over cytoplasma membranen?

Answer 182

En transport ind og ud af cellen, som bliver drevet af energi fra Proton motive force

Question 183

F4

Hvad er Aktiv transport (ABC) over cytoplasma membranen?

ABC står for ATP Binding Cassette

Answer 183

For at stoffet bliver transporteret over membranen, skal det bindes til et protein, og energien for transporten kommer fra ATP.

Question 184

F4

Hvad er Group translocation over cytoplasma

Answer 184

Før stoffet kan blive transporteret, skal der ske en kemisk modificering. Energien kommer fra et organisk molekyle, såsom phophenolpyruvate.

Question 185

F4

Hvorfor er der behov for cellevægge?

Answer 185

For at cellen kan modstå osmotisk/trugor tryk, for at forhindre celle lysis.

Lysis er når cellen sprænger, og derfor dør.

Question 186

F4

Hvad er bakteriers cellevægge opbygget af? Og hvordan er det sammensat.

Answer 186

Cellevæggen er opbygget af peptidoglycan ’strands’ som ligger parallelt rundt, og er bundet sammen med kovalente peptid bindinger.

Question 187

F4

I stedet for ’traditionelle’ cellevægge, har arkæer i stedet, hvad som deres yderste lag?

Answer 187

S-layer (protein shell)

Question 188

F4

Hvad er gram negative bakteriers ydre cellemembran opbygget af?

Answer 188

Lipopolysakkarider (LPS)

Lipopolysakkarider er polysakkarider der er kovalent bundet til lipider.

Question 189

F4

Hvad er periplasmen?

Answer 189

Et flydende miljø, placeret mellem den cytoplasmiske membran og den ydre membran.

Question 190

F4

Hvad er et S-layer? Og hvad er dets funktioner?

Answer 190

Et lag af proteiner eller glycoproteiner.
Det styrker strukturen og beskytter mod lysis. Tillader små molekyler at passere, men ’fanger’ større molekyler. Som det yderste lag kan det muliggøre at fastsætte sig på noget.

Lysis er når cellen sprænger.

Question 191

F15

Kan bakterier og archaea overføre celler til hinanden?

Answer 191

Ja

Question 192

F15

Hvad er en mutation?

Answer 192

En arvelig ændring af base sekvensen i genomet af en organisme/virus.

Question 193

F15

Hvad betyder genotype?

Answer 193

Der er sket en ændring i genomet i forhold til mildtypen.
Der er sket noget i forhold til bakteriens evne til at syntensere.

Question 194

F15

Hvad er phenotypen?

Answer 194

Phenotypen observerer mutanter

Question 195

F15

Hvordan kan Selekterbare egenskaber mutationer isoleres, og hvordan isoleres ikke-selekterbare egenskaber mutationer?

Answer 195

Selekterbare egenskaber kan isoleres ved selektion, og isoleres ikke-selekterbare egenskaber isoleres ved screening.

Question 196

F15

Hvordan kan mutationer opdeles?

Answer 196

• Spontane mutationer
• Persuade (induced) mutationer
• Point mutationer, herunder transition og transversion.

• Spontane mutationer: sker pga naturen.
• Induced mutationer: sker pga kemikalier og radiation.
• Point mutation, når et base par bliver til et andet. (se figur 9.5, F14, slide 8).

Question 197

F15

Hvor mange base par vil man gerne benytte til insertion og deletion?
1, 2, 3?

Answer 197

3

Ved 1 eller 2 base-par vil læserammen ødelægges.

Question 198

F15

Hvad sker der ved same-site revertants, og hvad sker der ved second-site revertants?

Answer 198

Same-site revertants: der sker en mutation, hvor den oprindelige mutation sad, og kommer derfor tilbage til udgangspunktet.
Second-site revertants: Der dannes et supressor tRNA, der ophæver mutationen.

(se figur 9.7, F14, slide 11)

Question 199

F15

Hvor ofte sker der fejl i DNA replikation af mikroorganismer?

Answer 199

10^-6 - 10^-7 per kbp per generation.

Question 200

F15

Har højere stillet organismer større mutations rate?

Answer 200

Nej, højere organismer har en lavere mutations rate.

Question 201

F15

Er der et repair system i RNA, ligesom der er i DNA?

Answer 201

Nej, det er der ikke.

Question 202

F15

Hvad sker der ved nucleotid base analogi? (mutagenesis)

Answer 202

De rigtige baser udskiftes med nogle som minder om de rigtige. Dette giver problemer, da de så ikke passer i baseparrene.
T –> B, A –> Am

Se F15, slide 14

Question 203

F15

Hvad sker der ved UV stråling? (mutagenesis)

Answer 203

Krydsbinding mellem to tyraminer.
Der formes pyrimidine dimers.

Se F15, slide 14

Question 204

F15

Hvad sker der ved kemisk modifikationer? (mutagenesis)

Answer 204

Der kan dannes af Hydrocylamine, som gør at C –> C*.

Det skaber en kemisk ændring af basen i DNAet.
## Footnote

Se F15, slide 14

Question 205

F15

Hvad sker der ved indskudte agenter? (mutagenesis)

Answer 205

Ethidium bromid.
Agenter sætter sig mellem to basepar

Se F15, slide 14

Question 206

F15

Hvad sker der ved ionizing stråling?

Answer 206

Skaber frie radikaler.

Question 207

F15

Hvad er direkte reversal proces?

Answer 207

Reparationssystem til at reparere skader af DNA.

Question 208

F15

Hvordan repareres en single-streng skade af DNA?

Answer 208

Den anden streng benyttes som template. Den skadede del fjerenes, og dannes på ny vha. template.

Question 209

F15

Hvordan repareres en double-strenget skade af DNA?

Answer 209

De to dele diffunderer væk fra hinanden.
Organismen ser dette som noget skidt, og sætter dem derfor blot sammen med noget.

Question 210

F16

Hvad er de tre muligheder der er for DNA når det kommer ind I en celle (overført fra en anden celle)?

Answer 210

1. Degradering af restriction enzymer
2. Replikere af sig selv
3. Recombine med værts kromosomet

Question 211

F16

I forbindelse med genudveklsing mellem celler, beskriv transformation, evt inkl. Tegning af processen

Answer 211

Der sker en lysis af donorcellen, så DNA frigives. Dette DNA optages af en anden celle. Kræver ikke direkte celle kontakt. Da DNAet let går i stykker er det kun en del af DNA’et som overtages.

En celle som kan modtage skal være kompetent, i bakterier relateres det til poli, som binder DNA og trækker det ind.

Se slide 2, powerpoint 16

Question 212

F16

I forbindelse med genudveklsing mellem celler, beskriv transduction inkl. Tegning af processen.

Beskriv både generaliseret og specialiseret transduction

Answer 212

DNA transfer sker via en virus, så det kræver ikke direkte kontakt mellem celler. Det sker derfor efter lytic cycle, hvor virus har fået host genom ind i sig.

Generaliseret transduction er et tilfældigt gen fra en genom pakket i en virion som overføres. Ved specialiseret transduction er det et bestemt gen som som overføres.

Se slide 2, powerpoint 16 for tegning
Se også slide 9 og 10 powerpoint 16

Question 213

F16

I forbindelse med genudveklsing mellem celler, beskriv konjugation inkl. Tegning af processen.

Answer 213

Det er horisontal gen overførsel. Kan både være overførsel af plasmid og af chromosom. Der skal være en fysisk bro imellem dem

F-plasmid anvendes til at mobilisere chromosomet til overførsel. Plasmidet kan integreres i modtager kromosomet.

Se slide 2, powerpoint 16

Question 214

F16

Beskriv homologous recombination, tegn gerne processen

Answer 214

Det er krævet, at to sekvenser af DNA fra to kilder er næsten ens
1. Endonuclease laver hul I DNA
2. Single strand protein binder sig til DNA
3. RecA protein sætter den nye åbning af DNA ind i modtager DNA strengen (vigtigt protein)
4. så sker der en cross-strand udveksling, så der dannes kryds mellem strengene.
Efterfølgende sker der holliday junction som danner heteroduplex regioner hvor hver strand stammer fra forskellige kromosomer.

Det skaber ny genotype

Question 215

F16

Hvis en celle ikke er kompetent til transformation I forvejen, hvordan gør man den så kompetent?

Kompetent celle: den kan overtage dele af DNA fra en anden celle

Answer 215

Kemisk, behandler med calcium og køler den
Elektrocompetent, sender strøm gennem DNA så det er lettere at få ind I cellen.

Question 216

F16

Forklar lytic cycle og lysogen fase I forhold til bakteriofagers livscyklus. Kan evt indeholde tegning

Bakteriofag er virus som går efter bakterier

Answer 216

I lytic cycle binder bakteriofagen sig til cellen som DNA/RNA optages. Herefter laver den kopier af sit eget DNA/RNA hvilket til sidst dræber cellen.

Den lysogene fase er inden cellen dræbes, her er de i hvile så den ikke kopierer sig selv i denne fase.

Slide 8, powerpoint 16

Question 217

F3

Forklar den anabolistiske vej (anabolisme)

Answer 217

En endergonisk reaktion, hvor et udgangsstof kræver energi, for at blive omdannet til cellematerialer.

Side 113 i bogen

Question 218

F3

Forklar aerobiske respiration af glukose - redox reaktion.

Answer 218

Celler omdanner glukose til energi (ATP), hvor der under overførsel af elektroner af glukose til ilt bliver skabt en redox reaktion. Dvs. at glukose er elektrondonor, og ilt er elektron-acceptor. Udover energi, så udvindes der også CO2.

Side 112 i bogen

Question 219

F3

Forklar om energiklasserne.

Answer 219

Energiklassernes deles i 2 forskellige klasser:

Fotoautotrofi:
Optager energi til metabolisme fra lys f.eks. planter.

Kemotrof:
Optager energi til metabolisme fra kemiske reaktioner f.eks. aerobisk respiration.
Optagelsen af energi kan enten komme fra organiske (Kemoorganotrofer), som glukose, eller uorganiske molekyler (Kemolithotrofer), som H2.

Begge energiklasser udvinder ATP.

Side 113 i bogen

Question 220

F3

Nævn eksempler på hhv. carbon-kilder og nitrogen-kilder.

Answer 220

Carbon:
Heterotrof:
Organiske molekyle, sukker fedtsyre, aminosyrer.

Autotrof:
CO2

Nitrogen:
Ammonia NH3, Nitrat NO3-, nitrogen N2, aminosyrer.

Question 221

F3

Hvad er en elektron donor?

Answer 221

Det stof, som oxideres i en redox reaktion, dvs. at stoffet afgiver sine elektroner.

Question 222

F16

Beskriv F plasmid, dets replikationsmetode og hvad det anvendes til (ifm. Genoverførsel)

Answer 222

F plasmid anvendes til at overføre DNA ved conjugation. Det replikerer ved “rolling circle”. Det overføres fra en HFr celle til en F- celle. Når det skal integreres i modtagercellen sker der recombination

Se slide 18, powerpoint 16 for figur

Question 223

F3

Hvad er en elektron acceptor?

Answer 223

Det stof, som reduceres i en redox reaktion, dvs. at stoffet optager elektroner.

Question 224

F3

Hvornår fremtræder redox reaktioner i par?

Answer 224

Halve reaktioner (også kaldt redox par):
En metode, hvor oxidationen og reduktionen analyseres hver for sig. Bruges f.eks. til galvaniske celler eller korrosion.

Se side 114 i bogen

Question 225

F3

Hvordan dannes vand ud fra en redox reaktion:

Answer 225

Anode, elektron-donor:
H2 -> 2 e- + 2 H^+

Katode, elektron-acceptor:
½ O2 + 2 e -> O^-2

2 H^+ + O^-2 –> H2O

Question 226

F3

Forklar hvordan et redox tårn er opstillet.

Answer 226

Redoxparene, som er de stærkeste elektron-donorer (reducerede stoffer) placeres i toppen, hvorimod redoxparene, som er de stærkeste elektron-acceptorer (oxiderede stoffer) placeres i bunden. Jo længere afstand, der er mellem elektron-donoren og elektron-acceptoren, jo mere energi vil der udvindes.

Side 114 i bogen

Question 227

F3

Hvad dækker begræbet energibærere (energy carriers) over?

Answer 227

Celler, som kan overføre energi fra én del af systemet til en anden del. De deles i to typer:

Prostetiske grupper:
Bundet til enzymer

Koenzymer:
F.eks. NAD+, NADP+

Question 228

F3

Giv et eksempel på et system med energibærer.

Answer 228

NAD+/NADH

NAD+ fremtræder i sin oxiderede form, hvor NAD+ under overførsel af elektroner samt hydroner bliver omdannet til NADH, som fremtræder i sin reducerede form, og udvinder energi.

Question 229

F3

Forklar NAD+/NADH-cyklen.

Answer 229

1. Enzymet reagerer med en elektron-donor og et oxideret koenzym (NAD+).
2. Efter enzym-substrat-komplekset er dannet reduceres NAD+ til NADH.
3. NADH kan binde sig til et nyt enzym, som så kører den modsatte vej og oxiderer NADH til NAD+.

Se side 116 i bogen

Question 230

F3

Hvad dækker begrebet bioenergi over?

Answer 230

Bioenergi tager hånd om Gibbs frie energi, som fortæller, om en reaktion er endergonisk eller exergonisk. Det bruges til at måle varme, da der i alle reaktioner mistes energi i form af varme.
Når ændringen i Gibbs frie energi er positiv, så reaktionen endergonisk.
Når ændringen i Gibbs frie energi er negativ, så er reaktionen exergonisk.

Question 231

F3

Nævn forskellige former af energi.

Answer 231

Substrat-level-fosforylering:
Bliver den energi-rige binding hydrolyseret for at syntetisere ATP.

Oxidativ fosforylering:
Overførelsen af elektroner fra elektron-donoren til elektron-acceptoren danner et proton motivt kraft for at syntetisere ATP.

Fotofosforylering:
Lys, der danner proton motivt kraft for at syntetisere ATP.

Question 232

F3

Hvad dækker begrebet aktiveringsenergi over.

Answer 232

Den energi, som skal til, at molekyler kan danne en kemisk reaktion.

Question 233

F3

Hvordan påvirker katalysatorer en kemisk reaktion?

Answer 233

Nedsænker aktiveringsenergien.
Øger reaktionshastigheden.

Question 234

F3

Nævn enzymers basale kararistika.

Answer 234

• Er proteiner
• Virkelig specifikke.
• Generelt større end deres substrat.
• Indeholder et aktivt center.

Question 235

F3

Hvad er et apoenzym?

Answer 235

Inaktive del af et enzym.

Question 236

F3

Hvilke grupper dækker cofaktorer over?

Answer 236

Prostetiske grupper
Koenzym
Metal ioner

Question 237

F3

Hvad er et holoenzym?

Answer 237

Katalytisk/aktive enzym.

Question 238

F3

Hvordan binder de forskellige cofaktorer til enzymet?

Answer 238

Prostetiske grupper:
Meget tæt og permanent.

Koenzymer:
Binder sig løst.

Metal ioner:
Både stærkt eller løst.

Question 239

F3

Forklar den katalytiske cyklus af lysozyme

Answer 239

1. Substratet binder sig i det aktive center og danner enzym-substrat-kompleks.
2. Bindinger bliver overanstrenget, hvorefter de frigiver produkterne.
3. Enzymet kan derefter begynde fra ny.

Question 240

F3

Hvor mange enzymklasser findes der?

Answer 240

6

Question 241

F3

Hvad går Michaelis Mentens ligning ud på?

Answer 241

Bestemmer initialreaktionshastigheden fra substratet til produkt, som katalyseres af et enzym.

Bruges til at bestemme enzymers effektivitet ud fra deres hastighed.

Question 242

F3

Hvad er et lineweaver burk plot?

Answer 242

Det går ud på at opstile en ligning, som kan burges til at finde reaktionens maksimale hastighed og den maksimale koncentration af stoffet ud fra Michaelis Mentens ligning.

Question 243

F12

Hvorfor er metabolisk regulering vigtigt, og hvad betyder det?

Answer 243

Metabolisk regulering forårsager hurtig tilvænning til skiftende miljøer og effektiv brug af ressourcer øger chancen for overlevelse.

Question 244

F12

Hvad er hovedmetoderne for metabolisk regulering?

Answer 244

Regulering af mængden af protein (langsom):
- Gene expression
o Regulering af transskription
o Regulering af mRNA translation til protein
- Regulering af protein degradering
Regulering af protein aktivitet (hurtig):
- Post transcriptional regulation

Question 245

F12

Hvad kan transkriptionsregulering gøre?

(Hurtig regulering)

Answer 245

• Nye proteiner kan laves hurtigt, når der er behov for dem, da mRNA kan transkriberes hurtigt.
• Hvis transkription stoppes, vil mRNA “cleares” hurtigt, hvilket stopper protein produktionen, da mRNA transkriptioner har et kort “half-life”.
• Forebygger produktionen af unødvendige proteiner.

Question 246

F12

Hvordan påvirker DNA bindende proteiner transskription?

Answer 246

De kan både aktivere eller blokere transskription.

Question 247

F12

lac og trp repressorer er DNA-bindende proteiner, der indeholder helix-turn-helix. Hvilken bakterie findes de i?

Answer 247

E. coli

Question 248

F12

Hvilke tre udfald er mulige efter DNA bindingsprocessen?

Answer 248

• DNA bindende protein kan katalysere en specifik reaktion på DNA molekylet. (Recruitment of RNA polymerase)
• DNA bindingsprocessen kan blokere transskription
• DNA bindingsprocessen kan aktivere transskription

Question 249

F12

Hvad er transskriptionsfaktorer(TF)?

Answer 249

Proteiner der kontrollerer hastigheden af transskription ved at binde sig til specifikke DNA reguleringssekvenser(promoter) opstrøms af det proteinkodende sekvens (CDS, gen), ved at interagere/modulere transskriptions maskineriet.

Question 250

F12

Hvad er aktivator og repressor proteiner?

Answer 250

Et aktivator protein tænder for transskription, ved at binde specifikke “motifs” af DNA i promotor sekvensen, og derved hjælper en med at rekrutere RNA polymerase og/eller sigma faktorer.

Et repressor protein slukker for transskription ved at binde specifikke “motifs” af DNA i operator regionen. Det inhiberer transskriptionen af gener, ved at blokere fastgørelsen af RNA polymerase til promotoren.

Question 251

F12

Hvad er det kollektive term for inducers og corepressors?

Inducers inducerer transskription.
Corepressors modvirker transskription.

Answer 251

Effectors.

Effektors er små molekyler, der bestemmer bindingen af aktivatorer og repressorer.

Question 252

F12

Hvilken type protein vil der benyttes, hvis en celle skal spare på energi?

Answer 252

Repressor protein.

Det stopper transskriptionen, som derved stopper med at bruge energi.

Question 253

F12

Hvad er enzym repression?

Answer 253

Det forebygger syntesen af et enzym, medmindre produktet det bestemte enzym laver mangler i en kultur.

Eks. hvis et enzym producerer arginin, vil det kun producere arginin, hvis der ikke er arginin tilstede i en kultur.

Question 254

F12

Hvad er det korrekte fagbegreb for et enzym, der nedbryder et andet stof?

Answer 254

Et katabolisk enzym. (Catabolic enzyme)

Question 255

F12

Hvad er det modsatte af enzym repression?

Altså hvor et signal inducerer produktionen af et enzym.

Answer 255

Enzym induktion. (Enzyme induction)

Question 256

F12

Hvad er negativ kontrol, og hvad er de største ulemper ved det?

Answer 256

Negativ kontrol er alle transskriptions regulations mekanismer, der involverer repressorer.

De største ulemper er at det ikke er 100 % effektivt, da det varierer i styrke, og derfor ikke altid stopper transskription helt.

Question 257

F12

Hvad er positiv kontrol?

Answer 257

Gener kontrollerede af aktivator proteiner.

Question 258

F12

Hvad kaldes flere operoner, der er kontrolleret af det samme regulerende protein?

En operon er en sammensætning af gener, der arbejder sammen for at producere bl.a. mRNA.

Answer 258

Regulon

Question 259

F12

Forklar simpelt hvad transduktion er.

Answer 259

Hvordan celler behandler signaler, der kommer ind til cellen.

Question 260

F12

Chemotaxis er bevægelsen mod attractants eller væk fra repellents. Hvad er de tre hovedtrin i chemotaxis?

Answer 260

1. Svar på signal (Response to signal)
2. Kontroller falgellar rotation (Controlling flagellar rotation)
3. Tilpasning (Adaptation)

Question 261

F12

Hvad er phototaxis?

Answer 261

Bevægelse mod lys.

Question 262

F12

Hvad er aerotaxis?

Answer 262

Bevægelse mod oxygen.

Question 263

F12

Hvad kaldes det der gør at prokaryoter kan regulere aktiviteter, der kræver en vis population?

Hvordan ved de at der er en stor nok population til f.eks. en infektion?

Answer 263

Celle-til-celle signalering, herunder quorum sensing.

Question 264

F7

Hvilken form for proces er fermentering, og hvornår sker det?

Answer 264

Fermentering er en ineffektiv proces, så sker kun, hvis den ingen andre muligheder for energi har.

Question 265

F7

Hvilken slags elektron donor skal være til stede for muligheden af fermentering?

Answer 265

Organisk elektron donor.

Question 266

F7

Hvordan noteres latin navne?

Answer 266

I kursiv med stort start bogstav

Question 267

F7

Hvad kendetegner aerobisk respiration?

Answer 267

Ingen komplex III
Konsekvens: 8 H+ overføres over membranen per 2 e-.

Question 268

F7

Hvad kendetegner anerobisk respiration?

Answer 268

Benytter nitrat reduktase i stedet for Cytochrome Bo3
Konsekvens: 6 H+ overføres over membranen per 2 e-.

Question 269

F7

Hvad benytter atotrophe som kulstofkilde, og chemolitotrophe som energikilde?

Answer 269

Autotroph = den bruger CO2 som kulstofkilde.

Chemolithotroph = uroganisk stof som energikilde

Question 270

F7

Hvad gør Calvin Cyklussen?

Answer 270

Den måde som organismer fikserer CO2 og danner sukker

Question 271

F7

Hvad dannes ved Calvin cyklussen?

Answer 271

Fruktose (6-phosphat)
CO2 fiksering.

Question 272

F7

Hvad former nogle mikroorganismer ved fikseringen af nitrogen (N2)?

Answer 272

Ammoniak (NH3)

Dannes vha nitrogenase

Question 273

F7

Hvad syntetiseres prokaryotiske polysakkarider fra?

Answer 273

Aktiveret glukose.

Question 274

F7

Hvad er glukoneogenesis?

Answer 274

• Syntese af glukose fra phosphoenolpyruvat.
• Phosphoenolpyruvat kan syntenseres fra oxaloacetate.

Question 275

F7

Hvad er den primære funktion af pentose phosphat pathway.

Answer 275

Primær funktion: C6 eller anden kulstofkilde, så skal den kunne lave kulstof 5 –> pentose

Question 276

F7

Hvad er erit medie og minimal medie?

Answer 276

Erit medie = frie aminosyrer, mm => kan tage hvad den skal bruge til at vokse
Minimal medie = nitrogen kilde, amoniak, kulstofkilde, glukose. => starter fra bunden

Question 277

F7

Hvor kommer carbon skeletter fra?

Answer 277

Carbon skeletter kommer fra intermediater af glykolysis eller citronsyre cyklusen.

Question 278

F7

Hvordan er fedtsyre syntenseret?

Answer 278

De syntenseres to carbon atomer ad gangen.

Fedtsyrer indeholder ofte et lige antal kulstoffer => da det bygges på i et to trin.

Question 279

F7

Indeholder Bakterier, Eukarya, og/eller Archaea fedtsyrer?

Answer 279

Bakterier & Eukarya: Den sidste samling af lipider består af adderingen af fedtsyrer.
Archaea: lipid indeholder phytanyl sidekæder i stedet for fedtsyrer.

Question 280

F7

Hvad er forskellen på mettede og umættede fedtsyrer i forhold til carbonatomer og protoner?

Answer 280

Mættede fedtsyrer => proton på alle carbon.
Umættede fedtsyrer => ikke mættet med protoner.

Question 281

F11

Hvad er funktionen af messenger RNA (mRNA)?

Answer 281

Har den gentiske information.

Question 282

F11

Hvad er funktionen af transfer RNA (tRNA)?

Answer 282

At transporter amino acids til ribosomet

Question 283

F11

Hvad er funktionen af ribosomal RNA (rRNA)?

Answer 283

Den struktuelle og katalytiske del af ribosomet.

Question 284

F11

I hvilken retning bliver en DNA-streng afkodet i?

Answer 284

Fra 5’ enden mod 3’ enden.

Question 285

F11

Forklar kort transskriptionen i proteinsyntesen?

Answer 285

Transskriptionen er det trin hvor DNA oversættes til mRNA. RNA polymerase påsættes ved promoteren på den ikke kodende streng, og aflæser nukleotiderne inden for den kodende sekvens. Polymerasen sammensætter sammetidig en komplimentær RNA streng til DNA strengen, ud fra basepar. Man skal være opmærksom på at i RNA vil thymin (T) være udskiftet med uracil (U).

Question 286

F11

Hvad er en promoter region, i forbindelse med transskription?

Answer 286

En bestemt sekvens, der indikerer at begyndelsen af en gen kode. Promotoren skal være til stede for at RNA-polymerase kan transskribere.

Promoter regionen kaldes også for -35 regionen, da der vil være 35 nukleotider til at den reelle gen sekvens begynder.

Question 287

F11

Hvad er en sigma faktor (skriptionsfaktor)?

I forbindelse med transskription.

Answer 287

Sigma faktoren er det som genkender promoteren, og derfor forbinder sigma faktoren RNA-polymerase til promoteren.

Question 288

F11

Hvordan kan sigma faktoren bruges til at regulere, mængden af et gen der bliver udtrykt?

Answer 288

Der skal være sigma faktor til stede, for at et gen kommer til udtryk. Ved at producere mere eller mindre sigma faktor, vil der derfor tilsvarende blive mere eller mindre af genet udtrykt. Der er også proteiner, hvis funktion er at deaktivere sigma faktorer.

Question 289

F11

Hvad er en af forskellene i transskriptionsfasen mellem eukaryoter og prokaryoter?

Answer 289

Hos prokaryoter kan flere gener blive transskriberet på en gang (operon), mens hos eukaryoter kan kun 1 gen af gangen bliver transskriberet.

Operon er en klynge af gener, under kontrol af en promoter.

Question 290

F11

Hvordan stoppes en transskription?

Answer 290

1. Der dannes et ’stem - loop’ i RNA, fordi der har været to komplementære sekvenser, efterfulgt af en række uracil baser, dette indikere gen sekvensen er ovre.
2. Polymerasen kan genkende ud fra sekvensen, at koden er slut nu. Dette er en mere aktiv måde.

Se F11 slide 12 for en visualisering af stem loopet.

Question 291

F11

Transskriptionen kan for eukaryoter deles op i 4 trin. Hvad er disse?

Answer 291

1. Primær transskription
2. Alternativ ’splicing’
3. Introns & extrons
4. ’Capping’ og polyadenylation

Question 292

F11

Hvad er formålet med splicing af den primære transskription?

Splicing sker med proteinkomplekset spliceosom.

Answer 292

I det primære transskript vil der være introns med, og disse bliver skåret fra under splicing, mens extrons bliver sammensat til et modent mRNA.

Introns er sekvenser der ikke bliver udtrykt, mens extron er sekvenser der bliver udtrykt.

Question 293

F11

Hvad er extrons?

Answer 293

Sekvenser af nukleotider der bliver udtrykt

Question 294

F11

Hvad er introns?

Answer 294

Sekvenser af nukleotider der ikke bliver udtrykt. Disse vil blive nedbrudt, i deres RNA-form.

Question 295

F11

Hvad bruges ’Capping’ og polyadenylation til i transskriptionen?

Answer 295

Det er stoffer som skal tilføjes til mRNA strengen, hvor 5’-Cap skal være tilstede for at translationen kan igangsættes. Poly-A tilføjes i 3’ enden for at stabilisere mRNA.

Er en del af transskriptionen da det sker inde i cellekernen.

Question 296

F11

Hvilken binding dannes mellem to aminosyre?

Answer 296

En peptidbinding

Question 297

F11

Hvad hedder processen af hvor mRNA ’omdannes’ til protein?

Answer 297

Translation

Question 298

F11

Hvad hedder processen af hvor DNA ’omdannes’ til mRNA?

Answer 298

Transskription

Question 299

F11

Hvad er den primære struktur af proteiner?

Answer 299

Rækkefølgen af aminosyre, på polypeptidkæden.

Question 300

F11

Hvad er den sekundære struktur af proteiner?

Answer 300

Enten alpha helix eller beta sheet.
Hvordan polypeptidkæden folder sig, ud fra hvilke interne bindinger der kan dannes.

Question 301

F11

Hvad er den tertiære struktur af proteiner?

Answer 301

Placering af alpha helix og beta sheet i forhold til hinanden. Der kan opstå syostion broer der er med til at opretholde struktur. Det er den rummelige struktur af polypeptidkæderne.

Question 302

F11

Hvad er den kvaternære struktur af proteiner?

Answer 302

Strukturen der dannes når flere polypeptidkæder fungere som et protein.

Question 303

F11

Hvor mange nukleotider, indgår i et codon?

Answer 303

3 nukleotider

Question 304

F11

Hvad er henholdsvis 2D og 3D strukturen af tRNA?

Answer 304

2D strukturen er en kløver, mens 3D strukturen er L-formet.

Question 305

F11

Hvordan bindes mRNA til tRNA?

Answer 305

tRNA har et anticodon, som kan binde sig til et codon i mRNA kæden.

Question 306

F11

Hvor mange binding cites til tRNA er der i ribosomet?

Answer 306

3 - accepter site, peptide site og exit site

Question 307

F11

Beskriv kort translations processen.

Answer 307

tRNA med start codon, hjælper med at binde mRNA til ribosomets binding site. tRNA med næste codon og dertilhørende aminosyre binder sig til ribosomets accepter, og der dannes en peptidbinding mellem aminosyrerne. Det orginale tRNA forlader ribosomet, og prossecen gentages indtil der er nået den ønskede polypeptidkæde.

Visualisering i F11 slide 37

Question 308

F11

Hvad er polyribosomer, og hvad er formålet med disse?

Answer 308

Flere ribosomer sidder sammen, således at translationen er optimeret.

Question 309

F14

Hvad betyder semi-syntetisk?

Answer 309

Modificering af naturlige stoffer.

Question 310

F14

Hvor ødelægges cellen af antibiotika.

Answer 310

Cellen ødelægges/nedbrydes indefra.

Question 311

F14

Hvad er de fire hovedklasser af naturlige antibiotika resistente mekanismer?

Answer 311

• Modifikation af det antibiotiske mål.
• enzym aktivitetsstandsning af den antibiotiske agent.
• Fjernelse af antibiotisk fra cellen via efflux pumper.
• Metabolisk bypas.

Question 312

F14

Hvad kan random kromosom mutation føre til?

I relation til antibiotika

Answer 312

Resistens

Question 313

F14

Hvordan kan naturligt resistente gener transporteres?

Answer 313

De kan transporteres ved vandret gen overføring og omflyttende elementer fra resistente til ikke-resistente celler.

Question 314

F14

Hvad er biofilm?

Answer 314

• Giver ekstra beskyttelse til bakterien:
  1. EPS matrix falder i gennemstrømningen af antibiotika.
  2. Opregulering af antibiotiske efflux systemer.
• Biofilm-baserede infektioner er svære at behandle.

Question 315

F14

Hvad sker der ved metabolisk bypas?

Answer 315

• Celler ændrer væsentlige cellulære processer målrettet af antibiotika til ikke-essentielle.
• Aktivering af alternative funktioner.

Question 316

F14

Hvad er antibiotika og hvornår kan celler fx anvende det?

Answer 316

Det er antimicrobielle stoffer som naturligt produceres af mikrober som dræber eller inhiberer den fra at vokse. De går efter grupper af bakterier.
De kan også være semisyntetiske og syntetiske, så de er fremstillet i lab.

Generelt anvendes det så de har bedre chance for at overleve, fx hvis der er begrænsning på en bestemt føde, så kan de dræbe de andre organismer, så der er mere til rådighed til dem selv.

Question 317

F14

Hvad går antibiotika særligt efter når det skal angribe en celle?

Answer 317

Dets mål er essentielle molekylære processer, fx metabolske mekanismer. Eller processer med DNA eller cellemembran/cellevæg.

Question 318

F14

Hvordan kan resistens overfor antibiotika opstå?

Answer 318

Det kan være en tilfældig mutation i kromosomet eller der kan overføres resistente gener via horisontal gen overførsel.

Question 319

F14

Hvad er funktionen af efflux pumper

I fbm. antibiotika

Answer 319

Det sænker den indre antibiotika koncentration, multi-drug resistent da den ikke er specifik til et bestemt molekyle. De opstartes når cellen fornemmer der er antibiotika.

Question 320

F14

Hvad er funktionen af biofilm ifm. Antibiotika?

Answer 320

De kan danne en solid bariere, så de er ekstra beskyttede. Deres effluxpumper bliver mere effektive.

Effluxpumper bruges til at pumpe antibiotika ud af cellerne.

Question 321

F14

Hvad er persister-celler

I forbindelse med antibiotika

Answer 321

De er tolerante overfor flere typer antibiotika. De er genetisk ens mens vokser ikke, og antibiotika kan ikke dræbe dem. når antibiotika behandling stopper, så begynder de at vokse igen.

Det er en tilstand cellen kan komme i.

Question 322

F14

Er antibiotika relevant for bioteknologi? Hvis ja, hvorfor?

Answer 322

Ja, da det er et problem ifm. Med sygdomme og helbredelse. Derfor ønsker man at udvikle nye strategier og begrænse spredning af resistens.

Question 323

F14

Hvad er en virus?

Answer 323

Genetisk element som kan formere sig i en levende værts celle. Den er ikke en del af livets træ.
Den får energi, metabolske intermediater og protein fra værtscellen. Stor diversitet i hvad de inficerer.

Question 324

F14

Forklar de fundamentale dele af en virus, herunder virion, capsid og capsomerer

Answer 324

Virion er den ydre del af virussen, capsid er proteinskallen som omringer genomet. Capsomererne er de enkelte proteiner som danner capsid.

Question 325

F14

Hvad er forskellen på en ”naked virus” og en ”enveloped virus”

Answer 325

En ”naked virus” har ingen ydre lag, en ”enveloped virus” har et ydre lag af et fosforlipidbilag (fra værtscelle) og proteiner. På det ydre lag har den proteiner som kan sætte sig fast og inficere. Hele virion kommer ind i dyrecellen når den inficerer.

Question 326

F14

Forklar kort de to former for virus infektioner

Answer 326

Lytic infektion, virus replikeres og ødelægger cellen
Lysogenic infektion, værtscellen ændres genetisk, da virus bliver en del af dens DNA.

Question 327

F14

Kan genomet i virus være DNA og RNA, eller kun DNA?

Altså ikke som en blanding af DNA og RNA, men enten den eller den anden.

Answer 327

Det kan være begge dele.

Question 328

F14

Er virus DNA dobbelt eller enkelt strenget, eller er begge muligt?

Answer 328

Begge er muligt

Question 329

F14

Hvad er de to måder en capsid på en virus kan dannes?

capsid er proteinskallen som omringer genomet

Answer 329

Den kan lave den selv ved at anvende capsomerer som er kodet i deres egen sekvens (self-assembly) eller de kan være afhængige af værten, og anvende dens chaperone proteiner til at folde og samle capsomererne

Capsomere er det, som capsid er opbygget af.

Question 330

F14

Skal der være enzymer tilstede i virions for at en virus kan inficere?

Virion er den ydredel af viraen

Answer 330

Ja fx lysozyme, som nedbryder peptidoglycan i bakteriecelle væggen.

Question 331

F14

Forklar de 5 trin i virus replications cyklus, inkl. tegning

Answer 331

1. fastsættelse af virus på hosten
2. indtrædelse af virion i cellen
3. syntese af virus’ nukleinsyre ved celle metabolisme
4. capsides og genomet pakkes ind i nye virions
5. de færdige virions sendes ud fra cellen.

For tegning se powerpoint 16, slide 29

Question 332

F14

Hvad kræves for at en virus kan inficere en vært?

Answer 332

Kræver komplementære receptorer på overfladen af værten og på den inficerende virus. Receptorer kan f være proteiner, lidpider, carbohydrater. Så hvis der sker mutation på en receptor, så kan det skabes resistens for viraen.

Question 333

F14

Hvad er en lysogen celle?

Answer 333

Den har en virus som en del af sit genom.

Question 334

F14

Hvad er de 3 hovedforskellen mellem dyre-vira og andre vira?

Answer 334

Hele virion kommer ind i cellen, de har viroplasms som øger hastigheden for dannelsen af virions, de har specifikke host cell receptorer

Question 335

F14

Tre major forskelle til plante-vira fra dyre vira

Answer 335

De har en bred vifte af værter, ofte ikke indpakkede, transmission er anderledes grundet plantecellevægge.

Question 336

F14

Har vira haft betydning for evolution? Og hvorfor?

Answer 336

Ja, overføre gener mellem arter, sikrer diversitet, gøre nye metabolismer mulige, stor påvirkning på økonomi (sundhed, medicin, landbrug)

Question 337

F18

Er det muligt at inducere lac promotor med IPTG?

Answer 337

Ja

Question 338

F18

Står cDNA for komplimentær DNA?

Answer 338

Ja

Question 339

F18

I site-directed mutagenesis, er det nemmest at forsvare sig mod linære eller cirkulære plasmider?

Answer 339

Linære plasmider

Question 340

F18

I en protein fusion kan det endelige protein være fluoricerende. Til en sådan fusion, vil GFP få proteinet til at lyse i hvilken farve?

Answer 340

Grøn

GFP står for Green Flourecent Protein.

Question 341

F18

Nogle steder i verden bruges mikrobiologi til at få køer til at have en større mælkeproduktion, ved at “snyde” koen til at tro at den er gravid. Hvad hedder typen af proteiner der dannes til dette formål?

Answer 341

Recombiant eller heterologous proteins.

Question 342

F18

Kan enzymer genkende chiralitet?

Answer 342

Ja

Question 343

F18

Hvad er “gene mining”?

Bruges bl.a. til et “genbibliotek”.

Answer 343

Indsamling af DNA prøver fra forskellige miljøer.

Question 344

F18

Hvad kalder man de biologiske dele, der benyttes i syntetisk biologi?

Answer 344

Biobricks

Question 345

F18

Hvad er forskellen på genome editing og metaboliske pathways?

Answer 345

Genome editing er arveligt.
Metaboliske pathways påvirker udelukkende subjectet.

Med subjectet menes “patienten” eller modtageren. Kan være menneske, bakterie og meget mere.

Question 346

F21

Hvordan er metabolisk diversitet defineret?

Answer 346

Defineret i termer af cellulære processer støttende vækst.

Question 347

F21

Hvordan er miljø-diversitet defineret?

Answer 347

Defineret i termer af mikrobielt samspil mellem organismer og deres miljø.

Question 348

F21

Hvordan er fylogenetisk diversitet defineret?

Answer 348

Defineret i termer af evolutionære forhold mellem organismer.

Question 349

F21

Der er mindst tre grunde til at metaboliske og økologiske træk er delt af divergente organismer, hvilke?

Answer 349

• Gen tab
• Konvergent evolution
• Vandret gen overførsel

Gen tab: A trait is present in a common ancestor is lost during divergence over time.

Konvergent evolution: A trait has evolved independently in two or more lineages is not encoded by homologous genes.

Vandret gen overførsel: Genes that code for a trait are homologous and have been exchanged between distantly related lineages.

Question 350

F21

Hvad er photosyntese?

Answer 350

Omdannelsen af lys energi til kemisk energi.

Kan enten være med eller uden ilt.
(anoxygenic/oxygenic)

Question 351

F21

Hvad udfører photosyntesen?

Answer 351

Phototropher

De fleste phototropher er også autotropher.

Question 352

F21

Er Cyanobakterier gram negative eller gram positive?

Answer 352

Gram negative

Question 353

F21

Hvad indeholder Cyanobakterier i deres cellevæg?

Answer 353

Peptidoglycan

Question 354

F21

Hvad fikserer Cyanobakterier, og hvordan generer de energi?

Answer 354

Cyanobakterier fikserer CO2 via Calvin cyklussen (dag), og generer energi via fermentering eller respiration (nat).

Mange Cyanobakterier fikserer N2 om natten.

Question 355

F21

Hvor finder nitrogen fikseringen sted?

Answer 355

Nitrogen fikseringen sker i Bakterier, findes i få Archaea, og ikke i Eukaryoter.

Question 356

F21

Hvad former Diazotrofer symbiotiske forhold med?

En diazotrof er en mikroorganisme, der er i stand til at vokse uden eksterne kilder til fikseret nitrogen.

Answer 356

Diazotrofer former symbiotiske forhold med planter, dyr og svampe.

Question 357

F21

Hvordan vokser denitrifikationer?

Answer 357

De vokser ved anerobisk respiration af uorganisk nitrogen (NO3-, NO2-) til gas produkterne NO, N2O og N2.

Question 358

F21

Hvor mange supergrouper er der af Eukaryoter?

Answer 358

5

Question 359

F23

Er E-coli prokaryot eller eukaryot?

Answer 359

Prokaryot

Question 360

F23

Er S. cerevisiae prokaryot eller eukaryot?

Det er en gær/svamp

Answer 360

Eukaryot

Question 361

F23

Er bade cyanobakterier og microalger prokaryoter?

Answer 361

Nej, cyanobakterier er prokaryoter rog mikroalger er eukaryoter.

Question 362

F23

Kan bakterier overføre DNA til svampe, alger og planter?

Answer 362

Ja, derfor er de meget anvendelige til “genetic engineering”.

Question 363

F23

Hvad er endogene gener, og hvad er heterologe gener?

Answer 363

Endogene gener stammer fra den pågældende organisme, hvor heterologe gener stammer fra en anden organisme, hvorefter de er blevet indsat I organismen.

Question 364

F23

Anvendes tilfældig mutagenese i metabolic engineering?

Tilfældig mutagenese er når fx stråling eller kemi skaber mutation og ændrer noget I microorganismen

Answer 364

Ja, det har været brugt til at få microorganismer til at producere fx madvare, vitaminer og antibiotika

Question 365

F23

Hvad er formålet med ”adaptive laboratory evolution (ALE)?

Answer 365

Det bruges til at dyrke mikroorganismer under bestemte forhold for at fremme mutationer som giver større chance for overlevelse

Question 366

F20

Hvordan ’konservere’*/omdanner alle celler energi?

*conserve energy

Answer 366

Ved at forbinde elektron flow til ATP syntese

Elektron flow består af redox reaktioner

Question 367

F20

Hvad er kataboliske reaktioner?

Answer 367

Nedbrydelse af molekyler, for at danne energi i metabolismen.

Question 368

F20

Hvad er anabolske reaktioner?

Answer 368

Opbyggelsen af molekyler, fx i forbindelse med vækst.

Question 369

F20

Hvad er navnet for organismer der omdanner energi i form af lys til kemisk energi?

Answer 369

Photothrops

Question 370

F20

Hvad er navnet for organismer der danner energi enten fra fermentation eller respiration?

Answer 370

Chemothrops

Question 371

F20

Hvad er fermentering, i tre træk?

Answer 371

• Har ingen ekstern elektron donor
• ATP er primært dannet ud fra substrate-level phosphorylation
• Der vil være et fermenteringsprodukt

Fermenteringsproduktet vil være en reduceret metabolit. En metabolit er et stof der indgår i stofskiftet.

Question 372

F20

Danner aerobisk eller anaerobisk respiration mest energi? Hvorfor?

Answer 372

Aerobisk respiration vil danne mest energi, da O2 / H2O er det mest elektropositive par.

Question 373

F20

Nævn 2 kendetegn ved respirationen.

Answer 373

• Har en ekstern elektron doner
• ATP dannes ud fra oxidativ fosfylering i elektron transport kæden, og er hermed forbundet til proton motive force.

Question 374

F20

Hvad kan autotropher?

Answer 374

Autotropher optager CO2 som kulstof kilde, og hermed byggestenen til celle materialet.

’Reduce CO2 to organic compounds’

Question 375

F20

Hvad beskriver Calvin cyklussen?

Calvin cyklussen sker for autotropher.

Answer 375

En ’pathway’ for CO2 fixering, benyttet af alle oxygenic phototrofer.

Question 376

F20

Beskriv kort Calvin cyklussen.

Calvin cyklussen sker for autotropher.

Answer 376

Hovedpointer,
* CO2 bliver fixeret
* CO2 omdannes til fructose-6-phosphate, der efterfølgende bruges til biosyntese
* Processen forbruger 12 NADPH og 18 ATP
* Enzymet RuBisCO er vigtigt, da det er enzymet der reducere CO2 til glyceraldehyde-3-phosphate

RiBisCO står for Ribulose bisphosphate carboxylase

Visualisering af cyklussen kan findes i F20 på slide 8

Question 377

F20

Hvordan fixere nogle autotropher CO2, udover Calvin cyklussen? Og hvilke fordele/ulemper er der ved denne metode?

Answer 377

’Reverse Citric Acid Cycle’ kan benyttes af autotropher til at fixere CO2.
Med denne metode dannes der mere effektiv energi, i form af glyceraldehyde 3-P.
Metoden kræver 24 hydrogener, og 10 ATP.

Se visualisering i F20 på slide 9.

Question 378

F20

Hvad er henholdsvis photoautotrofer og photoheterotrofer?

Answer 378

Photoautotrofer: Autotrofer der kan lave fotosyntese
Photoheterotrofer: Heterotrofer der kan lave fotosyntese.

Heterotrofer er stoffer der benytter organisk carbon, som carbon kilde.

Question 379

F20

Hvad er fotosyntesen?

Answer 379

Brugen af lys energi, til at drive biosyntese. Gennem lysreaktioner omdannes lys energi til kemisk energi.

Question 380

F20

Hvad er klorofyller?

Answer 380

Lys sensitivt pigment, som absorbere lys og igangsætter energi konverteringen.

Question 381

F20

Hvad er kloroplaster, og hvordan er det opbygget?

Kloroplast kaldes også for grønkorn.

Answer 381

Fotosyntesen sker i organellet kloroplast, hos eukaryoter. Det har et folde/ark membrane system kaldet ’thylakoids’, som ligger placeret således at kloroplast har to regioner.

Henholdsvis stoma og lumen, som gør proton motive force muligt.

Visualisering kan findes i F20 slide 15

Question 382

F20

Hvilket stof gør at phototrophe kan vokse ved lav lys intensitet, samt anoxygen forhold?

Answer 382

Klorofyl

Question 383

F20

Beskriv kort den anoxygen fotosyntese.

Answer 383

Fotosyntese apparat er fastlejret i membranen. Reaktionen der igangsætter elektrontransport kæden sker i reaktionscenteret for phototrofen. Elektroner bliver i membranen transporteret af proteiner og cytochromer.

Visualisering er i F20 slide 21.

Question 384

F20

Hvad er chemolithotrophs?

Answer 384

Microorganismer der bruger uorganiske elektron donere.

Eksempler på uorganisk stoffer er oxidation af svovl compounds, eller oxidationen af jern.

Question 385

F20

Hvordan bidrager chemolithotropher til nitrogenkredsløbet?

Answer 385

Nitrifikation, som er oxidationen af ammoniak til nitrat, med mellemproduktet nitrit.

Question 386

F20

Hvad påvirker om fermenteringen af mælkesyre vil være homofermentativ eller heterofermentativ? Og hvad er forskellen mellem de to fermenterings veje?

Answer 386

Hvis der er aldolase til stede, vil det være homofermentativ. Hvis aldolase mangler vil det være hetero.
Den hetero fermenteringsvej har flere steps, hvorved der dannes biprodukter. Derfor dannes der både mælkesyre, ethanol og CO2.
Den homofermentative vej danner kun 1 produkt i form af mælkesyre.

Aldolase er et enzym, som bruges i glykolysen.

Question 387

F20

Hvad er Entner-Doudoroff Pathway?

Answer 387

En variant af ’glycolitic’* pathway

*Glycolitic referer til behandling/nedbrydelse af et glukose molekyle, til noget der kan anvendes biokemisk.

Question 388

F20

Hvad er produkterne af ’mixed acid fermentations’?

Answer 388

En række syrer (eddike-, mælke- og ravsyre), samt nogle neutrale produkter som CO2, ethanol, H2.

Question 389

F20

Hvad er sekundær fermentering?

Answer 389

En fermentering, hvor udgangsstoffet er et fermenteringsprodukt.

En primær fermentering er, hvor organismer nedbryder og fermentere kulhydrater.

Question 390

F10

(Sandt eller falsk) Kan information overføres fra et protein til et andet protein eller nukleinsyre?

Answer 390

Nej

Question 391

F10

Forklar det centrale dogme

Answer 391

Det centrale dogme er det sted i alle celler, hvori der overføres genetisk information. Det medfører også større processer som proteinsyntesen.

Question 392

F10

Hvad er Messenger RNA’s (mRNA) funktion?

Answer 392

Enkeltstrenget molekyler, som overfører information fra DNA til ribosomer.

Question 393

F10

Hvad er Tranfer RNA’s (tRNA) funktion?

Answer 393

Hjælper med at omdanne genetisk information i RNA’et til aminosyrer i proteiner.

Question 394

F10

Hvad er Ribosomalt RNA’s (rRNA) funktion?

Answer 394

Hjælper med bevarelsen af ribosomer, og dermed at celler har nok ribosomer i cellen.

Question 395

F10

Forklar proteinsyntesen/biologisk flow.

Answer 395

1. Replikation: Dobbeltstrenget DNA alpha-helix-struktur bliver duplikeret. Katalyseres af DNA polymerase.
2. Transkription: DNA-information bliver lagret til RNA. Katalyseres af RNA polymerase.
3. Translation: RNA-information bliver overført til aminosyrer, som danner en polypeptid.

NB! Tænk alfabetisk rækkefølgende

Question 396

F10

Hvad koder gener for?

Answer 396

Proteiner

Question 397

F10

Hvorfor er DNA statisk, hvorimod mRNA og proteiner er dynamiske i det genetiske flow/proteinsyntesen.

Answer 397

DNA er statisk, da den ikke skal ændres.
mRNA er dynamisk, da dens genetiske sekvens kan variere.
Proteiner er dynamiske, da de udfører et aktivt arbejde.

Question 398

F10

Hvad er backbonens funktion, og hvordan er den opbygget?

Answer 398

Den består af phosphat og pentonse. Den funktion er at beskytte baseparene, og derfor sker baseparene inde for backbonene.

Question 399

F10

Hvorfor indeholder backbonene er minor og major grove?

Answer 399

Da deres afstand fra hinanden varierer.

Question 400

F10

Forklar supercoiling

Answer 400

Bakteriers metode for at tilpasse deres DNA, som de gør ved at gøre det mere kompakt.

Question 401

F10

Nævn plasmiders egenskaber.

Answer 401

Normalt dobbelstrenget
Cirkulært DNA
Indeholder kun ikke væsentlige gener

Question 402

F10

Nævn de fire forskellige plasmidtyper

Answer 402

Resistente plasmider
Bærer gener, der giver bakterier resistens over for antibiotika.

Plasmider der koder for virulente faktorer
Gør bakteriet mere patogent.

Plasmider der koder for bakteriociner
Bærer gener, der koder for bakteriociner, som er proteiner, der kan dræbe eller hæmme væksten af nært beslægtede bakteriestammer.

Modificerede plasmider

Question 403

F10

Hvad er en semikonservativ proces?

Answer 403

Semikonservativ replikation er den proces, hvorunder DNA kopieres, således hver ny DNA-dobbelthelix indeholder én original (gammel) streng og én nysyntetiseret (ny) streng.

Question 404

F10

Hvad er en primers funktion?

Answer 404

En primers funktion er at give et startpunkt for DNA-syntese.

Question 405

F10

Hvad er primase?

Answer 405

Primase er det enzym der sætter en RNA-primer på en DNA-streng.

Question 406

F10

Hvad er DNA-helikases funktion?

Answer 406

Adskiller de to strenge i DNA-dobbelthelixen ved at bryde hydrogenbindingerne mellem nukleotiderne.

Question 407

F10

Hvad er DNA replikation fork?

Answer 407

Et Y-formet sted, hvor DNA-double-helixen splittes i to, hvorefter de nye strenge kopieres.

Question 408

F10

Hvad er Okazaki fragmenter?

Answer 408

Okazaki-fragmenter er korte DNA-fragmenter, der dannes på lagging strand under DNA-replikation.

Question 409

F10

Hvad er forskellen på DNA polymerase I og III?

Answer 409

DNA polymerase I
Udskærer RNA-primeren og udfylder hullerne

DNA polymerase III
DNA-polymerase III er hovedansvarlig for syntesen af nye DNA-strenge under replikation.

Question 410

F10

Hvad forskellen på endo og exo?

Answer 410

“Endo” refererer til aktivitet inde i et molekyle, mens “exo” refererer til aktivitet uden for molekylet.

Question 411

F10

Hvad er DNA ligase?

Answer 411

DNA-ligase er et enzym, der reparerer brudte fosfodiesterbindinger i DNA ved at binde DNA-nukleotider sammen.

Question 412

F10

Hvad er DNA gyrase?

Answer 412

DNA-gyrase er et enzym, der supercoiler DNA’et under replikation og er et mål for visse antibiotika.

Question 413

F10

Hvad er tau?

Answer 413

Tau-proteinet er som en “lim” i hjernen, der holder tingene sammen. Det hjælper med at opretholde strukturen i nerveceller og hjælper med at transportere stoffer rundt i cellerne.

Question 414

F10

Hvad er replisomet?

Answer 414

Replisomet er en kompleks molekylær maskine, der udfører replikation af DNA.

Question 415

F17

Hvad er PCR (polymerase chain reaction)?

Answer 415

Isolere kopier af specifikke rene gener.

Question 416

F17

Hvordan foregår PCR?

Answer 416

Processen indebærer tre trin: Denaturering, hvor DNA opvarmes for at bryde hydrogenbindinger og adskille det i to enkelttråde; Annealing, hvor primere binder sig til de specifikke DNA-sekvenser, der skal kopieres; og Forlængelse, hvor DNA-polymerase bygger nye DNA-tråde ved at tilføje nukleotider baseret på de eksisterende tråde.

Question 417

F17

Hvad er introns?

Answer 417

Introner er ikke-kodende DNA-sekvenser, der fjernes under splicing af mRNA.

Question 418

F17

Hvad er transkriptase?

Answer 418

Transkriptase er et enzym, der katalyserer syntesen af RNA fra en DNA-skabelon under transkription.

Question 419

F17

Hvordan foregår reverse transkription PCR?

Answer 419

Reverse transcription PCR (RT-PCR) bruger enzymer som reverse transkriptase til at omdanne RNA til komplementært DNA (cDNA). Derefter bruges PCR til at amplificere dette cDNA. Resultatet er en forstærkning af RNA-sekvenser, hvilket gør det muligt at analysere dem.

Question 420

F17

Hvordan kan DNA-molekyler adskilles i agarose gel?

Answer 420

Under udførelse af elektroforese.

Question 421

F17

Hvordan fungerer elektroforese?

Answer 421

Elektroforese adskiller DNA, RNA eller proteiner baseret på størrelse og ladning ved at anvende elektrisk strøm til at bevæge dem gennem en gel. De mindre molekyler bevæger sig hurtigere og opdages tidligere, mens større molekyler bevæger sig langsommere.

Question 422

F17

Hvad er restriktionsenzymer?

Answer 422

Restriktionsenzymer er proteiner, der skærer DNA på specifikke sekvenser og muliggør genetisk manipulation og DNA-analyse.

Question 423

F17

Hvad er sticky ends?

Answer 423

Sticky ends er ujævne ender af et DNA-fragment, der dannes efter skæring med restriktionsenzymer og har en overhængende sekvens, der kan danne hydrogenbindinger med en komplementær sekvens.

Question 424

F17

Hvad er blunt ends?

Answer 424

Blunt ends er lige ender af et DNA-fragment, der dannes efter skæring med restriktionsenzymer og mangler overhængende sekvenser.

Question 425

F17

Hvad er methylaser?

Answer 425

Et enzym, som sætter methylgrupper på genkendte basepar.

Question 426

F17

Hvordan foregår molekylær kloning/gen kloning?

Answer 426

1. Klip DNA med restriktionsenzym.
2. Tilføj vektor klippet med samme restriktionsenzym.
3. Tilføj DNA-ligase for at danne rekombinante molekyler.
4. Indfør rekombinant vektor i en værtsorganisme.

Question 427

F17

Hvad er en vektor?

Answer 427

En vektor er et DNA-molekyle, der bruges til at transportere fremmed DNA ind i en værtsorganisme.

Question 428

F17

Hvad er Multiple cloning site (MCS)?

Answer 428

MCS er en specifik DNA-sekvens i en vektor, der indeholder flere restriktionsenzym-snitsteder, hvilket muliggør indsættelse af fremmed DNA.

Question 429

F17

Hvad er complementary DNA (cDNA)?

Answer 429

cDNA er en DNA-kopi af en mRNA-sekvens, syntetiseret ved hjælp af enzymet reverse transkriptase.

Question 430

F17

Hvad agarose gel og hvad bruges det til?

Answer 430

Agarosegel er en gel lavet af agarose, der bruges til elektroforese til at adskille DNA eller RNA efter størrelse.

Question 431

F13

Regulering af Chemotaxis – E. Coli

Answer 431

1. Respons til signal, via sensoriske proteiner (MCPs)
2. Kontrol af flagellar rotation via. CheY protein
3. Adapterer ved at genstarter sig sel

CheY = rotation mod uret
CheY-P= rotation med uret

Question 432

F13

Hvad er operoner?

Answer 432

Operoner er en sammensætning af gener, der arbejder sammen som en enkel enhed. Det er operoner der kan producere mRNA, gennem transkription.

Question 433

F13

Hvad hedder processen, hvorved mRNA bliver til proteiner?

Answer 433

Translation

Question 434

F13

Hvad er “regulons”?

Answer 434

Regulons er en sammensætning af både gener og operoner.

De kontrolleres at et regulerende protein. Slide 4.

Question 435

F13

Hvad gør globale kontrol systemer?

Answer 435

De regulerer udtryk for forskellige gener samtidige, som findes i flere “regulons”.

Kan bestå af regulerende RNA, signal molekyler, aktivatorer. Slide 5.

Question 436

F13

Hvad er “lac” operon?

Answer 436

Et sæt af gener, der er involveret i lactoses metabolisme i bakterier.

Question 437

F13

Hvad er lac operons rolle?

Answer 437

Sikre effektiv lactose udnyttelse, nå gluykose er mangelfuld.

Question 438

F13

Hvilket sukkerstof forbruges først?

Answer 438

Glukose

Question 439

F13

Hvad er katabolit repression?

Answer 439

En aktiverings form, hvor transkriptionen er kontrolleret af et aktivaterings protein.

Question 440

F13

Hvad er et eksempel på et aktiveringsprotein?

Answer 440

Cyclic AMP receptor protein (CRP)

Den aktiveres ved bindning med cyklisk AMP (cAMP)

Question 441

F13

Hvornår forøges cAMP?

Answer 441

Når glukose formindskes. Det aktiverer lac opersons.

Slide 10 F13

Question 442

F13

Hvornår er cAMP lav?

Answer 442

Når glukose er høj, hvilket betyder at CRP er inaktiv og der ingen transskription af lac operons forgår.

Question 443

F13

Hvad spiller fosfor (Pho) en stor rolle?

Answer 443

DNA, RNA, membran syntese, energi generation, celle signalering.

Question 444

F13

Hvilke komponenter består fosfor regulonet af?

Answer 444

• PhoR = membran bundet histidin kinase sensor protein
• PhoP=cytoplasmisk transkriptions regulator.

Slide. 13 F13

Question 445

F13

Hvad er fosfor regulon?

Answer 445

Et globalt kontrol system som er baseret på 2 komponenter, og som kan sanse ekstracellulære niveauer af fosfat.

Question 446

F13

Hvad betyder ncRNA?

Answer 446

Non-coding RNA

Question 447

F13

Hvad er ncRNA?

Answer 447

RNA molekyler der ikke er oversat til proteiner.

Question 448

F13

Hvad er sRNA?

Answer 448

Small-RNA som interagerer med mRNA eller proteiner for at regulære gene udtrykket. Betyder at bakterierne kan adapterer til ændringer i omgivelserne.

Question 449

F13

Hvad er ”riboswitches”?

Answer 449

En sekundær struktur i et mRNA molekyle, som kan binde molekyler til at kontrollere transkription eller translation af mRNA. De kan lave ændringer på produktionen af proteiner, kodet af mRNA.

Slide 20 F13

Question 450

F13

Hvor på mRNA findes ”riboswitches”?

Answer 450

Ved 5’ enden af u-oversat mRNA.

5’-UTR

Question 451

F13

Hvad er ”attenuation”?

Answer 451

Opstår ved terminering af mRNA syntese, som en slags transkriptionel kontrol.

Slide 24 F13

Question 452

F13

Hvordan forløber ”attentuation”?

Answer 452

Første del af mRNA som laves, kan deles i to forskellige sekundære strukture. Den ene tillader syntese af mRNA og den anden forårsager terminering.

Slide 254

Question 453

F13

Hvad er enzym regulering?

Answer 453

Sikrer at celler kan adapterer til forandrende miljøer og udnytte enzymet ordentligt.

Question 454

F13

Hvad beskriver hæmning af feedback?

Answer 454

En midlertidig slukning af reaktions biosyntetisk vej. Opstår da slut produktet binder sig til det første enzym i ”pathway”, som hæmmer aktiviteten.

Question 455

F13

Typer af ”post-translational” regulering?

Answer 455

Phosphorylation og methylation

Question 456

F19

Hvad var den første selv replikerende system?

Answer 456

Det var RNA baserede.

Question 457

F19

Egenskaber af RNA

Answer 457

RNA kan opbevare information, binde mindre molekyler, have katalystisk ektivitet (kan katalyserer sin egen syntese).

Question 458

F19

Hvor gammelt er det første mikrobielle bevis?

Answer 458

3,86 milliarder år gammelt

Question 459

F19

Hvor gammel er jorden?

Answer 459

4,5 milliarder rår gammelt

Question 460

F19

Hvad står LUCA for?

Answer 460

Last universal common ancestor

Question 461

F19

Hvornår eksisterede LUCA?

Answer 461

Mellem 3,8-3,7 milliarder år siden.

Question 462

F19

Hvorfor var primitive celler anaerobe?

Answer 462

Jorden havde ingen oxygen

Question 463

F19

Hvordan begyndte der at opstå oxygen på jorden?

Answer 463

Cyanobakterier begyndte at udvikle et fotosystem, som kunne bruge H2O i stedet for H2S og herved producerede oxygen.

Oxygen forblev ikke i atmosfæren, da den blev optaget af reduceret materialer i havet (FeS)

Question 464

F19

Hvornår startede ”the Great Oxidation Event”?

Answer 464

For 2,4 milliarder år siden.

Question 465

F19

Hvordan blev mængden af UV formindsket?

Answer 465

Da der opstod mere dioxygen i atmosfæren efter GOE, kunne dioxygen reagerer emd UV og danne ozon.

Question 466

F19

Hvilken rolle har ozon laget?

Answer 466

Beskytter jorden fra UV stråling.

Question 467

F19

Hvad er det universelle livs træ baseret på?

Answer 467

Nucleotide sekvensers lighed i rRNA.

Question 468

F19

Hvad beskriver det universelle livs træ?

Answer 468

3 domæner af liv: bakterier, archaea, og eukarya.

Question 469

F19

Hvad står LECA for?

Answer 469

Last eukaryotic common ancestor

Question 470

F19

Hvilke to hypoteser er der, til oprindelsen af eukaryotiske celler?

Answer 470

1. Serial endosymbiosis hypotese
2. Symbiogenesis hypotese

1=eukaryoter begyndte som en nukleus med en afstammning der senere forårsagede mitokondrier og kloroplaster.
2= eukaryoter com fra intracellulære imellem dioxygen optagende bakterier, som førte til mitoondrier.
Slide. 21 F19

Question 471

F19

Hvad er mutationer?

Answer 471

Tilfældige ændringer på DNA sekvenser over tid.

Question 472

F19

På hvilke måder kan mutationer opstå?

Answer 472

Substitutioner, sletninger, indsættelser, eller duplikationer.

Question 473

F19

Hvad er rekombinationer?

Answer 473

En process der ødelægger og genforeninger DNA segmenter, til at lave en ny kombi. Af genetisk materiale.

Question 474

F19

På hvilke måder kan rekombinationer beskrives?

Answer 474

Homologous: ens sekvenser
Nonhomologous: lille lighed.

Slide 25 F19

Question 475

F19

”Deleterious” mutationers

Answer 475

Har en negativ påvirkning på fitness som resulterer i at blive fjernet gennem naturlig selektion.

Question 476

F19

”Beneficial” mutationer

Answer 476

Har en positiv påvirkning på fitness. Resulterer i at være favourable.

Question 477

F19

Hvad betyder ”phenotype”?

Answer 477

Beskriver en microorganismens morfologiske, metaboliske, fysiologiske og kemiske egenskaber

Question 478

F19

Hvad er phylogeny?

Answer 478

Den evolutionære historie af en gruppe organismer.

Question 479

F19

Hvad er phylogenetiske træer?

Answer 479

Diagramer der beskriver den evolutionære historier. Indeholder noder og grene.

Question 480

F19

Hvad vil det sige, at gene sekvenser er ortholog?

Answer 480

Sekvenser har samme funktion og stammer fra et enkelt gene i en ”common ancestor”.

Question 481

F19

Hvad vil det sige at gene sekvenser er paralog?

Answer 481

Sekvenser har udviklet sig til at have forskellige funktioner, som resultat fra gene duplikation.

Question 482

F19

Hvad er mikrobiel systematikker?

Answer 482

Måden hvorpå microorganismer klassificeres. Beskriver egenskaber.

Slide 40 F19

Question 483

F19

Hvad er en art?

Answer 483

Et set af organismer, som kan få et fertilt afkom

F.eks. er heste og æsler ikke samme art, da de ikke kan få et fertilt afkom (muldyr).

Question 484

F19

Er det rigtigt, at DNA sekvenser for protein kodende gener, akkumulerer mutationer hurtgierer end rRNA gener?

Answer 484

Ja

Question 485

F19

Hvad er “multilocus sequence analyses” (MLSA)?

Answer 485

En metode hvor adskillelige husholdende gener fra en organisme er sekventeret.

Sekventeret: fastlæggelse af komponenter i et molekyle.
Slide 45 F19

Question 486

F22

Nævn nogle produkter biobricks bliver brugt til at lave i den industrielle sektor.

Answer 486

• Enzymer
• Plastik
• Food additives
• Tekstiler
• Bioenergi

Question 487

F22

Nævn nogle produkter biobricks bliver brugt til at lave i medicinsektoren.

Answer 487

• Antibiotika
• Vacciner
• Therapeutics

Question 488

F22

Hvilket term bruges i biosynthetics, når der bruges biobricks?

HINT: Engelsk term

Answer 488

Genetic engineering.

Question 489

F22

Hvor mange baser er der behov for til en fast-fase syntese af syntetisk DNA?

Baser som A, T, C og G.

Answer 489

30-40 baser.

Question 490

F22

I coronatiden blev PCR tests brugt til at på- eller modvise infektion med virussen. Hvad står PCR for?

Answer 490

Polymerase Chain Reaction.

Question 491

F22

Bruges “reverse transcriptase” til at lave cDNA eller mRNA?

Answer 491

cDNA.

Man bruger mRNA til at lave cDNA ved “reverse transcriptase”

Question 492

F22

Når man separere DNA molekylder i agarose gel, hvilken metode bruger man da?

Answer 492

Electrophoresis (elektroforese)

Question 493

F22

Hvad kaldes oligonuckleotider med fluoriscerende prober?

Answer 493

FISH: Fluorescent In Stitu Hybridization.

Question 494

F22

Hvad er endonukleaser?

De fleste af dem er homodimers. Deres funktion er at kløve.

Answer 494

Restriktions enzymer

Question 495

F22

Nævn nogle vigtige egenskaber plasmid klonings vektorer har.

Answer 495

• Små i størrelsen
• Nemme at manipulere
• Har hver deres egne oprindelige replikationssteder
• Den store mængde kopier, sørger for højt udbytte af hvert plasmid.
• Antibiotika resistante gener, gør valget af transformerede celler nemt.
• Konjugations transfer er fjernet.

Se evt. Chapter 12 ved udfordringer.

Question 496

F22

Hvad er en vektor i gen kloning?

Answer 496

Den del af et plasmid, der ikke er det klonede DNA.

Question 497

F22

Nævn en af de to mest brugte værter for molekylær kloning.

Hvis du kan, må du gerne nævne begge.

Answer 497

• Escherichia coli (E. Coli)
• Bacillus subtillis (høbakterie)