biochemie

Question 1

Isocitraat dehydrogenas?

Answer 1

Maakt onderdeel uit van de citroenzuurcyclus

Question 2

Wat is de rol van citroenzuur?

Answer 2

Centrale metabole pathway

Question 3

Wat is metabolisme?

Answer 3

Omzetting van:
1. brandstof naar energie en bouwstenen (katabolisme)
en/of
2. Energie en bouwstenen naar verschillende moleculen waaruit een cel is opgebouwd (anabolisme)

Question 4

Wat gebeurt er met suiker als het in onze lichaamscellen komt, wanneer deze cellen energie nodig hebben?

Answer 4

• Glycolyse in cytosol
• Omzetting van pyruvaat naar acetyl-CoA in de mitochondriën
• Citroenzuurcylus in de mitochondriën
• Ademhalingsketen en oxiddatieve fosforylatie in het binnen membraan van de mitochondriën
  (bij bacteriën gebeurd dit in het cytosol en in het plasmamembraan)

Question 5

Volledige omzetting va glucose –>

Answer 5

Splitsen van glucose –> 2 pyruvaat + enrgie
Glucose + 2ADP + 2Pi + 2 NAD+ –> 2 pyruvaat + 2 ATP + 2 NADH + 2 H2O + 2H+

Question 6

Investeringsfase?

Answer 6

op 2 plekken gaat er ATP in

Question 7

Pay-off fase

Answer 7

Er wordt op 2 plekken ATP gevormd en 2 NADH

Question 8

Hoeveel energie kost de de voorbereidingsfase?

Answer 8

2 ATP

Question 9

Wat doet het enzym kinase?

Answer 9

Enzym draagt fosfaatgroep over aan ATP naar ander molecuul

Question 10

Wat doet het enzym dehydrogenase?

Answer 10

Behoort tot de oxidoreductases: katalyseert oxidatieve reacties (NADH/FADH2 vorming, overdracht elektronen)

Question 11

Wat doet het enzym isomerase?

Answer 11

katalyseren van isomeraties (mutase verplaatst fosfaatgroepen)

Question 12

Wat doet het enzym enolases?

Answer 12

Enzym uit de lyase-klasse (splits C-O binding)

Question 13

Verschil kinase en fosfatase?

Answer 13

Fosfatase is nodig om de omgekeerde reactie van een kinase te doen

Question 14

Wat is pyruvaat shuttle?

Answer 14

Transport van het cytoplasma naar de mitochondriële matrix (kost 1 ATP) Acetyl-CoA wordt gevormd.

2pyruvaat + 2CoA + 2NAD+ –>
2Acetyl-CoA + 2CO2 + 2NADH + 2H+

Question 15

Het omzetten van pyruvaat naar Acetyl-CoA

Answer 15

*wordt gekatalyseerd door het pyruvaat dehydrogenase complex
- 5 co-enzymen nodig
- TPP, lipollysine en FAD zijn prosthetische groepen, die moeten wel binden aan het enzym en zitten er vast, maar met de stof gebeurd er zelf verder niks
- NAD+ en CoA-SH zijn co-substraten, want daar verandert niets

Question 16

Co-enzymen zijn?

Answer 16

niet-eiwit moleculen die bijdragen aan de functie van een enzym
- Als ze voortdurend aan het enzym gebonden zijn worden ze soms prosthetische groepen genoemd.

Question 17

Zijn Co-enzymen een permanent onderdeel van de structuur van een enzym?

Answer 17

Nee, ze binden, vervullen een functie en laten weer los.
De functie van CoA is het accepteren en dragen van acetyl-groepen

Question 18

Kan Acetyl-CoA de citroenzuurcyclus in?

Answer 18

Ja, in de citroenzuurcyclus wordt geen zuurstof gebruikt

Question 19

Hoe ziet de vergelijkingsreactie van de citroenzuurcyclus er uit?

Answer 19

2Acetyl-CoA + 6NAD+ + 2FAD + 2GDP + 2Pi + 4H20 –> 4CO2 + 6NADH + 6H+ + 2FADH2 + 2GTP + 2CoA

Question 20

waarom wordt FADH2 gebruikt?

Answer 20

Omdat deze minder energie oplevert
6 CO2 komt uiteindelijk vrij uit de citroenzuurcyclus

Question 21

Waar is de citroenzuurcyclus afhankelijk van?

Answer 21

De citroenzuurcyclus is afhankelijk van cofactoren zoals NAD+
Er is steeds aanvoer van acetyl-CoA waardoor de reactie telkens dezelfde kant op loopt

Question 22

Wat is fosforylering

Answer 22

Fosforylering van een eiwit is het plaatsen van een fosfaatgroep op een van de reactieve hydroxylgroepen (OH) van de samenstellende aminozuren (tyrosine, threonine en serine) van dat eiwit. De fosfaatgroep die wordt geplaatst op een reactieve hydroxylgroep, bijvoorbeeld ADP (adenosinedifosfaat), heeft de naam anorganisch fosfaat gekregen: Pi. Zodra deze anorganische fosfaatgroep wordt gekoppeld aan het ADP-molecuul, ontstaat er ATP: adenosinetrifosfaat.

Question 23

Waar bestaat fosforylering uit?

Answer 23

Fosforylering bestaat uit in totaal vier eiwitcomplexen. Die de elektronen aan elkaar overdragen. NADH met de 2 elektronen geeft een elektron af aan het eerste complex, daar is een Q (ubiquinone) bij betrokken. Die elektronen gaan door het complex heen en het ubiquinon kan dat vervolgens transporteren van het eerste complex naar het tweede complex. Dit gebeurt in het binnen membraan van de mitochondriën.

Question 24

elektronenstroom in de ademhalingsketin

Answer 24

• elektronen worden getransporteerd van de ene elektron acceptor naar de volgende, elke sterker dan de vorige (NADH – ubiquinone – cytochroom C – zuurstof)
• Vrijgekomen energie wordt gebruikt om protonen van de matrix naar de intermembrane space te pompen.b