Bactériophages Flashcards

1
Q

Quel type de phages tue la bactérie après l’infection?

A

Phage virulent

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2
Q

Comme se nomme une bactérie dans laquelle le phage a intégré son génome?

A

Bactérie lysogène

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3
Q

Comment se nomme un phage qui ne tue pas la bactérie mais intègre son génome au génome bactérien?

A

Phage tempéré

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4
Q

_____________ est un phage filamenteux

A

M13 est un phage filamenteux

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5
Q

Quel phage fait des plage de lyse avec zone trouble, et qu’est-ce que ça veut dire?

A

Lambda

Veut dire que certaine bactéries ne sont pas lysées, mais lysogènes, phage tempéré.

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6
Q

Quel phage ne lyse pas les cellules mais ralenti leur croissance? (pas de plage de lyse)

A

M13

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7
Q

Lors de l’infection de E.coli par le phage T4, quelle affirmation est fausse?
A) L’arrivée est l’interaction faible entre les fibres de la queue et le LPS
B) L’attachement est une forte interaction entre fibre courtes et protéines membranaires, irréversible
C) Lors de la contraction, le tube de la queue transperce le petidoglycane et la membrane externe
D) Lors de la contraction, le tube de la queue contracte pour percer à l’aide de la gaine

A

D) Lors de la contraction, le tube de la queue contracte pour percer à l’aide de la gaine

Faux, c’est la gaine qui contracte pour faire pénétrer le tube.

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8
Q

Quel phage infecte E.coli et a un ADN linéaire et bicaténaire?

A

Phage T4

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9
Q

Quelle protéine aide l’ADN à passer la membrane plasmique dans l’infection de E.coli par T4?

A

Protéine pilote

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10
Q

Quelles sont les 4 étapes du début de l’infection du phage T4? (Jusqu’à l’entrée de l’ADN phagique dans la cellules)

A

Arrivée
Attachement/fixation
Contraction de la gaine et pénétration du tube
Entrée de l’ADN

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11
Q

Quelle affirmation est vraie concernant la réplication du phage M13:
A) il s’agit d’un phage bicaténaire
B) Une protéine agit comme amorce
C) La forme réplicative est quand il y a un brin + et un brin-
D) L’ARNpolIII forme le brin positif
E) le brin négatif est le brin initial monocaténaire

A

C) La forme réplicative est quand il y a un brin + et un brin-

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12
Q

Quelle affirmation est vraie concernant la réplication du phage M13:
A) Il s’agit d’une réplication à cercle roulant à l’aide d’une enzyme bactérienne qui coupe le brin positif
B) Il s’agit d’une réplication à cercle roulant à l’aide d’une endonucléase produite à partir du gène II qui coupe le brin positif
C) L’endonucléase se lie au brin 5’ du brin négatif après le clivage

A

B) Il s’agit d’une réplication à cercle roulant à l’aide d’une endonucléase produite à partir du gène II qui coupe le brin positif

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13
Q

Comment le phage M13 s’introduit-il?

A

Via le pilus F

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14
Q

Par quelle protéine est initiée la réplication chez M13?

Et chez PhiX174?

A
  • Endonucléase produite du gène II

- Protéine A

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15
Q

Quel phage utilise une ADNpol phagique pour sa réplication?

A

Phi29

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16
Q

Quel phage utilise la recombinaison pour terminer sa réplication?

A

T4

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17
Q

Quel phage utilise la combinaison de plusieurs ADN bicaténaire en concatémères?

18
Q

Quel phage encapsule plus que le génome minimal?

19
Q

Quel phage forme une bobépine lors de la réplication puis une circularisation?

20
Q

Quel type de réplication utilise le phage Lambda? Laquelle se passe en premier?

A

Thêta et cercle roulant

Thêta, car cercle roulant inhibé par RecBC

21
Q

Quelles protéines sont impliquées dans le cercle roulant pour Lambda?

A

Protéines phagique Gam (inhibe RecBC) et endonucléase phagique initie.

22
Q

Quelles protéines sont impliquées dans thêta pour Lambda?

A

Protéines phagiques O et P

23
Q

Quelle-est la particularité de l’ADN linéaire de Lambda?

A

Il a des extrémités cos complémentaires et se circularise à son entrée dans la cellule pour se répliquer

24
Q

Quels-sont les 2 types de transduction?

A

Généralisée et restreinte

25
Q

Quel type de transduction n’a que de l’ADN bactérien? (erreur d’encapsidation)

A

Généralisée

26
Q

Quels-sont les 4 exemples de prévention d’absorbtion du phage par blocage des récepteurs?

A
  1. Mutation LamB- enlève le site d’attachement de Lambda
  2. Protéine A pour masquer récepteur de S.Aureus
  3. Protéine Llp pour masquer FhuA de E.coli (attachement de T1, T5 et phi80)
  4. Protéine Trat pour masquer OmpA chez E.coli (attachement de T2,T4)
27
Q

Comment les phages peuvent-ils contourner un blocage des sites d’attachement?

A

Mutation des protéines de la queue pour reconnaitre une autre protéine.

28
Q

Comment les phages peuvent-ils contourner la production d’une matrice?

A

Enzymes dégradant le EPS, polysaccharide lyase ou polysaccharide hydrolase

29
Q

Quels-sont les deux bactéries vues qui produisent une matrice et qu’est-ce qu’elle produisent?

A

Pseudomonas et Acetobacter, produisent alginate pour former biofilm

30
Q

Comment les phages contournent la production d’alginate chez Pseudomonas?

A

Phage F116 et PhiGH4 produisent une alginate lyase

31
Q

Comment entre l’ADN du plage T4 dans la bactérie?

A

Il dégrade le petidoglycane puis une protéine membranaire aide à la translocation de l’ADN phagique vers le cytoplasme.

32
Q

Quelles protéines sont produites par le phage T4 pour bloquer l’entrée d’autre ADN pHagique?

A

Imm et Sp bloquent la translocation

33
Q

Comment le phage T4 se protège-t-il de l’enzyme de restriction?

A

En modifiant son génome avec hydroxyméthylcytosine

34
Q

Quelle-est la réponse possible des bactéries au génome modifié du phage pour éviter le clivage?

A

McrABC et Mrr de E.coli ou DpnI de S.pneumoniae reconnait l’ADN modifié

35
Q

Quels type d’intron retrouve-t-on chez le Phage T4, cyanobactéries proteobactéries?

A

Intron du groupe 1

36
Q

Quels type d’intron retrouve-t-on chez E.coli, Calothrix spp Azotobacter vinelandii

A

Intron groupe 2

37
Q

D’où viennent les intéines?

A

De l’épissage d’un précurseur d’une protéine, donne une protéine mature et une intéine

38
Q

Qu’est-ce qu’un Rétron?

A

Molécule hybride ADN-ARN codant pour une transcriptase inverse, ayant un rôle potentiel dans la pathogénicité

39
Q

Quelle-est la molécule formée par un Rétron?

40
Q

Est-ce que les extéines ont des séquences conservées ou sont similiaires?

A

Non, ça peut être n’importe quelle protéine.

41
Q

Quelles-sont les séquences conservées chez les intéines?

A

His-Asn après aa hydrophobes au C-terminal

séquence codant pour homing nucléases comme introns groupe 1

42
Q

Vrai ou faux, les intéines peuvent catalyser leur mobilité comme les introns?