Bactéries domaine bacteria Flashcards
Quelles sont les caractéristiques générales de la classe actinobacteria?
- G+C > 50%
- depuis 1997, différences ARN 16S
- bactéries filamenteuses
- Gram +
Nommez les propriétés de Corynebacterium diphteriae
- Bacille de Loffler-Klebs 1884
- cause la diphtérie (maladie respiratoire)
- fait une toxine codée par un prophage (Yersin et Roux en 1880)
- traitement par antitoxine
- vaccination jeune
Nommez les propriétés du genre Mycobacterium
- coloré avec coloration alcoolo-acido résistance (seule) (coloration Gram marche pas, Gram mixte)
- croissance lente (bactérie inactive, + long antibio qui fct sur actives)
Nommez les propriétés de M. tuberculosis
- bacille de koch 1882
- cause la tuberculose (infection respiratoire contagieuse)
- traitement: vaccin BCG dérivé de M bovis = élimination maladie
- traitement avant: sanatoriums. repose-toi
Nommez les propriétés de M. leprae
- bacille de hansen 1893
2. cause la lèpre => tatou animal
Nommez les propriétés de M. bovis BCG
- bacille calmette-guérin
2. souche de tuberculose bovine atténue 13 ans (anticorps antigénicité croisée) comme variole. anticorps se ressemblent
Nommez les propriétés du genre Frankia
- bactérie fixe l’N (15% Terre)
2. fait de la symbiose avec plantes +/+
Nommez les propriétés de F. alni
- isolé aulne Tadoussac
2. reboisement sols pauvres
Nommez les propriétés du genre Propionibacterium
- commensalisme peau +/0 non pathogène
- H proprionique
- acné
Nommez les propriétés du genre Saccharopolyspora erythraea
- producteur érythromycine, antibio clinique
Nommez les propriétés du genre Streptomyces
- production d’antibiotiques et d’enzymes commercialement pour la dégradation de polymères (cellulose, xylane (papier blanchi), chitine)
- S. coelicolor = modèle comme E.coli
- cycle de reprod par différenciation:
exospores-milieu pauvre => germes - milieu riche => mycélium basal-filaments sol nutriments => mycélium aérien- cannibalisatinon jus cellulaire => exospores
Nommez les propriétés du genre Bifidobacterium
- lactose => acide lactique et acétique (fromage, yogourt)
2. anaérobies
Nommez les propriétés de B. bifidum
- tube digestif des beubés lait maternel
Nommez les propriétés du genre Bacteroides
- anaérobies obligatoires
2. intestins
Nommez les propriétés de B. fragilis
- bactérie ++ tube digestif
2. pathogène opportuniste appendicites et péritonites
Nommez les propriétés du genre Chlamydiae
- parasites intracellulaires
- pas synthèse propre ATP
- cycle de croissance unique
corps élémentaire - extracellulaire inactif spore => corps initial - actif . quand trop cell ça pète la memb, va réinfecter d’autres cell.
Nommez les propriétés de l’espèce C. trachomatis
- cause la blennorrhée
Nommez les propriétés du genre Cyanobacteria
- algues bleues/eaux polluées
- bactéries photosynthétiques
- N => ammoniaque
- synthèse neurotoxines
Nommez les propriétés du genre Spirulina
- non comestible => toxine
2. ressemble à Arthrospira
Nommez les propriétés du genreArthrospira
- comestible => pas toxine
2. ressemble à Spirulina
Nommez les propriétés du genre Prochlorococcus
- cyanobactérie marine
- petit org. photosynthétique sur terre
- abondant org. photosynthétique sur Terre
Nommez les propriétés du genre Thermus
- bactérie thermophile
Nommez les propriétés de l’espèce T. aquaticus
- ADN pol. => Rx PCR (TaQ) => prend
Nommez les propriétés du genre Bacillus faisant partie du phylum Firmicutes
- Gram +
- endospores
- aérobies ou anaérobies facultatifs
- saprophytes (vit sur matières en décomposition)
Nommez les propriétés de l’espèce B. cereus
- partout dans le sol
- 2 toxines => empoisonnement alimentaire
- endospores, donc résistent à la chaleur (aliments cuits)
Nommez les propriétés de B. anthracis:
- cause le charbon (niveau 3)
- 2 formes: externe (lésions cutanées) et pulmonaire (grave)
- rare dans les pays riches
Nommez les propriétés de B. thuringiensis
- cristal protéique servant à la lutte biologique vs les insectes comme la tordeuse des bourgeons
Nommez les propriétés du genre Staphylococcus
- parasites de la peau, des muqueuses de l’homme et des animaux à sang chaud
Nommez les propriétés de S. aureus
- infections posts-op (abcès)
- empoisonnement alimentaire (entérotoxine résistante à la chaleur)
- syndrome du choc toxique (vomissements)
- SARM: 50% des souches résistantes à la méthicilline
Nommez les propriétés du genre Lactobacillus
- Gram +
- pas d’endospores
- produits laitiers
- non pathogènes
- acide lactique
Nommez les propriétés de L. lactis
- fromage
Nommez les propriétés de L. delbrueckii ssp bulgaricus
- yogourt avec S. thermophilus
Nommez les propriétés de L. casei
- fromage
Nommez les propriétés du genre Streptococcus
- métabolisme fermentaire => aérotolérantes
2. homofermentaire (a. lactique)
Nommez les propriétés de S. pyogenes
- bronchopneumonie
- fièvre puerpérale
- scarlatine
Nommez les propriétés de S. pneumoniae
- pneumonies
2. découverte transformation : peuvent acquérir ADN facilement (ADN change phénotype bactérie et capsule pathogène)
Nommez les propriétés de S. thermophilus
- fromage et yogourt
Nommez les propriétés de S. lactis
- fromage
Nommez les propriétés de S. mutans
- carie dentaire
Nommez les propriétés du genre Clostridium
- anaérobie (fermentation => gaz)
2. Gram + avec endospores
Nommez les propriétés de C. botulinum
- cause le botulisme (empoisonnement alimentaire)
- conserves en canne mal stérilisées => top bombé (gaz)
- toxine => botuline: toxine + puissante
- botuline Botox réduit rides, paralysie muscles
- toxine détruite à haute T
- botulisme infantile: miel, formation spores intestins
Nommez les propriétés de C. tetani
- pénétration par une plaie => spore
- cause le tétanos (raideur musculaire)
- exotoxine (tétanospasmine) responsable maladie
- traitement: vaccins et antitoxines
- toxine se lie aux neurones irréversible
- 2ème + puissante toxine
Nommez les propriétés de C. difficile
- toxine => cause diarrhées
- maladie nosocomiale (hôpital)
- bactéries pas vrm infectieuses, mais quand établies, souches virulentes
- tits vieux taux mortalité 2.5%
Nommez les propriétés de C. perfringens
- spores (toxines) => infecte plaie => cause la gangrène gazeuse (peau tombe)
- alpha-toxine => trous dans la MP
- traitement antitoxine
- si avalé, entérotoxine => empoisonnement alimentaire
Nommez les propriétés du genre Christensenella
- ressemble à Clostridium
- pathogène normal tube digestif
- récent 2012
Nommez les propriétés de Christensenella minuta
- lien entre obésité et l’absence de la bactérie (flore intestinale)
Nommez les propriétés du genre Faecalibacterium
- ressemble à Clostridium
2. absent dans la maladie de Crohn iléale (infection tube digestif)
Nommez les propriétés de Erysipelothrix rhusiopathiae
- infection des porcs et autres animaux
Nommez les propriétés de Listeria monocytogenes
- Joseph Lister
- cause la listériose
- pathogène opportuniste
- infecte patients fragiles
- pénètre placenta et syst. nerveux
- présent dans eaux, boue, nourriture contaminée
Nommez les propriétés de Epulopiscium fishelsoni
- 2ème bactérie la + grosse
- isolée en 1985 surgeon fish
- reproduction: 1 à 7 cellules filles dans la cellule mère (formation de spores ancêtre) plusieurs copies de génomes
Nommez les propriétés du genre Nitrobacter
- oxydation nitrite NO2- en nitrate NO3- => É. important, car nitrat assimilable, pas NO2-
Nommez les propriétés du genre Agrobacterium
- ne fixe pas l’N
Nommez les propriétés de A. tumefaciens
- cause des tumeurs dans les racines et tiges des plantes
- génome de 2 chromosomes: 1 linéaire, l’autre circulaire
- plasmide Ti (tumor induction pTI) responsable de la transmission de la tumeur par transfert horizontal des gènes du plasmide
- important, car manipulation génétique des plantes, bactérie + plasmide servent à introduction gènes dans plantes (plantes transgéniques OGM)
Nommez les propriétés du genre Rhizobium
- cause nodules chez plantes
- aérobie
- symbioses +/+ bactérie fixation N vs nutriments plantes vers bactéries
Nommez les propriétés du genre Azospirillum
- fixation N
2. association avec racines plantes (maïs, blé) ou libres
Nommez les propriétés du genre Rickettsia
- parasites obligatoires
- cause maladies
- transmis par arthropodes (poux, puces, tiques)
Nommez les propriétés de R. prowasekii
- cause typhus (fièvre) épidémique
- transmis par le poux humain
- maladie de guerre, famille, conditions précaires (ex: Haïti)
Nommez les propriétés de R. typhi
- cause typhus ENDÉmique
2. transmis par puce de souris de maison
Nommez les propriétés de Bordetella pertussis
- cause la coqueluche (vaccination jeune)
- attaque l’épithélium cilié des bronches par toxine
- traitement antibiotiques et érythromycine
Nommez les propriétés du genre Thiobacillus
- bactérie de soufre
- bactéries acidophiles
- H2S => SO4 2-
Nommez les propriétés de t. thiooxydans
- extraction minéraux du sol (acide solubilise roche, liquide, pas $)
Nommez les propriétés du genre Neisseria
- coques en paires ou en amas (coques aplaties = S/V ++)
Nommez les propriétés de N. gonorrhoeae
- ITSS gonorrhée
- transmissible mère au foetus
- résistance aux antibiotiques
- pas d’immunité naturelle. risque échange ADN avec méningite et méningite résistance naturelle antibiotiques + grande
Nommez les propriétés de N. meningitidis
- méningite
2. si échange d’ADN avec gonorrhée, danger car résistance ++ donc risques mortalité ++
Nommez les propriétés du genre Nitrosomonas
- oxydation ammoniaque NH3 ou nitrite NO2- => É
Nommez les propriétés du genre Bdellovibrio
- parasite obligatoire ou facultatif d’autres bactéries
- reproduction par fragmentation (perte flagelle => bactérie rentre cell => spirochète s’allonge => fragmentation, reprenne flagelle => cellule explose, car trop=> libération bactérie => cycle recommence
Nommez les propriétés du genre Myxococcus et Stigmatella
- myxobactéries
- pas struct. ext. pour déplacements. fibres intracell. comme actine. surfaces solides.
- couche muqueuse
- fructifications et spores (myxospores) ++ communication et d’association intercellulaires
- S. aurantiaca
Nommez les propriétés du genre Campylobacter
- parasites syst. reprod. et intestinal et bouche de l’homme et des animaux
Nommez les propriétés de C. jejuni
- gastroentérites
2. lié syndrome Guylaine-Barré avec paralysie temporaire => bactérie attaque syst. nerveux
Nommez les propriétés du genre Helicobacter
- parasite du syst. digestif
Nommez les propriétés de H. pylori
- ulcères estomac et duodénum
2. habitat acide estomac
Nommez les propriétés de la famille Enterobacteriaceae
- bâtonnets Gram - anérobies facultatifs
Nommez les propriétés du genre Escherichia coli
- pathogène normal du tube digestif homme et animaux à sang chaud
- tourista causée par 2 souches 1 ETEc et EIEC
- connu
- génie génétique réalisé avec E. coli
- prend hôte pour survie MAIS lysogénie avec prophage P2 permet survie en-dehors hôte
Nommez les propriétés du genre Shiga
- ressemble à E. coli
Nommez les propriétés de S. dysenteria
- shigellose/dysentérie bactérienne (diarrhées)
- toxine Shiga codée par prophage
- gros intestin, bactérie absorbée par cell. épithéliales. bactérie multiplie en produisant toxine qui tue autres cell.
Nommez les propriétés du genre Salmonella
- toutes les souches sont pathogènes
- Daniel Salmon
- 2 espèces divisées en sérovars ou sérotypes (transfo chim. , antigènes restent ID
Nommez les propriétés de S. Typhi
- histoire Mary Mellar: transmission selles => nourriture
2. fièvre typhoïde
Nommez les propriétés de S. Thyphimurium
- salmonellose
2. réplication cell. épithéliales tube digestif => diarrhée à cause inflammation
Nommez les propriétés de Yersinia pestis
- peste (maladie contagieuse)
- épidémie 1300-1400 Europe, 30-40% population européenne morte.
- découverte Alexandre Yersin 1894
- transmission rat à l’homme grâce aux puces
Nommez les propriétés de Legionella pneumophila
- légionnellose : infection respiratoire
- eau, lacs pollués, air clim
- habitat: amibes et macrophages
Nommez les propriétés de Haemophilus influenzae
- méningite enfants
Nommez les propriétés du genre Pseudomonas
- aérobie certaines anaérobies
- certaines pathogènes
- métabolisme diversifié: si modifié génétiquement dégradation carbone (pétrole)
Nommez les propriétés de P. aeruginosa
- infection nosocomiale
- pneumonie, endocardite, ostéomyélite, infections gastro-intestinales, urinaires, méningite
- attaque faibles
Nommez les propriétés de Vibrio cholerae
- cause choléra
- synthèse toxines => cellules sécrètes eau + électrolytes 12-20 lbs/jour perdus
- immunité contre le sérotype qui a infecté
- tue 120 000 personnes/an ex: Haïti
Nommez les propriétés de Thiomargarita namibiensis
- grosse bactérie connue
2. bactérie du soufre
Nommez les propriétés des spirochètes
- forme d’hélices > 1 tour
- cellules flexibles
- mobilité fibres axiales
Nommez les propriétés de Leptospira interrogans
- leptospirose (jaunisse) => rein / foie
- eau, sol urine
- 2 chromo
Nommez les propriétés du genre Treponema
- bouche, intestins, génital
Nommez les propriétés de T. pallidum
- syphilis
- seul tréponème transmis sexuellement
- traitement pénicilline
- transmissible au foetus
- 1 chromo
Nommez les propriétés de T. denticola
- non pathogène dans bouche
Nommez les propriétés de Borrelia
- 1 chromo
Nommez les propriétés de B. recurrentis
- fièvre récurrente
2. transmis par tique
Nommez les propriétés de b. burgdorferi
- maladie de Lyme
- piqûres tiques qui se nourrissent de tits animaux
- peut vivre sans Fe, mais besoin Mn
- Qc: tique du chevreuil
- traitement antibiotiques
Nommez les propriétés de Tenericutes
- pas de paroi cellulaire = résistants aux antibio comme pénicilline (antibio ne rentrent pas dans cell)
- +/- résistants chocs osmo
- coques ou filaments
- division par fragmentation
- cholestérol dans MP
Nommez les propriétés de Mycoplasma pneumoniae
- pathogène opportuniste ou commensal => obligatoire
- pneumonie
- contaminant des cellules en culture => test microplasme, altère métabolisme cellule