Alla föreläsningar Flashcards

Question

Vilka beståndsdelar har en spliceosom?

Answer 1

**snRNPs** och **associerade proteiner**, bl.a. BBP (branchpoint binding protein) och hjälpproteinet U2AF.

Answer 2

* *Acetylering** av histoner görs av **HATs** - histon acetyl transferaser - och leder oftast till att kromatinet får en öppen struktur att genen alltså är påslagen. * *HDACs** - histondeacetylaser - **deacetylerar** histoner vilket leder till att genuttrycket stängs av. **Metylering** av histoner görs av **HMTs** - histonmetyltransferaser - och beroende på vilken position som metyleras kan det leda till mer öppet såväl som mer stängt kromatin. **Demetylering** görs av **histondemetylaser**.

Answer 3

* **IRE1**: reglerar mRNA-splicing och initierar translation av TRP1 * **PERK**: fosforylerar och inaktiverar *translation initiation factor*, vilket leder till minskning av proteinimport i ER samt selektiv translation av TRP2 * **ATF6**: reglerar proteolys i golgi, vilket leder till frisättning av TRP3 TRP = *transcription regulatory protein*, alltså transkriptionsfaktorer som aktiverar gener som ökar den proteinveckande kapaciteten i ER. Tillsammans står detta för **det oveckade proteinsvaret**, som motverkar ackumulering av oveckade proteiner i ER.

Answer 4

* **TGF-β**: * ECM-syntes + * MMP-syntes - * TIMP-syntes + * PDGF * Vissa ECM-komponenter + * **Kortison/kortisol** * ECM-syntes - * MMP-syntes + * TIMP-syntes - * TNF-α, Int-γ * ECM-syntes - * IL-1 * MMP-syntes +

Answer 5

1. Aktiverande domän 2. DNA-bindande domän 3. Ligandbindande domän Utan ligandbindning är receptorn i cytoplasman med en inhibitor bunden. Ligandbindning dissocierar inhibitorn så receptorn kan gå in i kärnan, dimeriseras och verka som transkriptionsfaktor.

Answer 6

**Kaspas 8** klyver och **aktiverar** **Bid**, som translokerar till mitokondriens yttre membran och **hämmar anti-apoptotiska Bcl2**, så dödssignalen förstärks.

Answer 7

Man kan använda koincidensdetektion, dvs man använder två olika antikroppar eller primers som "korsar".

Answer 8

**SOS** aktiverar **RAS** genom att byta GDP mot GTP. RAS fosforylerar och aktiverar **RAF** RAF fosforylerar och aktiverar **MEK** MEK fosforylerar och aktiverar **ERK** ERK går in i kärnan och ökar gentranskriptionen av **c-fos**, **c-jun** och **elk**.

Answer 9

1. I Golgi, för att forma en heterodimer som transporteras till cellens yta och där utgör själva Notch-receptorn 2. När Notch binder Delta klyvs den extracellulära domänen av ett extracellulärt proteas 3. Den cytoplasmatiska svansen klyvs från den aktiverade receptorn av gammasekretas. Den bortklyvda svansen går in i kärnan och fungerar där som transkriptionsfaktor.

Answer 10

* elektrostatiska interaktioner * vätebindningar * van der Waals-interaktioner * Proteindisulfidisomeras (PDI), ett ER-enzym * glykosylering

Answer 11

* Dimerisering * Fosforylering av tyrosin på receptorns intracellulära domän * Activation lip öppnas och frilägger en ATP-bindande ficka, vilket ger maximal enzymatisk aktivitet * Signalmolekylers SH2-domäner binder till fosfotyrosiner i receptorns intracellulära domän. Exempel på detta: GRB2. * RAS-vägen aktiveras.

Answer 12

* **Framtarm** → svalg, luftstrupe, lungor, tyroidea, tymus, matstrupe, magsäck, tolvfingertarm, lever, pankreas * **Mittarm** → tunntarm, tjocktarm * **Baktarm** → tjocktarm, rektum * **Allantois** → urogenitalsinus → urinblåsa, urinrör, prostata, delar av vagina Endodermet sluts ventralt till ett rör vid embryots laterala veckning. Röret organiseras rostro-kaudalt och det bildas knoppar och utskott som sedan utvecklas till olika organ.

Answer 13

CpG-islands är en typ av **promotor**; "öar" på ca 0,3-3 kb med **ovanligt många C och G**, ofta lokaliserade nära geners 5'-ände i själva promotorregionen. CpG-islands är ofta **hypometylerade**; annars är 70-80% av alla C i genomet metylerade. *Kallas CpG just för att C följs av G, och de separeras endast av en fosfatgrupp.*

Answer 14

Nysyntetiserat dubbelsträngat DNA har en sträng av original-DNA och en ny sträng. Watson och Crick, eller sense och antisense.

Answer 15

Amyloidsjukdomar (Alzheimers) Inflammation Cerebral malaria Aptitreglering

Answer 16

1. Frekvens (polymorfism) 2. Typ av förändring 3. Storlek 4. Vilken effekt den har på gener

Answer 17

Kromatinstruktur och transkriptionell aktivitet.

Answer 18

* **IP3 aktiverar IP3-receptorer på ER** * **Ca aktiverar ryanodinreceptorer på SR/ER** * **Ca aktiverar IP3-receptorer på ER** (calcium induced calcium release) * Cykliskt ADP-ribos (cADPr) * Nicotinic Acid Adenine Dinucleotide Phosphate (NAADP)

Answer 19

Protein med rätt signalsekvens binder till receptorprotein i **TOM**-komplexet i mitokondriens yttre membran, och förs in med hjälp av chaperoner som **HSP70**. Proteinet går vidare in i **TIM23** i det inre membranet och in i matrix via **OXA1**. Inne i matrix veckas proteinet på nytt, och signalsekvensen klyvs bort. * TOM = translocon of outer membrane* * TIM = translocon of inner membrane*

Answer 20

Trick question! Det finns ingen sådan signal.

Answer 21

Wnt binder till **Frizzled**-receptor på cellens yta. Frizzled ser ut som GPCR, men aktiverar inte G-protein. Frizzled rekryterar scaffoldproteinet **Dishevelled**, som skickar signalen vidare till andra signalmolekyler. Wnt/β-catenin-vägen reglerar proteolys av β-catenin. Wnt gör detta genom att binda både till Frizzled och en co-receptor, LRP. Detta aktiverade receptorkomplex rekryterar Dishevelled. LRP fosforyleras av GSK1 och CK1. Axin rekryteras och inaktiveras, vilket stör nedbrytningen av β-catenin i cytoplasman. Ofosforylerat β-catenin kan då samlas och translokera till cellkärnan där det påverkar gentranskription.

Answer 22

**Aktiverar** **Cdk** (cyclin-dependent kinase) i **sen G1-fas** och triggar progression genom **restriction point**, som är ett irreversibelt steg: efter det måste cellen fortsätta igenom cellcykeln. Nivåerna av G1/S-cyklin sjunker snabbt efter restriction point.

Answer 23

Antingen direkt till receptorn eller till docking/scaffolding-proteiner som i sin tur binder till receptorn.

Answer 24

Hjärtmissbildningar Låg födelsevikt Sämre lungfunktion Inlärningssvårigheter Död pga hypoxi, celldöd

Answer 25

**Replikationsgaffeln stannar** vid skador i templatet. Om reparation ej kan ske återställer **translesions-DNA-syntes** replikationen. Translesions-DNA-syntes ökar cellöverlevnaden, men har en hög felfrekvens.

Answer 26

* **Sprouting**: * Blodkärlen får en VEGF-signal. MMPs bryter ner basalmembranet. * Endotelcellerna migrerar ut genom hål i basalmembranet, och prolifererar. * Strukturell omvandling sker för att bilda kapillär. Lumen bildas; rörbildning. * Utmognad av kärlet, rekrytering av pericyter. * **Intussusception** * ECM trycker på kärlet så det snörps av och delas i två. * Snabbare än sprouting! * **Looping** * ****I sår ansamlas många myofibroblaster som drar ihop vävnaden, de drar då även in blodkärl som finns i närheten till det område som behöver syresättas. * **Endotelcellsprogenitorer** från benmärgen kan bidra till angiogenes genom att differentiera till endotelceller.

Answer 27

**P21** aktiveras av **p53** vid **DNA-skada** **P27** aktiveras av **TGF-β** vid **cellöverväxt**

Answer 28

**Proteoglykan**: Ett protein med en eller flera kovalent bundna **glykosaminglykaner** **Glykoprotein**: Ett protein med ett eller flera kovalent bundna **socker** (oligosackarider)

Answer 29

Medfött bukväggsbråck genom vilket tarmen kan bukta ut. Oftast på höger sida, där tillbakabildningen av navelsträngskärl har försvagat bukväggen.

Answer 30

Det ökar missbildningsfrekvensen 2-3 gånger. * ansiktsmissbildningar * läpp-gomspalt * distala extremitetsmissbildningar * hjärtmissbildningar

Answer 31

Transposition är en typ av rekombinering som ej kräver långa homologa DNA-sekvenser; istället kopieras genetiskt material och flyttas till en ny plats i arvsmassan. Det finns tre huvudsakliga klasser av transposoner: 1. DNA-transposoner 2. Retrovirus 3. Retrotransposoner/LINE-element

Answer 32

Klatrin COPI COPII

Answer 33

Tarmslynga finns kvar i navelsträngen

Answer 34

1. Transposas-monomerer binder till korta, inverterade repeat-sekvenser och sen till varandra, så det bildas en DNA-ögla som klipps av och bildar en transposom. 2. Transposas klyver sedan mål-DNA på en slumpmässig plats, där den nu avklippta transposomen kan sättas in 3. DNA-polymeras och -ligas fyller igen luckor och klistrar ihop strängarna

Answer 35

**Ureterknopp** **Metanefrogent mesenkym** **Reciprok induktion** Ureterknoppen inducerar kondensering av mesenkym, ger s.k. capmesenkym. Capmesenkymet inducerar i sin tur förgrening av ureterknoppen, vilket ger upphov till både ureter, njurbäcken och njurkalk.

Answer 36

* BBP och hjälpproteinet U2AF binder in till intronet * U2 snRNP binder in till branchpoint, U1 till 5'-splice site. * U4, 5 och 6 (trippel-snRNP) binder in och ihop, så intronet blir en ögla: Lariatbildning. * RNA klyvs, först 5' och sedan 3', och ligeras. Exonerna sitter nu ihop och intronet är borta. För de flesta introner sker splicingen co-transkriptionellt, dvs medan transkriptionen pågår. Ibland sker den post-transkriptionellt, dvs när hela transkriptet är färdigsyntetiserat.

Answer 37

1. Mutation 2. Genduplikation 3. Rekombinering 4. Transposition

Answer 38

Det är den **utgående** **artärstammen** under hjärtats bildning, som sedan delas upp i **aorta** och **lungartär** genom att **spiralvridna septa** bildas av **invandrande neurallistceller**. Septan möter och växer ihop med ventrikelskiljeväggen.

Answer 39

**Proof reading**, **exonukleas-aktivitet**. Den går då 3' till 5' och tar bort (via hydrolys) 3'-terminala nukleotider som inte är korrekt basparade till templatsträngen.

Answer 40

1. **Mikroskopiska metoder**: Kromosomala rearrangemang 2. **Arraybaserade metoder**: Kopietalsvariation 3. **PCR och sekvensering**: Indels och SNPs

Answer 41

De bildar MMPs (med hjälp av Twist och Snail) som bryter ner ECM.

Answer 42

Western blot Sandwich immunreaktion Proximitetsligering

Answer 43

N-glykosylering sker **direkt efter translokation till ER**. En oligosackarid (14 sockergrupper bestående av 9 mannos- och 3 glukos-molekyler) samt två N-acetylglukosaminer överförs av ett **oligosackaridtransferas**, och binder till **asparagin** på proteinet. Acceptorsekvensen är **Asn-X-Ser/Thr**. N-glykosylering har **flera funktioner**: * veckningskontroll * lokalisering/transport av protein * proteinaktivitet * stabilitet * löslighet

Answer 44

I flexibla vävnader, bl.a. hud, kärl och lungor.

Answer 45

1. Aktivator binder till enhancer 2. Aktivatorn rekryterar kromatinremodellerande och histonmodifierande enzymer 3. Övergång från hetero- till eukromatin sker 4. Fler aktivatorer kan binda in till DNA 5. Mediatorn binder till DNA-bundna aktivatorer 6. Aktiveringen av den generella transkriptionsinitieringen kan då påskyndas genom att bindningen av de generella transkriptionsfaktorerna till promotorn underlättas.

Answer 46

* Wnt * Wnt-inhibitorer * DKK * Fzb * TGF-β-familjen * BMPs * Nodal * Activin * TGF-β * GDF * TGF-β-inhibitorer * Chordin * Noggin * Follistatin Cerberus * FGFs * SHH * RA

Answer 47

**CAK** = Cdk-activating kinase. Fosforylerar en **aktiverande** site i Cdk. **Wee1** fosforylerar och **inhiberar** Cdk, förhindrar Cdk1-aktivitet innan mitosen. **Cdc25** defosforylerar och **aktiverar** Cdk. Tävlar mot Wee1.

Answer 48

Ett verktyg som används för att jämföra olika arter; ungefär som släktträd.

Answer 49

I cellkortex binder korta aktinfilament till cellmembranet via proteiner, detta skapar t.ex. den speciella cellform vi ser hos röda blodkroppar.

Answer 50

Mamman: Gomspalt, Downs syndrom Pappan: Schizofreni

Answer 51

1. En ny komplementär tRNA binder i ledigt A-site 2. En ny peptidbindning bildas i P-site, den stora subenheten flyttas 3. mRNA flyttas tre nukleotider till vänster på lilla subenheten, den använda tRNA skickas ut via E.

Answer 52

De sitter vid slidmynningens övre kant, mot urinröret.

Answer 53

**Syre** **α-ketoglutarat** **Järn** **Askorbinsyra** Hydroxyleringen är nödvändig för att kollagenfibrerna ska kunna korslänkas med vätebindningar; utan dessa vätebindningar är kollagenet instabilt.

Answer 54

Defekt kollagen VII och/eller defekt i laminin. Ger blåsor och inflammation i huden.

Answer 55

Testis omsluts av **tunica albuginea** och **tunica vasculosa**, ytterst ligger **tunica vaginalis**. Tunica albuginea delar in testikeln i **250 lober**, och bildar även **mediastinum** mot epididymis. I varje lobulus finns 1-4 **tubuli seminiferi**, sädeskanaler. **Blod-testis-barriären** är den barriär av **Sertoliceller** som är förbundna med tight junctions och hindrar ämnen från att vandra mellan testis och lumen i tubuli seminiferi. Den kallas även Sertoli Cell Barrier, SCB. **Sertolicellerna** är postmitotiska **stödjeceller**. De har FSH-receptorer som **stimuleras av FSH och testosteron**. De **producerar ABP, inhibin och aktivin**. Aktivin stimulerar spermatogenesen. **Leydigceller** finns i **interstitiet**. De är stora och kantiga, innehåller Reinkes kristaller. De har **receptorer för LH och prolaktin, och producerar testosteron**.

Answer 56

Detta sker hos melanocyter som lagrar melanin i sina lysosomer, de kallas då **melanosomer**.

Answer 57

UV-strålning kan ge **mutagena skador**, framför allt genom att bilda thymin-dimerer men även C-C-homodimerer samt C-T-dimerer. Resultatet blir att **DNA-strängen böjs**.

Answer 58

1. Myosin är relaxerat, har ADP+Pi bunet, kontakt med troponin/tropomyosin på aktinfilament 2. Ca kommer dit 3. Troponin/tropomyosin flyttas, Pi lossnar 4. Myosin binder aktinfilament och kontraherar 5. ATP binder, ADP lossnar 6. ATP hydrolyseras, myosin relaxeras, troponin/tropomyosin glider emellan myosin och aktin så de inte kan binda till varandra.

Answer 59

1. **Interfas**: DNA-replikation. Varje cell får dubbel uppsättning av DNA. 2. **Profas I**: Homolog rekombinering. Kromosomerna kondenserar, systerkromatiderna parar ihop sig. Chiasma - överkorsning. Spolkroppen bildas av mikrotubuli. 3. **Metafas I**: Kärnmembranet är upplöst, kromosomparen har samlats i cellens ekvatorialplan. 4. **Anafas I**: De homologa kromosomparen dras mot varsin cellpol. Obs: Paren delas inte, utan sitter fortfarande ihop i centromeren, systerkromatiderna dras alltså till samma sida. 5. **Telofas + Cytokines I**: Cellen delar sig till två nya celler som har 23 kromosomer och 46 kromatider var. Hos kvinnor stöts den ena kärnan ut som polkropp.

Answer 60

De är uppbyggda av olika subenheter, som saknar egen enzymatisk aktivitet men är kopplade till ett intracellulärt tyrosinkinas: JAK. Signaleringen går cytokin-JAK-STAT

Answer 61

Två akrocentriska kromosomer fuserar.

Answer 62

* Lateralt till uterus via **ligamentum ovarii proprium** * Till bäckenväggen via **ligamentum suspensorium ovarii** * Ovarier, tuba uterina och uterus täcks av **ligamentum latum**

Answer 63

Ryggen är öppen, ingen hud. Ryggmärgen är helt fri. **Neuralrörsdefekt**.

Answer 64

Kollagen är en **trimer av glykoproteiner**. Den ser ut ungefär som DNA, fast med tre strängar istället för två. Ger styrka, stabilitet och motståndskraft. Kollagenets trippelhelix-trimer: GXX * **G**lycin * Hydro**x**yprolin * Hydro**x**ylysin α-kedjor → helixar → fibriller → fibrer

Answer 65

- Metylering av cytosin i DNA - Acetylering/metylering av histoner

Answer 66

uPA = urokinase plasminogen activator uPA aktiverar plasminogen (inaktivt) till plasmin. Plasmin aktiverar pro-MMPs och bidrar på så sätt till nedbrytning av ECM, men kan också bryta ner vissa komponenter själv.

Answer 67

**Dödsreceptorer** (TNF-R) på cellytan binder en ligand, t.ex. **Fas**. Detta aktiverar **dödsdomäner** på receptorns cytosoliska del, som binder **FADD**, ett intracellulärt adaptorprotein. FADD binder i sin tur **pro-kaspas 8** och bildar på så sätt ett *death-inducing signaling complex*, **DISC**. Prokaspas 8 dimeriseras och klyvs i komplexet, och blir till **kaspas 8**. Kaspas 8 klyver och aktiverar prokaspas 3 till aktivt **kaspas 3**, som utför själva apoptosen.

Answer 68

**APC/C** katalyserar ubiquitinering av reglerande protein som är inblandade i exit från mitosen, inklusive securin, S- och M-cyklin. *Huvudregulator i metafas-anafas-övergången*. **Cdc20** är en APC/C-aktiverande subenhet som stimuleras av M-Cdk-aktivitet **Cdh1** är en APC/C-aktiverande subenhet som upprätthåller APC/C-aktivitet efter anafas och genom G1 **SCF** katalyserar ubiquitinering av reglerande protein som kontrollerar G1

Answer 69

Ribosomens lilla subenhet har ett bindningsställe för mRNA. Ribosomens stora subenhet har tre bindningsställen för tRNA: A (aminoacyl) P (protein) E (exit)

Answer 70

1. Immuncell når endotelet. Lagrat P-selektin frigörs till cellytan från WP-bodies 2. Immuncell binder P-selektin via PSGL-1 och börjar rulla på endotelet 3. Transkription av P- och E-selektin 4. Aktiverade trombocyter som fäst i endotelet utgör ytterligare förankringspunkter, immuncellen fortsätter rulla 5. Kemokiner uttrycks i endotelet, GPCR på immuncellen 6. Integriner aktiveras på immuncellen 7. Immuncellen börjar genomgå en konformationsändring, saktar ner och fäster på endotelet. Integriner fäster ICAM/VCAM som uttrycks av pericyterna 8. Ökat uttryck av TNF-α, Ca strömmar, ROS ökar i endotelet 9. Immuncellen transmigrerar genom endotelet Immuncellerna kan antingen transmigrera paracellulärt (mellan två endotelceller) eller transcellulärt (genom en endotelcell).

Answer 71

**Transposon** + **transposas** dvs själva det genetiska materialet samt enzymet som flyttar det till en ny plats i arvsmassan.

Answer 72

Ett utbyte av genetiskt material mellan homologa DNA-sekvenser. Sker vid DSB och meios, dvs - reparation av DNA vid brott i DNA-sträng - utbyte av genetisk information mellan kromatider för att skapa nya kombinationer av genetisk variation

Answer 73

* ger vävnader deras mekaniska egenskaper * utgör substrat för cellers migration * genererar signaler till celler via receptorer * reglerar vätskehomeostas

Answer 74

* fosforylering via proteinkinas * unmasking genom proteindissociation * instabilisering av N-terminalen

Answer 75

En **enzymatisk process** som ändrar RNA-nukleotider efter RNA-syntesen. Det finns två huvudtyper: **A → I** (inosin, beter sig som guanin, kräver ADAR: adenosindeaminas) **C → U** (ovanlig, kräver APOBEC-enzym) Mutationer beror ofta på misstag i transkriptionen. RNA-redigering sker efter transkriptionen, efter att mRNA har lämnat kärnan men innan det kommer fram till ribosomen där det translateras.

Answer 76

När **koncentrationsgradienten** och den **elektriska gradienten** är **lika stora och motriktade**. Räknas ut med Nernst ekvation.

Answer 77

**DNA** packas ihop genom att **lindas kring histoner**; annars skulle det aldrig få plats i kärnan. Runt en histonkärna bestående av **H2A**, **H2B**, **H3** och **H4** lindas 147 baspar DNA, detta utgör en **nukleosom**.

Answer 78

Apoptos och nekros, t.ex. vid hjärtinfarkt

Answer 79

**Oreglerad** membranfusion, s.k. **housekeeping**. Lösliga proteiner, membranlipider mm. Många receptorer, transportörer, jonkanaler.

Answer 80

Det fosforylerar dess CTD (C-terminal domain), vilket gör att... 1. RNA-pol II börjar transkribera 2. Transkriptionsfaktorerna släpper 3. Andra proteiner för RNA-processning binder till CTD 4. RNA-pol II kan då binda DNA hårdare och transkribera snabbare.

Answer 81

Insulatorelement blockerar effekten av omgivande positiva/negativa DNA-element (enhancers/silencers). På så sätt skapar den oberoende funktionella domäner i DNA-sekvensen, som kan innehålla en eller flera gener.

Answer 82

De byggs upp av aktin, och har en plus- och en minusände. När ett filament bildas börjar det med att **G-aktin** (globulärt aktin) samlas ihop och **bildar** **en "kärna" som sedan kan elongeras och polymeriseras**, det har då blivit till F-aktin (filament-aktin). Efter ett tag uppstår jämvikt, då aktinenheter läggs till och släpper ifrån filamentet i samma takt, detta kallas **steady state**. Processen med aktin som associerar och dissocierar kallas **treadmilling**. Polymeriseringen går snabbast i plusänden.

Answer 83

**Single Nucleotide Polymorphism**, den vanligaste formen av variation i vårt genom.

Answer 84

1. **Anläggning av primitivstrimman** * Wnt produceras av häftstjälken, inducerar EMT och bildningen av primitivstrimman * DKK = Wnt-inhibitor uttrycks i mitten på skivan, skapar ett anteriort signalcenter som begränsar Wnt-påverkan till den bakre delen av groddskivan * Nodal (TGF-β) induceras av Wnt, skapar ett posteriort signalcenter med Wnt. * Nodalinhibitorer syntetiseras i det anteriora centret och begränsar Nodal-påverkan till den posteriora domänen * Noden bildas i gränszonen mellan dessa domäner 2. **Neuroinduktion** * ytektoderm → neuroektoderm * BMP2-signalering från bl.a. underliggande endoderm omvandlar epiblaster till ytektoderm. * Noden inducerar bildningen av neuroektoderm genom att producera Chordin som inhiberar BMP2.

Answer 85

Det finns både kortikala nefron och juxtamedullära nefron. Varje njura har över en miljon nefron. De består av: * Corpus corpusculum: * Bowmans kapsel * Glomeruli * Proximala och distala tubuli * Henles tunna slyngor

Answer 86

Kranialt: Anencefali Kaudalt: Spina bifida

Answer 87

Proteinsyntesen startar vid fria ribosomer i cytosolen. Proteinerna sorteras via signalsekvenser i proteinet.

Answer 88

Mikrodeletionssyndrom kan uppstå om det blir fel vid den homologa rekombinationen. Deletioner och även duplikationer kan skapas (detta kallas NAHR, non-allelic homologous recombination). **Exempel: Williams syndrom**, en utvecklingsstörning som påverkar flera organ i kroppen. Patienterna har oftast precis samma deletion, orsakad av felaktig rekombination mellan flankerande DNA-sekvenser som är mycket lika.

Answer 89

* **Koncentrationsgradient** * Na/Ca-exchanger * Vissa glukostransportörer * **ATP-hydrolys** * Na/K-pumpen * Ca-ATPaser * CFTR * MDR * Ljus- eller **redoxreaktioner** * Redox i mitokondrierna * Inte ljus hus människan!

Answer 90

1. Activator binder in till packat kromatin 2. Kromatinet får en mer öppen struktur 3. Histoner modifieras (acetyleras av HATs) 4. Fler aktiverande proteiner binder in 5. Ett preinitieringskomplex bestående av generella transkriptionsfaktorer och RNA-polymeras II formas vid promotorn. 6. Transkription initieras.

Answer 91

GDNF = Glial cell-line derived factor inducerar bildningen av ureterknoppen. Om receptor för GDNF saknas kommer njurens utveckling att stanna pga ingen reciprok induktion

Answer 92

Defekt i kollagen I. Benen utvecklas helt fel och bryts. Dödligt.

Answer 93

Den hjälper till att **rekrytera** **preinitieringskomplexet**. Activatorn **binder till enhancer-regionen** (som kan ligga långt från den gen den reglerar) och kan sedan i sin tur binda **mediatorn**.

Answer 94

MMPs = matrix-metalloproteaser, bryter ner ECM. De har en zinkjon i sin katalytiska site. MMPs har en viktig roll i cellmigration eftersom de bryter ner ECM och därmed även adhesionspunkter, processar även cytokiner och frigör signalmolekyler. MMP-aktivitet regleras genom * biosyntes (genuttryck) * proteolytisk aktivering * lokalisation (vissa sitter t.ex. bara i membranet och kan bara verka lokalt) * inhibitorer (TIMP 1-4)

Answer 95

* bildning av * vävnader * strukturer * koordinering (ex. hjärta) * samarbete mellan olika celltyper * cellmigration * embryonal utveckling * sårläkning * regeneration * immunförsvar

Answer 96

TATA-binding protein, **TBP**, binder till TATA-boxen. TBP binder **TFIID**. Detta komplex binder **TFIIA** och **TFIIB**; därefter binder **RNA-polymeras II** och ytterligare faktorer in. Sist kommer **TFIIH** som har två funktioner: Dels fungerar det som ett **helikas** som separerar DNA-strängarna vid transkriptionsstarten, dels som ett **proteinkinas** som fosforylerar CTD på RNA-polymeras II.

Answer 97

Small interfering RNA. Stänger av genuttryck genom nedbrytning av utvalt mRNA och bildande av kompakt kromatinstruktur.

Answer 98

1. Cirkulärt, dubbelsträngat plasmid-DNA klyvs med hjälp av restriktionsenzym 2. DNA-fragmentet som ska klonas ligeras in i den öppnade plasmiden 3. Rekombinant DNA-plasmid blir cirkulär igen, och introduceras i bakteriecell 4. Cellerna delar sig i cellodling, producerar många nya plasmidkopior

Answer 99

* ljus * katekolaminer * peptider * chemokiner * glykoproteinhormoner * glutamat/Ca * trombin

Answer 100

Hemidesmosomer.

Answer 101

**SRP = Signal Recognition Particle**. Den är viktig för **proteintranslokation över ER-membranet**. När den växande polypeptidkedjan kommer ut ur ribosomen finns där en SRP som väntar på en **signalsekvens**. Signalsekvensen är en **hydrofob sekvens, 8-12 aminosyror lång**, som är N-terminalt placerad. SRP binder till denna signalsekvens, vilket gör att **translationen avstannar**, och drar med sig hela ribosomen till ER. På ER-membranet finns **SRP-receptorer** och **protein-translokatorer**. SRP binder till sin receptor, proteinet binder till protein-translokatorn och dockar ribosomen vid membranet. **SRP släpper** då från signalsekvensen, **translationen startar igen** och proteinet translokeras in i ER.

Answer 102

När cytokin binder till receptorn **dimeriseras** den, **autofosforyleras** (JAK) och **aktiveras**. Därefter fosforyleras receptorn så bindningsställen för SH2-domänerna på STAT-proteiner uppkommer. **STAT** binder, och **fosforyleras** av **JAK**. STAT släpper då, dimeriseras och åker in i kärnan där den påverkar genuttryck. ***STAT = Signal transducer and activator of transcription.** Fosforylering av STAT leder till kärntranslokation och transkription av gener.*

Answer 103

Karyotyp = den bild över kromosomernas antal och utseende som kan framställas genom att fotografera celler i mitosens metafas. Variation leder till olika karyotyper. Den normala karyotypen för en människa består av 44 autosomer och 2 könskromosomer.

Answer 104

* Mesonefrosgången utvecklas till manliga gonader. SRY-genen på Y-kromosomen kodar för könsbestämmande transkriptionsfaktor. Medullära könssträngar bildas, och Sertoliceller differentieras. * Sertolicellerna bildar AMH - anti-Müllerskt hormon - som gör så den Müllerska gången (paramesonefrosgången) tillbakabildas. * Sertolicellerna omsluter urkönsscellerna och ger spermatogonier som placeras i tubuli seminiferi. * Bindvävsceller mellan tubuli seminiferi bildar Leydigceller som producerar testosteron * Mesonefrosgången utvecklas till vas deferens, epididymis samt sädesblåsan.

Answer 105

Integriner är en stor receptorfamilj som finns på alla celler utom erytrocyter. De utgör **focal adhesion sites**, och aktiveras av att proteinerna talin och kindlin binder intracellulärt. Aktivering av integrin leder till exempel till att blodceller blir adhesiva. Inaktivering leder till cellmigration.

Answer 106

* Receptor-tyrosinkinaser * TGF-β-receptorer * Serin-threonin, aktiverar SMAD * Hedgehogreceptorer * Wnt-receptorer * Frizzled * LRP

Answer 107

* Klatrinmedierad * Caveolae (ungefär som klatrin men med caveolin istället) * Makropinocytos * Fagocytos

Answer 108

Ca 40%, men endast 1,5% är kodande sekvens.

Answer 109

Yttre: fibroblaster + kollagen Inre: myofibroblaster.

Answer 110

Yap/Taz är **transkriptionella co-activators** som bl.a. regleras av **Hippo core complex**. De är *master regulators of cell growth* och har en nyckelroll i kontrollen av **vävnadstillväxt** och homeostas. Yap/Taz regleras även av mekaniska krafter: *Vid hög aktin/myosin-spänning är Yap/Taz aktivt, vid låg spänning är det inaktivt. Detta gör att om cellen sträcks ut aktiveras Yap/Taz och cellen delar sig (prolifererar) istället för att gå sönder.*

Answer 111

Mismatch-repair-enzymer tar bort den nukleotid som har blivit fel i den ometylerade strängen, eftersom den är nysyntetiserad. DNA-polymeras kan sedan fylla på med en ny nukleotid.

Answer 112

tRNA och vissa andra små RNA, 5S-rRNA

Answer 113

* Sekretoriska proteiner samlas och bildar proteinaggregat i trans-Golgi-nätverket, skapar sekretoriska vesiklar * Klatrin-beklädda vesiklar tar emot överflödigt membran och luminalt innehåll, så vesikeln **komprimeras** och **mognar**. Dessa klatrinvesiklar går in i trans-Golgi-nätverket igen, medan de nu **mogna sekretoriska vesiklarna** åker vidare mot sitt mål.

Answer 114

NF-kB är vår viktigaste aktivator för stimulering av immunsvar såsom inflammation. NF-kB finns i cytosolen och sitter normalt sett bundet till **Ik-B** som inhiberar det. Vid stimulering av IL-1 eller TNF-alfa startar en signaleringskaskad som gör att Ik-B fosforyleras och skickas till proteasomen för nedbrytning. NF-kB, som nu är fritt, kan gå in i kärnan och stimulera transkription av olika immunsvars-gener: **NF-kB inducerar ett proinflammatoriskt immunsvar**.

Answer 115

Nej, det är bundet till proteiner. Mer än 90% av cellens kalcium är bundet till buffertproteiner som t.ex. parvalbumin, calbindin och calretinin.

Answer 116

**DNA replikeras och dupliceras**, replikationen initieras av **S-Cdk** (alltså: ett aktivt komplex av S-cyklin och Cdk) vid "origin". **S-Cdk är från början inhiberat av CKI och negativ fosforylering från Wee1**. G1/S-Cdk och G1-Cdk fosforylerar CKI, vilket är en signal till SCF att ubiquitinera CKI så det kan brytas ner i proteasomen. Cdc25 tar bort den negativa fosforyleringen som Wee1 gjort på S-Cdk om det inte finns någon DNA-skada. När inhiberingen släppt kan replikationen starta. S-Cdk fosforylerar och **inhiberar** även **ORC** (origin recognition complex) och **Cdc6**. ORC+Cdc6+Cdt1 har laddat på DNA-helikas runt DNA:t, men behövs inte längre eftersom man ju inte vill att det ska skapas ett nytt origin mitt under cellcykeln. **Istället aktiveras helikaset**, som delar DNA-strängarna så transkriptionen kan börja.

Answer 117

Transfer RNA. Viktig i proteinsyntesen som adapter mellan mRNA och aminosyror.

Answer 118

* **Självförnyande**: Kan genomgå mitos under hela sin livstid * **Differentieringsförmåga**: Kan bli mogna celler * Delar sig sällan, har **lång cellcykel**. **Progenitorer** är celler som är determinerade men ännu ej differentierade, s.k. förstadieceller. De saknar självförnyelseförmåga, och har en övergående celldelning: De genomgår i rask takt ett antal celldelningar och dör sedan.

Answer 119

Messenger RNA, kodar för protein.

Answer 120

Njuren, gonaderna och deras utförsgångar kommer från intermediärt mesoderm. 1. Mesonefrosgången bildas, ansluter nedåt mot urogenitalsinus 2. Pronefros bildas, förnjuren 3. Mesonefros bildas, den embryonala njuren 4. En knopp växer fram på mesonefrosgången 5. Metanefros, den definitiva njuren, induceras av knoppen, som bildar ureter 6. Njurarna vandrar upp, positioneras och vaskulariseras

Answer 121

* Korsbindning * Aktinstråk * Filament * Bindning till plasmamembranet, vesiklar eller andra intracellulära strukturer * Bindning till mikrotubuli

Answer 122

sur aminosyra - x - sur aminosyra

Answer 123

CNV = Copy Number Variation, **kopietalsvariation**. Segment av DNA kan variera i antal mellan olika individer, de kan vara långa och innehålla hela gener. Till exempel har populationer som äter stärkelserik föda fler kopior av amylasgenen än populationer som äter mer kött. Små variationer är vanligare än stora. Generellt är det *mer negativt med ett minskat genuttryck* (en kopia mindre) *än ett ökat uttryck* (en extra kopia).

Answer 124

E2F är en viktig transkriptionsfaktor för S-fas-gener. Aktivt Rb-protein binder E2F, som inaktiveras. **G1-CDK fosforylerar Rb** så det inaktiveras och **släpper från E2F, som nu blir aktivt**. E2F fungerar som transkriptionsfaktor och **stimulerar transkription av S-fas-gener, såsom G1/S-cyklin och S-cyklin**. S-cyklinet binder till Cdk, och S-fasen kan börja. Såväl G1/S-Cdk som S-Cdk ger positiv feedback till denna kedja, och hjälper alltså till att fosforylera Rb och ge mer aktivt E2F.

Answer 125

* **Synaptiska vesiklar kan sitta "primade" vid plasmamembranet**, redo att fusera så snart kalcium börjar flöda. * Exocytos är energikrävande! * **SNARE-proteiner** katalyserar fusion mellan vesiklar och målorganell/plasmamembran. * SNAREs kan återvinnas tack vare **NSF-ATPas**: NSF dissocierar SNARE med hjälp av energi från ATP-hydrolys.

Answer 126

En miljö i vuxna individer där stamcellernas tillväxt och odifferentierade tillstånd upprätthålls. Som exempel bildar panethceller sådana nischer i tarmen. Nischerna utformas av ECM, och viktigt i dem är: * ECM * Kemisk miljö * Faktorer som frisätts från nisch, ex. BMP, FGF, Wnt * Cell-cell-kontakter (Delta/Notch)

Answer 127

1. CPSF binder till polyA-signalen AAUAAA 2. CstF (Cleavage stimulatory factor) binder till den GU-rika sekvens som ska klippas bort 3. Endonukleas klyver mRNA vid polyA-site CA 4. PolyA-polymeras PAP adderar ca 200-250 A till 3'-änden 5. PolyA-binding protein PBP binder till polyA för att stabilisera mRNA Ibland kan det finnas flera polyA-siter vilket möjliggör alternativ polyadenylering. Antikroppar som ska binda till membranet måste använda en stark polyA-site. Om antikropparna ska utsöndras kan de använda en svagare site.

Answer 128

* capping * splicing * polyA

Answer 129

Mitokondrien släpper ut cytokrom-C i cytosolen. **Cytokrom-C** binder till adaptorproteinet **Apaf-1** och bildar en **apoptosom**. Apaf-1 i apoptosomen rekryterar **prokaspas 9** som klyvs och aktiveras. **Kaspas 9** klyver och aktiverar prokaspas 3 till **kaspas 3** som utför själva apoptosen. Den inre apoptosvägen regleras av Bcl2-proteiner som kontrollerar utsläppet av cyt-c.

Answer 130

Gener som (oftast) har förlorat sin förmåga att koda för proteiner, och inte längre är aktiva i cellens livsprocesser. De innehåller samma element som funktionella gener, men betraktas som inaktiva.

Answer 131

Polymerase Chain Reaction. Amplifierar DNA med hög specificitet och känslighet, används inom klinisk diagnostik, rättsmedicinska analyser mm. Tre huvudsteg: 1. **Denaturering**. DNA-strängarna separeras vid 95°C. 2. **Annealing**. Vid en lägre temperatur, ca 57°C, binder primers in till varsin sträng. 3. **Elongering**. Vid ca 72°C bygger polymeras en ny DNA-sträng som är komplementär till templatet. Detta upprepas \>20 gånger; varje gång fördubblas mängden DNA.

Answer 132

1. **Ras** - cellproliferation, neuronal differentiering, celltransformation 2. **Rab** - intracellulär vesikeltransport 3. **ARF** - intracellulär vesikeltransport 4. **Ran** - nukleär transport 5. **Rho** - reglering av aktincytoskelettet och cellmigration

Answer 133

* Endocytos vid cellmembranet * Mognad av sekretoriska vesiklar * Transport till lysosom från Golgi

Answer 134

1. DNA-polymeras 2. Deoxynukleosid-trifosfater (dATP, dCTP, dGTP, dUTP) 3. 5' till 3' 4. Via basparning till en templatsträng (A-T, G-C)

Answer 135

Genom vissa mutationer, t.ex. nonsense, frame shift eller när transkription inte kan initieras.

Answer 136

De kommer från den inre cellmassan i en blastocyst, och är pluripotenta. De kan differentieras i följande system: * embryon * teratom * embryonala kroppar och dedifferentieras: * in i blastocyst * i teratom * in vitro, embryonala kroppar * med transkriptionsfaktorer som åstadkommer pluripotens. Man stänger alltså av de gener som behövs för att differentiera cellen.

Answer 137

Kollagen IV, laminin, nidogen, perlecan mm. Finns i epitel, endotel, muskler, perifera nerver och fettceller.

Answer 138

Vascular endothedial cadherin, bildar homotypiska kopplingar mellan endotelceller och upprätthåller endotelets barriärfunktion. Binder till aktin i cytoskelettet via catenin.

Answer 139

miRNA står för posttranskriptionell reglering. När mRNA har bildats kan det t.ex. komma signaler till cellen om att det proteinet inte behövs; miRNA reglerar då hur mycket som translateras. Varje miRNA kan reglera flera olika mRNA.

Answer 140

De består av alfa- och beta-**tubulin**, och anläggs vid **MTOCs** (microtubuli organzing centers) såsom centrosomer och basalkroppar. Plusändan finns vid cellkärnan och cellkortex, minusändan är mot centrosomen. Mikrotubuli * bestämmer cellens form * ger polarisering av cellen * transporterar organeller (mha kinesin och dynein) * bygger upp cilier * deltar i mitosen

Answer 141

1. **Vesikeltransport** 2. **Fri diffusion** via kärnporen 3. **Licensing**: Binder till **importin**, som kan guida proteinet genom kärnporen.

Answer 142

* **eIF4F-komplexet** * eIF4A, eIF4E, eIF4G * cap-bindande protein * **43S-preinitieringskomplexet** * 40S-subenheten * eIF2-GTP * initiator-tRNA * eIF1, 3 och 5

Answer 143

Ribosomen är en **proteinsyntesfabrik** bestående av **proteiner** och **rRNA**. Den är uppdelad i en stor subenhet (**60S**) och en liten (**40S**).

Answer 144

cAMP + ATP aktiverar PKA så det kan gå in i cellkärnan där det aktiverar **CREB**. CREB binder till CBP (CREB-binding protein) som är en transkriptionsfaktor: binder till ett *cAMP response element* på DNA, därigenom aktiverar den genen.

Answer 145

Cdk = **cyclin-dependent kinase**. Om Cdk inte är bundet till ett cyklin är det inaktiverat och har alltså ingen kinasaktivitet. **Cyklin/Cdk-komplex** aktiverar de enzymer som **driver cellcykeln framåt** och in i respektive cellfas (G1, S, G2, Mitos). De **inducerar nedbrytning av föregående fasers cykliner** i en negativ feedback-mekanism, vilket driver cellen in i nästa fas. Eftersom cyklinerna för respektive fas kontinuerligt bryts ner är fasövergångarna irreversibla.

Answer 146

Prolinhydroxylering är en kovalent OH-modifiering av prolin. Kan möjliggöra nya interaktioner och stabilisera proteinstrukturer. Påverkar t.ex. styrkan hos kollagenfibrer. Kan fungera som motiv för ubiquitinering och nedbrytning.

Answer 147

Lite odefinierat. Bindväv utgörs till största delen av ECM, men har **celler** (vita blodkroppar, fibroblaster, fettceller och plasmaceller) också. Fibroblasterna producerar kollagen och elastin.

Answer 148

Proteoglykaner är en speciell typ av kolhydratkedjor som är kovalent kopplade till serin. Består av en proteinkärna som GAGs (glykosaminoglykaner) är kopplade till. De är negativt laddade och drar till sig katjoner och vatten. Binder alltså vätska och bildar "gel-like support" vilket är viktning för stötdämpning men även för t.ex. huden: *turgor*.

Answer 149

I starka vävnader såsom ben och senor. Kroppens vanligaste protein!

Answer 150

Morulan och embryoblasterna kan kompensera för förändringar i antalet celler. Celler kan avlägsnas eller tillföras utifrån utan att embryot påverkas.

Answer 151

Ran-GTP-gradienten

Answer 152

**Topologically associating domains**, eller *self-interacting genomic region*. DNA-sekvenser inom en TAD interagerar oftare fysiskt med varandra än med sekvenser utanför denna TAD. Till exempel är flera av de gener som gör en hand till en hand inom en och samma TAD.

Answer 153

**Depurinering**, följt av **deaminering av cytosin** (blir då uracil). Vanligt är även **spontana oxidativa skador**, **hydrolytiska attacker** och **okontrollerad metylering**.

Answer 154

**Kontrollerad**, programmerad celldöd som svar på specifik signal eller skada. Skydd mot överväxt, vid remodellering av vävnad, funktionell adaption osv. Apoptos är **ATP-beoende** och styrs genom olika signaleringsvägar, främst aktiva dödssignaler eller avsaknad av överlevnadssignaler. 1. Cellskelettet kollapsar 2. Kärnan förtätas, cytoplasman mister sin form och skrumpnar (blebbing), DNA:t fragmenteras i kärnan som självdestrueras, splittras i småbitar 3. Cellen fragmenteras - apoptotic bodies - fagocytos

Answer 155

Pericyter är stödjeceller (tillsammans med glatta muskelceller) på utsidan av blodkärl. * stabiliserar blodkärl * påverkar utmognad, migration och överlevnad hos endotelcellerna * reglerar blodflöde * upprätthåller blod-hjärn-barriären Tillväxtfaktorn PDGF (platelet-derived growth factor) behövs för rekrytering av pericyter till kärlen. PDGF uttrycks av endotelceller, och kan binda heparansulfat.

Answer 156

Hjärnans ventriklar är beklädda med ependym. Stamcellerna ligger precis ependymet, och kan bilda både neuroner och gliaceller.

Answer 157

Calcineurin är ett proteinfosfatas som stimuleras av Ca/calmodulin, och som **stimulerar T-cellernas IL2-produktion** vid immunreaktioner. Genom att hämma calcineurin med t.ex. **cyklosporin** dämpas även immunsvaret, dvs **immunsuppression**.

Answer 158

Hjärtmissbildningar, neuralrörsdefekter

Answer 159

Genom **molekylär kloning**, **PCR** eller framställning via **syntetisk biologi** (konstruktion från syntetiska DNA-strängar).

Answer 160

Small nuclear RNA. Viktig i många processer i kärnan, bl.a. splicing av pre-mRNA (ingår i spliceosomen).

Answer 161

Elastin ger vävnader elasticitet. Omges av mikrofibriller. Elastin polymeriserar till elastiska fibrer genom * bindning till mikrofibriller * korsbindning mha lysyloxidas Finns i artärer, lunga, hud, ligament, elastiskt brosk. Elastinfibrer bildas embryonalt och tidigt efter födseln. Inga nya elastinfibrer bildas hos vuxna, förutom vid skada. Omsättningen är långsam, ca 70 år. Elastinfibrerna åldras, vilket bidrar till lösare hud, stelare kärl, emfysem, svagare ligament.

Answer 162

Bildning av primitivstrimman Formation av neurallisten Bildning av hjärtklaffarna

Answer 163

O-glykosylering sker i **golgiapparaten**. En oligosackarid kopplas då till aminosyran **serin** eller **treonin**. Fler sockermolekyler kan sedan binda till den.

Answer 164

Proteinet själv hydrolyserar GTP till GDP, vilket gör att proteinet inaktiveras.

Answer 165

M-cyklin aktiverar Cdk som stimulerar inträde i mitosen i G2/M-övergången. Nivåerna sjunker halvvägs genom mitosen. M-Cdk aktiverar följande processer via fosforylering: * Kromosomkondensation (kondensin) * Kärnmembranets upplösning (nukleoporin, lamin) * Spolkroppens bildande (MTOC)

Answer 166

**Spermatogenes**: 1. **Mitos**: **Spermatogonier** delar sig till nya spermatogonier, typ A och B. Typ A stannar som spermatogonie, medan typ B kallas för **primär spermatocyt** och går in i meios I. *1 cell med 46 kromosomer* går alltså vidare. 2. **Meios I**: De primära spermatocyterna genomgår meios I och blir till **sekundära spermatocyter**. *Resultatet blir 2 celler med 23 kromosomer*. 3. **Meios II**: De sekundära spermatocyterna blir **spermatider**. *Vi har nu 4 celler med 23 kromatider* (halva kromosomer). **Spermiogenes** Efter meiosen ska spermatiderna mogna och genomgå metamorfos i testes och epididymis, de blir då spermatozoer. Spermiogenesen har fyra faser: * Golgifasen * capfasen * akrosomfasen * mognadsfasen

Answer 167

Den består av * **macula densa**: mörkare celler vid distala tubuli som känner av flödeshastighet och salthalt * **juxtaglomerulära celler** * **Laci's celler**; extraglomerulära mesangieceller, producerar IL-1 och PDGF

Answer 168

Den förstärker den transkriptionella aktiviteten. Innehåller liknande regulatoriska DNA-element som promotorn, men kan ligga långt ifrån TATA-boxen.

Answer 169

Det skyddar 5'-änden mot nedbrytning, underlättar transport till cytoplasman och underlättar translation av mRNA.

Answer 170

Bcl2, BclX

Answer 171

**Start- och stopp-transfersekvenser** startar och stoppar polypeptidkedjans slingrande ut och in genom ER:s translokationskanal. Start- och stopp-sekvenserna är **hydrofoba** och fastnar därför i membranet. Genom flera start-stopp kommer proteinet att passera flera gånger genom membranet, som t.ex. G-proteinkopplade receptorer. **Signalpeptidas** klyver bort signalsekvensen när translokationen är klar. Om C- eller N-terminalen hamnar inne i ER beror på **förekomst av positiva aminosyror**. Positivt = mot cytosolen.

Answer 172

1. Leucine-zippers 2. Helix-loop-helix 3. Helix-böj-helix 4. Homeodomänproteiner 5. Zinkfinger

Answer 173

Kluven rygg: ryggmärgen och ryggmärgshinnorna är intakta men kotorna är felaktiga eller fattas, så det bildas ett **ryggmärgsbråck**. * **Spina bifida occulta** är "dolt"; mjuk fläck på ryggen men det syns inte. * **Meningocele**: Hinnorna buktar ut * **Myelomeningocele**: Hinnor och ryggmärg buktar ut. **Neuralrörsdefekt**.

Answer 174

Somiter, som differentieras till sklerotom, myotom och dermatom.

Answer 175

**Elektrokemiska gradienten = koncentration + membranpotential.** Påverkar transport av laddade ämnen, både aktiv och passiv. **Na-gradienten** används för att ta in näringsämnen i cellen, används även för att reglera cellens pH och transportera Ca. **K-gradienten** i kombination med K-kanaler är grunden till cellernas vilopotential.

Answer 176

Processade (ca 8000) Icke-processade (ca 4000) Inaktiverade gener (ett fåtal) **Processade pseudogener** saknar introner, och har en poly-A-svans.

Answer 177

**DNA: Adenin, Thymin, Guanin, Cytosin.** **RNA: Adenin, Uracil, Guanin, Cytosin.** A och G är **puriner**, dvs har två ringar. U, T och C är **pyrimidiner** och har bara en ring. Nukleotiderna är uppbyggda av en **kvävebas + sockerfosfat**. Sockret är ribos/deoxyribos. A paras ihop med T/U via två vätebindningar. G paras ihop med C via tre vätebindningar.

Answer 178

1. Retrovirus tränger in i en värdcell och förlorar sitt virushölje. 2. Reverst transkriptas skapar cDNA från virusets RNA 3. Integras stoppar in virus-DNA i cellens DNA 4. När DNA transkriberas produceras virusets protein av värdcellen

Answer 179

Monomer - dimer - tetramerer på rad = ett **protofilament** (4 monomerer) Två protofilament = en **protofibrill** (8 monomerer) Tre-fyra protofibriller = ett **intermediärt filament** (ca 24-32 monomerer) Alltså. IF byggs upp av protofibriller som byggs upp av protofilament som byggs upp av monomerer.

Answer 180

I en **ostimulerad cell** är koncentrationen ca **0,1 µM**. Vid **stimulering** stiger den till **1-10 µM**. Den låga koncentrationen i cytoplasman gör att det behöver tillföras väldigt lite Ca för att ge en stor koncentrationsförändring.

Answer 181

* Typ I: Finns i epitel, hårda eller mjuka, heterodimeriseras med typ II och bildar då keratiner * Typ II: Finns i epitel, hårda eller mjuka * Typ III: Desmin (muskel), gliafilament (astrocyter), vimentin (fibroblaster), periferin (nervaxoner) * Typ IV: Neurofilament (nervceller) * Typ V: Laminer (i kärnan)

Answer 182

Ryanodinreceptor 1, RyR-1, aktiveras av konformationsförändring i spänningsstyrda Ca-kanaler i skelettmuskulatur. RyR-2 behövs för **hjärtmuskelkontraktion**. Kalcium kommer in i ventrikelcellen genom spänningsstyrda Ca-kanaler och aktiverar RyR-2 på ER-membranet, vilket leder till ytterligare kalciumfrisättning = calcium induced calcium release.

Answer 183

RNA är **instabilt** i vattenlösning.

Answer 184

1. Intron retention (intronet blir kvar) 2. Exon skipping (exon råkar klippas bort) 3. Activation of cryptic splice site/donor site (splicing startar eller slutar på fel ställe)

Answer 185

* **Survive** * **Grow + divide** * **Differentiate** * **DIE** Svaren kan vara både snabba (konformationsändring) och långsamma (genreglering/transkription).

Answer 186

Det är när både receptor och ligand finns inuti cellen. Finns i cancerceller, och är extremt svårbehandlat.

Answer 187

miRNA transkriberas av **RNA-polymeras II**. Först bildas pri-miRNA. **Drosha** (ett RNAse som verkar på dubbelsträngat RNA) binder till **pri-miRNA** tillsammans med proteinet **DGCR8** och klyver bort ändarna på pri-miRNA så det blir till **pre-miRNA**. **Exportin 5** exporterar pre-miRNA ut ur kärnan. I cytoplasman binds pre-miRNA av **TRBP** (tar binding protein) och RNAset **Dicer**. Dicer klyver pre-miRNA så det bildas ett **dubbelsträngat miRNA-duplex**: 21-23 baser med 2 oparade nukleotider på varje ände. Den ena strängen binder till proteinet **argonaute** och bildar därmed **RISC** (RNA-induced Silencing Complex). RISC binder till 3'-UTR på mRNA. En svag inbindning leder till translationell inhibering, en stark bindning leder till klyvning av mRNA.

Answer 188

P-bodies är *cytoplasmic RNA processing bodies,* dvs specifika områden i cytoplasman där RNA bryts ner. Hit kommer **mRNA** som har **RISC-komplex** bundet till sig. P-bodies innehåller **decapping enzymes**, som tar bort 5'-cap från mRNA, och **5'-3'-exonukleaser** som bryter ner RNA.

Answer 189

**miRNA** bundet till **argonaute**. Det binder till 3'-UTR på mRNA.

Answer 190

* Fullbordan av implantation, bildning av bilaminärt embryo * Trofoblaster blir till cytotrofoblaster och syncytiotrofoblaster * Embryoblaster blir till epiblaster och hypoblaster * Amnion och amnionhålan samt primära gulesäcken bildas. Implantationen är nu klar (ca dag 9) * Korion och korionhålan bildas * Definitiva gulesäcken bildas, den primära tillbakabildas * Häftstjälken utvecklas och fäster embryot vid korion

Answer 191

Det är olika typer av mutationer. Nymutationer sker hela tiden, de flesta vid replikationen. Spermier har fler mutationer än äggceller eftersom de har genomgått fler celldelningar. Somatiska variationer är s.k. *de novo-mutationer*, som vi alltså inte har ärvt från våra föräldrar. Variationerna kan vara heterozygota eller homozygota, dvs finnas på en eller båda kopiorna av de två homologa kromosomerna.

Answer 192

M-Cdk bildas och aktiveras om allt DNA har replikerats färdigt och ATR/ATM inte är aktiva - dessa aktiverar Chk som hämmar Cdc25. Cdc25 är viktigt för att motverka den negativa fosforyleringen av M-Cdk som utgörs av Wee1.

Answer 193

Splicing activator-proteiner binder till enhancers och ökar splicing Splicing repressor-proteiner binder till silencers och förbindrar splicing Vissa sjukdomar (t.ex. Spinal Muscular Atrophy) beror på splicingfel - en mutation kan göra så aktivatorproteinet inte kan binda till mRNA vid ett visst exon vilket gör att det exonet skippas vid splicingen, då kan man använda AONs (små, syntetiska RNA- eller DNA-molekyler) som blockerar repressorn från att binda till mRNA, splicingen blir rätt och genen blir stabil och komplett.

Answer 194

Katalyserar **defosforylering** - en fosfatgrupp spjälkas bort.

Answer 195

* Öppning av Ca-kanaler i **plasmamembranet** * Öppning av Ca-kanaler i **intracellulära förråd**, särskilt i ER Kanalerna kan vara **spänningsstyrda**, **ligandstyrda** eller **mekaniska**. **NMDA-receptorn** är ett exempel på en ligandstyrd kalciumkanal. Den är en glutamatreceptor som är betydelsefull för inlärning. Finns i CNS, orsakar hjärnskada vid bl.a. stroke. Ketamin (narkosmedel) är en NMDA-receptorantagonist.

Answer 196

Diverse funktioner i cellen, inklusive telomer-syntes, inaktivering av x-kromosom, proteintransport in i ER.

Answer 197

Cellnivå: * Cellförankring * Anti-apoptos * Cellproliferation * Cellmigration * Matrix-deponering Organismnivå: * Morfogenes * Koagulation * Immunförsvar * TGF-β-aktivering

Answer 198

**Acetylering** -\> gen aktiv **Metylering** -\> gen avstängd De får dock lite olika effekt, framför allt metylering, beroende på var modifieringen sker.

Answer 199

Från uterus och utåt: * Pars uterina * Istmus * Ampulla * Imfundibilum * Fimbrier * *Ser väldigt mycket ut som en arm, börjar vid axeln (pars) och avslutas med fingrarna (fimbrierna)*. Tre lager: * **Mucosa + lamina propria**. Två celltyper i epitelet: Cilierade celler (stimuleras av östrogen) och PEG-celler (ger näring till ägget, stimuleras av progresteron). * **Muskellager** (inre cirkulärt, yttre longitudinellt) * **Serosa peritoneum** (mesotel)

Answer 200

* **Aktivering genom membrantranslokation.** Genom att binda till PIP-receptorer kommer de åt membranet och kan reagera med lipiderna där. * **Aktivering genom konformationsändring.** Påverkas av protein-protein-interaktionen som har så hög affinitet att molekylerna kommer så nära varandra att de påverkas i sin veckning → förändring i aktivitet. * **Aktivering genom tyrosinfosforylering.** Signalmolekylen binder in till ett enzym och påverkas → förändringar i konformation och laddning.

Answer 201

Det måste ringslutas, detta skyddar mot mRNA-nedbrytning.

Answer 202

Transcytos sker när en återvinningsendosom skickar tillbaka återvunna receptorer till en annan del av plasmamembranet än de ursprungligen kom ifrån - de skickas alltså *genom cellen*.

Answer 203

* Aggrecan - finns i brosk * Versican - finns i många vävnader * Neurocan - finns i hjärnan * Brevican - finns i hjärnan

Answer 204

*Epigenetik är cellulär information som påverkar genuttryck, utöver själva DNA-sekvensen, och som ärvs från modercell till dotterceller vid celldelning.* Epigenetik förknippas med **kromatinstruktur** och **kromatinmodifieringar**, t.ex. metylering av C i DNA.

Answer 205

tRNA ser ut som en treklöver, och längst ut på "bladet" finns ett antikodon som parar med kodon i mRNA.

Answer 206

_Bcl2-proteiner_: **Bax**, **Bak** _BH3-proteiner_ (tillhör också Bcl2-familjen, men har bara BH3-domänen): **Bad**, **Bim**, **Bid**, **Puma**, **Noxa** Dessa fungerar främst genom att hämma de anti-apoptotiska Bcl2 och BclX, så Bax och Bak kan få fäste på mitokondriens yta.

Answer 207

På den främre delen av groddplattan. Det har en hästskoform (cardiac crescent), och hör ihop med det laterala mesodermets splankniska blad, där kärlen bildas.

Answer 208

IAP = Inhibitors of apoptosis **IAPs** ska förhindra att cellen dör felaktigt genom att se till så kaspas bara aktiveras när de ska, men kan även användas av virus som vill förhindra att den cell som viruset har infekterat tar död på sig själv. **anti-IAPs** är **Smac/Diablo** och **Omi**, de förhindrar alltså att apoptos förhindras.

Answer 209

Transkription regleras genom inbindning av genreglerande protein till DNA. Dessa kan vara aktiverande eller inhiberande.

Answer 210

* Snail 1 * Snail 2 (Slug) * ZEB 1 och 2 * Twist 1 och 2 TGF-β är en tillväxtfaktor som finns utanför cellen, och den ger en av de viktigaste signaleringsvägarna.

Answer 211

Cancerceller vill gärna in i blodkärlen så de kan spridas runt i kroppen via blodet. De intravaserar med hjälp av makrofager som äter sig igenom kärlväggen och drar med sig cancercellerna. Cancerceller migrerar gärna kollektivt; de håller ihop med e-cadherin ("kompisar efter baren"). När de ska extravasera tar de hjälp av blodplättar som aggregeras runt cancercellen så den stannar upp och fastnar i kärlväggen istället för att åka vidare. TGF-β binder då till en receptor och signalerar via SMAD, blodplättarna binder också till cellen och signalerar via NFkB. Resultatet blir EMT och migration.

Answer 212

Den hålls låg av flera olika transportörer: * **Ca-ATPas** * **Na/Ca-exchanger** * **SERCA** (det sarko-endoplasmatiska retiklets Ca-ATPas)

Answer 213

* **SH2** - fosfotyrosin + C-terminala aminosyror * **SH3** - prolinrika sekvenser * **PTB** - fosfotyrosin + N-terminala aminosyror * PH (**Pleckstrin homology**) - fosfolipider En signalmolekyl kan bestå av flera olika interaktionsmotiv i olika ordning.

Answer 214

Katalyserar **fosforylering** på aminosyror eller lipider.

Answer 215

Topoisomeras snurrar upp DNA:t. DNA-strängarna separeras av DNA-helikas. RNA-primer binder till lagging strand, okazakifragment bildas. DNA-polymeras syntetiserar DNA.

Answer 216

Den ökar, så antikroppar och immunceller snabbt ska komma till vävnaden från blodet. Histamin och bradykinin aktiverar PI3K - Akt - eNOS som ger NO, NO ger vasodilation och öppnar junctions.

Answer 217

Tillväxtfaktorer

Answer 218

* **Gated** - kärnporskomplexet * **Transmembrantransport** * **Vesikulär** transport

Answer 219

1. Silent (synonymous) 2. Missense (non-synonymous) 3. Nonsense (stop)

Answer 220

**Konstitutiv**: Alla exoner är med **Alternativ**: Selektivt urval av exoner

Answer 221

Lysosomer är cellens **nedbrytningstationer**, de innehåller **hydrolytiska enzymer** som bryter ner makromolekyler. pH-värdet är lågt, ca 4,5-5. Nedbrytningsprodukterna från lysosomen återvinns.

Answer 222

**Fosfoinositider**. Fungerar som "adresslappar" genom att huvudgrupperna i PIPs känns igen av olika proteinligander, vilket ger identitet till olika membrandomäner. PIPs modifieras av **PI/PIP-kinas** (fosforylerar t.ex. PIP2 till PIP3) och **PIP-fosfatas** (gör t.ex. PIP3 till PIP2 och PIP2 till IP3+DAG)

Answer 223

Ligandoberoende aktivering av receptorn, okontrollerad signalering.

Answer 224

* Gulegången är ansluten till mittarmen, och normalt sett tillbakabildas den helt. * Om tillbakabildningen störs bildas en divertikel, cysta eller fistel på tunntarmen bestående av **rester av gulegången**. Detta kallas Meckel's divertikel. * Inflammation eller annan komplikation i divertikeln (tarminnehåll kan t.ex. komma ut genom naveln) ger appendicit-liknande symtom. * Vanligare hos pojkar.

Answer 225

En multivesikulär kropp = vesikel med vesiklar i sig. En endosom har mognat, invaginerats och fått intralumenala vesiklar.

Answer 226

* **Hjärna**: Lungor, bröst, hud, njurar, kolorektalt * **Lungor**: Njurar, kolorektalt, hud, bröst, ben * **Lever**: Kolorektalt, pankreas, bröst, lungor, mage * **Ben**: Bröst, lungor, prostata, njurar, kolorektalt * **Bröst**: Ben, lungor, hjärna, lever Metastasering är en långsam och organspecifik process, som tar olika lång tid beroende på var modertumören sitter.

Answer 227

**mRNA**, snRNA, snoRNA, miRNA

Answer 228

Mesodermal stamcell - hemangioblast - angioblast - endotelcell

Answer 229

En **venshunt** **genom levern** för att syrerikt blod ska komma från navelsträngen till hjärtat. Efter födseln tillbakabildas ductus venosus och ger då upphov till **ligamentum venosum** i levern.

Answer 230

* Gastrulationen börjar kaudalt: epiblastceller genomgår EMT och vandrar ner via primitivstrimman. * Hypoblasten trängs undan av epiblastceller och **endoderm** bildas. Fortsatt epiblastvandring via primitivstrimman ger **mesoderm**. Kvarvarande epiblast ger **ektoderm**. * Ektoderm och mesoderm regionaliseras rostro-kaudalt resp. medio-lateralt * Ektoderm delas upp i yt- och neuroektoderm. * Mesodermet bildar kordan * Neuralrör bildas, vilket ger CNS

Answer 231

**LINE : Long interspersed nuclear elements** **SINE : Short interspersed nuclear elements**, ex. ALU-repeats, som är den vanligaste sortens transposon och består av korta DNA-sekvenser. SINEs kallas även "selfish or parasitic genes" eftersom deras enda funktion är självreproduktion. **LTR : Long terminal repeat transposable elements** Allt detta är olika klasser av repetitiva element som finns i många kopior, ofta inte funktionella.

Answer 232

**Myc**/Max AP1 (**fos**, **jun**) De stimulerar transkription av hundratals *delayed response-gener*. *Den första signaltransduktionen tar mindre än fem minuter, den tidiga förändringen i genuttryck då Fos, Jun och Myc aktiverar senare gener tar 15 till 60 minuter. Dessa sena gener uttrycks sedan efter 4 till 6 timmar.*

Answer 233

Utifrån och in: * Germinalepitel * Tunica albuginea * Cortex (med primordialfolliklar) * Medulla (med resten av folliklarna, kärl och nerver)

Answer 234

1. **Cargoreceptor** i membranet fångar upp cargomolekyler med sin extracellulära domän 2. **Adaptorproteiner** på membranets insida binder till cargoreceptorns intracellulära domän, **knopp** bildas. 3. **Klatrin** binder till adaptorproteinet 4. Vesikeln knoppas av med hjälp av **dynamin** 5. Höljet släpper

Answer 235

Oönskade proteiner och organeller förstörs via **autofagi**: 1. Proteinkinaser aktiveras och signalerar till det autofagala maskineriet att det är showtime 2. Membranvesiklar samlas ihop på en uppsamlingsplats och bildar en autofagosom 3. Membranet runt autofagosomen sluts 4. Autofagosomen fuserar med en lysosom med hjälp av SNAREs 5. Autofagosomens membran och innehåll bryts ner i lysosomen Om det är gamla mitokondrier som bryts ner på detta sätt kallas det **mitofagi**. **Fagocytos** är när mikroorganismer och döda celler bryts ner på det här sättet i makrofager och neutrofiler.

Answer 236

1. 5'-ändarna vid brottet bryts ner av nukleas 2. Strängutbyte sker (complementary base-pairing) 3. Branch migration. DNA-syntes sker. 4. Den invaderande strängen lossnar, dubbelhelix återformas. 5. DNA-syntes sker med strängar av skadat DNA som templat. 6. Ny ligering.

Answer 237

* **Mikrofilament** - aktin. Tvinnade, flexibla helixar * **Intermediära filament** (fem olika typer). Repliknande, stabila * **Makrofilament** - myosin * **Mikrotubuli** - dynein, kinesin, tubulin. Som rör: Långa, raka, ihåliga

Answer 238

**Syrebärande hemoglobin** är ett exempel på en genfamilj som finns i alla ryggradsdjur (homolog). Utvecklades från en enkel globinmolekyl via genduplikation till det hemoglobin med fyra subenheter som vi har idag.

Answer 239

Individens utveckling, delas upp i prenatal och postnatal.

Answer 240

Hydrofob sekvens, 8-12 aminosyror lång, ofta N-terminalt placerad.

Answer 241

Det är ett sätt för en och samma gen att uttryckas på olika sätt, beroende på vilken sorts cell den finns i. Exempel: * optional exon * optional intron * mutually exclusive exons * internal splice site

Answer 242

Fibronektin är ett adhesionsprotein, en dimer som hålls samman av disulfidbryggor. Fibronektinpolymerisering regleras av celler och kräver * integrinbindning * RhoA-aktivitet * myosin-dragning

Answer 243

* **Totipotent** - befruktat ägg, kan bli allt inkl. placenta * **Pluripotent** - embryonala stamceller, kan bli allt utom placenta * **Multipotent** - ex. hematopoetiska stamceller, kan bli många olika sorters celler inom en viss familj * **Unipotent** - ex. stamceller i epitel, kan bara bli en typ av celler.

Answer 244

* alternativ splicing * RNA editing * RNA-transport genom kärnmembranet * reglering av RNA-nivåer med hjälp av miRNA, piRNA och siRNA (små, ickekodande) * mRNA-stabilitet

Answer 245

En **cirkulär, dubbelsträngad DNA-molekyl**. DNA:t innehåller **13 proteinkodande gener** och ca **24 gener som ger tRNA och rRNA**. Det innehåller **inga introner** alls. Mitokondrie-DNA ärvs alltid från mamman, eftersom spermiens mitokondrier bryts ner under fertiliseringsprocessen.

Answer 246

1. Felveckade proteiner i ER signalerar att det behövs fler ER-chaperoner. De binder till, och aktiverar, **transmembrankinaset IRE1**. 2. Det aktiverade kinaset släpper lös en **endoribonuklas**-aktivitet. 3. Endoribonukleaset klyver vissa specifika RNA-molekyler (xBP-1) och skapar aktivt mRNA som translateras till transkriptionsfaktorn **xBP1**. 4. xBP1 går in i kärnan och aktiverar gener för ER-chaperoner såsom **BIP**. 5. Chaperonerna translateras i ER, och hjälper sedan till att vecka proteiner.

Answer 247

Huvudregulator är **APC/C**, ett ubiquitinligas som katalyserar ubiquitinering och nedbrytning av **securin**, **S- och M-cyklin**. Securin måste brytas ner för att systerkromatiderna ska kunna separeras. När cyklinerna bryts ner inaktiveras i princip allt Cdk i cellen, och alla proteiner som har fosforylerats av Cdk under cellcykeln defosforyleras av olika fosfataser i anafas-cellen. *Utan denna defosforylering kan inte M-fasen avslutas*. APC/C är sedan aktivt genom M- och G1-fasen, för att stängas av när GI/S-Cdk aktiveras i sen G1.

Answer 248

* **myeloida** (granulocyter, monocyter) * **lymfoida** (B- och T-celler) * **erytroida** (erytrocyter, blodplättar)

Answer 249

De är * långa * raka * starkt negativt laddade * repeterande disackarider De har en funktionellt heterogen grupp. Exempel: Aggrecan binder vatten Decorin reglerar kollagenfibrillers tjocklek Syndecan är coreceptor för bl.a. FGF

Answer 250

1. Ligand binder till RTK, receptorn fosforyleras och aktiveras. 2. GRB2 binder till fosfotyrosin på receptorn med sin SH2-domän. 3. SH3-domänen på GRB2 binder till prolinrika sekvenser på SOS (Ras-GEF). 4. SOS byter GDP på Ras till GTP, Ras aktiveras. 5. Ras → Raf → Mek → Erk → förändringar i proteinaktivitet eller genuttryck

Answer 251

* *Heterokromatin**: - Konstitutivt: Alltid packat. Innehåller inga gener, används inte. - Fakultativt: Packat, innehåller gener, används ibland. **Eukromatin**. Öppet, innehåller gener, används alltid. Packningsgraden av kromosomer (kromatin) varierar under cellcykeln.

Answer 252

- Inbindning av **proteiner** till DNA och histoner - **Kemiska modifieringar** av histoner och DNA - **3D-organisation** i kärnan

Answer 253

1. **Profas II**: Centrosomen delar sig i två, vandrar till varsin pol och bildar en spolkropp av mikrotubuli. 2. **Metafas II**: Kromosomerna radar upp sig i ekvatorialplatta, mikrotubuli fäster vid kromosomernas centromer. 3. **Anafas II**: Kromosomerna splittas i två genom att kohesinringarna i centromererna klyvs, kromatiderna går mot varsin pol. 4. **Telofas + Cytokines II**: En ny cellkärna börjar bildas runt kromosomerna och cellen genomgår cytokines. De nya cellerna har nu en haploid uppsättning kromosomer, dvs bara en kopia av varje kromatid.

Answer 254

* **Homologer**: Alla gener som är relaterade till varandra via härkomst. * **Paraloger**: Relaterade gener med divergent funktion, vilka uppstått via genduplikation (även inom samma genom). * **Ortologer**: Gener med samma funktion i två olika arter med gemensam senaste förfader.

Answer 255

Cellen fäster på ECM via **integrin**. Intracellulärt fäster aktinfilament på proteiner vilket ger stressfibrer som projicerar in mot cellens cytoplasma.

Answer 256

Spolkroppen består av * MTOC (centrosom) * polära och kinetokor-mikrotubuli * aster * ekvatorialplatta * motorprotein (dynein, kinesin)

Answer 257

Aktinfilament inuti cellerna binder till β-catenin intracellulärt. β-catenin i sin tur binder till e-cadherin som går extracellulärt och håller ihop cellerna.

Answer 258

Proteiner som ska brytas ner märks med en ubiquitinkedja. Tre enzymer är nödvändiga: **E1** - ubiquitin-aktiverande enzym **E2** - ubiquitin-konjugerande enzym **E3** - ubiquitinligas Ubiquitin aktiveras genom att binda till E1, och förs sedan över till E2 (E1 släpper). E3 binder E2/ubiquitin, och sedan till specifika nedbrytningssignaler på proteiner. E2 lämnar ifrån sig ubiquitinet som fäster på proteinet istället. E2 och E3 dissocierar då från proteinet. Detta upprepas flera gånger tills en hel ubiquitinkedja sitter på proteinet.

Answer 259

**eIF2-fosforylering**. Fosforylerat eIF2 binder starkt till eIF2B, och är då inaktiverat. Det fosforyleras av bl.a. PERK, men även många andra serinkinaser. Så länge eIF2 är fosforylerat kan translation inte ske.\*\*\* **eIF2-GTP** finns i 43S-preinitieringskomplexet**,** **bundet till det tRNA som ska binda till startkodonet** (Met). När Met-tRNA har funnit startkodonet **måste eIF2-GTP släppa från tRNA** så translationen kan börja. Detta görs genom att **eIF5 hydrolyserar eIF2-GTP till eIF2-GDP+Pi**. För att nästa translationsinitiering ska kunna ske måste eIF2-GDP göras om till eIF2-GTP igen, detta görs av **eIF2B som är en GEF**. \*\*\*mycket oklart vad som defosforylerar eIF2 igen så translation kan ske. Wikipedia vet inte, men hos sjögurkor triggas defosforylering bl.a. av befruktning.

Answer 260

Förlust av apikal-basal polaritet. Epiteliala celladhesionsprotein byts ut mot mesenkymala

Answer 261

Morfogen, men även teratogen. Retinoider får ej användas 1-2 år innan graviditet. Kan ge ökad spontanabort, ökad missbildningsrisk: * storhjärnan saknar vermis * ansiktsskelettet blir asymmetriskt * hjärtmissbildningar * mental retardism Hämmar neurallistcellernas utveckling. Kan lagras länge i fettväv. Tre former: Retinol, retinal och retinsyra, den sistnämnda är mest teratogen.

Answer 262

DNA, RNA, protein, posttranslationellt modifierat protein. Man påvisar dem med hjälp av specifika **affinitetsreagens** som binder till rätt molekyl (komplementära DNA-strängar, antikroppar), eller genom **identifiering av sekvensen av dess byggstenar** (nukleotid- eller aminosyrasekvens).

Answer 263

Mannos-6-fosfat

Answer 264

**Calnexin** är en ER-chaperon som binder till **ofullständigt veckade proteiner** som har **en glukosmolekyl kvar** på sin oligosackarid, och håller kvar dem i ER. **Glukosidas** plockar bort en glukosmolekyl i taget från oligosackariden på glykosylerade proteiner. När bara en glukos finns kvar binder proteinet till calnexin. När även den är borta släpper proteinet från calnexin för att exporteras ut ur ER. **Glukosyltranferas** håller koll på om proteinerna är färdigveckade eller inte, genom att försöka addera en glukosmolekyl till oligosackarider som precis blivit av med sin sista glukos. Ett protein som inte är färdigt tar emot glukosen och fäster vid calnexin igen. När proteinet är färdigveckat tar det inte emot några nya glukosmolekyler, utan lämnar ER.

Answer 265

1. Deletion 2. Insertion 3. Duplikation 4. Inversion 5. Translokation Kan vara **obalanserad** (DNA har tillkommit eller förlorats) eller **balanserad** (DNA-mängden är densamma).

Answer 266

HIF1α är en transkriptionsfaktor för VEGF (vascular-endothelial growth factor). När det finns gott om syre (normoxi) kommer HIF1α att hydroxyleras. pVHL är ett protein som känner av det, och ubiquitinerar HIF1α så det bryts ner i proteasomen. När det finns ont om syre (hypoxi) kommer HIF1α att stabiliseras och stimulerar då genuttryck för VEGF. **Mycket syre → lite HIF1α → lite VEGF** **Lite syre → mycket HIF1α → mycket VEGF** Fel på VHL-proteinet gör att VEGF uttrycks och transkriberas trots att det redan finns gott om syre.

Answer 267

Wnt-vägen reglerar transkription av många gener, t.ex Myc. Wnt-signalering **aktiveras** genom **stabilisering av β-catenin**, som translokeras in i kärnan där det styr genreglering. Wnt-signalering **stängs av** genom **proteolys av β-catenin**.

Answer 268

* **Follikelfasen**: * Vid varje cykel startar mognaden av 10-15 primordialfolliklar, men bara en mognar ut helt medan de andra går i atresi. * **Primordialfollikeln** består av en primär oocyt omgiven av enskiktat skivepitel. I början av en cykel utsöndras **FSH**, som gör att oocyterna börjar utvecklas. En väljs ut och blir en **primärfollikel**. Skivepitelet blir kubiskt och oocyten omges nu av **cellmembran**, **zona pellucida**, **granulosaceller** och ett **basalmembran**. * En **sen primärfollikel** har även fått **thecaceller** på utsidan, och utvecklas vidare till en **sekundärfollikel** med **theca externa, theca interna, basalmembran, granulosaceller, antrum** (vätskefyllt hålrum) och **zona pellucida** utanpå oocyten. * Det sista steget är **Graafs follikel**. Inuti zona pellucida har nu **corona radiata** och **cumulus oophorus** utvecklats. * **Theca interna** tar upp LDL-kolesterol från blodet och bildar **androstendion**, som transporteras till **granulosacellen** där **aromatas** omvandlar det till **östrogen**. Östrogen stimulerar **LH** som stimulerar ägglossning, *ovulation*. * **Ovulationen** * Östrogen ger en peak av både LH och FSH vilket gör att follikeln brister och ägget släpps ut, det fångas upp av fimbrierna och förs till ampulla där det hoppas bli befruktat. Ägget har vid det här laget gått igenom meios I och inlett meios II, men **blir kvar i metafas II** tills befruktning skett. * **Lutealfasen** * De granulosa- och thecaceller som blir kvar i ovariet efter ovulationen bildar **corpus luteum**. Den nu tomma follikelns basalmembran bryts sönder och kärl växer in. Granulosacellerna omvandlas till **follikulära luteinceller**, theca interna blir **theca luteinceller**. * Corpus luteum producerar östrogen och progesteron i respons till FSH och LH. Om ingen befruktning sker tillbakabildas corpus luteum, kvar blir **corpus albicans**, ett vitt "ärr".

Answer 269

Cis, medial, trans Cis är närmast ER, trans längst ut.

Answer 270

Ospecifik vävnadsskada ger **ATP-brist** i cellen, vilket gör att **jonpumparna** i plasmamembranet **slutar fungera**. Cellen **fylls med vätska** eftersom den är full av proteiner så vätska kommer in via osmos. Till slut spricker membranet - cellen **sprängs**. Innehållet sprids och ger inflammation, vilket är skadligt för kroppen.

Answer 271

Signalering kategoriseras utifrån ligandens ursprung; avstånd mellan signalerande cell och målcell. Det finns fem typer: 1. **Kontaktberoende**. Cellerna är i direktkontakt. 2. **Parakrin**. Närliggande celler. 3. **Autokrin**. En och samma cell uttrycker både ligand och receptor. 4. **Synaptisk**. Neurotransmitter, genom axon. 5. **Endokrin**. Liganden transporteras via blodet.

Answer 272

* Artärer * gälbågsartärer * dorsal aorta * vitellinartärer (gulesäcks-) * navelsträngsartärer * Vener * kardinalvener (övre/undre) * vitellinvener * navelsträngsvener

Answer 273

* Signalmolekyl binder till GPCR * Beta/gamma-enheten aktiverar PLC-beta (fosfolipas) * PLC-beta hydrolyserar PIP2, som klyvs till IP3 och DAG. * IP3 binder till IP3-gated kalciumfrisättande kanal i ER-membranet, så den öppnas * Kalcium frisätts ur ER-lumen och aktiverar PKC (proteinkinas C) som binder till DAG i plasmamembranet.

Answer 274

**Export och nedbrytning av felveckade protein** från ER. Proteinerna binder först till chaperoner, exporteras till cytosolen via translokatorkomplex, deglykosyleras, polyubiquitinyleras, och bryts ner i proteasomen.

Answer 275

Den reglerar cellöverlevnad. 1. Överlevnadssignalmolekyl binder till RTK som fosforyleras och aktiveras 2. Aktiverat (fosforylerat) PI3K binder till TK och fosforylerar PIP2 till PIP3 3. PDK1 och Akt binder till PH-domäner på PIP3 4. Akt fosforyleras och aktiveras av PDK1 och mTOR 5. Akt dissocierar från PIP3 och fosforylerar Bad, som har bundit ett inaktivt apoptoshämmande protein. När Bad fosforyleras släpper proteinet från Bad - proteinet blir aktivt och hämmar apoptos, Bad blir inaktivt.

Answer 276

Modifieringarna kan påverka proteinernas * stabilitet (ubiquitinering, SUMO) * lokalisering (lipidering/fosforylering) * veckning (prolinhydroxylering) * aktivitet (fosforylering, proteolys)

Answer 277

Tight junctions Desmosomer Adherens junctions Gap junctions

Answer 278

ENU = etyl-nitroso-urea, en **potent mutagen**. Den överför en etylgrupp till nukleofila platser på kvävebaserna, oftast A eller T, vilket leder till muterade proteiner (missense är vanligast) vilket kan leda till sjukdom.

Answer 279

De består av fibrillin 1 och 2 + associerade proteiner. Har en strukturell roll, krävs för elastin-polymerisering till elastinfibrer. Reglerar aktivitet/tillgänglighet av TGF-β och BMP7.

Answer 280

* korda (ryggsträng) * paraxialt mesoderm * intermediärt mesoderm * lateralt mesoderm * somatiskt blad * splankniskt blad * kardiogent mesoderm Kordan bildas av centralt mesoderm och växer i mittlinjen under det blivande ektodermet fram till prekordalplattan - svalgmembranet. Fungerar som ett organiserande "center" som talar om var mitten av embryot är. Här kommer ryggraden så småningom att utvecklas.

Answer 281

* replikationsgafflar som stöter på skadade templat * V(D)J- och "class switch"-rekombinering i lymfocyter * joniserande strålning * strålningsrelaterade droger * topoisomeras-gifter * UV-strålning Om reparation av DSB misslyckas kan det sluta med **celldöd** eller **kromosomrearrangemang**. Mutation av DSB-reparationsenzym kan t.ex. leda till cancer.

Answer 282

Hjärtmissbildningar, septumdefekter Spina bifida Omphalocele Fetma är ett säkerställt humanteratogen!

Answer 283

**Akrosomen** innehåller enzymer - hyaluronidas och proteolytiska enzymer - som bryter ner äggets yttre skyddslager. Sitter som en störthjälm på spermiens huvud, utanpå vakuolen. **Flagellum** har tre huvudkomponenter: * ett centralskelett av mikrotubuli, kallas axoneme * ett tunt cellmembran som täcker axoneme * en samling mitokondrier i svansens "kropp"

Answer 284

* **Menstruation** * 4-5 dagar * Utblödning av stratum functionale. Kvar blir stratum basale med nedre delarna av körtelrören och spiralartärerna. * **Progesteronhalten går ned, prostaglandin går upp**. Det leder till kramp i blodkärlen - ischemi - blödning. * **Proliferationsfas** * 9 dagar * Ett nytt funktionellt lager växer till. Man ser rikligt med mitoser, körtelrören ökar i längd och blir mer veckade. Lamina propria blir mer ödematös. Stromaceller producerar matrix. Spiralartärerna växer till. * Regleras av **östrogen**, pågår fram till ägglossningen * **Sekretionsfas** * 14 dagar * Regleras av **progesteron** * Inväxt av spiralartärer. Sekretion av glykogen. Decidualceller delar sig i anslutning till kärlen, producerar näring till ett eventuellt kommande embryo.

Answer 285

Vanligtvis finns där en TATA-box ca 25-30 nukleotider uppströms om transkriptionsstarten, eller en initiator. CpG-islands är också vanliga.

Answer 286

1. Sar1-GEF rekryterar **Sar1** till ER-membranet 2. Sar1 rekryterar **adaptorprotein** **Sec23** och **Sec24** samt **cargoreceptorer** 3. **Coatproteinerna Sec13** och **Sec31** rekryteras. Dessa tillsammans med adaptorproteinerna (alltså: Sec 23, 24, 13 och 31) utgör **CopII:s** **höljeproteiner**. 4. Färdigveckade **proteiner med exitsignaler** fäster till cargoreceptorn 5. Vesikeln knoppas av med hjälp av **dynamin** 6. Höljet faller bort strax efter avknoppningen 7. Vesikeln transporteras längs **intracellulära filament** med hjälp av motorproteiner.

Answer 287

S-cyklin binder Cdk så snart cellen kommit in i S-fasen, och **stimulerar duplikation av kromosomerna**. S-cyklinnivåerna förblir höga ända till M-fasen, och bidrar också till att kontrollera vissa tidiga händelser i mitosen.

Answer 288

**Wee1** är ett proteinkinas som kan **fosforylera och därmed inhibera Cdk**. **Cdc25** är ett fosfatas som **defosforylerar** **och** **stimulerar Cdk**. De har alltså motsatt effekt.

Answer 289

1. **PCR** detekterar DNA/cDNA 2. **Sandwich** immunreaktioner för detektion av proteiner 3. **FISH** Fluorescent In Situ Hybridization för DNA och RNA 4. **Immunohistokemi** för antikroppsmedierad detektion av proteiner 1 och 2 görs i vätskefas; 3 och 4 är in situ dvs avbildningsmetoder.

Answer 290

Katalyserar utbyte av nukleinsyror: **GDP → GTP**

Answer 291

Modifierade histoner och metylerat DNA utgör bindningsställen för **repressor-proteiner**. Modifieringarna avgränsas av **barriärproteiner**.

Answer 292

Fetala endotelceller Basalmembran Syncytiotrofoblaster Placentabarriären är s.a.s. väggarna i korionvilli: I det intravillösa rummet (dvs i själva villi) går fostrets blodkärl, cotelydoner, vars väggar förstås har endotelceller. Villi-väggarna består av syncytiotrofoblaster på ett basalmembran. I det intervillösa rummet, alltså utanför syncytiotrofoblasterna, finns mammans blod.

Answer 293

Heparin är en högsulfaterad variant av heparansulfat som tillverkas av mastceller. Används som läkemedel för att hämma blodkoagulation.

Answer 294

Den **primära gulesäcken** bildas genom att hypoblaster bekläder coelomet mot cytotrofoblasterna och ger upphov till Heusers membran. Extraembryonalt mesoderm vandrar ut mellan cytotrofoblasterna och Heusers membran, som alltså består av hypoblaster. Det extraembryonala mesodermet spricket upp och ger korion (utåt) och korionhåligheten. Senare vandrar en ny våg av epitelceller ut och bildar den definitiva gulesäcken.

Answer 295

5'-capping Splicing Polyadenylering

Answer 296

Under eller efter translation.

Answer 297

Katalyserar **hydrolys** av GTP till GDP + Pi.

Answer 298

De börjar med GU och slutar med AG.

Answer 299

ER-proteinet **STIM1** känner av koncentrationen i ER, genomgår en konformationsförändring och aktiverar **Orai1-kanaler** i plasmamembranet som släpper in kalcium i cytoplasman från extracellulärrummet.

Answer 300

Glandula vestibularis: Slemproducerande körtlar vid slidmynningens nedre kant

Answer 301

Fyra samtidiga defekter: ## Footnote **Pulmonalisstenos** **Kammarseptumdefekt** **Högerförskjutning av aorta** **Högerkammarhypertrofi**

Answer 302

Differentiering och utmognad av specifika celler genom lateral inhibition, en kontaktberoende signaleringsmekanism. Delta finns på ytan av prekursorcellerna. Delta binder till närliggande cellers Notch-receptorer; receptorcellen får då en signal att **inte** differentiera.

Answer 303

* **Profas** * Kromosomkondensation * Kärnmembranet upplöses * Spolkropp börjar bildas från centrosomen * **Prometafas** * Kärnmembranet är helt upplöst * Centromererna har bildat varsin pol, mikrotubuli polymeriseras * **Metafas** * Ekvatorialplatta bildas * Spolkroppen färdigbildas, "spänns" av kinesin 5 som sätter sig mellan mikrotubuli, håller isär dem och elongerar cellen. Dynein drar astren mot cellmembranet. * Två sorters mikrotubuli i spolkroppen: Polära mikrotubuli, som går mellan polerna och förbinder centrosomerna, och kinetokorer som fäster vid kromosomerna. * **Anafas** * Kromosomvandring (centromeren förstörs) * Aster och kinetokor-mikrotubuli förkortas * Polära mikrotubuli glider och förlängs * **Telofas** * Spolkroppen upplöses * Kärnmembran återbildas * Två kärnor, en cell * Kromosomdekondensation * Hetero- och eukromatin återbildas * En kontraktil ring bildas * **Cytokines** * Den kontraktila ringen, som består av aktin- och myosinfilament, dras ihop och delar cellen i två.

Answer 304

**VEGFR1** hämmar angiogenes. Viktigt för att reglera mängden fritt VEGF! **VEGFR2** stimulerar angiogenes via Ras/Raf, men kan även signalera via PLC-PKC-eNOS vilket ger ökad vaskulär permeabilitet. De plasmaproteiner som läcker ut utgör en tillfällig ECM som endotelcellerna kan migrera i när ett nytt blodkärl bildas. **VEGFR3** stimulerar lymfangiogenes

Answer 305

* Zygoten, fortfarande omgiven av zona pellucida, klyvs snabbt till flera celler. * Morula bildas (16-32 celler) * Morula kompakteras pga ökad celladhesivitet (E-cadherin), enskilda celler syns inte längre * Blåsbildning ger blastocyst med blastocoel (vätskefyllt hålrum) * Polarisering ger embryonal resp. abembryonal pol * Blastocystens celler delas upp i inre och yttre cellmassa: Embryoblaster och trofoblaster. * Blastocysten "kläcks" ur zona pellucida dag 5, strax innan implantationen * I uterus har en decidualreaktion skett, vilket gör att blastocysten kan fästa mot endometriet. Den embryonala polen fästs mot väggen, och den abembryonala polen är alltså utåt i livmodern.

Answer 306

Det beror på hur stor den misstänkta avvikelsen är. Karyotypering (10⁷bp) Array-analys (10⁴ bp) DNA-sekvensering (1 bp)

Answer 307

Laminin är en proteintrimer som hålls samman av disulfidbryggor. Håller ihop kollagentrådar i en rutnätsstruktur i basalmembran. Defekt laminin kan ge muskeldystrofi.

Answer 308

Small nucleolar RNA. Processar och modifierar rRNA.

Answer 309

* Ovarierna utvecklas ur intermediärt mesoderm, genitallisten samt urkönsceller. Kortikala könssträngar bildas och oogonierna omsluts av follikelceller. * Paramesonefrosgången (Müllerska gången) utvecklas till tuba uterina, uterus och delar av vagina. * Mesonefrosgången tillbakabildas i frånvaron av testosteronbildande Leydigceller. * Vagina utvecklas ur paramesonefrosgången + sinovaginal knopp (endoderm)

Answer 310

Epiblastceller bryter sig loss från epiblasten genom EMT och tränger undan hypoblasten i mittlinjen, vilket ger upphov till endoderm. EMT startar kaudalt på groddskivan vilket ger primitivstrimman, som sedan utökas framåt. Celler vandrar under epiblasten åt sidorna och framåt. Fortsatt ned- och invandring av epiblastceller via primitivstrimman på endodermet ger mesodermet. Kvarvarande epiblastceller ger ektodermet.

Answer 311

**Insertioner** och **deletioner**, den näst vanligaste formen av variation. Kan leda till frameshift om inte hela kodon tas bort eller läggs till.

Answer 312

1. Introniska 2. Exoniska 3. Promotor 4. 5'-UTR 5. 3'-UTR 6. Splice site mutation

Answer 313

De modifieras och sorteras för vidare transport. 1. N-acetylglukosamin adderas 2. Mannos-6-fosfat (M6P) signalen avtäcks 3. Proteinet binder till M6P-receptorn, får ett klatrin-hölje och transporteras till endosomen. 4. I den tidiga endosomen dissocierar proteinet från receptorn pga lågt pH 5. M6P-receptorn åker tillbaka till Golgi.

Answer 314

* Könen är lika fram till vecka 12 * Genitaltuberkel blir glans clitoris/penis * Blivande uretra löper och är öppen ventralt * Urogenital/uretralveck ger penis resp. labia minora samt deras svällkroppar * Labioscrotalveck ger scrotum resp. labia majora Urogenitalvecken ska växa ihop för att bilda penis. Om detta inte sker kallas det hypospadi.

Answer 315

De kan * inaktiveras * subfunktionaliseras * neofunktionaliseras Genevolution genom duplikation ger bl.a. antikroppar. Funktionella genmoduler återanvänds ofta i lite olika kombinationer, för att öka genvariationen används alternativ splicing som gör att en gen kan få flera olika funktioner.

Answer 316

En shunt i det embryonala hjärtat som så att säga förbikopplar lungorna genom att koppla lungartären direkt till aortabågen. Den stängs vid födseln.

Answer 317

**p27** hämmar G1/S-Cdk och S-Cdk-aktivitet i G1. **p21** hämmar G1/S-Cdk och S-Cdk vid DNA-skada **p16** hämmar G1-Cdk-aktivitet i G1. Inaktiveras ofta vid cancer.

Answer 318

Uterus delas in i fundus, corpus, istmus och cervix uteri. Cervix uteri delas upp i endocervikala kanalen, ectocervix och transformationszonen. Transformationszonen är den yttre övergången mellan cervix och vagina, där epitelet övergår från cylinder- till skivepitel. Känsligt för virus, t.ex. HPV.

Answer 319

DNA -\> RNA -\> protein -\> styr cellens funktioner

Answer 320

* **Kollagener** * CAM: **Celladhesionsproteiner** * fibronektin * laminin (bara i basalmembran) * **Mikrofibriller** (fibrillin) * **Elastin** * **Proteoglykaner** * aggrecan * decorin * perlecan * **Hyaluronan**

Answer 321

En hel familj av **cytoplasmatiska tyrosinkinas** som kan fungera som signalprotein. De vanligaste är **Src**, **Yes** och **Fyn**. Reglerar framför allt **cellmigration** och **celldelning**.

Answer 322

Ribosomalt RNA, bygger upp ribosomen och katalyserar proteinsyntes.

Answer 323

Groddstadiet (vecka 0-2) Embryostadiet (vecka 3-8) Fosterstadiet (vecka 9-38) Obs: Fosterveckor, inte graviditetsveckor.

Answer 324

1. Kollaps av replikationsgaffeln 2. 5'-änden av den brutna strängen bryts ner 3. Ligering mellan nysyntetiserad sträng (från intakt ursprungssträng) med bruten ursprungssträng 4. Strängutbyte: Enkelsträngad 3'-ände till homolog del i dubbelsträngat DNA 5. Branch migration + DNA-syntes 6. Klyvning av fosfodiesterbindningar vid överkorsningen + ny ligering 7. Omstart av replikationsgaffeln

Answer 325

1. En specifik, deaminerad bas tas bort av t.ex. uracil-DNA-glykosylas 2. Endonukleas och fosfodiesteras tar bort sockerfosfaten där basen satt 3. DNA-polymeras fyller i den saknade nukleotiden 4. DNA-ligas försluter strängen

Answer 326

**DNMT = DNA-metyltransferas** DNMT1 metylerar 5'-cytosin i hemimetylerat DNA, dvs nysyntetiserat DNA där C på den ena (gamla) strängen är metylerat sedan tidigare. DNMT3A och 3B metylerar ometylerat DNA.

Answer 327

Non-Homologous End Joining

Answer 328

1. **N-terminal**. Först ut ur ribosomen. Klyvs bort. 2. **Intern**. Del av färdigt protein (gated transport). 3. **C-terminal**. Del av färdigt protein (transmembran-translokation). 4. **Kombination**. Ytmotiv. Från olika delar av primärsekvensen. Del av färdigt protein (gated transport, vesikulär transport).

Answer 329

När spermien når zona pellucida spricker hela akrosomen. Dess enzymer frigörs då och kan göra hål genom att bryta sönder bindningarna mellan äggets granulosaceller. Spermiehuvudet tränger sig igenom hålet och smälter samman med ägget: 23+23=46 kromosomer. Flagellum släpper. Kalcium strömmar nu in genom oocytens membran och frisätter kortikala granula in i det perivitellina utrymmet. Dessa granula förändrar zona pellucida så den blir ogenomtränglig.

Answer 330

1-2 korta sekvenser med många positiva aminosyror

Answer 331

Polyadenylering av mRNA **skyddar mRNA från degradering** och underlättar vid **translationen**. Processen initieras av **proteiner som är bundna till RNA-polymerasets CTD-svans**. **CPSF** (cleavage and polyadenylation specificity factor) binder till **polyA-signalen** (AAUAAA, 10-30 nukleotider uppströms) och ser till så den GU-rika regionen i CTD klyvs bort, och binder sedan till **PAP** (polyA-polymeras) som syntetiserar ca 200 st adenin-molekyler.

Answer 332

"Snurpar" bildas av **snRNA** (U1, U2, U4, U5 och U6) som binder **proteiner** och därmed skapar snRNPs, **small nuclear ribonucleoproteins**.

Answer 333

Nedbrutna adherens junctions frigör β-catenin. Det fungerar då som en transkriptionsfaktor, som differentierar cellen och tillåter proliferation.

Answer 334

Desmosomer som fäster epitelceller vid basalmembranet och inte vid varandra.

Answer 335

Inversioner.

Answer 336

LINE = long interspersed nuclear element, en typ av **retrotransposon**. 1. L1 sitter inkorporerat i värdkromosomen, och producerar **ORF2**, ett protein som innehåller en **retrotransposondomän** och en **endonukleasdomän** 2. ORF2 binder L1-RNA och klyver ena strängen på mål-DNA. 3. DNA:t används som primer för **revers transkription**. cDNA skapas. 4. Den andra DNA-strängen skapas.

Answer 337

Mitogen-activated protein kinase kallas även för ERK: Extracellular-regulated kinase är ett serin/treoninkinas

Answer 338

Den har fokala adhesionspunkter, "fötter", av integrin. Sen ser cellen ut lite som en godisbil, med lamellipodium i fram, myosin i bak och aktin däremellan. När cellen sträcks ut polymeriseras aktin så det sticker ut framför lamellipodium, då drar myosinet ihop cellen mot lamellipodiet och på så sätt flyttar sig cellen framåt. Typ som en snigel.

Answer 339

Ett inaktivt G-protein har GDP bundet till sig. Det byts ut mot GTP av **GEF** (guanine nucleotide exchange factor, t.ex. SOS), och G-proteinet blir då aktivt. **GAP** (GTPase activating protein) hydrolyserar GTP så det förlorar en Pi och blir till GDP; G-proteinet blir då inaktivt igen.

Answer 340

Molekyler kan färdas mellan dem utan att korsa ett membran. * Kärnmembran * ER * Golgi * vesikel * endosom * lysosom * peroxisom * ECM

Answer 341

* Produktionshastighet * Stabilitet * Aktivering * Förvaring * Distribution * Produktion av antagonister

Answer 342

**Sicklecellsanemi** (mutation i en hemoglobingen) * Homozygot: Allvarlig sjukdom * Heterozygot: Enbart bärare, ingen sjukdom. Resistens mot malaria. **Cystisk** **fibros** (mutation i en kloridjonkanalgen, CFTR) * Homozygot: Allvarlig sjukdom. * Heterozygot: Enbart bärare, normalt ingen sjukdom. Resistens mot kolera.

Answer 343

Telomerer är **de områden i ändarna av kromatiderna som skyddar dem från att brytas ner och förlora information**. De innehåller sekvensen TTAGGG repeterad många gånger - de är flera tusen baser långa. Varje gång cellen delar sig blir telomererna kortare. **Cancerceller** har extra långa telomerer för att kunna delas extra mycket och fort. I **könsceller** finns aktivt **telomeras** som kan förlänga telomerer.

Answer 344

* **Direkt** * VEGF * Histamin, Bradykinin * **tillväxtfaktorer, cytokiner** * **Indirekt** * kärldilation * tromboser * **blodtryck och flöde**

Answer 345

1. PLC hydrolyserar PIP2 till IP3 + DAG 2. DAG aktiverar PKC, vilket ger en bred signaltransduktionseffekt 3. IP3 stimulerar Ca-utsläpp från ER. 4. Ca stimulerar Calmodulin som stimulerar CaM-kinas

Answer 346

Urinblåsan. Den rymmer upp till en liter, och har tre lager glatt muskulatur. Ingången av urinledare (ureter) och urinrör (uretra) bildar trigone triangle. Ureteringången är täckt med ett tunt membran som förhindrar återflöde när blåsan töms. Uretra har två sfunktrar: En inre, autonom vid blåsans öppning till uretra, och en yttre, viljestyrd där uretra passerar bäckenbotten.

Answer 347

Via signalöverföring: 1. Ligandbindning 2. Konformationsförändring 3. Signalkedjor 4. Cellulära svar

Answer 348

* Äggfertilisering * Celldelning * Kemotaxis * Cilie- och flagellrörelser * Muskelkontraktion * Metabola enzymer * Neurotransmitterfrisättning * Endokrin hormonfrisättning * Exokrin sekretion * Fagocytos * med mera

Answer 349

I brosk och ögats glaskropp.

Answer 350

* Via slumpvis fördelning av kromosompar * Via rekombination

Answer 351

* Cell-cell-kommunikation, vid synapser och endokrina organ. Mycket snabb process. * Reglerad membranfusion kräver signal från t.ex. hormon eller neurotransmitter. * Sekretoriska vesiklar * Beroende av kalcium och SNARE.

Answer 352

1. DNA-helikas delar på DNA-strängarna vid skadan 2. Nukleas klyver bort ca 30 nukleotider 3. DNA-polymeras och -ligas återställer strängen

Answer 353

Detta är tack vare **Rab-proteiner** (GTPaser) och **Rab-effektorer** (*tethering proteins*). Rab-effektorerna sitter i organellens membran, och binder till Rab-GTP på vesikeln. Eftersom olika organeller har olika kombinationer av Rab-proteiner kan bara en viss vesikel binda till en viss organell. När vesikeln når rätt ställe binder Rab-GTP till Rab-effektorn, detta gör så v-SNARE kan snärjas in i t-SNARE, vesikeln dockar och kan fusera.

Answer 354

ECM-strukturer är... * ordnade * ofta komplexa (t.ex. kollagen II, elastinfibrer, basalmembran) * ihopsättningen kontrolleras av celler (t.ex. fibronektin, laminin) * inte lätta att framställa artificiellt * har varierande omsättningstid (dagar - decennier)

Answer 355

Katalyserar **hydrolys av lipidgrupper**.

Answer 356

De stärker kollagenfibrillerna. Korsbindningen fortgår hela livet, och ju fler korsbindningar desto mindre elasticitet - detta är förstås inte alltid bra, utan orsakar bl.a. benskörhet och slapp hud.

Answer 357

En **stängd kromatinstruktur** och transkriptionell **repression** av närliggande gen.

Answer 358

De fungerar genom att interagera med proteiner som co-receptorer, bidrar till att gradienter av morfogener bildas och vidmakthålls.

Answer 359

PCP = planar cell polarity Ordnar upp cellerna så de hamnar åt rätt håll. Gör t.ex. så hårstrån hamnar i samma riktning. Flamingo, Frizzled och Vangl uttrycks på olika delar av cellytan och berättar vilken sida som ska vara åt vilket håll *(tänk lite som magneter, plus måste vara mot minus. Vangl kan inte vara mot Vangl.)* PCP-signalering reglerar en mängd utvecklingsprocesser: * gastrulation * mönstring av innerörat, hörsel * stängning av ryggmärgen * ciliogenes * riktad celldelning * förgreningar i lungan * likriktad hårfollikel-arrangering * left/right symmetry

Answer 360

Det samlas mycket **P53** (tumor suppressor protein) som **aktiverar transkription av Puma och Noxa**, de triggar sedan den inre apoptosvägen så den skadade cellen dör istället för att utvecklas till en cancertumör.

Answer 361

1. Ökad produktion av Bcl2 och BclX 2. Inaktivering av Bad, Bim, Bid, Puma och Noxa. 3. Inaktivering av anti-IAPs, dvs Smac/Diablo och Omi.

Answer 362

Urkönscellerna har sitt ursprung i epiblasten. I samband med gastrulationen vandrar de ut till gulesäckens vägg. De vandrar sedan in igen via det dorsala mesenteriet och koloniserar genitallisten. Gonaderna bildas ur genitallistens celler och urkönscellerna. En ny utförsgång anläggs utanför mesonefrosgången: Paramesonefrosgången, eller Müllerska gången.

Answer 363

**Kromatin** är DNA + histoner (dvs nukleosomer) + associerade proteiner. Histonsvansar håller ihop nukleosomer för att skapa **kromatinfibrer**. Histon H1 hjälper till att dra ihop DNA ytterligare.

Answer 364

* kompetitiv DNA-bindning * maskering av aktiveringsytan * direkt interaktion med generella TF * rekrytering av kromatinremodelleringskomplex * rekrytering av histondeacetylaser * rekrytering av histonmetyltransferaser

Answer 365

1. mRNA:t måste vara processat, dvs capping, splicing och polyA måste vara klart 2. Exportadaptor binder mRNA 3. Exportreceptor binder adaptor och NPC (nuclear pore complex)

Answer 366

I Golgiapparaten

Answer 367

Heparansulfat är en glykosaminglykan som tillverkas av alla celler utom erytrocyter. HS har en cellspecifik struktur med olika sulfateringsmönster vilket bestämmer dess biologiska aktivitet. serglycin perlecan syndecan glypican

Answer 368

* Period * Embryots genotyp * Exponering

Answer 369

TATA-binding protein Generella transkriptionsfaktorer RNA-polymeras II

Answer 370

* producerar urin, avlägsnar avfallsprodukter * blodtrycksreglering * salt- och syra-basbalans * endokrina funktioner * erythropoietin (EPO) * renin * vitamin D

Answer 371

N-terminal amfipatisk alfahelix

Answer 372

* Påkoppling av funktionell grupp * fosforylering * lipidering * acetylering * Påkoppling av protein * protein-protein-interaktioner * ubiquitinering * Kemisk modifiering * prolinhydroxylering * Strukturell modifiering * proteolys * disulfidbryggor

Answer 373

Sekvenser som kan kopiera sig själva och flytta sig i genomet med hjälp av co-enzymet transposas. De upptar ca 42% av genomet.

Answer 374

Signalmolekyler för TGF-beta-receptorer. När en ligand binder till TGF-beta-receptor typ 2 fosforylerar och aktiverar den receptor typ 1. När den fosforylerats kan Smad binda in till den. Smad fosforyleras då, släpper, dimeriseras och fungerar som transkriptionsfaktor i kärnan.

Answer 375

* Stressfibrer * Filopodier * Lamellipodier (rufflor?!!)

Answer 376

Metionin = AUG

Answer 377

Next Generation Sequencing. Billigare och mycket mer effektivt än gamla metoder, istället för att undersöka en gen i taget kan man undersöka ett helt genom eller miljarder olika molekyler. Används till att undersöka bl.a. * genomsekvens * genuttryck (mRNA) * tarmflora * genomstruktur * nukleosompositionering * proteinuttryck

Answer 378

Chaperoner underlättar **proteinveckning** och -uträtning. HSP = **Heat Shock Proteins**, en typ av chaperoner. HSP60 veckar om felveckade färdiga proteiner. HSP70 veckar redan under translationen.

Answer 379

* i cytoplasman eller ER * mRNA är specifikt distribuerat * mRNA-bindande protein kan stimulera eller hämma translation * fosforylering av translationsinitieringsfaktorer (eIF2)

Answer 380

Non-allelic homologous recombination

Answer 381

Transkriptionsfaktorer är proteiner som binder till DNA och reglerar geners uttryck. Människan har \>2000 TF-gener, som delas in i familjer baserat på homologi i den DNA-bindande domänen (ex. homeobox, Zn-finger) som binder en specifik DNA-sekvens.

Answer 382

**Initiering**: * Interaktion mellan polyA och 5'cap ger **ringslutet mRNA**. eIF4F-komplexet är cap-binding protein och bidrar till ringslutningen, interagerar även med eIF3 och gör så 43S-preinitieringskomplexet + lilla subenheten binder till mRNA. * 43S-preinitieringskomplexet + lilla subenheten rör sig 5' till 3' på mRNA som rätas ut (fortsätter vara ringslutet!), **AUG (startkodon) identifieras**, komplexet stannar då upp och cap-binding protein dissocierar. * Ribosomens lilla subenhet binder initierings-tRNA (Met) **efter att eIF2 har hydrolyserats** av eIF5 (GTP → GDP) och släppt från tRNA. * **eIF5-GTP krävs** för att den stora subenheten ska kunna binda till den lilla. Den hydrolyseras till eIF5-GDP när båda subenheterna är på plats, och släpper då så det bara är 80S kvar. * Fun fact: 40S + 60S = 80S **Elongering**: * Inbindning av tRNA baserat på komplementaritet (antikodon:kodon) * Peptidyltransferasreaktioner katalyseras av RNA * mRNA rör sig tre baser framåt åt gången (aka stora subenheten förflyttar sig ett kodon i 3'-riktning) **Terminering**: * "Release factors" eRF3 binder **stop-kodon** i A-site * **eRF3 hydrolyserar bindningen mellan tRNA och polypeptidkedjan** så polypeptidkedjan släpper från tRNA och ribosom * mRNA släpper från ribosomen som åter delas upp i stora och lilla subenheten * Om mRNA är ringslutet och eIF2B har gjort eIF2-GDP till eIF2-GTP kan en ny translation nu initieras, och så börjar allt från början igen. Snipp snapp slut, så var sagan slut.

Answer 383

* Endokondral ossifiering * Indirekt benbildning * Mesodermal broskmall i extremiteterna ossifieras (förbenas) * Ryggradens ben, extremiternas ben * Intramembranös (dermal) ossifiering * Direkt benbildning * Skallens ben, nyckelben, käke mm

Answer 384

Man kan klassificera dem och försöka utreda varifrån cancern kommer, genom att cancercellerna behåller sin IF-typ.

Answer 385

_Mitokondrien_: * **N-terminal amfipatisk sekvens** i proteinet. _ER_: * **Hydrofob sekvens, 8-12 aminosyror lång**, ofta N-terminalt placerad.

Answer 386

* Fosfolipider * Kolesterol * Transmembranproteiner * SNAREs * V-ATPas (t.ex. ATF) * Väte/glutamat-transportörer

Answer 387

M-Cdk aktiveras genom att Cdc25 defosforylerar M-Cdk samtidigt som Wee1 inhiberas. M-Cdk triggar igång mitosen: * kromosom-kondensation * mitotic spindle * fäster systerkromatinparen vid microtubuli Anafasen startas sen av APC/C, som stimulerar nedbrytning av securin som har hållit ihop kromatinparen. APC/C sätter också igång nedbrytning av cykliner, vilket leder till att M-Cdk inaktiveras. När två dotterkärnor har formats i mitosen är det cytokinesen som gör att de bildar separata celler.

Answer 388

C-vitamin (askorbinsyra) är nödvändigt för att hydroxylera lysin och prolin. **Brist på C-vitamin gör att vi inte kan bilda hydroxyprolin och hydroxylysin** som behövs för att kollagenfibrerna ska kunna korslänkas till varandra. **Som ett resultat minskar mängden kollagen i bindväven** och den som finns får dålig kvalitet. Man får blödningar i tandköttet, tandlossning, blåmärken, muskelförtvining... **skörbjugg**.

Alla föreläsningar Flashcards

inte så mycket på embryologi och framåt pga tidsbrist :(