Alineamiento de secuencias

Question 1

Qué es el alineamiento de secuencias ?

Answer 1

Comparar una secuencua de ADN, ARN o aminoácios frente aotra de referencia e identificar similitudes y diferecias

Question 2

Hay dos formas de interpretar los desajustes en un alinemaniento de secuencias. Son …

Answer 2

Mutación: diferencia puntual
Brecha (indel): por inserción o deleción

Question 3

Cuáles son los dos tipos de alineamiento de secuencias ?

Answer 3

Global: abarca la secuencia completa
Local: solo abarca una secuencia específica

Question 4

Cuál es el algoritmo básico para el alineamiento de secuencias por pares ?

Answer 4

Dot plot
Tabla con una secuencia en las filas y la otra el columnas.
Coincidencias se marcan con un punto

Question 5

Cómo funciona el algoritmo de Needelman-Wunch para alineamiento por pares ?

Answer 5

Dot plot
Agrega un valor a cada celda basando en

• match
• missmatch
• gap

y encontrar el mejor emparejamiento posible

Question 6

Cuál es el algoritmo de alineamiento por pares optimisado para alinemientos locales ?

Answer 6

Algoritmo de Smith & Waterman

Question 7

Para qué sirven los alineamientos de secuencias múltiples ?

Answer 7

• Detectar conservaciones o variabilidad en una familia de proteinas
• Análisis filogenpetico: identificar la especie a la que pertenece la secuencia
• Evaluar** homología** entre familias multigénicas