ADN - La réplication Flashcards
De quelle type de réplication s’agit-il ?
Sémi-conservatrice
Quelles sont les bases présentes dans l’ADN?
Adénine - Cytosine (purines - 2 anneaux)
Guanine - thymine (pyramidines - 1 anneau)
Qu’est-ce la dénaturation ?
Séparation des deux brins et deux simples brins.
L’initiation à la réplication se fait grâce à….
Des signaux provenant soit des cellules adjacentes, soit de l’environnement de la cellule.
Y-a-t-il plusieurs origines à la réplication ?
Oui, de plus elle est bidirectionnelle
Comment se fait la dénaturation ? Comment est-elle régulée ?
Par un complexe de protéine qui se fixe sur l’origine de réplication. C’est le complexe ORC qui régule la réplication selon son état : actif ou non.
Le complexe va agir en induisant une tension (lors de sa fixation), ce qui va engendrer une dénaturation partielle
La région subissant la dénaturation par le complexe de protéine est…
Généralement riche en A-T, car il n’y a que deux ponts hydrogènes (plus simple à rompre)
Quelle protéine permet d’avancer le long de la chaîne après la dénaturation ?
Les helicases permettent d’avancer le long de la chaîne en séparant les deux brins afin d’exposer leurs bases.
L’ADN simple brin est exposé, cela risque de l’abîmer?
Oui, il est beaucoup plus exposé (aux endonucleases notamment) , plus fragile, c’est pour cela que des protéines protège le simple brin d’ADN dénudé
La réplication nécessité-elle une amorce?
Oui, en un bout 3’-OH libre. Sans celle-ci aucune réplication est possible!
Comment l’amorce est synthétisée?
C’est un ARN synthétisé par la primass
Qu’est ce que la primase?
Une ARN polymérise
Dans quel sens se fait la réplication ?
5’ - 3’
L’ADN polymérase ajoute au bout 3’OH un nouveau nucléotide complémentaire par…
Liaison phosphodiester
Étant donné la bidirectionnalité de la réplication un problème se pose, lequel?
Étant donné que la réplication se fait dans le sens 3’ - 5’, l’autre ira dans la mauvaise direction. En effet, l’hélicase se déplaçant toujours dans le même sens, un brin sera continu et l’autre discontinu
Comment appelle-t-on le brin continu?
Le brin précoce
Comment appelle-t-on le brin discontinu ?
Le brin tardif
Comment se passe la réplication sur le brin tardif?
Étant donné que l’amorce se fait exclusivement sur le brin 3’OH, lorsque assez d’ADN sera libéré, une nouvelle amorce sera créé par la primase et ainsi de suite…
Comment s’appelle les petits bouts d’ADN synthétisé sur le brin tardif?
Les fragments d’okazaki
Que ce passe-t-il quand les fragments d’okazaki se rencontrent ?
La première amorce est éliminée par l’exonuclease, puis l’ADN-ligase intervient afin de les “coller” ensemble pour former un brin continu.
Pour que la réplication des brins soit coordonnée…
L’ADN utilise un replisome qui tiendra les deux brins d’ADN ensemble malgré la synthèse discontinue du brin tardif (plus lente forcément)
A quelle vitesse se fait la réplication ?
100 nucléotides/seconde
A un certain l’hélicase ne peut plus dénaturer l’ADN pourquoi?
Car la force de torsion est trop élevée et cela engendre un surenroulement de l’ADN.
Que faut-il faire pour relâcher la tension créée par le surenroulement ? Qui se charge de cette action?
Il faut couper un des deux brins, ou les deux brins afin de relâcher la tension. C’est le rôle des topoïsomerase I & II
Quel est le rôle de la topoïsomerase I, quand agit-elle ?
- La topoïsomerase I coupe un seul brin d’ADN. Elle rompt une liaison phosphate covalente ce qui relâche la tension.
- Elle agit DURANT la réplication
Quel est le rôle de la topoïsomerase II, quand agit-elle?
- Elle coupe les deux brins, elle les libère. (Ils sont entrelacés)
- Elle agit APRÈS la réplication
Qu’est ce qu’une telomerase?
Une transcriptase inverse
Quand est-elle le plus souvent présente?
Dans les cellules qui ont une haute activité de réplication
L’Amorce crée au début de la réplication (formée d’ARN) s’intègre à l’ADN?
Faux, l’ARN n’étant pas un constituant de l’ADN, l’amorce se fait enlevé par des nucleases.
L’amorce étant supprimée, l’ADN raccourcirait a chaque fois (donc le chromosome aussi) quelle est la solution?
La telomerase met en place un mécanisme spécial qui lui permet d’intervenir. Elle utilise une matrice ARN directement incorporée dans sa structure. Elle crée ainsi un bout d’ADN de manière répétitive sans altéré l’information en amont/avale dans le chromosome. Le bout qu’elle synthétise n’est pas contient uniquement des séquences non codante. (On appelle telomere la structure spécifique ajoutée en chaque extrême du chromosome).
Étant une ADN polymérase, quelle amorce utilise la telomerase?
Le bout 3’OH déjà existant sur l’ADN
La telomerase est un mélange de…
Protéine et ARN, on l’appelle alors “RIBONUCLEO-PROTEINE”
Dans quelles cellules y-t-il forte présence de telomerase ?
Dans les cellules germinales
Quelles sont les différentes sortes de mutations?
Mutations ponctuelles : Un seul nucléotide est changé - substitution, transition (purine pour purine/pyramidine pour pyramidine)
Transversion (purine pour pyramidine)
Mutations grossières : plusieurs nucléotides changés - délétion, insertion, inversion
Quels sont les effets des mutations?
- néfaste
- neutre
- bénéfique
Les personnes présentants un défaut de répartition de l’ADN développe les maladies plus facilement tel que le syndrome de Werner (vieillissement précoce)
Quelles sont les sources de mutations de l’ADN?
Erreur de réplication par la polymérase
Changement par modification de l’ADN (physique ou chimique)
Modification de base par deamination
Perte d’une base (purine le plus fréquent)
Que ce passe-t-il lorsque les deux brins sont endommagés?
On ne peut pas recoller tout simplement les deux bouts ensemble, risque de délétion. Les enzymes chargées de la réparation se fixe sur les bouts libres, et utilise le chromosome homologue comme matrice. (Avantage d’être diploïde)
Les enzymes distingues les bouts libres aisément sans les confondre avec les télomeres, car ils n’ont pas les protéines spécifiques à ces derniers.
Quels sont les différents types de recombinaison ?
Recombinaison homologue
Recombinaison illégitime
Recombinaison site spécifique
Recombinaison somatique
Quand se déroule majoritairement la recombinaison ?
Durant la méiose ( deux chromosomes homologues)
Quelles sont les étapes de la recombinaison classique?
Coupure d’un brin de chaque ARN (père/mère) -les nucléaires viennent couper les extrémités-
Appariement par homologie, les extrémités s’apparient par complémentarité
Synthèse et libation
Résolution par coupure et religation
si il y a une des différences d’appartement, une enzyme vient les corriger
Quel est le but de la recombinaison ?
Le but est d’obtenir lors de la méiose des gamètes ayant des informations provenant de la mère et du père.
-> fidélité de ségrégation
A quoi est due la recombinaison illégitime ?
Elle est due à un mauvais alignement des chromosomes homologues, ce qui abouti en général à la duplication d’un gène sur l’un des brins, et la délétion de gène sur l’autre brin.
Cela peut être une translocation aussi.
Qu’est ce qu’un élément sauteur ?
Ce sont des séquences Tn ou IS qui saute d’un endroit du génome a un autre. Il se déplace sur le même ADN ce qui donne une duplication du gène.
On peut également avoir une transposition a l’intermédiaire d’un ARN. -> virus qui s’intègre à l’ADN par exemple.
Qu’est ce que la recombinaison par site spécifique ?
Elle peut se faire chez l’homme au niveau des anticorps. C’est l’enzyme recombinase qui reconnaît une séquence bien définie (15-20 nucléotides) -> changement de la spécificité des anticorps par recombinaison site spécifique lors de l’epissage
Il s’agit d’un phénomène réversible
(Souvent utilisé chez les virus)