ADN & Génomique Flashcards by CCharles TTardif

Combien il y a de base qui forment l’ADN?

Comment s’appellent-elles?

A - Adénine
C - Cytosine
T - Thymine
G - Guanine

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ADN se retrouve dans quel type d’organisme?

Animal
Végétal
Bactérien
Viral 
*(Universalité du code génétique)

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Définition de la génomique :

Étude de l’ensemble du matériel génétique d’un être vivant (humain, animal, plante ou virus).

Analyse des génomes de ces organismes, du point de vue anatomique et physiologique.

La génomique est le principe de dessiner la carte des gènes.

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Qu’est-ce qui a augmenté la popularité de la génomique?

Informatisation de la biologie.

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Quels étaient les premiers génomes à été séquencés?

Pourquoi ?

Les virus (FX 174).
Ils ont un code génétique plus court. (5700PB : Paires de Base)

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Quel projet de recherche international a été lancé en 1990?

Quand est-ce que ce projet a été terminé?

Séquençage du code génétique de l’Homo Sapiens (3 milliards de PB).
Avril 2003.

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En quel année le coût du séquençage a diminué drastiquement?

Combien coûte le séquençage en 2011?

en 2007-2008.

moins de 0,10$ par MPB.

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Comment peut être utile de connaitre la séquence nucléotidique? (5)

1- Exploration des fonctions associées aux gènes, aux variations alléliques et au polymorphisme génétique.

2- Reconstruction d’arbres phylogénétiques d’espèces vivantes.

3- Analyse de l’histoire évolutive des êtres vivants en lien avec leur écosystème.

4- Compréhension de maladies liées aux gênes.

5- Découvrir des marqueurs de sélection de certaines caractérisques.

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Combien de pays sont dans l’ « INTERNATION BARCODE OF LIFE » project? (IBOL)

25 pays.

5 organisations canadienne dans le projet

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Qu’elle est le but de l’IBOL?

Construire une bibliothèque de référence de codes barres d’ADN pour une système d’identification.

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Combien de spécimens/espèces étaient dans l’IBOL pendant sa première phase (2010-2015)?

Cinq millions de spécimens, soit 500 000 d’espèces.

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Quels est le secteur le plus importants de l’industrie du Québec?

Le secteur bio alimentaire.

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Quels sont les défis/obstacles que rencontre le secteur du bio alimentaire québécois? (4)

Approvisionnement local et mondial
Enjeux liés à la sécurité, qualité et valeur nutritive
Résistance aux maladies, parasites et insectes
Adaptation aux changements climatiques

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Comment la génomique peut être un outil utile à la bio alimentation?

Elle permettrait de trouver des solutions aux défis déjà nommés.
(défis : Approvisionnement local et mondial
Enjeux liés à la sécurité, qualité et valeur nutritive
Résistance aux maladies, parasites et insectes
Adaptation aux changements climatiques)

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Quels sont les deux (2) types de modes de production agricole?

Génétiquement modifiés.

Non génétiquement modifiés.

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Quels étaient les buts de SoyaGen?

Améliorer le rendements et la résistance aux maladies du soya.

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Quel était le but de Apple Biodiversity Collection?

Cartographier le génome de chaque variété de pomme pour réduire le temps de production d’un nouveau cultivar (nouvelle espèce).

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Quel était le but du projet de la tomate?

Cibler les gènes connus pour moduler les perceptions du goût et de la préférence du nouveau cultivar.

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Qu’est-ce qu’un SNP (snip) ?

Quels sont les deux (2) types de snip?

Single nucleotide polymorphism
1 - Silencieux (s’il n’affecte pas l’expression du gène.
2 - fonctionnel s’il affecte le gène dans une maladie.

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Nommez les sept (7) exemples de marqueur pour les caractères simples pour la sélection animale.

Défaut génétique
Résistance au maladies
Qualité du produit (lait ou viande)
Caractères phénotypiques auxiliaires (cornes ou pas)
Fertilité
Identification du sexe chez l’embryon
Vérification de l’ascendance.

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À quoi sert la puce BOV50SNP?

À surveiller et contrôlé les épidémies causées par le virus de la diarrhée porcine.

Quel était le but de la génomique pour les abeilles?

Surveillance des génotypes des abeilles africaines (pouvait être mortel pour l’abeille commune)

Quel était le but de la génomique pour l’industrie porcine sur le marché mondial?

Cibler les caractéristiques importantes concernant :

La qualité et le goût de la viande.
Efficacité alimentaire.
Reproduction de l’animal.
Le bien être de l’animal.

Quel était le but de la génomique selon le développement et la commercialisation d’un supplément d’enzymes?

Identifier les enzymes pour favoriser la digestibilité, car nourrir les porcs et la volaille coûte cher (seulement le 3/4 de la nourriture est absorber)

Les virus représentent combien de % de cas des maladies d'origine alimentaire au Canada?

65%

Parle moi de la bactérie ECOLI et la génomique dans les usines.

Test génomique automatisé S'assurer que la viande est propre à la consommation avant qu'elle quitte l'usine Réponse en 8 heures

Que permettrait la génomique au niveau de la pêche et de l'aquaculture?

Identification des marqueurs génétiques associés à l'efficacité de la reproduction pour optimiser la sélection génétiques des saumons, dans l'avenir les pétoncles, les homards et ++ Outil de suivi d'ensemencement en milieu naturel

Quel est le but de la génomique chez les fromages?

Maitriser le fragile écosystèmes des bactéries, des levures et des moisissures qui rendent la fabrication du fromage si complexe.

Que vise la génomique selon l'environnement et les changements climatiques?

Optimiser le rendement par la résilience aux maladies, à la sécheresse et aux températures extrêmes. Détecter les pathogènes envahissants, insectes nuisibles, mauvaises herbes ex. avoir des outils pour détecter la présence des algues bleu dans les lacs

Qu'est-ce que le GE3LS?

Génomique et ses aspects Éthiques, Environnementaux, Économiques Légaux Sociaux

Quels sont les quatre (4) étapes de la conception d'un OGM?

1. Trouvez le génome chez un organisme. 2. Isoler et multiplier ce gène. 3. Introduire ce gène dans des explants NON-GM. (direct avec un canon à particules ou indirect avec l'aide d'une bactérie) 4. Régénération de cette plantes avec les parties maintenant génétiquement modifiées.

Quel est la conclusion des études sur les OGM ?

(d'après beaucoup d'étude, depuis 20 ans environ) Les OGM sont sécuritaires.

Quel est la plante la plus utilisé avec les OGM?

le SOYA.

Quel est le caractère le plus populaire pour les OGM des plantes (selon le graphique après le soya)?

La tolérance à un herbicide.

En quel année fut la première culture de plantes GM?

1996

Combien d'hectares de cultures de GM? | Combien tout cela vaut $$?

179,7 millions d'hectares | 15,3 milliards US$

Combien de pays utilisent les OGM?

28 pays | le Canada est au 5e rang

Quel est le seul animal génétiquement modifié approuvé présentement pour le commerce? En quelle année ça lô été accepté ?

Saumon à croissance accélérée. | 2015 (USA) et Canada (2016)

Si le maïs BT est un OGM, est-ce que son sirop sera considéré comme GM?

non.

Combien de grammes d'ADN modifié un humain consommerait à chaque jour ?

0,1g jusqu'à 1g.

Quelles sont les deux philosophiques existantes lorsqu'on parle des OGM dans nos aliments?

Provenance de l'ingrédient (d'une plante GM ou non) | Présence d'ADN ou de protéine GM

Quel est le risque environnementaux des OGM?

Dispersion de gènes. | exemple : ne plus savoir la différence entre le soya naturel et le soya GM.

Comment fonctionne les GM pour les herbicides chez les plantes?

Les plantes GM tolérantes à un herbicide ne synthétisent pas ou ne contiennent pas un herbicide.

Quels sont les stratégies utilisées pour les herbicides? (2)

1. La plante GM produit une nouvelle protéine qui annule l'effet toxique. 2. La protéine ciblée est remplacée par une qui est insensible à l'herbicide.

Qu'est-ce que le CRISPR?

C'est un outil à l'ADN pour ajouter, enlever ou cibler un gène précis. (édition génomique)

Qu'est-ce que l'édition génomique ou l'édition génique?

L'ensemble des techniques et technologique permettant de modifier une séquence nucléotidique précise de l’ADN d’une cellule à l’aide d’enzymes de restriction. Éliminer, ajouter, réparer un/des gènes de manière sélective. Ciseau qui coupe l’ADN à une certaine place, transmissible de génération en génération.

Qu'est-ce l'édition génique permet?

Éliminer, ajouter ou réparer un gène de manière sélective (une séquence particulière) - 4 familles de nucléées (ciseaux moléculaires) utilisées pour couper l'ADN au niveau souhaité

Quelle est la définition d'un OGM?

Organisme génétiquement modifié : microorganisme, plante ou animal dont le patrimoine génétique a été modifié par génie génétique pour lui attribuer des caractéristiques qu’il ne possède pas du tout ou à un degré insatisfaisant à son état naturel, ou pour lui enlever/atténuer celles jugées indésirables.

Extrapolation au panier d'épicerie | Quel est le taux d'incidence des aliments dérivés d'OGM?

- de 8 à 9% | - 2,5 à 3% en excluant les aliments contenant de l'ADN à l'état de traces

Consommation d'OGM et les impacts pour les animaux (4)

- la valeur nutritive est la même (grains transgéniques vs grains traditionnels) - effet diète à base d’OGM vs diète non GM mêmes effets - les animaux digèrent l’ADN et la protéine ajoutés des grains GM - Aucun dérivé d’OGM dans lait, œufs, viande. Aliments d’origines animales équivalentes et saines pour humain

Quels sont les effets inattendus entre GM et non GM?

Il y a plus de différences entre 2 soya non-GM, que de différences entre 2 soya GM (Les conditions environnementales créent davantage de variation à l’intérieur de la plante que la transformation génétique en elle-même)