ACIDES AMINÉS Flashcards
Quelles sont les quatre classes de biomolécules?
- Protéines
- Lipides
- Sucres
- Acides nucléiques
De quoi dépend la fonction d’une protéine?
La fonction d’une protéine dépend de sa structure. Comprendre la structure permet de développer des stratégies thérapeutiques.
Qu’ont en commun la plupart des maladies génétiques?
La plupart sont liées à un fonctionnement anormal d’une protéine.
D’où provient la caractère pathogène de nombreux agents infectieux?
De l’action d’une protéine.
Définir le génome.
Ensemble de l’ADN.
Définir le transcriptome.
Ensemble des ARN.
Quel est l’autre nom de l’hormone de croissance?
Somatotrophine
Quels sont les 7 types de fonction des protéines? Donner des exemples pour chaque.
- Support mécanique (prot du cytoquelette, des tissus de soutien (collagène, kératine, …))
- Transformation - Enzymes
- Hormones (insuline, vasopressine, glucagon, …)
- Signalisation (interrupteurs moléculaires, récepteur/ligand)
- Transporteurs (transferrine, hémoglobine, transporteurs transmembranaires)
- Stockage de matériels (ferritine, myoglobine pour l’oxygène)
- Reconnaissance et défense (anticorps = immunoglobulines)
Quelles enzymes ne sont pas des protéines?
Les ribosomes (ARN)
Qu’est-ce qu’une liaison covalente?
Une liaison forte qui correspond à la mise en commun d’au moins une paire d’électrons entre deux atomes adjacents
Quelle est le rôle d’une liaison covalente?
Le maintien de l’intégrité des biomolécules
Quel est l’ordre d’énergie d’une liaison covalente?
Quelques centaines de kJ/mole
Citer les 4 types de liaisons faibles, ie interactions non covalentes réversibles. Par quoi diffèrent-elles?
- ioniques
- hydrogènes
- Van der Waals
- hydrophobes
Diffèrent par leur géométrie, leur longueur et leur spécificité. Elles sont affectées de façon différente par la présence de l’eau dans les milieux biologiques.
Quelles sont les deux rôles des liaisons faibles?
- reploiement des protéines : relation structure/fonction
- interactions : enzyme/substrat ou récepteur/ligand
Par rapport aux liaisons covalentes, de quel ordre est l’énergie des liaisons faibles?
20 fois moindre
Quels sont les trois synonymes de liaisons ioniques?
- liaisons salines
- ponts salins
- forces électrostatiques
Quels sont les deux rôles des liaisons ioniques?
- interaction molécule-molécule
- modification conformationnelle
Energie d’une liaison ionique en milieu aqueux? Qu’est ce qui peut rompre une liaison ionique?
10kJ/mole. Un pH trop extrême ou bien une concentration ionique trop élevée.
Qu’est-ce qu’une liaison hydrogène?
Une liaison entre deux molécules polaires qui résulte de l’attraction électronique due à la répartition inégale des électrons dans une liaison covalente.
Quel est l’effet de l’eau sur les liaisons hydrogène?
L’eau affaiblit les liaisons hydrogène entre molécules polaires. C’est un excellent solvant des molécules polaires car les molécules polaires peuvent former des liaisons hydrogène avec les molécules d’eau.
Quel est l’ordre d’énergie des liaisons de Van der Waals?
2 à 4 kJ/mole
Qu’est-ce qu’une liaison hydrophobe?
Une liaison entre deux molécules hydrophobes, ie apolaires.
Qu’est-ce qu’un acide aminé? Quels en sont les 5 éléments constitutifs?
Un AA comporte un carbone alpha lié à :
- une fonction carbonyle a-COOH
- un groupement amine a-NH2
- une chaîne latéral R spécifique de chaque AA
- un hydrogène H
Les AA sont-ils solubles dans l’eau?
Plutôt oui
Quel est l’autre nom des AA standards? Combien y en a-t-il?
Les AA protéinogènes. 20 à 22.
Quels sont les rôles des AA standards?
- rôle métabolique
- rôle de médiateur chimique ou précurseur
Quel est l’AA qui n’a pas de carbone asymétrique? Quelles sont les deux formes de tous les autres AA?
La glycine. Tous les autres AA ont un carbone asymétrique, il existe ainsi pour chacun deux énantiomères stéréoisomères L et D qui ont souvent des propriétés biologiques différentes.
Dans le règne animal, quelle série d’AA est constitutive des protéines?
La série L, pour lévogyre, ce qui signifie que la molécule dévie la lumière vers la gauche. Pour noter une molécule L, le groupe amine est à gauche ( COOH au-dessus et R en bas)
Quelle est l’orientation des chaînes latérales des protéines avec des AA apolaires?
Souvent vers l’intérieur, due à une aversion pour l’eau.
Qu’est-ce que le pI? Comment le calculer?
Le point isoélectrique, qui correspond à la demi-somme des deux pK qui entourent la forme zwitterion (=electriquement neutre) de l’AA.
