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Questões abrangendo provas passadas

1
Q

Como se apresentam, de forma geral, a estrutura genoma procarióta ?

A
  • Constituidos por DNA de fita dupla
  • Uma região codificadora - RNA ou Proteina
  • Pequenas regiões reguladoras - Faz expressão
  • Geralmente um cromossomo circular, mas pode ter mais de um cromossomo ou com cromossomos lineares.
  • Regiões intergênicas bastante curtas
  • Presença de Elementos genéticos móveis
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2
Q

Qual a variaçao de tamanho e densidade que o genoma procarioto pode apresentar ?

A
  • De menos de 0,16Mb - 13Mb
  • Maioria 2 - 5 Mb
  • Densidade 1/kb
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3
Q

O que define a orientação de cada gene procarioto ?

A

O sentido de sua transcrição

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4
Q

Como se comporta a replicação em procariótos ?

A

Possui uma origem de replicação (oriC)

Possui uma regiao de término (terC)

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5
Q

Variação de tamanho do genoma bacteriano

A

De

159.000pb = 150kb = 0,15Mb

até

13.000.000pb = 13.000kb = 13Mb

Obs:

pb = Pares de Bases

1 kb = 1 Kilobases = 1.000 Pares de Bases;

1Mb = 1 Mega = 1.000.000 Pares de Bases

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6
Q

Qual a função das sequencias reguladores em procariotos ?

A

Controlar a transcrição

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7
Q

Cite as sequências reguladoras mais fundamentais nos procariotos e sua posição na linha

A
  • Promotor
    • regiao 5`
    • upstream da região codificadora
  • Terminador
    • regiao 3`
    • downstream da região codificadora

Ainda podem estar presentes…nao necessariamente

  • Elementos reguladores
    • adjacente ou sobreposto ao promotor
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8
Q

Definição de sítio promotor

A
  • Sitio de ligação da RNA-Polimerase
  • RNA - Pol transcreve o gene
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9
Q

Definição de sitio terminador

A
  • É uma sequência de nucleotídeos
  • Determina qndo a RNA-Pol dissocia da fita molde
  • Determinando o fim da transcrição
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10
Q

Definiçao de elementos reguladores nas sequencias reguladoras da transcriçao em procariotos

A

Sítios de ligação de proteínas ativadoras ou repressoras da transcrição.

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11
Q

Como apresenta o DNA do genoma na maioria das espécies de bactérias e de arqueas ?

A
  • Único cromossomo na forma de uma molécula de DNA de fita dupla circular covalentemente fechada
  • Ex: E.coli
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12
Q

Como é organizado os cromossomos de procariotos ?

A

Divididos em unidades de replicação chamadas de REPLICONS

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13
Q

Defina Replicons

A
  • Segmentos de cromossomos que replicam a partir de uma origem de replicação
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14
Q

Compare os replicons de bactérias; arqueas e eucariotos

A
  • Bacterias
    • um replicon - cromossomos unica origem de replicacao
  • Arqueas
    • um só replicon ou
    • duas até três origens de replicaçao (2-3 replicons)
  • Eucarito
    • cada cromossomo centenas ou milhares de replicons
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15
Q

Definição de genes parálogos

A

Genes que são similares nas suas sequências, pois são resultado de um evento de duplicação gênica ocorrido em um orga­nismo ancestral (1 gene gerou 2 cópias)

  • Genes gerados por duplicação e posterior divergência
  • 1 gene mantém a função do ancestral outro gene assume outra função relacionada
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16
Q

Diferencie éxons de introns

A

DNA possui regiões codificantes e não codificantes posicionadas intercaladamente.

  • Éxons são as codificates -
  • Introns não codificantes
17
Q

IntronsIn no processamento do RNAm em procariontes ?

A
  • Introns são raros em procariontes
  • São transcritos em RNA no núcleo
  • Não estao presentes no citoplasma como RNAm pois não sao codificantes; nao apresentam produto proteico final
18
Q

Quais são as estruturas basicas de um gene

A
  • Região codificadora
  • Sequencias reguladoras
19
Q

Defina enzimas de restrição / Endonucleases de restrição

A
  • Reconhecem uma sequência de bases específicas de DNA de fita dupla e corta
  • Corte é feito nas duas fitas e em regiao específica
20
Q

Para quais fins podemos utilizar as enzimas de restrição?

A
  • Ánalise de estrutura de cromossomos
  • Sequenciamento
  • Isolamento de Genes
  • Geração de clones
21
Q

Defina DNA recombinante

A
  • Junção de um Inserto de DNA + Vetor de clonagem
  • Os dois são introduzidos dentro da célula hospedeira (transformação)
22
Q

Defina fator Sigma

A
  • É a subunidade da RNA-polimerase que tem especificidade à ligação da enzima ao DNA (Promotor)
  • Permite o inicio da transcrição em diferentes locais do promotor
23
Q

Cite uma desvantagem na replicação bidirecional do genoma procarioto.

A

Podem acontecer colisões entre os sistemas de replicação e transcrição

24
Q

Desvio GC

A
  • Assimetria entre os nucleotídeios guanina e citocina
  • Fita lider, mais guanina
  • Fita tardia, mais citocina
25
Q

Diferencia fita lider de fita tardia

A
  • Fita Lider - replicada continua
  • Fita Tardia - replicada descontinua
26
Q

Calculo do desvio GC

A

GCdesvio = (G-C)/(G+C)

27
Q

Qual a finalidade do calculo do desvio GC ?

A

Identificação dos sítios de inicio e termino da replicação - pontos de transição

28
Q

Defina sintenia

A
  • Descreve situações de conservação da ordem de genes e outras sequências ortólogas entre dois ou mais genomas
  • Estudos genômicos,
29
Q

Genes ortólogos

A
  • Quando o determinante da homologia sao eventos de especiação**
  • Mesmo ancestral

**Surgimento de uma nova espécieao longo da evolução

30
Q

Defina ilhas genônicas

A

São segmentos de genomas procarióticos que diferem em algumas características do restante do genoma, como em conteúdo de GC e padrões de sintenia e orientação gênicas

31
Q

Qual as possiveis causas das ilhas genômicas ?

A

Estão associadas em algum grau a

  • elementos genéticos móveis, como bacteriófagos
  • elementos conjugativos ou transponíveis
  • eventos de transferência gênica horizontal.
32
Q

Defina gene

A

Segmento de DNA que contém a informação necessária para a sintese de um produto biológico funcional.

33
Q

Funções da polimerase III na replicação

A
  • 􏰇Subunidade Alpha - atividade de polimerização
  • Subunidade Epsilon􏰃 - correção de erro
34
Q

RNAses

A
  • As nucleases são enzimas que quebram as ligações fosfodiéster.
  • O foco das nucleases é a ligação entre o fosfato e o açúcar
35
Q

Defina Replicons suscintamente

A
  • Unidades de replicação
  • Segmentos cromossômicos que replicam a partir de uma origem de replicação