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Questões abrangendo provas passadas
Como se apresentam, de forma geral, a estrutura genoma procarióta ?
- Constituidos por DNA de fita dupla
- Uma região codificadora - RNA ou Proteina
- Pequenas regiões reguladoras - Faz expressão
- Geralmente um cromossomo circular, mas pode ter mais de um cromossomo ou com cromossomos lineares.
- Regiões intergênicas bastante curtas
- Presença de Elementos genéticos móveis
Qual a variaçao de tamanho e densidade que o genoma procarioto pode apresentar ?
- De menos de 0,16Mb - 13Mb
- Maioria 2 - 5 Mb
- Densidade 1/kb
O que define a orientação de cada gene procarioto ?
O sentido de sua transcrição
Como se comporta a replicação em procariótos ?
Possui uma origem de replicação (oriC)
Possui uma regiao de término (terC)
Variação de tamanho do genoma bacteriano
De
159.000pb = 150kb = 0,15Mb
até
13.000.000pb = 13.000kb = 13Mb
Obs:
pb = Pares de Bases
1 kb = 1 Kilobases = 1.000 Pares de Bases;
1Mb = 1 Mega = 1.000.000 Pares de Bases
Qual a função das sequencias reguladores em procariotos ?
Controlar a transcrição
Cite as sequências reguladoras mais fundamentais nos procariotos e sua posição na linha
- Promotor
- regiao 5`
- upstream da região codificadora
- Terminador
- regiao 3`
- downstream da região codificadora
Ainda podem estar presentes…nao necessariamente
- Elementos reguladores
- adjacente ou sobreposto ao promotor
Definição de sítio promotor
- Sitio de ligação da RNA-Polimerase
- RNA - Pol transcreve o gene
Definição de sitio terminador
- É uma sequência de nucleotídeos
- Determina qndo a RNA-Pol dissocia da fita molde
- Determinando o fim da transcrição
Definiçao de elementos reguladores nas sequencias reguladoras da transcriçao em procariotos
Sítios de ligação de proteínas ativadoras ou repressoras da transcrição.
Como apresenta o DNA do genoma na maioria das espécies de bactérias e de arqueas ?
- Único cromossomo na forma de uma molécula de DNA de fita dupla circular covalentemente fechada
- Ex: E.coli
Como é organizado os cromossomos de procariotos ?
Divididos em unidades de replicação chamadas de REPLICONS
Defina Replicons
- Segmentos de cromossomos que replicam a partir de uma origem de replicação
Compare os replicons de bactérias; arqueas e eucariotos
- Bacterias
- um replicon - cromossomos unica origem de replicacao
- Arqueas
- um só replicon ou
- duas até três origens de replicaçao (2-3 replicons)
- Eucarito
- cada cromossomo centenas ou milhares de replicons
Definição de genes parálogos
Genes que são similares nas suas sequências, pois são resultado de um evento de duplicação gênica ocorrido em um organismo ancestral (1 gene gerou 2 cópias)
- Genes gerados por duplicação e posterior divergência
- 1 gene mantém a função do ancestral outro gene assume outra função relacionada
Diferencie éxons de introns
DNA possui regiões codificantes e não codificantes posicionadas intercaladamente.
- Éxons são as codificates -
- Introns não codificantes
IntronsIn no processamento do RNAm em procariontes ?
- Introns são raros em procariontes
- São transcritos em RNA no núcleo
- Não estao presentes no citoplasma como RNAm pois não sao codificantes; nao apresentam produto proteico final
Quais são as estruturas basicas de um gene
- Região codificadora
- Sequencias reguladoras
Defina enzimas de restrição / Endonucleases de restrição
- Reconhecem uma sequência de bases específicas de DNA de fita dupla e corta
- Corte é feito nas duas fitas e em regiao específica
Para quais fins podemos utilizar as enzimas de restrição?
- Ánalise de estrutura de cromossomos
- Sequenciamento
- Isolamento de Genes
- Geração de clones
Defina DNA recombinante
- Junção de um Inserto de DNA + Vetor de clonagem
- Os dois são introduzidos dentro da célula hospedeira (transformação)
Defina fator Sigma
- É a subunidade da RNA-polimerase que tem especificidade à ligação da enzima ao DNA (Promotor)
- Permite o inicio da transcrição em diferentes locais do promotor
Cite uma desvantagem na replicação bidirecional do genoma procarioto.
Podem acontecer colisões entre os sistemas de replicação e transcrição
Desvio GC
- Assimetria entre os nucleotídeios guanina e citocina
- Fita lider, mais guanina
- Fita tardia, mais citocina
