à partir de la p.73 Flashcards

1
Q

c’est quoi une chromatographie d’affinité?

A

La chromatographie d’affinité est une technique de chromatographie qui permet de séparer un composé en utilisant des interactions biologiques entre un ligand spécifique (greffé sur une matrice macromoléculaire) et son substrat, en l’occurrence la molécule à isoler.

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Q

Les étapes de la chromatographie d’affinité

A
  1. ajout du substrat (équilibre)
  2. absorption(liaison entre ligand et substrat)
  3. laver les impurités, enlever la matrice non nécessaire
  4. faire sortir du tube les substrats( les faire libérées une fois séparées de la matrice)
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3
Q

S’il y a bcp d’affinité, parler de la liaison entre les analytes et les ligands

A

les analytes peuvent se lier sans problèmes sur les ligands situés sur les molécules dans le tubes

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4
Q

Est-ce que les molécules qui sont pas retenues passent par le détecteur aussi?

A

oui

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5
Q

quelles sont les molécules purifiées?

A

sont celles qui sont isolées et liées aux ligands.

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6
Q

comment l’étape d’élution a lieu?

A

Des ligands libres, pas sur les molécules du liquide (agarose ou silice) dans le tube, sont injectées dans le tube afin que les analytes puissent se lier plus à eux afin d’être éjecter dehors

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7
Q

Est-ce que les ligands sur les molécules d’agarose du liquide dans le tube ont la meme affinité que ceux qui sont libres?

A

oui

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8
Q

Est-ce que les analytes sont fixés de manière permanents sur les ligands?

A

non

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9
Q

Les deux types de ligands

A
  1. ligand de groupes spécifiques

2. ligands monospecifique

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10
Q

quels sont les ligands monospecifiques?

A

les anticorps
les enzymes inhibitrices
les hormones

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11
Q

Vrai ou faux

ceux avec une grande affinité dans la phase stationnaire ne restent pas longtemps dans le tube

A

Faux

il restent plus longtemps du à leur affinité

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12
Q

étapes pour la purification

A
  1. choisir la colonne d’affinité dans le tube
  2. injecter l’échantillon pour favoriser la liaison entre le ligand et la molécule d’intérêt.
  3. élution de manière non spécifique ou spécifique
  4. Rééquilibre de la colonne avec le tampon de liaison…
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13
Q

quelle intéraction est réversible pour la purification?

A

celle où il faut injecter l’échantillon contenant la biomolécule désirante

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14
Q

trois techniques d’élution non-spécifique

A
  1. changer la force ionique
  2. la polarité de l’éluant(substance du tube qui a les ligands sur lui)
  3. changer le pH
  4. changer le tampon
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15
Q

deux techniques d’élution spécifique

A
  1. avec un soluté compétitif

2. avec un ligand compétitif

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16
Q

avantage de changer le tampon

exemple: les deux techniques non-spécifiques

A

cela permet l’élution de la biomolécule sans affecter le ligand ( separation entre le ligand et la biomolécule sans qu’ils subissent un changement)

17
Q

lors de ph extremes oou concentrations élevées de chaotropes, qu’est-ce qui se passe?

A

le matériel d’affinité ( la biomolécule ou/et le ligand sont affectés- trop petits ou trop grands pour qu’ils soient liées)

18
Q

Avantage des méthodes spécifiques

A

cela permet d’augmenter la spécificité du ligand

19
Q

quels groupes doivent être ajoutés pour ces méthodes spécifiques

A

des groupements fonctionnels adéquats( avidin, PO4)

20
Q

Chromatographie par échange d’ions

Séparation c’est un principe de…

A

d’échange d’ions

une compétition des ions entre la phase mobile et le soluté ionique injecté

21
Q

Le soluté ionique injecté est pour qui

A

c’est pour les sites chargées de la phase stationnaire

22
Q

Phase stationnaire

Résine échangeuse d’anions: quelle charge?

A

chargée positivement

23
Q

Phase stationnaire

Résine échangeuse de cations :quelle charge?

A

chargée négativement

24
Q

les composants de la phase mobile

A
  1. tampon aqueux

2. gradient de ph ou de sel( force ionique)

25
Q

Les échantillons sont composés de?

A
  1. des composés ioniques ou ionisables
26
Q

les constituants de ces composés?

A

les acides faibles bases faibles, acides aminés et grosses molécules

27
Q

Types de détection

A
  1. Conductimétrique directe (chromatographie échangeuse d’ion)
  2. Conductimétrique avec suppression (Chromatographie ionique)
  3. Absoprtion UV
28
Q

L’absorption UV quand peut être utilisée?

A

Lorsque l’analyte a un chromophore

29
Q

Si la résine cationique est utilisée quel type d’échangeuse il y aura?

A

échnageuse d’Anions et pour résine anionique: échangeuse de cations

30
Q

Expliquer la chromatographie par échange d’ions

A

Les composés avec des charges négatives sont abosrbées dans la phase stationnaire et sont séparés par les composés de charge positive et ceux de charge neutre. Les composés absorbées sont après élués en augmentant la force ionique de la phase mobile

31
Q

Expliquer la chromatographie par échange d’ions: échangeuse d’anions

A

Les analytes avec une charge nette plus faibles sont éluées à une concentration moyenne de sel, tandis que les analytes avec une charge nette plus grande nécessite une phase mobile avec une force ionique plus forte encore avant d’être éluées eux aussi.

32
Q

la désorption (opposé d’absorbance) des analytes chargés négatives vient d’où?

A

vient d’un anion échangeur qui est réalisé grâce à la concentration élevée de sel.

33
Q

Si le pH est augmenté, l’analyte va…

A

ses molécules vont perdre des ions H+

34
Q

Si du sel (NaCl +) est ajouté, l’analyte va..

A

le sel va obliger l,échantillon de se deéplacer en diminuant l’intéraction entre la résine anionique des molécules de l’éluant

35
Q

Quelles protéines ont tendance à être éluées le plus vite: avec une plus grande ou plus faible charge nette au pH donné?

A

avec une faible charge nette au pH.

36
Q

Élution progressive des protéines est due grace à quoi?

A

grâce à l’augmentation du gradient de force ionique

37
Q

quelle méthode est utilisée avec un échantillon inconnu d”obtenir le profile de la protéine?

A

L’élution de gradient

38
Q

l’effet de l’étape’’ Step élution’’ cause?

A

cause une accélération pour séparer le temps et réduire la consumption buffer en retenant en meme temps le niveau de pureté.