9. Fylogenier Flashcards
Vad är fylogenier och vilka 2 andra begrepp kan användas som synonymer?
Fylogenetiska träd. Evolutionära träd. Kladogram. Hypotes/diagram för utvecklingslinjen av taxa som härstammar från en gemensam förfader. Rekonstruktion av evolutionärt släktskap mellan studerade taxa.
Nämn 3 anledningar till vad man kan använda fylogenier
-Systematik
-Hur har egenskaper evolverat?
-Datera/undersöka evolutionära händelser
Vad är en taxa?
En grupp organismer oavsett taxonomisk nivå
Hur kan vi göra fylogenetiska träd om våra förfäder då vi endast har kännedom om arter i spetsarna av trädet?
Vi kan härleda förgreningar från likheter mellan nu levande arter.
Vad menas med rotade träd?
Unik nod för taxonens MRCA. Visar den evolutionära riktningen. Träd rotas med en utgrupp.
Vad menas med orotade träd?
Visar släktskap utan antaganden om ursprung
Vad rotas fylogenetiska träd med?
En utgrupp
Vad menas med en utgruppsanalys?
I en utgruppsanalys visar besläktad grupp utseende hos förfäder
Vad menas med en parsimonianalys?
Ta reda på när evolutionära förändringar har skett för att få lägst antal förändringar i trädet
När det kommer till fylogenetiska träd kan man få falska signaler genom, vad?
Analogier/homoplasi: delade egenskaper genom konvergent evolution
Återgång: till en förfaders form
Vad menas med analogier?
Delade egenskaper genom konvergent evolution
Vad är ”mitokondrie-Eva” och y-Adam?
Alla människors mitokondrier har en gemensam urmoder och allas y-kromosomer en urfader
Varför passar det inte att använda fylogeni inom en art?
Olika gener har olika evolutionär historia
Vad är bootstrapping?
ett sätt att mäta hur starkt stöd man har för en förgrening i det bakomliggande datasettet
Hur går en bootstraping till?
- Gör träd från data
- Gör bootstrap-replikat genom att skumpvis samla datapunkter
- Gör nytt träd från bootstrap-replikaten
- Upprepa många gånger
- Se hur ofta en förgrening stöds i bootstrap-träden
Om 70% eller mer: troligen representativt för evolutionen
