6 - Compartiments cellulaires Flashcards
quels sont les 4 types de chemins d’un compartiment à l’autre
- pores nucléaires
-1 membrane (RER, peroxysome)
-2 membranes (mitochondrie, chloroplastes)
-hors cellule (secrétion)
que faut il pour distribuer les protéines dans la cellule (3)
-énergie
-peptide signal (étiquette)
-récepteur (destination)
composition membranaire du noyau (2)
2 membranes et 1 espace intermembranaire (en continuité avec le RER)
pore = liaison entre nucleoplasme et cytoplasme
(slm protéines autorisées passent)
décris le pore nucléaire (4)
-transport bidirectionnel
-centre protéique varie taille pore
-protéines de 9 nm passent par transport passif
-grosse moléc passent par transport actif (bsn énergie)
Éléments pr entrer / sortir du noyau
-pore nucléaire (CPN)
-protéine cargo (signal SLN = entrée, SEN = sortie) ticket d’entrée
-karyophérine (récepteur importine et exportine)
-protéine Ran (Ran-GTP ou GDP)
-Ran-GEF (echange GTP et GDP sur Ran)
-autres prot pr entrée et sortie de karyo/cargo/Ran
C’est quoi une nucleoporine (nups) et FG nups
protéine composant les CPN
FG nups (phenylalanine-glycine rich repeat) forment le canal central et intéragit avec les karyophérines
Signal d’importation SLN
Signal de localisation nucléaire = nécessaire pr entrer ds noyau par transport actif
ce signal est un petit peptide chargé ++
Signal exportation SEN
Signal export nucléaire pr sortir du noyau
helice a amphiphile avec bcp résidus leucine
Cest quoi une karyophérine
récepteur de signaux SLN et SEN et transportent la protéine cargo à travers le pore nucléaire
C’est quoi une protéine Ran
petite GTP-ase ss forme Ran-GTP ou Ran-GDP
GEF prend GDP et change pr GTP
GEF et GAP
Ran-GDP en Ran-GTP par GEF (noyau)
Ran-GTP en Ran-GDP par GAP (cytoplasme)
Comment l’importine lie Ran-GTP et protéine cargo SLN?
pas en même temps
importine lie cargo dans cytoplasme puis passe par pore vers noyau
ensuite lie GTP et relache cargo (GEF) - Ran-GDP en Ran-GTP
importine-GTP retourne dans cytoplasme (GAP) Ran-GTP en Ran-GDP
De quoi depend la proportion Ran-GTP et GDP
des activites GEF et GAP (GAP = hydrolyse)
Comment l’Exportine lie Ran-GTP et protéine cargo SEN?
en meme temps prend cargo SEN et GTP dans le noyau et les expulse dans le cytoplasme
C’est quoi des récepteurs nucléaires?
ils sont liés dans le cytoplasme et lient hormone et ensuite transloqués au noyau pr modif expression gènes
Qu’est ce qui permet de transmettre un signal externe dans la cellule
cascade de signalisation
Nomme 2 organites à 2 membranes et que permet cette double membrane?
chloroplastes et mitochondries
empêche traffic vesiculaire (vesicule pt pas libérer son contenu)
V ou F chaque membrane possède une activité propre
V , protéines propres et activités propres
Quelle particularité ont les double membranes quant à l’importation de protéines complètes (3D)
Leurs pores sont pas assez grandes donc pour entrer il faut dénaturer.
signal + énergie + récepteur
Quel est le signal le plus commun pr rentrer dans les mitochondries? Quelle partie est reconnu par le recepteur de l’ext du mitochondrie?
serie d’aa en NT formant hélice a amphiphile (une moitie hydrophobe et une moitie chargé +)
la partie hydrophobe est reconnue par récept
Comment appelle t on les deux complexes translocateurs+recepteurs des deux membranes mitochondriales?
TOM (membrane externe)
TIM (membrane interne)
Role de HSP70
Garde les prot dépliées pr qu elles puissent entrer, doivent hydrolyser de l’ATP pr ce faire
Grandes étapes de l’importation de prot dans le mitochondrie
protéine reconnue par TOM et depliée par HSP70.
dans espace intermembranaire reconnue par TIM et rentre à l’interieur
signal coupé.
Est-ce que tous les peptides passent par TOM / TIM
passent tous par TOM ms ds espace intermembranaire peut passer ailleur selon signaux internes
que se passe-t il avec le peptide signal qd elle arrive dans l’endroit désiré?
coupé
à part signaux internes
ou sont la plupart des proteines ds les Chloroplastes?
stroma et tylakoides
Comment appelle-t on les complexes recepteurs+translocateurs chez les chloroplastes?
TOC (membrane externe) et TIC (membrane interne)
a quoi ressemble le peptide signal chez les chloroplastes?
encore en NT mais très variable
V ou F il faut un autre signal pr incorporer proteines au thylakoides
V, il sera aussi clive qd arrivé a destination
Que se passe-t il lorsque le chloroplaste subit des dommages oxydatifs? Par quelles réactions chimiques
l’incorporation des protéines peut être temporairement inactivée
Groupement thiol sur TOC et TIC réagit avec l’oxygène inactive
que fait le cycloheximide
empeche synthese proteines
ribosomes se collent sur mitochondries ms synthese arretee
REL et RER
REL: réticulum endoplasmique lisse = synthèse des lipides (production de membranes)
RER: réticulum endoplasmique rugueux = protéines de sécretion
Que fait l’Acyl transférase et la scramblase dans la REL
acyl transf fait phospholipides à partir de acide gras + glycérol (ajout sur feuillet externe)
scramblase equilibre quantité de phospholipides sur les 2 membranes
comment sont transportés les phospholipides?
par transport vésiculaire et répartis grâce aux flippases +ATP
role peroxysome
oxydation et eliminer les peroxydes
que sont les peroxines ou sont elles produites ou migrent elles
protéines de la membrane des peroxysomes et elles sont produites dans le RER et migrent vers le REL pour produire peroxysomes par bourgonnement
d’ou viennent les protéines du peroxysome
du RER et du cytoplasme
Sont inserées par les péroxines (signal SKL CT)
Deux facons de faire croitre un peroxysome
- de novo (lent) fusion de 2 vésicules du RE
- croissance et fission de peroxysomes déja existants (rapide)
V ou F le contenu des peroxysomes est le mm dune cell à l’autre
F
ou se fait la bioluminescence
peroxysomes insectes
que fait le trafifc vesiculaire? quels organites exclut il
transport protéine du RE à golgi et autres endroits
pas pr mitochondries et chloroplastes
comment se fait le transport des phospholipides pr les mitochondries et les chloroplastes
pk pas le mm type de transport
par PEP
membrane double
cmt proteines crees ds le RER
ribosome attache RER et traduit prot ds le RER
les prot ont un signal hydrophobe de 20 aa PSIT
clivage signal site AXA par peptidase
que fait SRP?
arrete temporairement la traduction par le ribosome, GTP hydrolysé par SRP puis translocation par Sec61 dans le RER
pourquoi il y a bouchon sur le translocateur du RER
reguler translocation
cmt protéines hydrophiles entrent ds le RER
PSIT clivé grâce au signal AXA
cmt fr proteines hydrophobes
signal SAT
Cmt prot sait si elle doit rester ds RER ou aller ds golgi
PSIT KDEL = RER
KDEL = golgi
decris ajout sucre sur proteines par RER
pr aider au repliment de proteines on pt ajouter des sucres (oligosaccharide transferase)
tjr mm unité de 14 sucres(mannose, glucose, NAG)
ds maturation devient 4-5 sucres
la plupart des proteines du RER sont exportées. quels ajouts peut on faire pr proteger les proteines?
ajout groupements SH et ancre GPI (lipidique pr aider ancrage a la membrane)
cmt vont les prot du RER vers le golgi
transport vesiculaire 3 types
clathrin COPI COPII
Cmt former COPII
Sar1 activee par GEF
Sar1 se rassemble avec Sar23 et 24 et proteines a transporter
Sec13 et 31 font enveloppe vesicule et va vers Golgi
Qq COPII arrive au golgi que se passe t il
perd son ancienne membrane et fusionne avec membrane Golgi
2 types de protéines que les COPII utilisent pr arriver au golgi
Rab et SNARE
que font SNAREs
proteines membranaires aident à fusionner membranes vesicule
v-SNARE = sur vesicule
t-SNARE = sur membrane exemple Golgi
trois parties du golgi
cis-golgi = fusion vesicule
median-golgi = maturation proteines
trans-golgi = proteines triées et emballées pr destination finale (endosome/lysosome)
role vesicules COPI
medient retour vers Golgi
reconnaissent prot ayant signal KDEL pr proteines solubles et KKXX pr proteines transmembranaires
pk glycosyler
solubiliter, ciblage, couche protetectrice, adheration et signalisation
