5. Cycle de Krebs Flashcards
Qu’est-ce que la respiration cellulaire
Oxydation aérobique du catabolisme
Les cellules animales sont aérobiques et elles oxydent le carburant en CO2 et H2O
Carburant= Sources d’énergies organisque comme glucose, AG, AA…
La respiration cellulaire se produit en combien d’étape
Les nommer
3:
Glycolyse
Cycle de Krebs
Chaine de transport des électrons et chimiosmose
Qu’est-ce que le carrefour métabolique
Point final et commun du catabolisme des glucides (glycolyse, voie des pentoses phosphates), lipides et protéines/acides aminés car tous aboutissent à la formation d’acétyl-CoA
Qu’est-ce que la centrale énergétique de la cellule
La matrice mitochondriale
À l’intérieur de la mitochondrie
Quel est le but du cycle de krebs
But: produire des intermédiaires énergétiques qui serviront à la production d’ATP dans la chaîne respiratoire (prochain thème).
Intermédiaire énergétique: NADH, FADH
Que se passe-t-il au niveau du cycle de Krebs globalement
La majeure partie des oxydations et de la production d’énergie d’une cellule
Expliquer pourquoi le cycle de Krebs est une série de réactions cycliques
Par opposition à linéaire
Le dernier métabolite, l’oxaloacétate, est aussi impliqué dans la première réaction du cycle.
Quel est le substrat du cycle de krebs
Acétyl-CoA
Combien de rx comporte le cycle de krebs
8 rx enzymatiques
Qui suis-je: Nous sommes réoxydés par la chaîne respiratoire au cours des phosphorylations oxydatives et l’énergie libéré est couplé à la synthèse d’ATP
NADH et FADH2
Produit du cycle de krebs
Qui suis-je: nous sommes utilisés dans la biosynthèse de nombreux constituants cellulaires vitaux
Intermédiaires du cycle de krebs
Vrai ou faux: toute dysfonction du Cycle de Krebs produits des conséquences critiques
Vrai
Les maladies associées sont rares (autosomales récessives) et graves
Qu’est-ce que l’acidose lactique
Si hypoxie, les mitochondries sont incapables de continuer la synthèse de l’ATP à un débit suffisant aux besoins de la ø tandis que la glycolyse se fait normalement.
Résultat: excès de pyruvate qui est convertit en lactate (respiration anaérobique ou fermentation) et relaché par la ø dans le sang où il s’accumule
Hypoxie: apport en oxygène insuffisant
Pyruvate: produit de la glycolyse
L’acétyl-CoA est un produit commun de dégradation de…
- Glucides
- AG
- AA
De quoi est formé le CoA
- Groupe B-mercaptoéthylamine
- Acide pantothénique
- 3’,5’-adénosine diphosphate
Acide pantothénique=Vitamine B5 nutrient essentiel ø synthétisé in vivo
Le CoA assure quoi
Transport du groupement Acétyle
En le liant à son groupement thiol du B-Mercaptoéthylamine
Où s’accroche l’Acétyl
Au groupe thiol actif pour faire un lien thioesther
Vrai ou faux: L’Acétyl-CoA est un composé riche en énergie
Vrai
Hydrolyse de son lien thioesther
∆G˚’ = très -
Quel est le précuseur immédiat de l’acétyl-CoA
Lors de la dégradation des glucides
Pyruvate
Vrai ou faux: le oyruvatee doit être transporté dans la mitochondrie
Expliquer
Vrai
Le pyruvate doit être transporté dans la matrice mitochondriale via un système de transport actif (symport)
Pyruvate: Cytosol
Cycle de Krebs: Mitochondrie
Parenthèse en chimie-physique
∆G˚
- Qté totale d’énergie utilisée ou produite
- Condition standard
- [ ] de tous les réactifs fixé à 1
- Rx atteindra l’équilibre
Parenthèse en chimie-physique
∆G˚’
- pH fixé à 7
- [H+] 10^-7 (pas 1)
+réaliste en biologie car plupart des rx se produisent à pH neutre 6 à 8
Parenthèse en chimie-physique
Pourquoi est-il plus fréquent et réaliste d’utiliser le ∆G
dans une cellule, des paramètres autre que le pH varient (Concentration des substrats, cofacteurs)
∆G= tout en conditions physiologiques
Parenthèse en chimie-physique
∆G’
- Conditions physiologiques
- pH = 7
Parenthèse en chimie-physique
∆G˚’ = 0
[ substrats ] [ produits] sont égales à l’équilibre
Parenthèse en chimie-physique
Vrai ou faux: l’énergie requise pour la synthèse d’ATP (ou généré apr son hydrolyse) n’est pas fixe et dépend des concentration d’ADP, d’ATP, de Pi et du pH
Expliquer
Vrai
∆G varie selon les conditions de la cellule
L’acétyl-CoA
Synthèse de l’Acétyl-CoA se déroule en cmb d’étapes et fait intervenir quoi dans le cas de la décarboxylation oxydative du pyruvate
5 étapes
fait intervenir un complexe multienzymatique appelé complexe pyruvate déshydrogénase (PDH)
Qui suis-je: Nous sommes formés d’enzymes associées qui catalysent deux réactions successives ou plus, d’une voie métabolique
Complexes multi-enzymatiques
Complexes multi-enzymatiques
En quoi ces complexes représentent un saut évolutif important
En terme d’efficacité catalytique
Ils offrent des avantages mécanistiques
Complexes multi-enzymatiques
Quels sont les avantages mécanistiques
- Vitesses des réactions enzymatiques sont limitées par la fréquence de collisions entre enzymes et substrat. Si une suite de réactions se déroule au sein d’un complexe multi-enzymatique, la distance que doivent parcourir les substrats entre les sites actifs est minimisée, ce qui augmente la vitesse de l’ensemble des réactions
- La formation d’un complexe donne les moyens de guider les intermédiaires métaboliques d’une enzyme à l’autre dans une voie métabolique, minimisant ainsi les réactions annexes
- Les réactions catalysées par un complexe multi-enzymatique peuvent être régulées de manière coordonée
Complexe PDH
Composé de
3 enzymes :
- pyruvate déshydrogénase (E1)
- dihydrolipoyl transacétylase (E2)
- dihydrolipoyl déshydrogénase (E3)
5 coenzymes (certaines sont des groupements prosthétiques*) :
- thiamine pyrophosphate (TPP)
- lipoamide/dihydrolipoamide *
- coenzyme A (CoA)
- flavine adénine dinucléotide (FAD) *
- nicotinamide adénine dinucléotide (NAD+)
Complexe PDH
Quel coenzyme est l’accepteur dans Acétyl-CoA
Coenzyme A (CoA)
Complexe PDH
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