4 - Nukleotid og nukleosider Flashcards

1
Q
A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Hva består et nukleosid av?

A

En nitrogenholdig base bundet til en pentose.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Hva kalles fosforylerte nukleosider?

A

Nukleotider.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Hvilke pentoser finnes i RNA og DNA?

A
  • D-ribose (i RNA) * 2’-deoksy-D-ribose (i DNA)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Hvilke nitrogenbaser finnes i DNA?

A
  • Adenin (A) * Tymin (T) * Cytosin (C) * Guanin (G)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Hvilke nitrogenbaser finnes i RNA?

A
  • Adenin (A) * Uracil (U) * Cytosin (C) * Guanin (G)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Hva er tautomere former?

A

Konstitusjonsisomerer som lett interkonverterer og er i likevekt med hverandre.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Hvordan er basene bundet til pentosen?

A

Gjennom en N-β-glykosidbinding.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Hva er DNA?

A

Et polynukleotid bestående av deoksyribo-nukleotidresiduer.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Hvilke baser inneholder deoksyribonukleotidene?

A
  • dAMP (A) * dTMP (T) * dCMP (C) * dGMP (G)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Hva er fosfodiesterbindinger?

A

Bindinger som forbinder 3’-karbonet i et nukleosidresiduum med 5’-karbonet i det neste.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Hva er Chargaffs regler?

A
  • % A = % T * % G = % C * Varierer mellom arter, men er konstante innen en art.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Hva er 5’-enden av en DNA-tråd?

A

Enden som ikke er bundet til et nukleotid i 5’-posisjon.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Hva er 3’-enden av en DNA-tråd?

A

Enden som ikke er bundet til et nukleotid i 3’-posisjon.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Hva er B-DNA?

A

Den mest stabile formen av dobbelttrådet DNA under fysiologiske betingelser.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Hva er A-DNA?

A

En flattrykt struktur med større diameter, favorisert i vannfattige miljøer.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Hva karakteriserer Z-DNA?

A

En venstrehendig heliks med en mer utstrakt form.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Hva er semikonservativ replikasjon?

A

Replikasjon der hvert nytt DNA-molekyl består av en tråd fra det opprinnelige DNA-molekylet og en ny tråd.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Hva er replikasjonsbobler?

A

Strukturer dannet når DNA-trådene separeres under replikasjon.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Hva er førstemeldingsretningen for DNA-syntese?

A

5’ til 3’ retning.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Hva er Okazaki-fragmenter?

A

Diskontinuerlige fragmenter som dannes under syntese av den laggende tråden.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Hva katalyserer sammenkoblingen av Okazaki-fragmenter?

A

DNA ligase.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Hva er rollen til DNA polymeraser?

A

Katalyserer dannelsen av fosfodiesterbindingene.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Hva er smeltetemperaturen (Tm) til DNA?

A

Temperaturen der halvparten av baseparene er brutt opp.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Hva er ribonukleinsyre (RNA)?
Et polynukleotid bestående av ribonukleotidresiduer.
26
Hvilke baser inneholder ribonukleotidene?
* AMP (A) * UMP (U) * CMP (C) * GMP (G)
27
Hva er messenger-RNA (mRNA)?
RNA som fungerer som budbringer av genetisk informasjon fra DNA til ribosomet.
28
Hva er transfer-RNA (tRNA)?
Adaptere som oversetter den genetiske informasjonen i mRNA til en aminosyresekvens.
29
Hva er ribozymer?
RNA-molekyler med katalytisk aktivitet.
30
Hvilke sekundærstrukturer kan RNA danne?
Høyrehendige helikser.
31
Hva fungerer som adaptere som oversetter den genetiske informasjonen i mRNA?
olekyler
32
Hva kalles RNA-molekyler med katalytisk aktivitet?
ribozymer
33
Hvilken type helikser dannes av enkelttrådete RNA-molekyler uten lange selv-komplementære basesekvenser?
høyrehendige helikser
34
Hva er π-stacking interaksjoner?
Interaksjoner mellom nabobaser
35
Hvilke baser danner sterkest π-stacking interaksjoner?
Purin-baser
36
Hva danner to RNA-molekyler eller deler av ett RNA-molekyl med komplementære basesekvenser?
A-form høyrehendig dobbeltheliks med antiparallelle tråder
37
Hvilke basepar dannes i en A-form dobbeltheliks?
* A med U * C med G
38
Hva er G-U baseparing?
Et wobble basepar
39
Hva er en 'inverted repeat'?
En sekvens som etterfølges av en sekvens som er den omvendte av sekvensens komplementære sekvens
40
Hva danner enkelttrådete nukleinsyrer med inverted repeats?
hårnåler (hairpins/stem-loop)
41
Hva danner dobbelttrådete nukleinsyrer med inverted repeats?
kors (cruciforms)
42
Hva skjer med fosfodiesterbroene i nukleinsyrer under basiske betingelser?
De hydrolyseres, noe som gir frie nukleosider
43
Hvorfor hydrolyseres RNA mye lettere enn DNA?
Deprotonering av 2’-OH-gruppen muliggjør angrep på fosforatomet intramolekylært
44
Hva skjer med nukleinsyrer under sure betingelser?
Både fosfodiesterbroene og β-N-glykosidbindingene hydrolyseres
45
Hva er pseudouridin?
Et modifisert nukleosid, den vanligste posttranskripsjonelle modifikasjonen av RNA
46
Hvilken binding brukes til å binde uracil til D-ribose i pseudouridin?
C5-C1’ binding
47
Hva er den viktigste komponenten i BioNTech/Pfizer og Moderna-vaksinene?
Modifisert mRNA-molekyl
48
Hvilken base er byttet ut med N1-metylpseudouridin i modifisert mRNA?
Alle uridinene
49
Hvilke stoffer kan alkylere og modifisere DNA- og RNA-basene?
Endogene og eksogene stoffer
50
Hva er metylering?
En modifikasjon av DNA- og RNA-basene, spesielt adenin og cytosin
51
Hva er metyldonoren for metylering?
SAM/adoMet (S-adenosylmetionin)
52
Hva skjer med DNAet i cellekjernen?
Det er utsatt for skade fra eksogene forbindelser, reaktive spesier og ioniserende stråling
53
Hvor mange tilfeldige, midlertidige endringer skjer i DNAet til en enkelt celle hver dag?
Flere titusentalls
54
Hva er Ames-testen?
En test for mutagenisitet som bruker en bakteriestamme med en mutasjon
55
Hva skjer med bakterien i Ames-testen når den utsettes for mutagene forbindelser?
Det øker sannsynligheten for tilbake-mutasjon slik at den kan syntetisere histidin
56
Hva gjør DNA-reparasjonsmaskineriet?
Oppdager og korrigerer skader/feil i genomet
57
Hvor mye av de midlertidige endringene blir permanente takket være DNA-reparasjon?
< 0,02%
58
Hvilke gener koder for komponenter av DNA-reparasjonsmaskineriet?
Gener i E. coli involvert i DNA-metabolisme
59
Hvilke arvelige sykdommer skyldes gener for dysfunksjonelle komponenter av DNA-reparasjonsmaskineriet?
* Xeroderma pigmentosum * BRCA1/2-mutasjoner
60
Hva er en vanlig type skade på DNA?
Oksidasjon av G til 8-okso-G
61
Hva er Base Excision Repair (BER)?
Reparasjon der kun den skadede basen/nukleotidet klippes ut og erstattes
62
Hva er Nucleotide Excision Repair (NER)?
Reparasjon der et segment på 12-24 nukleotider klippes ut og resyntetiseres
63
Hva er Non-homologous end joining (NHEJ)?
En metode for reparasjon av dobbelttrådbrudd
64
Hva er en glykosylase?
Et enzym som katalyserer hydrolyse av N-glykosidbindingen
65
Hva er rollen til DNA polymerase I i Base Excision Repair?
Erstatter nukleotider i den skadede tråden
66
Hva er en viktig acetylgruppe-donor i metabolismen?
Acetyl-CoA