3 domaines et des virus Flashcards
Procaryotes
Membranes intracellulaires absentes
Dimensions plus petites que 1 um
Pas d’histones chez les bactéries
Histones chez les archées
ADN circulaire
Reproduction par fission binaire
Grande diversité du métabolisme
Caractères propres des bactéries
Paroi de peptidoglycanes contient de l’acide muramique
1er acide amine: formylméthionine
Un seul type d’ARN polymérase
Absents: introns, histones, membranes internes, organites
Première classification
Selon leur réaction avec la méthode de coloration de Gram:
G+ : plusieurs pathogènes sensibles aux antiobiotiques
G- : quelques pathogènes, résistance aux antiobiotiques
Classification récente et diversité
Infos génétiques et approche phylogénétique
Séquence gène ARN 16s similaire à 97%
1 million à 1 milliard de bactéries sur Terre
Diversité des bactéries
Au sein d’une même espèce, les différences peuvent être considérables lorsqu’on analyse l’ensemble des gènes
Génome de base commun
Pan-génome énorme
Diversité métabolique
Photo-autotrophes: source d’énergie lumineuse, n’absorbent pas les mêmes longueurs d’onde que la chlorophylle des plantes vertes
Chimio-autotrophes: source d’énergie chimique inorganique
Chimio-hétérotrophe (composés organiques): regroupent la majorité des bactéries
Origine des bactéries
Premiers fossiles: milliards d’années, premiers organismes vivants
Stromalites; structures d’origine bactérienne
Importance écologique des bactéries
Organismes fixateurs N2: rhizobiums (légumineuses et bactéries), lichens à cyanobactéries
Importance écologique des bactéries
Cycles biogéochimiques
Fixation de l’azote atmosphérique
Photosynthèse et production d’O2
Production primaire planétaire
Décomposition et dégradation des déchets humains
Symbiose avec d’autres organismes
Microbiote bactérien chez les humains et autres animaux
Utilité des bactéries
Production de nourriture
Antiobiotiques
Maladies humaines importantes
Biotechnologie
Probiotiques
Caractères dérivés propres
Phospholipides membranaires particuliers
ARN de transfert particulier
Ribosome avec une forme caractéristique
Habitat des archées
Milieux extrêmes:
Sources géothermales
Milieux acides
Milieux anoxiques
Milieux très froids
Présentes dans le tubes digestifs des humains/ruminants
Marais
Feuilles
Caractères dérivés propres
ADN dans un noyau délimité par une mambrane nucléaire
Chromosomes condensés lors de la division cellulaire
Division cellulaire par mitose
Microtubules du cytosquelette
Présence de mitochondries
Reproduction sexuée (échange entre les paires de chromosomes)
Mitochondries
Endosymbiose primaire d’une protéobactérie aérobique
Chloroplastes
Endosymbiose en série d,Une cyanobactérie photosynthétique
Diversité/évolution des eucaryotes
Unicellulaires ou pluricellulaires
Plusieurs transitions indépendantes vers la multicellularité
Deux grands clades: bicontes, unicontes
Plusieurs noeuds irrésolus
Caractères dérivés propres des bicontes
Deux flagelles
Lignée verte
Caractères dérivés propres des unicontes
Un seul flagelle
Animaux/humains
Unicellulaires eucaryotes (protistes)
Partout où il y a de l’eau/humidité
Phytoplancton
Zooplancton
Diversité des protistes
Mode de vie: libre ou symbiose
Métabolisme: autotrophe ou hétérotrophe
Moyen de locomotion: cils, flagelles, …
Mode de reproduction: asexué ou sexué, cycle vital simple ou complexe
Présence d’une coquille externe: silice ou calcaire
Définition de virus
Agent infectieux qui doit se répliquer dans une cellule hôte
Structure de virus
Formé d’une capside protéique qui contient des molécules d’ARN ou d’ADN et parfois quelques enzymes
Enveloppe avec lipides entoure parfois la capside
Non-cellulaire: sans membranes ni organelles, sans métabolisme
Types de virus
Selon le matériel génétique pour former l’ARN messager
Virus à ADN
Virus à ARN
Virus à transcription inverse
Diversité des virus
Chaque domaine du vivant est infecté par des virus tout à fait différents
Étapes générales de la réplication virale
- Adsorption
- Pénétration
- Décapsidation
- Synthèse d’acides nucléiques et protéines virales
- Assemblage et encapsidation
- Libération
Microbiote
La communauté de micro-organismes vivant ensemble, leur diversité
Qualifié par le lieu
Microbiome
Le microbiote et son milieu
Metagénome
Diversité génétique du microbiote
Holobionte
Microbiote et son hôte
Hologénome
Génome de l’holobionte
