הרצאה 3 Flashcards
באיזה שלב התאים הם
totipotent?
מתי התאים הופכים ל
pluripotent?
לאיזה סוג התאים שהיו ב
inner cell mass
יכולים להתחלק?
מהן שלוש ששכבות הנבט, ובגסות, למה כל אחת מהן הופכת?
אילו תאי גזע יש בבוגרים? למה הם יכולים להתמיין? איפה הם נמצאים? למה נוכל לגרוםלהםלהתמיין במעבדה?
מהי שושלת התאים?
איזה שלבים היא כוללת?
תאר כל שלב
מהם
instructive factors?
מהם
extrinsic factors?
על מה הם משפיעים?
כמה קומבינציות שונות של תאים יכולים לתת שלוש פקטורי שעתוק בעלי שני מצבים - פועל ולא פועל?
מהו המנגנון העיקר של בקרת הביטוי הגנטי?
שעתוק זה המנגנון העיקרי בבקרת ביטוי גנטי. אבל יש גם בקרה פוסט-שעתוק כמו ייצוא
mRNA
splicing
תרגום חלבונים, עיבוד ומודיפיקציות פוסט-תרגומיות .
מהן איזורי ציס ומהם איזורי טראנס?
מי הם פקטורי השעתוק הכלליים שקיימים בתא, שנמצאים לצורך שעתוק של דנא? איפה הם מתחברים ביחס לאיזור תחילת השעתוק?
מה זה
enhancer?
מה מתחבר אליהם? אקטיבטורים או רפרסורים?
האם פקטור שעתוק מסויים חייב להיות רק אקטיבטור או רק רפרסור?
איך נקרא פקטור שעתוק שיכול להיות גם וגם?
פקטור שעתוק שיכול להיות גם וגם נקרא פקטור שעתוק פליאוטרופי
מה הקונספט שמנים להעביר לנו בתמונה?
מהו
feed forward mechanism?
איזה תא אנחנו מכירים שעובד בצורה הזו?
מה ניתן לומר על הביטוי של הגן
even skipped?
איך הוא מתבטא בהתחלה ואיך בהמשך? מה מאפשר את השינוי הזה?
מהו קוד ההיסטונים? איזה סוג בקרה הוא עושה?
מה עושה היסטון אצטילאז?
מה עושה היסטון אצטילז טרנספראז וקינאזות?
מה עושה היסטון מתילאז טרנספראז?
לפני שיש התמיינות של תאים נצפה לראות הרבה הטרוכרומטין או הרבה כרומטין פתוח?
בהתחלה, כשהתאים עוד לא התמיינו זה מצב דיפולט של הטרו-כרומטין, וכדי שתהיה
התמיינות צריך לפתוח את ההטרו-כרומטין .
מהו הניסוי שעשו בתרנגולים שהוכיח את הקשר בין מבנה הכרומטין לביטוי הגן?
מה זה
positive autoregulation?
איך זה עובד בתא שריר (באופן כללי, לא ספציפי)
מה הקשר בין פקטרוים חיצוניים לפקטורים פנימיים שמשפיעים על שעתוק של גנים?
איזה סוג תאים רואים בכל שלב של התמונה?
מה גורם למעבר משלב 1 לשלב 2? מה התאים מפסיקים לעשות במעבר הזה?
מה יקרה אם נחבר תא שריר של עכבר לתא לתא כבד של אדם? מה המשמעות של התוצאה?
תאר את הניסויים בעזרתם גילו את הגן
MyoD
איך נקראת משפחת החלבונים אליה שייך החלבון
MyoD?
איזה עוד חלבונים המשפחה מכילה?
באיזה אופן החלבונים עובדים? (לבד? ביחד? בדימר עם חלבון אחר?)
מה התמונה באה להדגים?
מה שצבוע בכחול בתמונה זה כמות ביטוי של הגן
MyoD.
ניתן לראות שיש הרבה ממנו בסומיטים, ושהוא מתחיל לנדוד לכיוון הבטן ולכיוון הגפה העליונה התחתונה. אלו איזורים בהם אנחנו יודעים שאמוריםלהתפתח שרירים
עם מי חלבוני ה
MyoD
יודעים להקשר כדימר? איזה חלק בחלבון
MyoD
נקשר לדנא? מה בתכונות החלבון מאפשר זאת? איזה חלק שלו מאפשר לו להקשר כדימר לחלבון הנוסף אליו הוא נקשר?
איך נקרא הרצף דנא אליו נקשר
MyoD?
איזה נוקלאוטידים הוא מכיל?
באיזה תאים מתבטאים החלבונים איתם
MyoD
עובד כדימר?
איזה חלבונים מהווים אקטיבטורים לפעילות של
MyoD
ואיזה חלבונים עובדים כרפרסורים? איך עובדים הרפרסורים האלה?
מאיזה חלק בעובר נוצרים על שרירי השלד מהצוואר מטה?
מהסומיטים
איפה נמצאים הסומיטים?
כשנלך לאיזה כיוון נקבל סומיטים יותר בוגרים? לכיוון הראש או הרגל?
חלוקה לאיזה שתי קבוצות עובר הסומיט?
מה נוצר מכל קבוצה?
באיזה אופן הקבוצה השנייה נודדת ביחס לראשונה? (מעליה? מתחתיה?)
1
Neural tube
2
Epaxial dermomyotome
3
Dermomyotome
4
Myotome
5
Hypaxial dermomyotome
6
Mygrating myogenic progenitor cells
7
pre muscle mass
8
Limb
9
Sclerotome
10
Notochord
באיזה איזור בסומיט מתבטא
MyoD?
איזה שרירים יווצרו מאיזור זה?
באיזה איזור בסומיט מתבטא
Myf-5?
איזה שרירים יווצרו מאיזור זה?
מתי מתבטא
MRF4?
מתי מתבטא
Myogenibn?
MyoD: expressed in hypaxial (limbs, abdominal) myotome
כלומר ייצור את שרירי הגפה והבטן
Myf-5: expressed in epaxial (back) myotome
כלומר ייצור את שרירי הגב
MRF-4: expresed as myoblasts differentiate into
myotubes and myofibers
כלומר הוא מתבטא בשלב מאוחר יותר, בשלב הדיפרנציאציה של המיובלסטים
Myogenin: expresed as myoblasts differentiate into
myotubes and myofibers
גם הוא מתבטא בשלב מאוחר יותר. מצורפת תמונה
מוסתרים סיגנלים שהולכים למקומות שונים בסומיט. מהם הסיגנלים?
1
BMP4
noggin
מוסתרים סיגנלים שהולכים למקומות שונים בסומיט. מהם הסיגנלים?
2
Wnt
מוסתרים סיגנלים שהולכים למקומות שונים בסומיט. מהם הסיגנלים?
3
Shh
לאיזה איזור של הסומיט הולך הסיגנל
Wnt
למה הוא גורם? מי מוציא את הסיגנל?
מי מוציא את הסיגנל
Shh
לאן הוא הולך ואיך הוא משפיע?
מי מפעילאת הסיגנל
BMP
לאן הוא הולך ועל מה משפיע?
לא כתוב אבל הלטרל מזודרם מוציא
BMP4
מהם השלבים השונים של התמיינות שריר שלד?
איזה גונים פועלים בכל שלב?
הבהרה:
MyoD, MyF5
הם גנים שנמצאים במיובלסטים. ברגע שמסירים מהאיזור את הפקטורי גידול, התאים המיובלסטים יפסיקו להתחלק ויתחילו להתמיין לתאי שריר של ממש. אז יבואו לידי ביטוי גנים כמו
Myogenin
Mrf4
מה נקבל אם נעשה נוקאאוט ל
MyoD
בלבד?
ל
MyF5
בלבד?
לשניהם?
מה יקרה אם יעשו נוקאאוט למיוגנין?
מה המנגנון שגורם לכך שכשיש פקטור גדילה אין התקדמות להתמיינות לשריר ושכשאין פקטור גדילה יש התמיינות?
ניתן לראות שכשיש פקטור גדילה
FGF
מופעל הקומפלקס
CyclinD1-Cdk4
שגורם לפרוליפרציה ועוצר את
MyoD
מלקדם התמיינות.
כשמרחיקים את פקטור הגדילה
העיכוב של מיוד מפסיק, הוא גם מוביל להתמיינות, וגם מפעיל את החלבון
p21
שמונע גדילה
האם
MyoD
ו
Myogenin
מתחברים לאותו איזור בדנא? האם יש להם את אותם חלקים?
על מה אחראי כל אחד מהגנים?
מה יש בחלבון
MyoD
שאין בחלבון
myogenin?
היסטדין ציסטאין והליקס 3, כפי שניתן לראות בתמונה
מה התפקיד של החלקים היסטידין ציסטאין והליקס 3 במיוד?
הם מביאים חלבונים שמשפיעים על מבנה הכרומטין:
Histone acetylreansferase
הוא עושה הצטליציה של היסטונים וגורם לפתיחת הכרומטין
למיוג’נין אין את החלקים האלה ולכן הוא לא משפיע על מבנה הכרומטין.
מהם הקומפלקסים
Swi/snf?
למי הם יכולים להתחבר?
הם יכולים להתחבר רק למיוד ולא למיוג’נין. זה קומפלקס שבאמצעות אנרגיית
ATP
יכול לפתוח כרומטין
למי מיוד קשור במיובלסט, שמונע ממנו לפעול?
למי הוא קשור בהיעדר פקטור גדילה?
במיובלסט, כשיש פקטורי גדילה באיזור, הוא קשור לקומפלסקס
HDAC
שמעכב אותו. בהיעדר פקטורי גדילה
HDAC
עובר לציטופלזמה, ואז מיוד נקשר ל
HAT
שמסוגל לעשות אצטילציה להיסטונים ולרווח את הדנא.
איך נראה אתר הקישור של
myoblast
ושל
myogenin
מה יכולת הקשירה של מיוד אליו במיובלסט? איך הוא בסוף מצליח להקשר אליו? מתי מיוג’נין יוכל להתבטא?
מיוד נקשר ל25,000 אתרים בגנום אך משפיע רק על 1900 גנים. למה?
מהו המנגנון
feed forward?
איך הוא קשור ל
MyoD?
מהם תאי
satellite?
למה הם יהפכו בגלל סיגנל? מתי יגיע הסיגנל?
איזה פקטורים נראה מופעלים בכל שלב של ההתמיינות שלהם?
אלו תאי גזע יוניפוטנטים שיכולים להפוך לשריר. הם יופעלו בעת פציעה שיש צורך לתקן.
השאר בתמונה