25.08 ביוכימיה 1 Flashcards

1
Q

כמה מתוך 90 היסודות בטבלה המחזורית נחשבים כ trace elements ?

A

13 ,
- מרביתם קטנים , מלבד 3 (יוד, טנגסטן, מולבידם)
- הם נדרשים במיליגרמים ביום.
- חיוניים לתפקוד אנזימים וחלבונים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

מהו מספר היסוד הראשון ממשפחת הלנטנידים?
ומהו מספר היסוד הראשון ממשפחת האקטנידים?

A

לנטנידים - 57
אקטנידים - 89

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

כמה מהיסודות בטבלה המחזורית נחשבים Bulk Elements , ומהו תפקידם ?

A

10 יסודות,
נדרשים בגרמים מדי יום ,
בעלי תפקיד מבני בתאים וברקמות.
H, Na, Cl, K, Ca, C, O, N, S, P

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

כיצד משפיע הקשר התוך מולק׳ על הקשר הבין מולק׳ ?

A

יכולת המולק׳ לעשות קשרים בין מולקולריים תלויה ונגזרת מאופי ותכונות הקשרים התוך מולקולריים , ככל שהקשר הקוולנטי ( תוך מולקולרי) יותר קוטבי , המולק׳ יותר פולארית ויוצרת קשרי דיפול יותר חזקים , נוכחות אטומי NOF משפיעה על היווצרות קשרי מימן.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

על אלו תכונות של המולקולה ישפיעו קשרים בין מולקולריים ?

A
  • מסיסות (הידרופילי או ליפופילי)
  • מצב צבירה , ככל שיש יותר קשרים והם יותר חזקים המולק תהיה יותר סדורה
  • נק׳ רתיחה / התכה , ככל שיש יותר קשרים והם יותר חזקים נק׳ הרתיחה / התכה תעלה.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

מהו מספר הקשרים המקסימלי שאטום חנקן יכול ליצור עם אטום פחמן?

A

2 קשרים ,
מאידך , שני אטומי חנקן יכולים ליצור 3 קשרים עם עצמם.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

מהי הגאומטריה של המולקולה CH4 ?

A

1) המולקולה בעלת מבנה טטראהדרלי,
2) בין אטומי המימן לפחמן ישנה זווית של 109.5 מעלות,
3) אורך הקשר (קשר יחיד) 0.154 ננומטר,
4) ישנו ציר סיבוב חופשי

** ציר סיבוב חופשי קיים בקשר יחיד -C-C- , אלא אם כן על כל אחד מהפחמנים יש קבוצות טעונות מאד או גדולות מאד.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

מהם תכונותיו של קשר כפול ?

A
  • קצר (0.134 ננומטר)
  • כל האטומים המשתתפים בו נמצאים על אותו מישור
  • קשיח ואינו מאפשר סיבוב חופשי (רוטציה מוגבלת)
  • בין קבוצות הצד יש זווית של 120 מעלות.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

מהו אורכו הממוצע של קשר בודד ?

A

0.154 ננומטר

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

ממה מורכבת קבוצת אנהדריד?

A

משתי קבוצות קרבוקסיליות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

בטבעת אימידאזול (imidazole):

  • יש שני אטומי גופרית
  • יש שני אטומי זרחן
  • יש שני אטומי חנקן
  • מורכבת אך ורק מפחמן ומימן
A

שני אטומי חנקן

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

כמה קבוצות פונקציונליות מכילה המולקולה אציטיל קו A ?

A

8 קבוצות פונקציונליות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

כמה אטומי גופרית מכילה מולקולת אציטול קו-A ?

A

אחד , כחלק מקבוצת תיואסתר אחת שקיימת במבנה שלה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

איזה סוג קשר מחבר בין קבוצת אציטיל למולקולת קואנזים-A ?

A

קשר תיואסטרי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

כמה אטומי זרחן יש במולקולת אציטיל קו-A ?

A

3

שניים כחלק מקבוצת פוספואנהדריד.
אחד כחלק מקבוצת פוספוריל.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

בתא אי קולי, איזה מאקרו-מולקולה מהווה את האחוז הכי גבוה ממשקל התא ?

A

חלבונים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

איזה מבין שתי המאקרו-מולקולות הבאות תורמת יותר למשקלו של חיידק האי קולי ?

DNA או RNA

A

RNA,

פי 6 יותר מ DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

משקלה הממוצע של מאקרו-מולקולה הוא ?

A

מעל ל 5000 KDA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

איזה מבין הבאים אינה נחשבת מאקרו-מולקולה ?

  • חלבונים ,
  • חומצות גרעין ,
  • שומנים ,
  • פוליסכרידים.
A

שומנים

** מאקרו-מולקולות הם פולימרים גדולים , שומנים אינם יוצרים פולימרים (אלא קומפלקסים כדוגמת הממברנה).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

איזומרים מרחביים (סטריאואיזומרים) נבדלים זה מזה ב:

  • נוסחה מולקולרית
  • קישוריות בין האטומים
  • קונפיגורציה
  • קונפורמציה
A

קונפיגורציה.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

מהם הגורמים הקובעים את הקונפיגורציה של מולקולה ?

A

1) קשרים כפולים (המונעים סיבוב חופשי סביב הקשר)

2) מרכזים כיראליים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

במה נבדלת קונפורמציה מקונפיגורציה ?

A

קונפיגורציה: סידור מרחבי של אטומי המולקולה , לא ניתן לעבור בין קונפיגורציות שונות בלי שבירת קשר.

קונפורמציה: הסידור המרחבי של אטומי המולקולה , ניתן לעבור בין קונפורמציות שונות בלי לשבור קשר קוולנטי , הודות ליכולת הסיבוב החופשית סביב קשר יחיד.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

האם קונפיגורציה היא תכונה בלעדית של מולקולות בעלות קשרים כפולים?

A

לא , גם במולקולות שיש בהם מרכז כיראלי ייתכנו מספר קונפיגורציות.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

מה מניע הפיכת 11-ציס-רטינאל ל all trans retinal ברשתית העיין של חולייתנים ?

A

ספיגת אנרגיית אור (250 kj/mol)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

פחמן כיראלי הוא:

A
  • פחמן טטראהדרלי
  • הקבוצות הסובבות אותו יכולות להתארגן ביותר מצורה מרחבית אחת.

שקף 35/37

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

מולקולה המכילה מרכז כיראלי אחד ויחיד:

A

יהיה לה שני סטריאואיזומרים אך ורק מסוג אננטיומרים

(שקף 37)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

במולקולה המכילה יותר ממרכז כיראלי אחד:

A

נקבל גם אננטיומרים וגם דיאסטריומרים

(שקף 37)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

תערובת שאינה מסיטה אור מקוטב היא:

  • תערובת רצמית
  • תרכובת שאין בה מרכזים כיראליים
  • שתי התשובות נכונות
  • אף לא תשובה נכונה
A

שתי התשובות נכונות

(שקף 41)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

תערובת רצמית:

A

חסרת פעילות אופטית

(שקף 41)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

קונפורמציית staggered יותר יציבה מקונפורמציית eclipsed, ולכן ניתן לבודד אותה?
נכון / לא נכון

A

קונפורמציית staggared אכן יותר יציבה , אך בפועל לא ניתן לבודד אף אחת מהן.

(שקף 43)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

המעבר בין קונפורמציית staggered ל קונפורמציית eclipsed דורש התערבות אנזימטית:

A

לא נכון ,

המעבר אינו דורש התערבות אנזימטית , אלא שהוא מתרחש הודות לסיבוב חופשי סביב קשר יחיד.

(שקף 41)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

staggered vs. eclipsed:

A

הן שתי הקונפורמציות של מולקולה נתונה שמציגות את הפוטנציאל האנרגטי הנמוך ביותר (s) , והגבוה ביותר (e).
ועל כן , הן הקונפורמציה הכי יציבה (s) של המולקולה , והכי פחות יציבה (e).

ההפרש האנרגטי בינהן קטן מאד, ולכן המעבר בינהם מהיר מאד , מליוני פעמים פר שניה , ולכן לא ניתן לבודד אותם.

(שקף 43)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

מה משפיע על הסיבוב החופשי של אטומים סביב קשר בודד?

A
  • גודל הקבוצה
  • מטען הקבוצה

ככל שהקבוצה יותר גדולה / ויותר טעונה כך יכולת הסיבוב החופשי נפגעת , וזה יוריד את מספר הקונפורמציות היציבות של המולקולה.

(שקף 43)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

מהי סטריאוספיציפיות ?

A

ההתאמה הסטריאו-כימית בין שתי מולקולות , שדרושה כדי שתהיה בינהן אינטראקציה.

(שקף 45)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

באורגניזם , רוב המולקולות מתקיימות רק בצורה כיראלית יחידה?
נכון / לא נכון

A

נכון ,
מכיוון שהאנזימים שמייצרים אותם הם בעצמם כיראליים.

(שקף 45)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

מה קובע התאמה סטריאוכימית בין שתי מולקולות?

  • קונפיגורציה
  • קונפורמציה
  • קונפיגורציה + משקל מולקולרי
  • תשובות א׳ + ב׳
A

הצירוף של קונפיגורציה וקונפורמציה

(שקף 45)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

במעבדה אנחנו יכולים לסנתז צורה כיראלית אחת ויחידה של מולקולה נתונה:
נכון / לא נכון

A

לא נכון ,

בניגוד לגוף , במעבדה אנחנו יכולים לסנתז סטריאואיזומרים עם כמה צורות של המרכז הכיראלי.

(שקף 45)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

בגוף האדם יש גם D-glucose, וגם L-glucose, אולם קונפיגורציית D יותר נפוצה , ולכן הקסוקינאז עובד בעיקר על D-glucose:

נכון/ לא נכון

A

לא נכון ,

בגוף קיים רק D-glucose ,
הקסוקינאז אינו מזהה L-glucose

(שקף 45)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

מה הם התנאים שצריכים להתקיים כדי ששתי מולקולות יוכלו להתרכב אחת עם השניה ?

A

הם צריכות להתנגש אחת בשניה בעוצמה ובכיוון הנכונים.

(שקף 49)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

מהם תכונותיו של קבוע שיווי המשקל עבור ריאקציה מסויימת:

A
  • קבוע בתנאי טמפ׳ ולחץ נתונים
  • אינו תלוי בריכוזים ההתחלתיים של המגיבים או התוצרים
  • חסר יחידות (מבטא יחס)
  • מבטא את היחס בין התוצרים למגיבים רק לאחר שהריאקציה הגיעה לשיווי משקל (ריאקציה הפיכה)
  • בהינתן קבוע ש.מ של ריאקציה , היחס בין התוצרים למגיבים הינו קבוע , כל עוד הטמפ׳/ לחץ לא השתנו
  • ככל שערך Keq גבוה יותר, משמע הריאקציה נוטה חזק יותר לכיוון התוצרים

(שקף 49)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q

מה זה מנת הריאקציה Q ?

A

הוא היחס בין התוצרים למגיבים בריאקציה מסויימת , ברגע נתון, שלא בהכרח נמצאת בשיווי משקל.

(שקף 49)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
42
Q

האם מנת הריאקציה , Q, יכול להיות שווה לקבוע שיווי המשקל ?

A

כן,
כאשר …

(שקף 49)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
43
Q

מי מהבאים ישנה את קבוע שיווי המשקל של ריאקציה ?

  • העלאת הטמפרטורה
  • הורדת ה ph של הריאקציה והעלאת ריכוז התוצרים
  • שינוי בלחץ האטמוספרי
  • תשובות 1 ו- 3
A

לחץ / טמפ׳

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
44
Q

כיצד ישפיע שינוי בריכוז התוצרים על קבוע שיווי המשקל של ריאקציה כלשהי?

A

שינוי בריכוז התוצרים או המגיבים , אינו משפיע על קבוע שיווי המשקל של הריאקציה , אולם המערכת יוצאת משיווי משקל , מכיוון שהיחס בין התוצרים למגיבים השתנה (מנת ריאקציה Q)

(שקף 51)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
45
Q

בהוספת תוצרים לריאקציה נתונה , כיצד תושפע מנת הריאקציה Q ?

A

תהיה יותר גדולה מקבוע שיווי המשקל , כי במשוואה התוצרים נמצאים במונה.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
46
Q

מה עושה האנזים adenylate kinase ?

A
  • מעבר בין 3 הצורות ATP/ ADP/ AMP.
    2ADP = ATP + AMP
  • הריאקציה נמצאת קרוב לשיווי משקל בתא,
  • האנזים דורש מגנזיום כקו פקטור.
47
Q

מתי קצב הריאקציה יעלה ?

A

כאשר יהיו יותר התנגשויות בין מולקולות המגיבים, מתי זה קורה?

  • כאשר טמפ׳ המערכת יותר גבוהה (אנרגיה קינטית)
  • בריכוז סובסטרט (מגיבים) יותר גבוה
  • בריכוז אנזים יותר גבוה (תעלה מהירות התחלתית)
  • ככל שאנרגיית האקטיבציה תהיה יותר נמוכה.
48
Q

האם קצב הריאקציה מושפע מנוכחות אנזימים ?

A

כן ,

אנזים מוריד את אנרגיית האקטיבציה ועל כן מעלה את קצב הריאקציה.

״קצב הריאקצה״ הוא מדד קינטי , ועל כן תלוי בריכוז האנזים.
ככל שיש יותר אנזימים , הקצב יעלה

(שקף 55)

49
Q

תאר את השפעתו של אנזים על דלתא ג׳י של ריאקציה:

A

אנזים מוריד את הדלתא ג׳י שבין מצב המעבר למגיבים (מוריד אנרגיית שפעול) ,

אך הוא אינו משפיע על הדלתא ג׳י שבין התוצרים למגיבים.

50
Q

כיצד משפיע אנזים על קבוע שיווי המשקל של הריאקציה ?

A

הוא אינו משנה את ערכו !!

בנוכחות אנזים הריאקציה תגיע לשיווי משקל מהר יותר (עקב קצב ריאקציה גבוה יותר), אך ערך שיווי המשקל לא ישתנה.

51
Q

תגובה שלא יכולה להתרחש , משיקולים תרמודינמיים , לא תתרחש גם בנוכחות אנזים!

A
  • אנזים אינו משפיע על הרכב שיווי המשקל
  • אינו משפיע על כיוון הריאקצה
  • אינו משפיע על קיום / אי קיום הריאקציה

הוא רק מזרז ריאקציה שבכל מקרה ״יכולה״ לקרות , דרך הורדת מחסום אנרגטי!

52
Q

בריאקציה רב שלבית , איזהו השלב קובע המהירות ?

A
  • השלב האיטי ביותר
  • השלב המבוקר ביותר
53
Q

האנרגיה החופשית של גיבס היא מדד ל ?

A

כמות העבודה שיש לבצע , (במערכת סגורה!!!) , כדי שריאקציה מסויימת תצא לפועל.

(שקף 59)

54
Q

מה אומר ערך דלתא ג׳י חיובי עבור ריאקציה מסויימת ?

A

שהריאקציה בתנאי הטמפ׳ והלחץ הנתונים תתקדם בכיוון המגיבים!

55
Q

מה אומר ערך של דלתא ג׳י שלילי ?

A

שהריאקציה הנתונה (בתנאי טמפ׳ ולחץ קבועים) , תתקדם באופן ספונטני ואקסרגוני (שאינו דורש אנרגיה) לכיוון התוצרים

56
Q

ערך דלתא ג׳י חיובי עבור ריאקציה נתונה אומר ש ?

A

כדי שהריאקציה תתקדם בכיוון התוצרים , נדרשת השקעת אנרגיה (ריאקציה אנדרגונית)

57
Q

כאשר שני אטומים נמצאים ממש רחוק אחד מהשני , יש להם את האנרגיה הפוטנציאלית הגבוהה ביותר?

A

לא נכון , כאשר הם קרובים מאד אחד לשני ויש בינהם דחיה , האנרגיה הפוטנציאלית שלהם היא הכי גבוהה , במרחק גדול , האנרגיה הפוטנציאלית שלהם קרובה לאפס.

(שקף 59)

58
Q

מהי אנתלפיה ?

A

מדד לאנרגיה (אנרגיית חום) האגורה בתוך מערכת תרמודינמית

59
Q

דלתא H הוא ?

A

האנרגיה הפנימית שאגורה בקשרי התוצרים פחות האנרגיה הפנימית האגורה בקשרי המגיבים.

60
Q

מה אומר דלתא H חיובי ?

A

שאנרגיית החום האגורה בתוצרים גבוהה מזו שבמגיבים.

61
Q

אם לריאקציה יש דלתא H חיובי , ניתן להגיד ש:

A

הריאקציה היא אנדותרמית , כלומר הושקעה אנרגיה (חום) מהסביבה אל תוך המערכת.

62
Q

כיצד משפיע מספר הקשרים הבין / תוך מולקולריים על האנתלפיה ?

A

ככל שבמערכת יש יותר קשרים (בין מולק׳ ו/או תוך מולק׳) זה אומר שהאנרגיה במערכת קטנה יותר , ועל כן האנתלפיה נמוכה יותר.

במעבר ממצב צבירה עם הרבה קשרים למצב צבירה עם מעט קשרים , יש עליה באנטרופיה

(שקף 61)

63
Q

אנתרופיה:

A
  • מדד לאקראיות שבה תהליכים יכולים להתרחש במערכת תרמודינמית , ככל שהתהליכים יותר אקראיים , האנתרופיה יותר גבוהה.
64
Q

ככל שהרנדומליות של תהליך, והתנועה של המולקולות תעלה :

A

האנתרופיה תעלה

65
Q

ככל ש דלתא S יותר חיובי ?

A
  • התהליך מועדף יותר תרמודינמית
66
Q

האם ריאקציה אקסותרמית היא ספונטנית ?

A

לא בהכרח ,

ריאקציה אקסותרמית משמעה שהיא פולטת חום לסביבה ( דלתא H שלילי) , אך זה לא מבטיח שהיא ספונטנית (דלתא ג׳י שלילי).

67
Q

מהי ריאקציה אנדותרמית ?

A

ריאקציה שבה הושקעה אנרגיית חום מהסביבה אל תוך המערכת ( דלתא H חיובי)

68
Q

מה ההבדל בין ריאקציות אנדרגוניות / אקסרגוניות לריאקציות אנדותרמיות / אקסותרמיות ?

A
  • אנדרגונית: לא ספונטנית, דורשת השקעת אנרגיה, דלתא ג׳י חיובי.
  • אנדותרמית: קולטת חום מהסביבה, דלתא H חיובי.
  • אקסרגונית: ספונטנית, אינה דורשת אנרגיה, דלתא ג׳י שלילי.
  • אקסותרמית: פולטת חום לסביבה, דלתא H שלילי.
69
Q

בתהליך ספונטני :

A
  • דלתא ג׳י שלילי
  • משתחררת אנרגיה חופשית
70
Q

האנרגיה החופשית בתהליך בניית מקרומולקולות בתא היא חיובית, מדוע ?

A

כי המקרומולקולות (פולמרים) יותר מאורגנים ופחות יציבים (תרמודינמית) בהשוואה למונומרים שמרכיבים אותם.

** בעיקר בהיבטים של אנטרופיה , כלומר הם יותר מסודרים.

71
Q

במולקולת ATP ישנם 3 קבוצות ______ המחוברות בקשר ______ ?

A
  • פוספוריל
  • פוספואנהדרידי
72
Q

תנאים סטנדרטים הם:

A
  • טמפ׳ 25 צלזיוס (298 קלווין)
  • ריכוז תוצרים ומגיבים שווה 1 מולאר במומסים או 1 אטמוספרה בגזים.
73
Q

מהו מחסום אקטיבציה ?

A

מחסום אנרגטי , עליו יש להתגבר ( על ידי השקעת אנרגיית אקטיבציה) כדי שריאקציה תתרחש , כלומר , שנעבור ממגיבים לתוצרים.

74
Q

למה תגרום הורדת אנרגיית האקטיבציה של ריאקציה נתונה ?

A

העלאת קצב הריאקציה

** אנרגיית אקטיבציה וקצב ריאקציה הם מדדים קינטיים !

75
Q

יציבות קינטית היא ?

A

הזמן שלוקח לריאקציה להתרחש , ככל שלוקח יותר זמן לריאקציה להתרחש , כך היא יותר יציבה קינטית.

קשר פפטידי למשל בחלבונים הוא בעל מחצית חיים של 7 שנים בערך , לוקח לו המון זמן להתפרק , ולכן הוא יציב קינטית.

יציבות קינטית היא תוצר של אנרגיית אקטיבציה גבוהה מאד.

אנזימים שמורידים אנרגיית אקטיבציה , יגרמו לתהליך מסויים להתרחש יותר מהר , ובכך מורידים יציבות קינטית.

76
Q

באיזה סוג ריאקציות נוצרים נשאי אלקטרונים מחוזרים , כדוגמת NADH ?

A

ריאקציות קטבוליות

77
Q

ריכוז ה ATP בתאים הוא גבוה / נמוך מריכוזו בשיווי משקל ?

A

ריכוז ATP בתאים גבוה בהרבה מריכוזו בשיווי משקל ,
ולכן פירוקו הוא מאד אקסרגוני (דלתא ג׳י גדול ושלילי) , ומועדף תרמודינמית.

78
Q

מהו תפקידם של נשאי אלקטרונים מחוזרים כגון NAD(P)H ?

A
  • מסירת אלקטרונים בתהליך נשימה תאית (יצירת ATP)
  • קידום שלבי חיזור במסלולי סנתזה (?)

(שקף 74)

79
Q

כיצד E.coli מייצר איזוליאוצין ?

A
  • החיידק מייצר איזוליאוצין מתריאונין במסלול מטבולי בן 5 שלבים שמאונזמים ע״י 5 אנזימים שונים.
  • איזוליאוצין בעצמו הוא מעכב של המסלול ,
  • כשריכוזו עולה , הוא נקשר לאנזים הראשון במסלול ומעכב אותו
  • זהו אפוא עיכוב במשוב שלילי
80
Q

מהו אורכו של קשר מימן בין שתי מולק׳ מים ?

A

0.177 ננומטר

81
Q

ממה נובעות תכונותיה של מולק׳ מים ?

A
  • מכוחות המשיכה הקיימים בין מולקולות המים (מימן / דיפול)
  • מנטייתה המועטה של מולקולת המים להתיינן (למסור פרוטון)

** תכונות אלו של המים גם משפיעות על תכונותיהם של כלל מרכיבי התא האחרים (חלבונים, שומנים וכו׳) , ועל יכולתם להתרכב זה עם זה ולויצור אינטראקציות. !!

(שקף 81)

82
Q

מהי אנתלפיית אידוי (או אנרגיית אידוי)

A
  • כמות האנרגיה שיש להשקיע ב גרם אחד של מים נוזליים , בטמפ׳ החדר ובאטמוספרה אחת , כדי להמיר אותם למצב גזי
  • האנרגיה שיש להשקיע כדי להתגבר על כוחות המשיכה (מימן) שיש בין מולק׳ מים במצבם הנוזלי.
83
Q

מה משפיע על חוזקו של קשר מימן ?

A

הזווית שבין האטום המקבל (acceptor) והקשר הקוולנטי שבין האטום הנותן ( donor) למימן.

אם הזווית היא 180 מעלות , קשר המימן יהיה חזק יותר , אם זו זווית אחרת הקשר יהיה חלש.

במצב כזה המטען החיובי שעל המימן יהיה ממוקם בדיוק באמצע בין שני מטענים חלקיים שליליים.

(שקף 88)

84
Q

מהן תכונותיו של קשר מימן ?

A
  • הכי חזק בין כל הקשרים הבין מולקולריים
  • קשר משיכה אלקטרוסטטי
  • תנאי להיווצרות NOF + H/NOF
  • כיווני מאד , משמע על מנת ששתי מולק׳ יוכלו ליצור קשרי מימן זו עם זו , הן צריכות להיות בסידור גאומטרי מסויים זו יחסית לזו.
85
Q

רוב הביומולקולות בתא הן תרכובות טעונות או קוטביות !

A

וזה הגיוני כי המדיום בתא זה מים , שבעצמם קוטביים , וזה מאפשר המסה של אותן מולקולות.

86
Q

כיצד מלחים (סריגים יוניים) מומסים במים ?

A

המים מפרים את הקשר האלקטרוסטטי שמחזיק את היונים ביחד ומחלישים אותו (מתחרים עליו) , המים לאחר מכן מתקבצים סביב היונים , מנטרלים (חלקית) את המטענים שלהם ומייצבים אותם , ובכך פועלים כנגד נטיית היונים להתגבש (להסתדר).

87
Q

מים טהורים נוטים להתיינן במידה מועטה

A

משמע שבריאקציה:

H2O = H3O + OH

רוב המולקולות יהיו ב מצב של H2O ,
קבוע שיווי המשקל של הריאקציה יהיה קטן מ 1

88
Q

מהו ריכוז המים בשיווי משקל בריאקציה
H2O = H3O + OH
בתנאים סטנדרטים ובנפח 1 ליטר ?

A

55.5M

89
Q

מהו ה ph של תמיסה בעלת ריכוז פרוטונים
? [H] = 10^-4

A

4

90
Q

הערך [H]*[OH] בתמיסה מימית ובתנאים סטנדרטים הוא ?

A

קבוע , ושווה
10^-14 M^2

91
Q

בתמיסה מימית ובתנאים סטנדרטים pH + pOH יהיה שווה ?

A

14

92
Q

מדוע הגזים O2 ,N2, CO2 אינם מסיסים במים ?

A
  • אינם פולריים
  • המעבר ממצב גזי למצב ממויים , מוריד את האנטרופיה במערכת ועל כן לא מועדף
93
Q

כיצד פחמן דו חמצני מועבר בזרם הדם ?

A

פחמן דו חמצני יוצר חומצה פחמתית בתמיסה מימית ( H2CO3) , ומועבר בזרם הדם הן כיון בי קרבונט חופשי (HCO3-), או כשהוא קשור להמוגלובין.

94
Q

הכנסת מומס לא פולרי אל תוך מים תגרום ל ?

A
  • התארגנות מולקולת המים בקרבתו המידית של המומס (יצירת כלוב) , בצורה שמגבילה את מספר האוריינטציות האפשריות של מולקולות המים הנ״ל מה שמעלה את הסדר , ולכן זהו מצב לא מועדף.
  • ככל ששטח הפנים / שטח המגע של החומר הלא פולרי גדל , כך התארגנות מולק׳ המים סביבו תעלה , ועל כן הסדר יעלה והאנטרופיה תרד יותר.
  • clathrates: תרכובות גבישיות של מומסים לא פולריים ומים , שבהם יש יותר סדר , אנטרופיה נמוכה יותר, מאשר ״בכלוב״.
95
Q

תאר את השינויים בדלתא G , דלתא H , דלתא S שחלים במערכת כאשר מכניסים מומס לא קוטבי אל תמיסה מימית

A

השינויים שחלים אינם מועדפים אנרגטית:
G - עולה
H - עולה
S - יורד

96
Q

מתי מושגת יציבות תרמודינמית ?

A
  • כאשר דלתא S עולה
  • כאשר דלתא H יורד
97
Q

האם מים מעבירים זרם חשמלי ?

A

כן,
- מים מיוננים מעבירים זרם חשמלי
הודות לתופעת ״דילוג פרוטונים״
- בדילוג פרוטונים קיימת תנועה מהירה של H ו- OH לשני קטבים מנוגדים בתמיסה
- בעצם מדובר בשרשרת מעבר פרוטונים בין מולק׳ מים עוקבות הודות לקשרי המימן
- כל פרוטון בעצמו עובר בדילוגים מרחק קצר, אך בנטו התנועה היא למרחקים גדולים
- דילוג פרוטונים הרבה יותר מהיר מדיפוזיה רגילה.

98
Q

כיצד עובדות ריאקציות מעבר פרוטונים ביולוגיות ?

A
  • דרך ״דילוג פרוטונים״
  • בתא אין H חופשי
  • ציטוכרום f בממברנת הכלורופלסט עובד בשיטה זו
  • 5 מולק’ מים שמחוברות בקשרי מימן עם עצמן וח. אמינו בחלבון מעבירות פרוטונים בשיטה זו
  • בחלבון יש טבעת הם (ברזל) שמעבירה אלקטרונים בצימוד למעבר פרוטונים
99
Q

מה זה Kw ?

A
  • קבוע שיווי המשקל של מים טהורים
  • מתאר את מידת היינון של המים

מים טהורים הם מיוננים מעט!!

100
Q

חומצה הידרוכלורית , חומצה חנקתית וחומצה גופרתית הם חומצות ?

A

חזקות ,

HCl, H2NO3, H2SO4

101
Q

קבוע שיווי משקל עבור חומצה vs בסיס

A
  • עבור חומצה:
    ככל ש Ka גדול יותר/ pKa קטן יותר החומצה חזקה יותר.
  • עבור בסיס:
    ככל ש Kb גדול יותר / pKb קטן יותר הבסיס חזק יותר (ועל כן החומצה המצומדת חלשה יותר).
102
Q

לבסיס נתון pKb נמוך מאד , מה זה אומר על החומצה המצומדת שלו ?

A

חומצה חלשה

103
Q

pKa + pKb = ?

A

14

104
Q

כאשר ה pH של התמיסה שווה ל pKa - 1 של החומצה , ניתן להגיד ש:

A

10% ממולקולות החומצה מסרו את הפרוטונים שלהם (בד״כ)

105
Q

טטרציה :

A

C1V1 = C2V2

  • אני יודע את כמות הבסיס שהכנסתי (נפח וריכוז)
  • אני יודע את נפח התמיסה
  • כשהתמיסה מגיעה ל pH ניטרלי , אני מסיק את ריכוז החומצה.

המשוואות של טטרציה:
- H2O = H3O + OH
- HA = H3O + A

106
Q

לתמיסה מסויימת שמכילה חומצה כלשהי , הוספו 0.5 אקוויולנטים של הבסיס NaOH , בתמיסה נמדד pH שערכו היה x, מהו ערך ה pKa של החומצה ?

A

X

** ערך ה pH של התמיסהה שנמדד לאחר הוספת 0.5 אקוויולנט בסיס, הוא ה pKa של החומצה !

107
Q

משוואת הנדרסון הסלבך:

A
  • צורת עקומת הטיטרציה של כל חומצה חלשה מתוארת ע״י משוואת הנדרסון הסלבך.
  • pH = pKa + log [A][HA]
108
Q

כל עוד ה pH של הסביבה קטן מה pKa של החומצה , החומצה לא תמסור את הפרוטון שלה !

A

משפט הקסם

109
Q

מה הם הבופרים הביולוגיים/פזיולוגיים, והיכן הם עובדים ?

A
  • חלבונים וחומצות חלשות
  • היסטדין וחלבונים שמכילים הסטדין ציטופלסמה
  • נוקליאוטידם כגון ATP ומטבוליטים בעלי משקל מולק נמוך - ציטופלסמה
  • פוספט (H2PO4) - ציטופלסמה
  • ביקרבונט בופר במערכת הדם
  • אמוניה בופר של השתן
  • אברונים, מרכיבים חוץ תאיים המכילים תרכובות שמשמשות כבופר כמו למשל הוואקולה בצמחים.
110
Q

אצל יונקים , לנוזלים חוץ תאיים ולרוב המדורים הציטופלסמטיים יש ph בטווח של ?

A

6.9 - 7.4

111
Q

פוספט הוא אחד משני הבופרים החשובים ביות במערכות ביולוגיות , השני הוא ביקרבונט , מהו ערך ה pka של פוספט ?

A

6.86

** ועל כן הוא מצויין כבופר בציטופלסמה של כל התאים

לשים לב מערכת הבופר היא H2PO4 = HPO4
ולא H3PO4

112
Q

כל חומצה בעלת pka שקטן ממינוס 2 נחשבת חומצה חזקה

A

שזה אומר שה Ka שלה הוא 100 , כלומר על כל חומצה שלא התפרקה , 100 כן התפרקו.

113
Q

סדר הופעת האטומים בגוף מהכי הרבה להכי מעט:

A

HCON
מימן הכי הרבה , חנקן הכי פחות.