25.08 ביוכימיה 1 Flashcards
כמה מתוך 90 היסודות בטבלה המחזורית נחשבים כ trace elements ?
13 ,
- מרביתם קטנים , מלבד 3 (יוד, טנגסטן, מולבידם)
- הם נדרשים במיליגרמים ביום.
- חיוניים לתפקוד אנזימים וחלבונים.
מהו מספר היסוד הראשון ממשפחת הלנטנידים?
ומהו מספר היסוד הראשון ממשפחת האקטנידים?
לנטנידים - 57
אקטנידים - 89
כמה מהיסודות בטבלה המחזורית נחשבים Bulk Elements , ומהו תפקידם ?
10 יסודות,
נדרשים בגרמים מדי יום ,
בעלי תפקיד מבני בתאים וברקמות.
H, Na, Cl, K, Ca, C, O, N, S, P
כיצד משפיע הקשר התוך מולק׳ על הקשר הבין מולק׳ ?
יכולת המולק׳ לעשות קשרים בין מולקולריים תלויה ונגזרת מאופי ותכונות הקשרים התוך מולקולריים , ככל שהקשר הקוולנטי ( תוך מולקולרי) יותר קוטבי , המולק׳ יותר פולארית ויוצרת קשרי דיפול יותר חזקים , נוכחות אטומי NOF משפיעה על היווצרות קשרי מימן.
על אלו תכונות של המולקולה ישפיעו קשרים בין מולקולריים ?
- מסיסות (הידרופילי או ליפופילי)
- מצב צבירה , ככל שיש יותר קשרים והם יותר חזקים המולק תהיה יותר סדורה
- נק׳ רתיחה / התכה , ככל שיש יותר קשרים והם יותר חזקים נק׳ הרתיחה / התכה תעלה.
מהו מספר הקשרים המקסימלי שאטום חנקן יכול ליצור עם אטום פחמן?
2 קשרים ,
מאידך , שני אטומי חנקן יכולים ליצור 3 קשרים עם עצמם.
מהי הגאומטריה של המולקולה CH4 ?
1) המולקולה בעלת מבנה טטראהדרלי,
2) בין אטומי המימן לפחמן ישנה זווית של 109.5 מעלות,
3) אורך הקשר (קשר יחיד) 0.154 ננומטר,
4) ישנו ציר סיבוב חופשי
** ציר סיבוב חופשי קיים בקשר יחיד -C-C- , אלא אם כן על כל אחד מהפחמנים יש קבוצות טעונות מאד או גדולות מאד.
מהם תכונותיו של קשר כפול ?
- קצר (0.134 ננומטר)
- כל האטומים המשתתפים בו נמצאים על אותו מישור
- קשיח ואינו מאפשר סיבוב חופשי (רוטציה מוגבלת)
- בין קבוצות הצד יש זווית של 120 מעלות.
מהו אורכו הממוצע של קשר בודד ?
0.154 ננומטר
ממה מורכבת קבוצת אנהדריד?
משתי קבוצות קרבוקסיליות
בטבעת אימידאזול (imidazole):
- יש שני אטומי גופרית
- יש שני אטומי זרחן
- יש שני אטומי חנקן
- מורכבת אך ורק מפחמן ומימן
שני אטומי חנקן
כמה קבוצות פונקציונליות מכילה המולקולה אציטיל קו A ?
8 קבוצות פונקציונליות
כמה אטומי גופרית מכילה מולקולת אציטול קו-A ?
אחד , כחלק מקבוצת תיואסתר אחת שקיימת במבנה שלה
איזה סוג קשר מחבר בין קבוצת אציטיל למולקולת קואנזים-A ?
קשר תיואסטרי
כמה אטומי זרחן יש במולקולת אציטיל קו-A ?
3
שניים כחלק מקבוצת פוספואנהדריד.
אחד כחלק מקבוצת פוספוריל.
בתא אי קולי, איזה מאקרו-מולקולה מהווה את האחוז הכי גבוה ממשקל התא ?
חלבונים
איזה מבין שתי המאקרו-מולקולות הבאות תורמת יותר למשקלו של חיידק האי קולי ?
DNA או RNA
RNA,
פי 6 יותר מ DNA
משקלה הממוצע של מאקרו-מולקולה הוא ?
מעל ל 5000 KDA
איזה מבין הבאים אינה נחשבת מאקרו-מולקולה ?
- חלבונים ,
- חומצות גרעין ,
- שומנים ,
- פוליסכרידים.
שומנים
** מאקרו-מולקולות הם פולימרים גדולים , שומנים אינם יוצרים פולימרים (אלא קומפלקסים כדוגמת הממברנה).
איזומרים מרחביים (סטריאואיזומרים) נבדלים זה מזה ב:
- נוסחה מולקולרית
- קישוריות בין האטומים
- קונפיגורציה
- קונפורמציה
קונפיגורציה.
מהם הגורמים הקובעים את הקונפיגורציה של מולקולה ?
1) קשרים כפולים (המונעים סיבוב חופשי סביב הקשר)
2) מרכזים כיראליים.
במה נבדלת קונפורמציה מקונפיגורציה ?
קונפיגורציה: סידור מרחבי של אטומי המולקולה , לא ניתן לעבור בין קונפיגורציות שונות בלי שבירת קשר.
קונפורמציה: הסידור המרחבי של אטומי המולקולה , ניתן לעבור בין קונפורמציות שונות בלי לשבור קשר קוולנטי , הודות ליכולת הסיבוב החופשית סביב קשר יחיד.
האם קונפיגורציה היא תכונה בלעדית של מולקולות בעלות קשרים כפולים?
לא , גם במולקולות שיש בהם מרכז כיראלי ייתכנו מספר קונפיגורציות.
מה מניע הפיכת 11-ציס-רטינאל ל all trans retinal ברשתית העיין של חולייתנים ?
ספיגת אנרגיית אור (250 kj/mol)
פחמן כיראלי הוא:
- פחמן טטראהדרלי
- הקבוצות הסובבות אותו יכולות להתארגן ביותר מצורה מרחבית אחת.
שקף 35/37
מולקולה המכילה מרכז כיראלי אחד ויחיד:
יהיה לה שני סטריאואיזומרים אך ורק מסוג אננטיומרים
(שקף 37)
במולקולה המכילה יותר ממרכז כיראלי אחד:
נקבל גם אננטיומרים וגם דיאסטריומרים
(שקף 37)
תערובת שאינה מסיטה אור מקוטב היא:
- תערובת רצמית
- תרכובת שאין בה מרכזים כיראליים
- שתי התשובות נכונות
- אף לא תשובה נכונה
שתי התשובות נכונות
(שקף 41)
תערובת רצמית:
חסרת פעילות אופטית
(שקף 41)
קונפורמציית staggered יותר יציבה מקונפורמציית eclipsed, ולכן ניתן לבודד אותה?
נכון / לא נכון
קונפורמציית staggared אכן יותר יציבה , אך בפועל לא ניתן לבודד אף אחת מהן.
(שקף 43)
המעבר בין קונפורמציית staggered ל קונפורמציית eclipsed דורש התערבות אנזימטית:
לא נכון ,
המעבר אינו דורש התערבות אנזימטית , אלא שהוא מתרחש הודות לסיבוב חופשי סביב קשר יחיד.
(שקף 41)
staggered vs. eclipsed:
הן שתי הקונפורמציות של מולקולה נתונה שמציגות את הפוטנציאל האנרגטי הנמוך ביותר (s) , והגבוה ביותר (e).
ועל כן , הן הקונפורמציה הכי יציבה (s) של המולקולה , והכי פחות יציבה (e).
ההפרש האנרגטי בינהן קטן מאד, ולכן המעבר בינהם מהיר מאד , מליוני פעמים פר שניה , ולכן לא ניתן לבודד אותם.
(שקף 43)
מה משפיע על הסיבוב החופשי של אטומים סביב קשר בודד?
- גודל הקבוצה
- מטען הקבוצה
ככל שהקבוצה יותר גדולה / ויותר טעונה כך יכולת הסיבוב החופשי נפגעת , וזה יוריד את מספר הקונפורמציות היציבות של המולקולה.
(שקף 43)
מהי סטריאוספיציפיות ?
ההתאמה הסטריאו-כימית בין שתי מולקולות , שדרושה כדי שתהיה בינהן אינטראקציה.
(שקף 45)
באורגניזם , רוב המולקולות מתקיימות רק בצורה כיראלית יחידה?
נכון / לא נכון
נכון ,
מכיוון שהאנזימים שמייצרים אותם הם בעצמם כיראליים.
(שקף 45)
מה קובע התאמה סטריאוכימית בין שתי מולקולות?
- קונפיגורציה
- קונפורמציה
- קונפיגורציה + משקל מולקולרי
- תשובות א׳ + ב׳
הצירוף של קונפיגורציה וקונפורמציה
(שקף 45)
במעבדה אנחנו יכולים לסנתז צורה כיראלית אחת ויחידה של מולקולה נתונה:
נכון / לא נכון
לא נכון ,
בניגוד לגוף , במעבדה אנחנו יכולים לסנתז סטריאואיזומרים עם כמה צורות של המרכז הכיראלי.
(שקף 45)
בגוף האדם יש גם D-glucose, וגם L-glucose, אולם קונפיגורציית D יותר נפוצה , ולכן הקסוקינאז עובד בעיקר על D-glucose:
נכון/ לא נכון
לא נכון ,
בגוף קיים רק D-glucose ,
הקסוקינאז אינו מזהה L-glucose
(שקף 45)
מה הם התנאים שצריכים להתקיים כדי ששתי מולקולות יוכלו להתרכב אחת עם השניה ?
הם צריכות להתנגש אחת בשניה בעוצמה ובכיוון הנכונים.
(שקף 49)
מהם תכונותיו של קבוע שיווי המשקל עבור ריאקציה מסויימת:
- קבוע בתנאי טמפ׳ ולחץ נתונים
- אינו תלוי בריכוזים ההתחלתיים של המגיבים או התוצרים
- חסר יחידות (מבטא יחס)
- מבטא את היחס בין התוצרים למגיבים רק לאחר שהריאקציה הגיעה לשיווי משקל (ריאקציה הפיכה)
- בהינתן קבוע ש.מ של ריאקציה , היחס בין התוצרים למגיבים הינו קבוע , כל עוד הטמפ׳/ לחץ לא השתנו
- ככל שערך Keq גבוה יותר, משמע הריאקציה נוטה חזק יותר לכיוון התוצרים
(שקף 49)
מה זה מנת הריאקציה Q ?
הוא היחס בין התוצרים למגיבים בריאקציה מסויימת , ברגע נתון, שלא בהכרח נמצאת בשיווי משקל.
(שקף 49)
האם מנת הריאקציה , Q, יכול להיות שווה לקבוע שיווי המשקל ?
כן,
כאשר …
(שקף 49)
מי מהבאים ישנה את קבוע שיווי המשקל של ריאקציה ?
- העלאת הטמפרטורה
- הורדת ה ph של הריאקציה והעלאת ריכוז התוצרים
- שינוי בלחץ האטמוספרי
- תשובות 1 ו- 3
לחץ / טמפ׳
כיצד ישפיע שינוי בריכוז התוצרים על קבוע שיווי המשקל של ריאקציה כלשהי?
שינוי בריכוז התוצרים או המגיבים , אינו משפיע על קבוע שיווי המשקל של הריאקציה , אולם המערכת יוצאת משיווי משקל , מכיוון שהיחס בין התוצרים למגיבים השתנה (מנת ריאקציה Q)
(שקף 51)
בהוספת תוצרים לריאקציה נתונה , כיצד תושפע מנת הריאקציה Q ?
תהיה יותר גדולה מקבוע שיווי המשקל , כי במשוואה התוצרים נמצאים במונה.