הרצאה 2 - בתי גידול, פילוגנטיקה וטקסונומיה Flashcards
מה אין לחיידקים
גרעין תא
כמה אחוז מהווים החיידקים מהביומסה
14 אחוז
למה החיידקים נמצאים בכל מקום בכדור הארץ
מצאו יכולת להסתגל לכל בית גידול אפשרי
כמעט חצי מהפוטוסינתזה מתקיימת ב__
אוקיינוסים
למיקרואורגניזמים באוקיאנוסים יש תפקיד חשוב
ב___. רובם מתרחשים אצל מיקרואצות
שחיים ב__ מטר העליונים של האוקיאנוס ומבצעים
בין____ מהפוטוסינתזה.
פוטוסינתזה
200
שליש לחצי
כאשר נסתכל על הביומסה של המיקרואורגניזמים
שעושים פוטוסינתזה באוקיאנוס הוא ___פי 3
מהמיקרואורגניזמים שעושים פוטוסינתזה ביבשה.
קטן
מה זה פיטופלנקטון
שעושים פוטוסינתזה באוקיאנוס
יש תפקיד מרכזי במערכות אקולוגיות ימיות. הco2 שמקבלים
מהאטמוספרה הם מכניסים אותו לאוקיאנוס, הם היצרניים הראשונים.
מה זה Prochlorococcus
היצור הפוטוסינתטי הקטן והנפוץ ביותר
בעולם , גילו אותו לפני 30 שנה. מכיל מגוון אדיר של תתי מינים.
בעל חשיבות גדולה מבחינת התפקיד שלו באקוסיסטם הגלובלי כי
מאוד נפוץ, את רוב הפוטוסינתזה באזורים באוקיאנוס נעשית על
ידיו, הוא אחראי לייצור החמצן.
מה זה SAR11
החיידק הנפוץ ביותר
באוקיינוס, חיידק זהיר, פחות
ממיקרון, הטרוטרופ, חשוב
למערכת האקולוגית
יש פי ___ וירוסים באוקיינוס מאשר חיידקים
10
מה הוא בית הגידול העשיר והמגוון ביותר על פני כה”א
אדמה
איזה חיידקים מפרקים חומרים אורגניים בקרקע
חיידקים אירוביים
מה הם אקטינומיציטים
חיידיקם אירוביים
תפקיד חשוב במערכת האקולוגית בקרקע,
מורפולוגיה- יוצרים קורים. יודעים לפרק חומרים אורגנים שקשה
לחיידקים אחרים לפרק ולכן בעלי חשיבות גדולה מאוד. הקבוצה הזו
ידועה בזה שמייצרים באופן טבעי אנטיביוטיקות שאנו משתמשים בהם
כיום לרפואה.
בביופילם- הרבה מינים או מין אחד של חיידקים
הרבה מינים
מה זה
פילוספרה
מעל הקרקע
מה זה
ריזוספרה
מתחת לקרקע
מה זה טקסונומיה
סיווג היררכי, כך שעצמים בכל רמה חולקים את התכונות המגדירות את הרמה שמעליהם, ותכונות נוספות שמשותפות לרמה הנוכחית.
סיווג שיטתי של עצמים מאותו תחום.
כמו עץ כזה שמתחלק ללמטה
מה ההיררכיה של הפילוגנטיקה (לא יודעת איך לנסח את השאלה)
על ממלכה ממלכה מערכה מחלקה סדרה משפחה סוג מין
מה מההיררכיה כוללים שמות החיידקים
לדוגמא ECOLI
- סוג ESCHERICIA
2. מין COLI
בחיידקים הסיווג למינים הוא
עפ”י קריטריונים_____ (סיווג גנוטיפי)
גנטיים
מה זה
MLST
סיווג גנוטיפי
= שיטת סיווג טקסונומי המבוססת על הרצפים של מספר גנים. Multi-Locus Sequence Typing
כדי שגן יהיה שימושי לסיווג טקסונומי, עליו להיות:
- נוכח המספר קבוצות טקסונומיות
2. שונה בין קבוצות טקסונומיות
הגן שבשימוש הנפוץ ביותר בטקסונומיה הוא
16S rRNA
איך מגדירים מין (Species) בחיידקים?
הפרקטיקה כרגע עפ”י השוואת רצפים גנטיים
16SrRNA similarity (97%) and genomic hybridization (70%)
כמה מיני מינים ידועים כרגע בכדוא
של חייקים
10000 זוהו
מעריכים שיש יותר ממליון
מה זה פילוגנטיקה
חקר הקירבה האבולוציונית בין אורגניזמים
מה בהיררכיה מפריד בין בקטריה לארכאה
על ממלכה
בעבר סיוג המין בחיידקים היה על פי
הפנוטיפ
מה זה שיטה מטגנומית
- לקיחת דגימה מהסביבה ולחלץ רק את הדנא ולהשתמש
באמפליפקציה של דנא ולרצף את הדנא ולעשות ניתוח מהמידע הזה- נזכור שהמידע הזה
לא נותן באופן ישיר רצף של גנום של חיידק מסויים. אנו מקבלים רצפים שאנו יכולים לשחזר
למי הרצף שייך.
מה זה s Cell-Single GENOMICS
ד שיטה ,לבודד חיידקים מדגימות על ידי מיכשור מתקדם ולעשות
תהליך שמאפשר לעשות אמפליפקציה של גנומים בודדים ורצפים- מאפשר לקבל גנומים
כמעט שלמים