פרק 17 - מחזור התא Flashcards
מה הם שלבי המיטוזה?
, פרופאזה, פרומטאפאזה,מטאפאזה,אנאפאזה,טלופאזה ציטוקנזה דרך לזכור הכל -בקיצור דרך - פרופסור מת אנא טלפן
מה הם שלבי מחזור התא ?
G1,S,G2, Mitosis
מה הם נקודות הרסטריקציה לאורך מחזור התא , ומה התנאים כדי לעבור בין כל אחד מהשלבים של מחזור התא?
יש נקודות במעבר בין G1/S , G2/M, ובתוך שלב המיטוזה בין מטאפזה ואנאפזה.
התנאים הם - בדיקה שהסביבה מתאימה , שהדנא שוכפל במדויק (במעבר בין שלב הג׳י-2 ובין שלב המיטוזה) , ובדיקה שהכרומוזומים מחוברים לספינדל (בתוך שלב המיטוזה)
אילו חלבונים עוברים פירוק במחזור התא ?
ציקלינים
אילו חלבונים נשארים בציטוזול ולא מתפרקים במהלך מחזור התא?
CDK.
מי הציקלין בעל הפעילות הכי ארוכה במהלך מחזור התא?
ציקלין אס
מתי עובד הקומפלקס ציקלין-G1/S
עובד מאמצע השלב ג׳י- 1 ועד סופו
מי הציקלין שמשופעל הכי הרבה זמן במחזור התא, ובאילו שלבים ?
האס-ציקלין משופעל לאורך הזמן הכי ארוך. זמני הפעולה שלו הם מאמצע שלב הג׳י-1 עד לאמצא שלב המיטוזה (מטאפאזה)
פרט או פרטי את הציקלינים והסי-די-קיי לכל אורך מחזור התא - איזה ציקלין עובד עם איזה סי-די-קיי
בשלב G1 - עובד הציקלין D ויחד עם CDK4/6
במעבר בין G1/S עובד הציקלין E ביחד עם CDK2
בשלב ה-S עובד הציקלין A יחד עם CDK1/2
בשלב המיטוזה עובד הציקלין B יחד עם CDK1
**שיטה מפגרת שעוזרת לי לזכור את השלבים הוא שאני זוכר את המילה DEAB - שזה בעצם סדר הופעת הציקלינים, וכדי לזכור את הCDK השונים - אני זוכר שזה פשוט הולך מגבוה לנמוך - מ-6 עד 1.. - וככה אני מצליח לבנות לי את הטבלה בראש..
איזה מצב הוא מאוקטב חלקית בקומפלקס ציקלין-CDK2
מצב משופעל חלקית הוא כאשר הציקלין מתחבר לCDK שלו
מה דרוש כדי לעבור למצב משופעל מלא ?כולל איזה חלבון משתתף בכך (בהמשך לשאלה הקודמת)
על ידי זירחון של הקומפלקס ציקלין-CDK בלולאת הT.
הזרחון מתבצע על ידי CAK
היכן נמצא ה-ATP שמשמש לזרחון הקומפלקס ציקלין-CDK?
הATP נמצא באתר הפעיל של הקומפלקס, והוא משמש כסובסטרט לטובת הזרחון
מה עושה האנזים wee1 ?
מבצע זרחון אינהיביטורי על הקומפלקס ציקלין-CDK
מה עושה האנזים cdc25?
האנזים הוא פוספטז שמוריד את הפוספט האינהיביטורי שהניח שם wee1 .
מה עושה p27 ?
מבצע סקווסטרינג של הקומפלקס ציקלין- cdk , ומונע ממנו לזרחן הלאה חלבונים נוספים.
אילו עוד חלבונים עושים פעולה דומה לp-27 ? ואיזה מהם הוא חלבון המצוי בשמרים?
ישנם עוד שלושה חלבונים בעלי פעילות דומה - p-21,p-16,sic1 . כאשר רק sic1 בשמרים , והשאר ביונקים.
איזה מחלבוני הp מאוקטב כתוצאה מנזק בדנא?
p-21
איזה מחלבוני ה-p לא פעיל בסרטן?
p-16
מי מחלבוני הp מפורק על ידי SCF ?
p-27
מה הוא חלבון ה f-box. ?
חלק מקומפלקס הSCF , שמפרק על ידי יוביקוויטין את p-27 .
במה שונה פעילות CDH1 מ-CDC20. ? - מבחינת תזמון ושלב במחזור התא.
cdc20 אחראי על הפעלת APC/C בזמן שלב המיטוזה במעבר בין מטא-פאזה לאנאפזה.
לעומת זאת , CDH1 , אחראי על הפעלת APC/C לאחר האנאפזה, ולאורך שלב הG1 .
מתי נבנה הקומפלקס preRC. ?
נבנה כבר בסוף שלב המיטוזה, בתחילת שלב ג׳י-1
איזה קומפלקס חלבוני חשוב אחראי על היצירה של קומפלקס הpreRC בסוף המיטוזה?
APC/C
מה Cdt1.Cdc6 ו-ORC עושים יחד ?
הפעולה המשותפת שלהם מונעת מההליקז לפעול ולהתחיל לשכפל את הדנא.
למה כל אחד מהם נקשר?
כל אחד מהחלבונים האלו מעכב חלבון אחר :
Cdt1 - מעכב את ההליקז Mcm .
Cdc6 ו-ORC עוזרים לטעון הליקז לא פעיל , ולחבר אותו בצורה לא פעילה לדנא, בסמוך לORC.
בנוסף יש להם תפקיד במניעה של שכפול נוסף , תוך כדי שמתבצע שכפול.
יש בספר איור עם 4 חלבונים שאחראים על התחלת השכפול - מה הם , ומה תפקידם.
יש שני initiator proteins, שתפקידם הוא לעזור בנטרול Cdc6 וCdt1 ו-ORC וגיוס הדנא פולימרז.
S-CDK - עוזר בגיוס חלבוני איניציאציה להליקז .
DDK - קינז שמזרחן את ההליקז , ועוזר לשפעל אותו.
**הניסוח בספר לא היה לי הכי ברור , והוא היה קצת כללי , מקווה שזה עבר ברור
מה המבנה של הקוהזין?
הקוהזין מורכב מ-4 תת יחידות , כאשר שתי תת יחידות מרכיבות יחד coiled-coil , ושני coiled-coils יוצרים יחד את המבנה הטבעתי השלב של הקוהזין.
בנוסף, הקוהזין הוא בעל דומיין ATPase , שמשמש על ידי שינוי קונפורמציה לדחוס כרומוזומים.
מה תפקיד החלבון ג׳מינין?
חלבון אשר מנטרל את Cdt1
מה הן שלוש משפחות הקינזות שעובדות במיטוזה?
M-CDK, Aurora Kinases, Polo-like kinases
מה ההבדל בין אורורה-בי ואורורה-איי ?
אורורה איי - עוזרים לייצב את הספינדל על ידי זרחון חלבונים
אואורה בי - אחראים על קישור המיקרוטובולים לכרומטידות
מה קורה בכל אחד משלבי המיטוזה?
פרופאזה - מתחיל להווצר הספינדל , יש תזוזה לקטבים של הצנטרוזום , ללא קישור המיקרוטובולים לכרומוזומים , וללא שבירה של ממברנת הגרעין , דחיסת הכרומוזומים.
פרומטהפאזה - תחילת שבירת ממברנת הגרעין , כרומוזומים מתחילים להקשר למיקרוטובולים , תזוזה אקטיבית של קינטוכורים (רשום בספר את הניסוח הזה)
מטהפאזה - הכרומטידות מחוברות למיקרוטובולים , ממברנת הגרעין נשברה , נוצר הספינדל , הכרומוזומים מיושרים ביחד
אנאפאזה - הפרדות הכרומטידות האחיות , פירוק מיקרוטובולי והתקצרותם, תזוזה נוספת של הצנטרוזומים אחד מהשני .
טלופאזה - הכרומוזומים כבר מגיעים לקצוות שלהם , ממברנת הגרעין מתחילה להתחבר שוב , יש התחלה של יצירת הcontractie ring
תחטוקנזה - הציטופלזמה נחצת לשניים , יש הווצרות של טבעת האקטין שחותכת את הממברנות ומפרידה את שני תאי הבת
מה עושה קונדנסין?
קונדנסין דומה בצורתו לקוהזין, אבל הוא אחראי על כיווץ כל כרומוזום בנפרד, ולא על כרומטידות אחיות
מה הם שלושת סוגי המיקרוטובולים במיטוזה?
אינטרפולרים - מיקרוטובולים שעוברים מצד אחד לצד שני של התא , ולא קשורים לכרומטידות
אסטרליים - מיקרוטובולים שיוצאים מהצנטרוזום ונשלחים לממברנת התא הקוטבית - כלומר , לכיוון השני מהכרומטידות
מיקרוטובולים קינטוכורים - מיקרוטובולים שנקשרים לכרומטידות.
איפה מצוי דינאין במיטוזה?
דינאין מחובר למיקרוטובולים האסטרלים , ועוזר להרחיק את הצנטרוזומים אחד מהשני ולמקם אותם בתא איפה שצריך
מה הם הקינזים המעורבים ?
קינזין 5 - קינזין שמתחבר לשני מיקרוטובולים - כאשר לאחד הוא מעוגן, ועל השני הוא הולך לכיוון הפלוס וככה הוא מרחיק את הצנטרוזומים אחד מהשני.
קינזין 14 - הולך לכיוון המינוס . עוזר לקרב את הצנטרוזומים אחד לשני - ליצור איזון כך שלא יתרחקו יותר מדי.
קינזין 4 ו-10 - מושכים את הכרומטידות לכיוון הצטרוזום , לקטבים.
באיזה שלב משוכפלים הכרומוזומים?
בסוף שלב ה-G1 ותחילת שלב S.
מה מנגנון השכפול שלהם?
סמי-קונסרבטיבי
איך משפיעים משפחת חלבוני הRan על המיטוזה?
חלבוני הRan (אלו מהגרעין…) אחראים על יצוב מיקרוטובולי באזור הכרומוזומים על ידי גיוס חלבונים שעושים זאת.. לא מפורט מאד מה קורה שם - להכיר שזה מה שקורה.
זה קשור גם לכך שה-GEF שלהם נמצא על הכרומוזומים , ולכן גם במיטוזה הם יכולים לפעול.
מהי הבי-אוריינטציה? ואיך היא קורית?
זהו מצב בו כל כרומטידה מחוברת למיקרוטובולי שמגיע מהקוטב הנכון - שהיא אמורה ללכת אליו .
היא קורת בדרך של ניסוי - וטעיה . המיקרוטובולי מפולמר בקצה הפלוס , עד שהוא מתחבר לקינטוכור. חיבור לא נכון - הוא לא יציב , ולכן יפורק.
מה עושה הקינז אורורה-בי ?
מזרחן את הNdc80 , וגורם לאפיניות נמוכה בין המיקרוטובולי ובין הקינטוכור.
מה קורה לקינז אורורה-בי כשיש חיבור של מיקרוטובולי לקינטוכור?
כאשר יש מתח כתוצאה מחיבור של מיקרוטובולי לקינטוכור , אורורה-בי לא מסוגל לזרחן את הקומפלקס Ndc80, וכשהוא לא מזורחן יש אפיניות בין המיקרוטובולי לבין הקינטוכור - מה שעוזר לייצב את הכרומטידות האחיות .
איך הקומפלקס APC/C פועל כדי להפריד את הכרומטידו תהאחיות ? אילו חלבונים עובדים יחד איתו?
הפרדת הכרומטידות האחיות נעשת על ידי APC/C ובעזרת Cdc20. שניהם יחד שולחים את החלבון securin לפירוק בפרוטאזום על ידי יוביקוויטילציה.
כאשר securin מפורק, משתחרר החלבון separase שמפרק את הקוהזין - ומשחרר את הכרומטידות האחיות.
מה תפקיד החלבון mad2 ?
החלבון מזהה כאשר הקינטוכורים לא מחוברים למיקרוטובולים ומתחבר אליהם. על ידי כך מונע מ-APC/C-Cdc20 לפרק את הקוהזין. וזה כדי למנוע הפרדה לא נכונה של כרומטידות אחיות.
מה הם שני שלבי האנאפאזה השונים ? (רשום בספר A ו-B)
בשלב A - שתי הכרומטידות זזות לעבר הקטבים
בשלב B - שני הקטבים מתרחקים עוד, והצנטרוזומים מתרחקים.
איור להמחשה - בעמוד 995
מהי ה-contractile ring - מאילו סיבים מורכבת,באיזה מבנה הסיבים ואיזה חלבון משתתף בתהליך ההתהוות שלה?
נוצרת בציטוקנזה על מנת להפריד את הציטופלזמה של שני תאי בת.
הסיבים שיוצרים אותה הם אקטין במבנה של stress fibers.
חלבון חשוב שאחראי על איגוד הסיבים הוא formin
איזה חלבון אחראי על הקסקדה להרכבת ה-contractile ring.
ממה הוא מורכב , לאיזו משפחה הוא שייך,אילו חלבונים מגייס ואיך הוא פועל.
החלבון הוא החלבון RhoA .
יש לו דומיין GTPase, והוא ממשפחת ה-Ras
הוא מקדם את יצירת הטבעת לציטוקנזה , ומגייס מיוזין 2 ואקטין לקורטקס התא.
הוא פועל על ידי יצירת קסקדת זרחונים , שגורמים לזרחון השרשרת הקלה של מיוזין 2 בעזרת MLCK (מופיע גם בפרק על שלד התא) וגיוס החלבון פורמין
עמוד 998 בספר - איור שממחיש.
מה הוא מיטוגן? איזו דוגמה יש בספר למיטוגנים
מיטוגן היא מולקולה שמזרזת חלוקה של התא על ידי כניסה לגי׳-1 .
יש בספר דוגמה ל- PDGF שהוא מיטוגן
איזו דוגמה יש בספר למולקולה שמונעת כניסה לחלוקת התא?
קוראים לזה TGF-beta , והיא מונעת את התקדמות שלב ג׳י-1
איך מופעל החלבון Ras ?
על ידי מיטוגן
מה המאפיינים של החלבון Ras ?
חלבון עם דומיין GTPase, מפעיל קסקדת קינזות שבסופה מופעלים פקטורים שמאקטבים שעתוק
מהו Myc , ואיך הוא מופעל ?
מופעל כתוצאה מקסקדה שמופעלת מRas.
הוא פקטור שעתוק.
מה Myc מפעיל?
גורם להפעלה של G1-CDK - שכולל את ציקלין D וCDK4 .
מה הקסקדה שמופעלת בעקבות הפעילות של Myc והG1-CDKשהוא מפעיל ?
יש אינאקטיבציה של החלבון Rb , על ידי זרחונו - בעקבות פעילות הקינז של G1-CDK
לאחר העיכוב של Rb, משוחרר הפקטור E2F, שגורם לשעתוק של קומפלקס CDK של שלב ה-S . (ציקלין E)
ברגע שהוא מופעל - יש שכפול דנא.
אילו פידבקים קורים בתהליך ?
יש שני פידבקים חיוביים שקורים -
1. שE2F שעושה positive feedback לעצמו .
- פידבק נוסף קורה על ידי הקומפלקס S-CDK ו-G1/S-CDK שעוזרים לאינאקטיבציה לRb, ומשחרר לחופשי את E2F
איור בעמוד 1013
מה קורה לחלבון Rb כאשר יש קידום של מחזור התא?
הוא מזורחן ועל ידי מעוכב. וכל זה נעשה על ידי G1-CDK
לחזור שוב על הציקלינים שפועלים בקסקדת הMyc - מה עובד מתי.
מתחילים עם G1-CDK, ואז מופעל G1/S-CDK, ולבסוף מופעל S-CDK
מה הם ATM/ATR - מה הם מפעילים ולמה הם מופעלים?
שניהם קינזים שפועלים כשקורה נזק לדנא
הם מפעילים שני קינזים שנקראים chk1 ו -chk2 .
מה הם chk1/2 ?
מופעלים על ידי ATR/ATM. גם הם קינזים , והם גורמים לזרחון P-53
נה הוא Mdm2 ?
הוא יוביקוויטין ליגז שמפרק את P-53 על ידי יוביקוויטילציה.
מה גורם לP-53 לפעול , ולא להיות מפורק על ידי יוביקוויטלציה?
כאשר P-53 מזורחן (כתוצאה מהקסקדה של chk1/2) , הוא לא מתפרק יותר על ידי Mdm, והוא יכול לשעתק גנים .
אילו גנים p-53 משעתק?
לפי האיור בספר - הוא משעתק את P-21, שעושה סקווסטרינג לקומפלקסי CDK-Cyclin , ומונע את פעילותם .
איור בעמוד 1015 - לעבור עליו
מה קורה כאשר החלבון Myc מופעל ביתר ?
מוםעל החלבון Arf , שגורם לעיכוב החלבון Mdm2 , ואז P-53 משוחרר, ויכול לעכב את מחזור התא.
מה עושה PI-3K ?
מזרחן את PIP2 , והופך אותו לPIP3
איך מופעל TOR?
מופעל על ידי PIP3 , וגורם ליצירת ריבוזומים והפעלת פקטור התרגום האקריוטי eIF4E
איזה מין סוג חלבון הוא TOR?
קינז