1.2 Généralités Flashcards
Différencier un virus d’un virion
Virus : agent infectieurx à tous les stades du cycle viral, extracellulaire ou intracellulaire
Virion : particule virale infectieuse complète
De quoi est composé le virion?
- Génome
- Capside de nature protéique
- Enveloppe de nature lipidique (pas toujours présente)
Comment peut-on appeler un génome et un capside ensemble?
Nucléocapside
En général, quel est le cycle reproductif associé aux virus nus?
Lytique
D’où provient l’enveloppe de virus enveloppés?
C’est une couche bi-lipidique qui provient de la membrane de la cellule hôte (ou de son noyau)
Nommer les 6 différents types de génome des virus
- ADN double brin linéaire
- ADN db circulaire (rare)
- ADN sb (rare)
- ARN sb +
- ARN sb -
- ARN db +/- (rare)
Les acides nucléiques des virus codent pour quels 3 groupes de protéines virales?
- Protéines de structure (enveloppe et capside)
- Enzymes pour la réplication
- Protéines de régulation se fixant sur des promoteurs des gènes viraux pour en réguler l’expression
Vrai ou faux : l’ARN + est dans le même sens que l’ARNm
Vrai
Quel est l’avantage pour un virus d’avoir un ARN +?
Pas besoin d’enzymes
Quelles sont les 2 fonctions de la capside?
1- Protection du génome viral
2- Fixation du virus à sa cellule cible (virus env-)
Différentier les notions de protomère, capsomère et capside.
- Protomère = sous-unité protéique = sous-unité de structure
- Capsomère = unité morphologique formée par l’assemblage de sous-unités de structure, identiques ou différentes
- Capside = revêtement protéique du génome formé par l’assemblage des capsomères
Quelles sont les 2 symétries de capsides les plus rencontrées?
Hélicoïdales et icosaédriques
Comment peut-on caractériser la structure de la capside d’un bactériophage?
Complexe
De quoi est constitué la capside de virus de symétrie hélicoïdale?
De sous-unités identiques
Quelle enzyme est nécessaire pour faire l’assemblage des sous-unités de virus hélicoïdaux?
Aucune, ça se fait par autoassemblage
Comment appelle-t-on la structure où l’acide nucléique va pouvoir se loger?
La ringole
Qu’est-ce que le site de reconnaissance d’un segment de l’ARN génomique permet chez les virus à symétrie hélicoïdale?
Initiation de l’autoassemblage de la capside
Quels sont les 5 paramètres qui permettent de définir le virus à symétrie hélicoïdale?
-Le nombre de sous-unités protéiques par tour
-Le pas de l’hélice
-L’angle φ (angle formé entre l’axe central de la capside et le
barycentre de 2 sous-unités)
-le nombre d (distance entre 2 sous-unités)
-la longueur de l’hélice
Combien de côtés, de sommets et d’arêtes possède un icosaèdre?
20 côtés
12 sommets
30 arêtes
Sur un icosaèdre, combien a-t-il de versants par sommet?
5 versants
Quel est le minimum d’unités de structure dans un icosaèdre?
Il y en a une par versant au minimum
12*5 = 60
Combien est-ce qu’il y a de pentamères par virion icosaédrique?
12
Combien a-t-il d’unités de structure par face d’un icosaèdre?
Au moins 3
Quelle est la formule qui permet de trouver le nombre d’unités de structure par triangle dans un icosaèdre?
60 * le nombre de triangulation
Nommer les 2 types de virus qui n’appliquent pas la règle du nombre de triangulation pour trouver le nombre d’unités de structure
- Réovirus (double capside)
- Rotavirus
Qu’est-ce qui permet à la membrane de se lier aux récepteurs cellulaires de façon spécifique?
Les déterminants viraux (protéines)
Vrai ou faux : les virus enveloppés sont plus fragiles que les virus nus
Vrai
D’où peuvent provenir les enveloppes des virus? (3)
- la membrane cytoplasmique
- La membrane nucléaire
- une membrane du réticulum endoplasmique
Sur l’influenza, quelles sont les 2 protéines (spicules) importants?
H et N
À quel moment se fait l’acquisition des glycoprotéines sur l’enveloppe?
Lors du bourgeonnement du virus
Nommer d’autres composantes virales (4)
• Les protéines de la matrice
• Des enzymes
• Autres composantes virales (protéines activatrices, protéines
nécessaires à la dégradation de l’ARNm, etc)
• Composantes cellulaires (histones, ARNt, myristate, lipides, cyclophiline
A, etc)
Quelles sont les 7 classes de virus selon la classification de baltimore?
- ADNdb
- ADNsb
- ARNdb
- ARNsb+
- ARNsb-
- ARNsb+ qui s’insèrent dans le génome en devenant db
- ADN/ARN avec un des 2 brins incomplet
Vrai ou faux : un virus à ADNsb doit avoir un intermédiaire double brin
Vrai
Caractériser les rétrovirus
ARNss+ qui ont la capacité de devenir ADN db et s’insérer dans le génome
Vrai ou faux : l’ARNsb- d’un virus peut être utilisé directement comme un ARNm
Faux, c’est le cas de ARNsb+
