1.1 Flashcards
Codons d’initiation possibles
AUG, GUG
Nombre de codons dans le code génétique
64
Caractéristiques des codons
Contigus, non-chevauchant et sans virgule
Nombre de codons associés à un acide aminé
61
Codons de terminaison
UAA, UAG et UGA
UAA
Codon ocre
UAG
Codon ambre
UGA
Codon opale
Code dégérné
Plus d’un codon peut spécifier un acide aminé (max de 6 codons)
Acides aminés ayant un seul codon
Met et Trp
Acides aminés ayant 6 codons
Arg, Leu, Ser
Codons jaunes du code génétique
Polaires
Codons bleus du code génétique
Basiques
Codons roses du code génétique
Acides
Mauves
Polaires non chargées
But de l’évolution du code génétique
Minimiser l’effet délétère des mutations
Pyrimidine
C, U, T
Purine
A, G
Pyrimidine à la deuxième position du codon
Acide aminé hydrophobe
Purine à la deuxième position du codon
Acide aminé polaire
Découverte du code génétique
Utilisation d’ARNm artificiel (homopolymères synthétisés par la par la polynucléotide phosphorylase) dans des systèmes sans cellule pour la synthèse des protéines
Détermination de la composition en bases et découverte du code génétique dégénéré
Traduction des ARNm in vitro contenant 2-3 nt dans un ordre aléatoire et dans des proportions différentes
Détermination de l’ordre des nucléotides
Utilisation de polyribonucléotides de séquences connues de 2, 3, 4 nt.
Mutations ponctuelles
Modification d’une seule paire de bases
Moyens pour effectuer des mutations ponctuelles
Traitement par des analogues de bases (transitions, intégration de nucléotides synthétiques intégrés dans le matériel génétique) et traitement par des agents modifiant chimiquement certaines bases
Analogues de bases
5BU et 2AP
5BU
Mutation lors de l’appariement avec G (forme céto), appariement avec A (forme énol) [analogue de T].
2AP
Mutation lors de l’appariement avec C, analogue de A = normalement apparié avec T
Agents chimiques provoquant des transitions
Acide nitreux et hydroxylamine
Acide nitreux
Réaction de désamination oxydative, permet d’accélérer le phénomène spontané C vers U.
Hydroxylamine
Réaction d’hydroxylation.
Agents chimiques provoquant des transversions
Agents alkylants
Agents alkylants
Responsables des gros groupements, ne jouent pas sur l’appariement des bases
Diméthylsulfate et éthylnitrosurée
Transitions
Purine vers purine, pyrimidine vers pyriminde
Transversions
Changements majeurs de la structure: purine vers pyrimidine ou pyrimidine vers purine
Mutation avec décalage du cadre de lecture
Insertions ou délétions d’une ou plusieurs bases par des agents intercalants
Agents intercalants
Bromure d’éthidium, proflavine
Molécules fortement aromatiques et planaires pour l’intégration dans la double hélice de l’ADN
Détermination du cadre de lecture de trois codons
Crick et Brenner: travaux sur le bactériophage T4
Travaux de Crick et Brenner
Mutants induits dans le gène rIIB du bactériophage T4 avec traitement à la riboflavine
Mutant FC0
Croissance sur E. coli B, mais aucune croissance sur E. coli K12
Mutant FC1
Retour au phénotype sauvage (mutation neutralisation la première mutation, rétablissement du cadre de lecture original)
Surpresseur intragénique
Annulation de la mutation précédente
Isolement du mutant FC1
À partir du backcross, double mutants (FC0-FC1)
Catégorie + de mutants
Nombre pair de mutations (additions)
Catégorie - de mutants
Nombre impair de mutations (délétions)
Particularité des petits génomes de bactériophages
Une même séquence d’ADN peut coder 2-3 polypeptides différents
Variations par rapport au code standard
Mitochondries: 2 codons d’arrêt au lieu de 3
