101 Flashcards

1
Q

האם וירוס הוא ייצור פרוקריוטי ?

A

לא , וירוס אינו מוגדר לא כפרוקריוט ולא כיוקריוט וזאת כי אינו מוגדר כתא (אינו ייצור חי).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

הגדרת החיים:
רק מי שמקיים את כל ההגדרות ייחשב כיצור חי

A
  • ממברנה
  • יכולת רביה עצמאית
  • גדילה , התפתחות והתמיינות
  • יכולת לבצע מטבוליזם
  • יכולת לשמור על הומיאוסטזיס
  • יכולת לתקשר עם הסביבה
  • אבולוציה
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

היררכיה בעולם החי:

A

אוכלוסיה: צבר תאים שמקורם בתא יחיד
חברה: אוכלוסיות שונות שחיות בסמיכות זו לזו

מין: ייצורים שמקיימם בינהם יחסי רביה , הם מבודדים רבייתית ממינים אחרים , ומסוגלים להעמיד צאצאים פוריים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

צורות חיים שונות של חיידקים:

A
  • תא וגיטטיבי: תא חי שמסוגל להתרבות
  • נבג: אנדוספורה , אין יכולת רביה.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

שמות של חוקרים:

A

רוברט קוך: הראשון לבודד חיידקים מבעה״ח

ספלנציאני: הראשון להוכיח שאין התפתחות ספונטנית של חיים. הוא הרתיח אוכל , חלק סגר במיכל אטום וחלק לא סגר , רק בחלק שלא סגר התפתחו חיים. ביקורת: מנע כניסת אוויר.

לואי פסטר: הוכיח בצורה חותכת שאין בריאה ספונטנית. יצר צוואר ברבור - אוויר יכול להיכנס אך לא מיקרואורגניזמים מבחוץ. עמ׳ 3 + שקף 50

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

מהם 4 הקריטריונים לסיווג צורות חיים ?

A
  • גודל: מאקרואורגניזמים / מיקרואורגניזמים
  • סוג התא: חד תא / רב תאי
  • תזונה: הטרוטרוף / אוטוטרוף
  • נשימה: אירובי / אנאירובי
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

צורות החיידקים:
עמ׳ 4

A
  • בצילוס: מתג
  • קוקים: ספריים
  • ספירוכט: תלת מימדי
  • ספירילום: דו מימדי

סטפילוקוקיים לאחר החלוקה מייצרים אשכולות.
סטרפטוקוקיים לאחר החלוקה מייצרים מבנה שרשרת.
דיפלוקוקיים לאחר החלוקה נשארים בזוגות.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

האם לכל החיידקים יש דופן תא ?

A

לא,

למרבית החיידקים יש דופן תא כזה או אחר , מלבד חיידק המיקופלסמה , שהוא חסר דופן.

דופן התא איננה סלקטיבית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

מיקופלסמה:

A

חיידק חסר דופן , ועל כן מסוגל להתקיים רק בסביבות איזוטוניות.

במקום דופן , יש למיקופלסמה שכבת הגנה מעל הממברנה הבנויה מליפופרוטאינים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

האם רק לחיידקים יש דופן תא ?

A

לא ,
גם ליצורים יוקריוטים יש דופן תא , כמו צמחים ופטריות.

ישנם שני הבדלים עיקריים הין דופן תא חיידקי לדופן תא יוקריוטי:

1) החומר ממנו בנויה הדופן (צילולוז בצמחים / כיטין בפטריות / פפטידוגליקן בחיידקים).

2) תפקיד: בחיידקים לדופן יש תפקיד ממשי בחלוקה התאית. ביוקריוטים אין , תפקיד הדופן ביוקריוטים הוא תמיכה מכנית בעיקר.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

פרוקריוט לעומת יוקריוט:

A

גנום:
1) פרוקריוט חסר גרעין ואברונים לעומת ביוקריוט שיש גרעין ואברונים.

2) בפרוקריוט הגנום מעגלי לעומת ביוקריוט שהוא לינארי.

3) בפרוקריוט הגנום נמצא בציטופלסמה ומעוגן פיזית בנקודה אחת לממברנת התא ולדופן דרך חלבונים (חיוני לחלוקה שווה) לעומת ביוקריוט שהוא מבודד מהציטופלסמה בגרעין.

4) בפרוקריוט ישנם שינויים גנטיים מהירים (מוטציות + קליטת גנום מבחוץ) לעומת ביוקריוטים שאין שינויים מהירים.

בשני הסוגים אותם בסיסים - AGCT - מרכיבים את הדנא.

ריבוזום:
בפרוקריוט הריבוזום השלם הוא 70s ומורכב משתי היחידות 30s + 50s
ביוקריוטים הריבוזום השלם הוא 80s , ומורכב משתי תת היחידות 40s + 60s.

בשני המקרים מורכב בעיקר מ RNA.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

מבנים חיידקיים נוספים:

A

אלא מבנים שלא חייבים להיות קיימים בכל סוגי החיידקים:

1) קפסולה: מדובר בשכבת הגנה רירית שהחיידק מפריש , מקנה לו יכולת היצמדות למשטח + הגנה מפני הסביבה (לרבות מערכת החיסון ואנטיביוטיקה) , ועל כן , מהווה פקטור אלימות. הקפסולה היא מבנה נפרד מהממברנה ומהדופן. איקולי מייצר ממברנה.

2) פילאי: חלבונים בצורת ריסים ושיעריות שהחיידק מצמיח מהמנברנה הציטופלסמטית , חוצות את הדופן , ובולטות כלפי חוץ. היצמדות למשטח + תקשורת בין תאית.

3) פלאג׳לה: מקנה יכולת תנועה פיזית לחיידק , המנוע יושב בממברנה.

4) נבג: מדגים יכולת התמיינות של החיידקים. מבנה קטן שמכיל חומר תורשתי / חלבונים חיוניים לתחילת החיים / המון עטיפות הגנה.פ , כמעט ואין בו ציטופלסמה (דה הידרציה). הנבג חסר יכולת התרבות וכמעט חסר פעילות מטבולית.

צמחים ופטריות גם מסוגלים ליצר נבג , אך הוא כן משמש לרביה.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

ספורולציה:

A

1) תהליך מורכב שאורך מספר שעות , ודורש השקעת אנרגיה רבה.

מתרחש בעיקר בגרם חיוביים

2) תהליך חד כיווני , ברגע שהחיידק התחיל אותו , הוא לא יכול לעצור באמצע. אם התהליך נעצר באמצע , הנבג מת.

3) נוצר בתהליך חלוקה אסימטרי של הממברנה (סממן מבדיל בין הנבגה לחלוקה).

בחלוקה זו נוצר forespore , שזה החלק הקטן יותר , מכיל עותק אחד של הדנא , עובר המון תהליכים של דה הידרציה ובניית שכבות מגן. ה forespore מוכל בתוך החלק השני שנוצר , ״תא האם״ , שתפקידו זה לתמוך בנבג ולספק לו את הדברים שהוא צריך להשלמת התהליך. בסוף התהליך תא האם עובר ליזיס ונשאר רק הנבג.

המהג שורד שנים בתנאי קיצון , כשהתנאים משתפרים , הוא עושה תהליך הידרציה ונביטה, ומשתמש בחלבונים שיש לו.

אנטרקס , טטנוס , בוטוליניום.

שקף 79 + 80

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

כיצד נוכל לראות חיידקים ?

A

חיידקים ניתן לראות דרך מיקרוסקופ אור. חיידקים הם שקופים ורטנים , כדי לראות אותם במיקרוסקופ חייבים לצבוע אותם.

קיימים שני בוגים של צביעה:

  • צביעה פשוטה
  • צביעה אבחנתית
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

צביעה פשוטה:

A

צובעים את החיידקים רק כדי שנוכל לראות אותם , בד״כ משתמשים בצבע אחד. צביעה זו נותנת מידע כללי לגבי החיידק:

  • צורה (מתג , ספרה)
  • התארגנות (אשכולות , דיפלוקוק)

אנחנו לא צובעים רכיב ספיציפי בחיידק , אלא פשוט שהצבע נספח לחיידק ומתקבע בו.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

צביעה אבחנתית:

Use of two contrasting stains , separated by a decolorizing agent

A

משתמשים בשני סוגי צבעים לפחות , כאשר הצבע מכוון לסוג ספיציפי של מולקולה , כך אנחנו מקבלים מידע לגבי תכונות מסויימות שקיימות בחיידק אחד , ולא קיימות בחיידק אחר.

צביעה אבחנתית יכולה לשמש ל identification:
- צביעת גרם
- צביעת acid fast לשחפת

או ל visualisation of structure:
- צביעת נבג spore stain
- צביעת קפסולה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

צביעת גרם:

A

צביעה אבחנתית שמתבססת על נוכחות פפטידוגליקן (דופן).

חיידקים גרם חיוביים נצבעים בסגול , גרם שליליים באדום.

שלבים:

1) קיבוע החיידקים למצע ע״י חימום.

2) הוספת צבע בסיסי שנקרא קריסטל ויולט , הצבע נכנס לדופן של כל החיידקים בתערובת (כולם סגולים).

3) הוספת יוד , שביחד עם הקריסטל ויולט יוצר קומפלקס שמתקבע בדופן (כולם סגולים).

4) שטיפה עם אלכוהול , הצבע נשטף מהגרם שליליים אך נשאר בדופן של הגרם חיוביים (חיוביים סגולים / שליליים לבנים).

5) שטיפה בצבע סרפנין אדום

6) שטיפה במים (חיוביים סגולים /שליליים אדומים).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Gram p Vs. Gram n:

A

בגרם חיוביים יש ממברנה אחת (פלסמטית) ומעליה יש דופן עבה , שמורכבת משכבות רבות של פפטידוגליקן וחומצה טיכואית. הדופן איננה סלקטיבית בכלל !!

גרם שליליים מכילים שתי ממברנות, פלסמטית וחיצונית (LPS) , ובינהם שכבה דקה של פפטידוגליקן. שתי הממברנות הן בעלות סלקטיביות שונה.

ממברנת ה LPS היא זו שמונעת היווצרות קומפלקס בין קריסטל ויולט ליוד , ולכן הצבע נשטף באלכוהול.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

ממה מורכבת דופן התא בחיידקים גרם שליליים ?

A

1) שכבה דקה של פפטידוגליקן

2) המרווח הפריפלסמטי

3) ממברנה חיצונית

שקף 90

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

ממה מורכב המרווח הפרי פלסמטי ?

A

מהחלל שבין שתי הממברנות , הפלסמטית וה LPS בגרם שליליים , ומשעבה דקה של פפטידוגליקן באמצע.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

פפטידוגליקן בגרם חיובי לעומת גרם שלילי:

A

בין 40% - 90% מהמשקל היבש של הדופן בגרם חיוביים

בין 5% - 10% מהמשקל היבש של הדופן בכרם שליליים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

איזה תכונה מבנית מקנה לפפטידוגליקן את הקשיחות שלו ?

A

הקשרים הפפטידיים הצולבים בין השכבות השונות.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

תאר את מבנה הפפטידוגליקן;

A

שכבות של סוכרי NAM-NAG-NAM-NAG שמחוברים זה לזה בקשרי β 1-4

מסוכרי ה NAM בשכבה נתונה יוצאים זנבות פפטידיים , שמתחברים לזנבות הפפטידיים משכבה אחרת (נותן קשיחות).

שקף 95

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

מהו האנזים ליזוזים ?

A

זהו אנזים שנמצא אצלו בעיניים וברוק , אנזים זה יודע לפרק את הקשרים ה β גליקוזידיים שהדופן (הקשרים שבין הסוכרים). הוא מחורר את הדופן , וגורם לו להתפוצץ (בסביבה היפוטונית).

בגוף , התנאים הם איזוטוניים , ולכן החיידק לא יתפוצץ , אולם הפגיעה בדופן תפגע במנגנון החלוקה שלו.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
צביעת acid fast:
צביעה אבחנתית שמסתמכת על נוכחות **חומצה מיקולית**. זוהי צביעה ייעודית שנועדה לצבוע את חיידקי השחפת שלבים: 1) צביעה של כל החיידקים במצע בצבע אדום שנקרא קארבולפוסין 2) חימום: גם מקבע את החיידקים למצע וגם את הצבע לחומצה המיקולית בחיידקי השחפת 3) נשטוף באלכוהול חומצי , כך שכל החיידקים שאין להם חומצה מיקולית יחזרו להיות שקופים 4) נצבע עם מטילן בלו שקף 100 + 101 **לשים לב שבניגוד לצביעת גרם רגילה , פה קודם צובעים ואז מקבעים בעזרת חימום**.
26
האם חיידקי השחפת הם גרם חיוביים או גרם שליליים ?
הם חיידקים גרם חיוביים - מכילים ממברנה ציטופלסמטית ודופן , וללא שכבת LPS. הם שייכים למשפחת **המיקובקטריה** , ולמרות היותם גרם חיוביים , הם אינם נצבעים בצביעת גרם רגילה , ועל כן דורשים צביעת acid fast.
27
מה יקרה לחיידק שמורידים לו את הדופן ?
בסביבה היפוטונית = יתפוצץ בסביבה איזוטונית = ימשיך לחיות , יתעגל אך לא יתחלק (שקף 70).
28
תאר מבנה חיידק השחפת: שקף 99
1) ממברנה פלסמטית 2) דופן: - שכבת פפטידוגליקן דקה - שכבת ארבינו גלקטאן= ארבינוז גלאקטוז 3) שכבה שומנית: - חומצה מיקולית - גליקוליפידים 4) חלבונים ופורינים הפפטידוגליקן , ארבינוגלקטן והחומצה המיקולית מחוברים בינהן באופן קוולנטי , מה שלא מאפשר לצביעת גרם רגילה להתרחש.
29
צביעת capsule stain;
צביעה אבחנתית שנועדה לאבחן את החיידקים שיש להם קפסולה. בצביעה אנחנו לא צובעים את הקפסולה עצמה אלא את ה DNA של החיידק ואת המצע , כך החיידקים שיש להם קפסולה מקבלים הילה שקופה מסביבם שקף 103
30
תאר את שלבי ה capsule stain:
1) צביעה בקריסטל ויולט בסיסי שחודר את הקפסולה ומגיע ל DNA , צובע את כל החיידקים בכחול (מבפנים). 2) מוסיפים קופר סולפט ומקבעים את הצבע ל DNA שלא ישטף 3) שוטפים , החיידקים נשארים כחולים מבפנים 4) נצבע את המצע ונקבל חיידקים כחולים , רקע ורוד , ולמי שיש קפסולה יהיה הילה שקופה מסביב.
31
קפסולה:
מבנה בעל **מרקם ג׳לי** שמורכב בעיקר מפוליסכרידים שהחיידק מפריש. הקפסולה מאפשרת לחיידק להיצמד למשטחים , לחמוק ממערכת החיסון , ולא מאפשרת ל AB לידרו דרכה = פקטור של אלימות. הקפסולה היא בעלת מטען ניטרלי , ולכן לא נצבעת כי מרבית הצבעים שאנו משתמשים בהם הם טעונים , ולכן לא נקשרים אליה , ועל כן הצורך בצביעת capsule stain. חיידקים שמייצרים קפסולה לא מייצרים אותה כל הזמן , אלא רק כשהם חשים סטרס , ולכן אם נרצה לאבחן למי יש קפסולה , עדיף לקחת אוכלוסיית חיידקים מבוגרת שנמצא בשלב סטציונרי.
32
ב capsule stain ניתן להבדיל בין חיידקים גרם חיוביים לחיידקים גרם שליליים ?
לא נכון , הצבע **חודר את הקפסולה בשני סוגי החיידקים** ומגיע ל DNA של החיידק , ולכן לא ניתן לזהות בצביעה זו בין חיידקי גרם חיובי לגרם שלילי.
33
Spore stain:
צביעה אבחנתית , שמאפשרת לנו לזהות חיידקים שמייצרים נבג. 1) צובעים בצבע ירוק שנקרא מלכית גרין את כל החיידק - גם את ה forespore וגם את תא האם. 2) מקבעים בעזרת חימום 3) שוטפים , הצבע נשטף מתא האם ונשאר מקובע לספורה צובעים בספרנים , נקבל ספורה ירוקה ותא אם אדום שקף 104
34
סיכום: שקף 107 (עמ׳ 15)
לשים לב לגופפי האגירה שהמעטפת שלהם היא חלבונית
35
תא אנימלי לעומת תא צמחי לעומת חיידק:
בתא חיידק אין אברונים , אולם יש נטיה להתייחס למרווח הפריפלסמטי כאברון כי מתקיימים בו תהליכים מטבוליים ששונים מהתהליכים בציטופלסמה תא צמח מכיל בנוסף למה שתא אנימלי מכיל גם דופן יתא (צילולוז) , כלורופלסט (פוטוסנתזה) , ואקוולה (אגירה ויציבות). בתא אנימלי יש מבנים של מיקרווילי שאינם קיימים בתא צמח שקף 115.
36
רביה בפרוקריוטים לעומת יוקריוטים ?
פרוקריוטים מתרבים בתהליך שנקרא חלוקה בינארית , יוקריוטים מתרבים במיטוזה. שני התהליכים הם תהליכים אמיניים , ובשניהם מתקבלים צאצאים (שני תאי בת) זהים.
37
ארכיאה:
יצור פרוקריוטי , חסר גרעין לא ידועים זנים שמחוללים מחלות בבני אדם לרוב חי בנישות קיצוניות , מכיל ממברנה , דופן וריבוזומים ששונים מפרוקריוטים (חיידקים) אחרים.
38
מצגת 2 - גידול חיידקים:
בגוף שלנו יש פי 10 יותר חיידקים מאשר תאים סומטיים. 50% מהביומסה בכד״ה היא של מיקרואורגניזמים 15% בעה״ח 35% צמחים
39
אוכלוסיית חיידקים:
אוכלוסיית חיידקים היא אוסף של פרטים שיש להם **זהות גנטית משותפת**. במעבדה , אנחנו קוראים לאוכלוסיית חיידקים ״מושבה״ , והיא נוצרת מאותו תא , שמתחלק שוב ושוב. למרות הזהות הגנטית , פרטים שונים באוכלוסיה חווים את הסביבה באופן שונה , ולכן הם נבדלים אחד מהשנים מבחינה מטבולית: חיידקים שונים (באותה אוכלוסיה) מבטאים אנזימים וחחבונים באופן מעט שונה זה מזה.
40
ספירת חיידקים:
קיימות שתי שיטות לספור ולכמת חיידקים: 1) ספירה ישירה: סופרים פיזית את החיידקים באמצעות מיקרוסקופ. סופרים גם חיידקים חיים וגם מתים. 2) ספירה עקיפה: מכמתים את החיידקים לפי פרמטר עקיף - מסה , עכירות , כמות DNA , חמצן. בתוך שתי החלוקות הנ״ל יש שתי תת חלוקות נוספות: - **ספירה חיה**: סופרים אך ורק חיידקים חיים. - **ספירה כוללת**: סופרים גם חיידקים חיים וגם מתים.
41
קבע באיזה סוג ספירה מדובר:
- זריעת חיידקים על צלחת ? - בדיקת כמות חמצן שנצרך מהמצע ? - הסתכלות דרך מיקרוסקופ ? - עכירות ? - משקל יבש ? - ספירת DNA ? עמ׳ 18
42
ספקטרופוטומטר:
מכישיר שמשמש לספירת חיידקים עקיפה כוללת , בעצם אנחנו מודדים עכירות של התמיסה , שהוא מדד עקיף לכמה חיידקים יש. כוללת כי כל עוד החיידק לא התפוצץ , המכשיר אינו מזהה בין חיידק חי למת , ושניהם בולעים אור באותו אורך גל.
43
תכונות מכשיר הספקטרופוטומטר:
- האור המוקרן על התמיסה הינו מונוכרומטי - אנחנו בוחרים את אורך הגל בו הבליעה היא המקסימלית - המכשיר מחשב את הדלתא - חיידקים חיים מוקרנים באורך גל של 600 ננומטר - צפיפות החיידקים הינה ביחס ישר לעכירות (שקף 18).
44
עקום כיול:
עקום מתאר צפיפות חיידקים **חיים** כנגד מידת עכירות התמיסה , כלומר משלב שיטה כוללת (OD) עם שיטה חיה (זריעה). עכירות ניתן למדוד בזמן אמת , ספירה חיה יום למחרת. דרך העקום , אנחנו עושים מדידה של OD וכנגד זה רושמים כמה מושבות יש , ואז לפי ערך משולש ניתן לכמת לכל ערך OD את מספר החיידקים החיים שמתאים לו. את כמות החידקים שמתקבלים בזריעה מודדים ביחידות של CFU עמ׳ 20
45
התרבות ליידקים:
רביה אל מינית , מכל תא נוצרים שני תאי בת זהים , כלומר בכל דור מספר החיידקים מוכפל. **זמן דור**: הזמן שלוקח לאוכלוסיית חיידקים להכפיל את מספר פרטיה (ברמת החיידק , הזמן שלוקח לחיידק אחד להתחלק לשני תאים). ככל שהתנאים יותר אופטימליים זמן הדור יותר קצר = קצב החלוקה יותר מהיר.
46
שקף 25
מה צריך לדעת ?
47
ספירה חיה: מהמדיום הנוזלי אל המצע המוצק-
כאשר רוצים לספור חיידקים (בשיטה של המשבצות) , אנחנו תחילה מגדלים אותם במבחנה שמכילה מדיום נוזלי , ואז לוקחים דגימה מהמבחנה וזורעים אותה על צלחת גידול. בד״כ לא ניתן לעשות זאת באופן ישיר מהמבחנה לצלחת בגלל כמות החיידקים הרבה במבחנה שתתן דשא של חיידקים בצלחת , ולכן נדרש דילול. כיצד עושים דילול ? מכינים סדרה של מבחנות שכל אחת מכילה 9 מ״ל של נוזל כלשהו <= למבחנה הראשונה אני מכניס 1 מ״ל מתמיסת המקור שבה אני רוצה לכמת את כמות החיידקים <= למבחנה הבאה אני מכניס 1 מ״ל מהמבחנה הראשונה וכן הלאה **בעצם בכל מבחנה ריכוז החיידקים יורד פי 10** דקף 36
48
מדוע אוכלוסיית חיידקים אינה גדלה עד אינסוף ?
בגלל גורמים מגבילים בסביבה. גורמים מגבילים נחלקים לגורמים **ביוטיים** - אורגניזמים כאלה ואחרים שמתחרים על משאבים , מפרישים חומרים וכו׳. ולגורמים **אביוטיים** - תכונות כימקליות / פיזיקליות של הסביבה כגון חום , מליחות , טמפ׳ וכו׳.
49
עקום גידול של חיידקים:
מורכב מ 4 שלבים: - הסתגלות lag - גדילה מעריכית log - עמידה stationary - מוות death **בכל פעם שמעבירים חיידקים לנישה חדשה , הם יעברו את 4 השלבים**. שקף 20 מצגת 2
50
תאר את שלב ה lag:
זהו שלב הכרת הסביבה וההסתגלות , במהלכו החיידקים לומדים את הסביבה בה הם נמצאים ומסנתזים חלבונים בהתאם. לקראת סוף שלב ה lag החיידקים מתחילים לגדול פיזית , ומתכוננים לחלוקה. ככל שהתנאים בסביבה יותר נוחים לחיידקים , משך שלב ההסתגלות ירד , למשל במצע עשיר שחיידקים מקבלים הכל מוכן , יש פחות אנזימים שהם צריכים לסנתז כדי לייצר חומרים אורגניים. כאמור כל חיידק חווה את הסביבה באופן שונה , ולכן אנחנו נמצא חיידקים בודדים שכבר מתחילים להתחלק בשלב הזה , אך בגדול כאוכלוסיה , אנחנו נגדיר אותם כשלב הסתגלות. במעבר ממצע למצע , יהיה שלב lag , ככל שהמצעים יותר דומים בהרכבם , השלב יהיה קצר יותר. שקף 42
51
שלב ה log:
שלב הגידול המעריכי , החיידקים נמצאים בשיא הפעילות המטבולית שלהם , משכפלים את הגנום ומתחלקים. המצב נמשך עד להופעת גורם מגביל כלשהו שקף 43
52
שלב סטציונרי:
שלב שבו החיידקים **פשוט מתקיימים**. הם לא מתרבים ולא מתחלקים , אך הם גם לא מתים (בגדול כאוכלוסיה). ישנה פעילות מטבולית בסיסית שבה החיידקים מייצרים את החלבונים הנחוצים בעבור ההישרדות שלהם. מרבית החיידקים בטבע נמצאים בשלב הזה שקף 44
53
שלב המוות:
החיידקים לא מצליחים לשרוד יותר , ומתחילים למות , עדיין יהיו כאלה שיצליחו להתרבות , אך כאוכלוסיה הרוב מתים.
54
ספירה חיה לעומת בדיקת עכירות:
אלה הם שתי השיטות הכי נפוצות במעבדה לכימות מספר החיידקים. **בציור גרף של ספירה חיה , אף פעם לא מתחילים מאפס , כי לפחות יש חיידק אחד בצלחת הגידול** לעומת זאת , בגרף שמתאר עכירות , יתכן שנתחיל מ 0 בציר ה y , כי הדבר נתון למידת הרגישות של המכשיר. שקף 46 + עמ׳ 25
55
שקף 47:
1) אם נקח חיידקים שנמצאים בשלב ה log לעומת חיידקים שנמצאים בשלב סטציונרי , ונעביר אותם ממצע עשיר למצע עשיר אחר , אנחנו נצפה בשלב lag בשני המקרים , אולם באורכים שונים: - העברה ממצע עשיר למצע עשיר אחר משלב ה log , תדגים שלב הסתגלות קצר יותר - העברה ממצע עשיר למצע עשיר אחר משלב סטציונרי , תדגים שלב הסתגלות ארוך יותר. ההבדל נובע מהרכב האנזימים שיש בחיידק , ומרמת הפעילות המטבולית. ככל שההבדל בין המצעים גדול יותר / ככל שהפעילות המטבולית של החיידקים מצומצמת יותר , כך יתארך שלב ה lag
56
השפעת הגורם המגביל:
**צפיפות:** כמות החיידקים הסופית תהיה זהה , הם יגיעו לאותו שלב סטציונרי , רק שלחיידקים במצע עני יקח יותר זמן (lag ארוך יותר שיפוע log מתון יותר). **מזון**: חיידקים שגדלים במצע גידול עני יגיעו מהר יותר לשלב סטציונרי מאשר חיידקים שגדלים במצע עשיר. במצע העני חיידקים צריכים לסנתז המון דברים בעצמם , וזה דורש צריכת יתר של משאבים מהסביבה , ולכן המצע מתכלה מהר יותר. עמ׳ 26
57
מצעי גידול:
קיימים שני סוגים של מצעי גידול: - מצע גידול עני - מצע גידול עשיר (מורכב). **עני**: מכיל מים , מלחים וגלוקוז , החיידקים צריכים לייצר בעצמם את אבני הבניין , תהליך שדורש אנרגיה וזמן. **מצע עני הוא תמיד מצע מוגדר**. **עשיר**: מכיל אבני בניין (פולימרים) מוכנים , החיידק אינו צריך להכין כלום בעצמו ולכן חוסך זמן ואנרגיה. **מצע עשיר לרוב יהיה בלתי מוגדר** כי מכיל תמצית שמרים / מרה , אם כי ניתן להכין מצע עשיר מוגדר.
58
סוגי מצעים:
**מצע העשרה:** מצע שכל החיידקים יכולים לצמוח עליו , אך הוא מכיל מרכיבים שנותנים יתרון לסוג חיידקים מסויים שצומחים עליו ביתר שאת. **מצע סלקטיבי**: מאפשר רק לסוג מסויים של חיידקים לצמוח עליו , למשל במצע שמכיל AB רק חיידקים עמידים יוכלו לגדול. **מצע דפרנציאלי**: מאפשר לכל החיידקים לצמוח עליו , אך מכיל חומר מסויים שלפיו נוכל לדעת את תכונות החיידקים שצומחים.
59
מצע LB
מצע עשיר ולא מוגדר (מכיל תמצית שמרים) , **תמיד יהיה נוזלי**. מתאים למרבית החיידקים.
60
אגאר דם: (מכיל דם של כבשים)
מצע העשרה דפרנציאלי העשרה: נותן יתרון לחיידקים גרם שליליים , כאלה שרגילים לחיות בתוך בעלי חיים. אבחנתי: נוכל דרכו לגלות נוכחות חיידקים המוליטיים , וגם סוג ההמוליזה שהם עושים.
61
מצע מקונקי:
זהו מצע סלקטיבי דפרנציאלי. סלקטיבי כי מאפשר רק לחיידקים גרם שליליים לגדול עליו (סלקטיבי לשליליים). דפרנציאלי: ניתן דרכו לגלות חיידקים שמפרקים לקטוז (הופך מורוד לצהוב). הסלקטיביות של מקונקי נובעת ממיצי מרה שמכניסים אליו , מיצי מרה הורגים חיידקים גרם חיוביים. משמש למציאת חיידקים צואתיים
62
מצע mannitol salt agar:
מצע סלקטיבי דפרנציאלי סלקטיבי: מאפשר רק לחיידקים אוהבי מלח לגדול עליו. דפרנציאלי: נוכל לזהות חיידקים שיודעים לפרק מניטול (הופך מצע מורוד לצהוב). - חיידקים רגישים למלח: לא יגדלו - עמידים למלח שלא מפרקים מניטול: יגדלו ולא יהיה שינוי בצבע - חיידקים עמידים למלח מפרקי מניטול: צבע צהוב.
63
מצע EMB - eosin methylene blue
מצע סלקטיבי דפרנציאלי. סלקטיבי: מאפשר רק לחיידקים גרם שליליים לצמוח עליו דפרנציאלי: מלמד אם החיידקים שצמחו יודעים לפרק לקטוז/סוכרוז. פירוק לקטוז: צבע ורוד פירוק סוכרוז: צבע סגול-שחור אווזין מיתילן הורג חיידקים גרם חיוביים. מצע זה משמש למציאת קוליפורמים (חיידקי מעיים).
64
תאר השפעת טמפ׳ על גדילת חיידקים:
טמפרטורה אופטימלית תגרור קצב גדילה מקסימלי **טמפ׳ גבוהה** מדי תפגע במבנה החלבונים , תעשה להם דנטורציה , ולכן גם התפקוד שלהם יפגע , **אי לכך בטמפרטורות גבוהות נראה ירידה בקצב הגדילה הודות לפגיעה במבנה החלבונים.** בנוסף לכך , טמפ׳ גבוהה תגרום לפגיעה במבנה הממברנה ולקריסה שלה , ולכן בטמפ׳ גבוהות ממש החיידקים גם ימותו. **טמפ׳ נמוכה** מדי: אין פגיעה במבנה החלבונים אבל יש האטה בפעילות שלהם. וכן , התקשות של הממברנה (היכן שמתרחשים ריאקציות מטבוליות) ובגדול הכל קורה לאט יותר. ולכן בטמפ׳ נמוכות מאד תתכן שלא תהיה צמיחה בכלל של חיידקים , וככל שמתקרבים יותר ויותר לטמפרטורת האופטימות קצב הגדילה ילך ויעלה. שקף 61: נראה שבטמפ׳ גבוהה הירידה בקצב הגדילה היא חדה מאד וזה כתוצאה מהרס חלבונים , בטמפ׳ נמוכות הירידה בקצב הגדילה יותר מתונה , וזה הודות להאטה בפעילות שלהם.
65
סדר מהטמפרטורה הגבוהה ביותר לנמוכה ביותר: מזופיליים , טרמופיליים , היפר טרמופיליים , פסיכרופיליים.
1) היפרטרמופיליים: 60-110 (מעיינות חמים) 2) טרמופיליים: 40-60-70 3) מזופיליים: 10-39-45 (כולל בני אדם) 3) פסיכרופיליים: טמפ׳ נמוכות כגון מעמקי האוקיינוס , הקוטב שקף 62
66
כיצד חיידקים ששורדים בטמפרטורות גבוהות עושים זאת ?
מבנה דופן , ממברנה וחלבונים שונה , וזה מאפשר להם לשרוד טמפ׳ גבוהות.
67
האם חיידקים מסוגלים לחיות בתנאי חומציות שאינם ניטרליים ?
כן, אסידופיליים: חיידקים שחיים בסביבה חומצית אלקלופיליים: חיידקים שחיים בסביבה בסיסית (בד״כ יהיו גם טרמופיליים).
68
האם הסביבה הפנימית (ציטופלסמה) של חיידקים אסידופיליים תהיה גם כן חומצית ?
לא ! חיידקים , גם כאשר חיים בסביבות קיצוניות , לרוב שומרים על סביבה ניטרלית וקבועה. במצב של חומציות / בסיסיות קיצוניים בסביבה , החיידקים מייצרים מולקולות שמנטרלות את המימן / הידרוקסיל. או לחילופין מפרישים החוצה לסביבה חומרים שפועלים כבופר.
69
על איזה פונקציות בחיידק משפיעה חומציות הסביבה ?
- פעילות אנזימטית - נשימה
70
שקף 68
רואים שחיידקים יכולים לגדול בטווח נתון של חומציות. קיים ערך אופטימלי שבו קצב הגדילה הוא הכי מהיר. גם רואים שכאשר חורגים מטווח האופטימום , יש ירידה בקצב הגדילה , אולם , בשונה מטמפרטורה הפעמון שמתאר זאת הינו סימטרי. וזאת כי לא משנה אם אנחנו באובר חומציות או בתת חומציות , מבנה החלבונים נפגע באותו אופן , וכך גם פעילותם.
71
באיזה סוג סביבה מבחינת ריכוז מומסים חיים רוב החיידקים ?
רוב החיידקים חיים בסביבה **היפוטונית** בעלת ריכוז מומסים נמוך , ולכן מים נכנסים אל תוכם , אך הודות לנוכחות הדופן הם לא מתפוצצים. חיידקים כאלה נקראים nonhalophile והם חיים בסביבה בעלת ריכוז מומסים של מקסימום 1% (אצלנו בגוף זה 0.9%). אי קולי שייך לסוג הזה.
72
סווג חיידקים לפי יכולתם לחיות בתנאי מליחות שונה:
1) **נונהלופילים:** חיים בין 0.01% ל 1% 2) **הלוטולרנטים:** מעדיפים ריכוזי מלח נמוכים בסביבתם , אך סובלים מליחות גבוהה. 3) **הלופילים:** אוהבי מלח , מתחלקים ל 3 סוגים: הלופילים **mild:** חיים במי ים 1-6 הלופילים **moderate:** חיים במלפפון חמוץ 6-15 הלופילים **extreme:** חיים בים המלח 15-30. סביבה שאינה מלוחה מספיק היא טוקסית עבורם.
73
מהם מנגנוני ההתמודדות של חיידקים כנגד מליחות גבוהה בסביבה ?
1) הגדלת ריכוז המומסים התוך תאיים (גליצין , גליצרול) , אלה מומסים שאינם טעונים כדי לא לפגוע בחלבונים ציטופלסמטיים. 2) נטרול יוני המלח (אחרי שמתפרקים) ע״י קישורם למאררומולקולות בציטופלסמה. 3) שאיבת יונים מהסביבה (כגון אשלגן) והשוואת האוסמולריות בציטופלסמה לאוסמולריות בסביבה , אופייני לחיידקים שהם extreme הלופיליים.
74
Dunaliella:
אצה חד תאית , יכולה לחיות בטווח ערכים גדול מאד של מליחות: 0.5% - 20%. בתנאי מליחות קיצוניים מסנתזת גליצרול כדי לאזן את האוסמולריות , וכשהמליחות יורדת היא מפרישה אותו החוצה.
75
לחץ:
לחץ גבוה בשילוב עם טמפ׳ משמש לסטריליזציה , יעיל גם נגד נבגים. בארופיליים: חיים במעמקי האוקיינוס בארוטולרנטיים: הרוב , חיים סמוך לפני האדמה.