1- Structure de l'ADN et de l'ARN Flashcards
1
Q
Comment pouvons-nous décrire la pangénèse ?
A
Ce serait la transmission, au cours des rapports sexuels, de fragments corporels miniaturisés: cheveux, ongles, veines, artères, tendons et os sous la forme de particules invisibles de petites tailles. L’embryon serait assemblé à partir de ces composantes minuscules.
2
Q
Qu’est ce que l’eugénisme? Qui a créer ce mouvement?
A
- c’est l’ensemble des méthodes et pratiques visant à transformer le patrimoine génétique de l’espèce humaine dans le but de le faire tendre vers un idéal déterminé
- Francis Galton
3
Q
Quelles chaînes constituent l’ADN?
A
des chaînes polynucléotidiques
4
Q
De quoi se compose l’ADN?
A
- bases azotées
- squelette de sucre-phosphate
5
Q
Par quoi sont accessibles les bases azotées de l’ADN?
A
Accessibles par les petits et les grands sillons
6
Q
Où se projettent les bases azotées de la structure de l’ADN?
A
à l’intérieur, le squelette se trouve à l’extérieur
7
Q
Quelles sont les 2 molécules composant un nucléoside?
A
Une base azotée (ex: l’Adénine) et un sucre
8
Q
Quelles sont les 3 molécules retrouvées dans un nucléotide?
A
Une base azotée (ex: l’Adénine), un sucre et un à trois groupements phosphate
9
Q
Quel type de lien relie la base azotée et le sucre d’un nucléoside?
A
un lien glycosyle
10
Q
Par quel type de lien le groupement phosphate est-il attaché au sucre dans l’ADN?
A
Liaison phosphoester
11
Q
Quels liens forment le squelette régulier sucre-phosphate (lien entre chaque nucléotide)?
A
Lien phosphodiester
12
Q
Quelles bases forment la classe des purines?
A
Adénine et guanine
13
Q
Quelles bases forment la classes de pyrimidines?
A
Cytosine, thymine et uracile (ARN seulement)
14
Q
Vrai ou faux:
il est impossible de former un nucléotide par condensation?
A
FAUX
Possible, car la condensation libère une molécule d’eau
15
Q
Sous quels états tautomériques existent les bases Adénine et Cytosine? Laquelle est dominante?
A
- Formes amino et imino
- la forme amino est dominante
16
Q
Sous quels états tautomériques existent les bases T et G? Laquelle est dominante?
A
- Formes céto et énol
- la forme céto est dominante
17
Q
Pourquoi est ce que la forme tautomérique amino (pour les bases A et C) et céto (pour les bases G et T) sont-elles dominantes?
A
Car les 2 formes sont complémentaire
18
Q
Pourquoi est ce que la forme tautomérique amino (pour les bases A et C) et céto (pour les bases G et T) sont-elles dominantes?
A
Car les 2 formes sont complémentaires
19
Q
Qu’est ce qu’un état tautomérique?
A
c’est une configuration en équilibre d’une base azotée
20
Q
Dans quelle état doivent être les bases pour que l’appariement Watson-Crick soit possible?
A
dans leur état tautomérique préférentiel (dominant)
21
Q
Quel type de liaison relie les bases des brins opposés de l’ADN?
A
Des liaisons hydrogènes
22
Q
Combien de liaisons hydrogènes génèrent les base G:C?
A
3
23
Q
Combien de liaisons hydrogènes génèrent les base A:T?
A
2
24
Q
Que vont assurer les liaisons H+ entre les bases de la double hélice?
A
- la stabilité thermodynamique de l’hélice
- la spécificité d’appariement des paires de bases
25
Quels sont les facteurs qui influencent la stabilité thermodynamique de l'hélice de l'ADN?
- l'entropie
- l'empilement des bases
- les influences hydrophiles/hydrophobes
26
Comment l'entropie stabilise-t-elle la double hélice?
-Chaque liaison H entre 2 bases provient de la disparition d'une liaison H préexistante avec une molécule d'eau
-Quand les brins sont séparés, les molécules d'eau sont alignées sur le bord de la chaîne
-Quand les brins s'apparient, les molécules d'eau sont chassées ce qui créé de l'entropie et stabilise l'hélice
27
Comment l'empilement des bases stabilise-t-elle la double hélice?
Les bases ont tendance à s'empiler de façon perpendiculaire à l'hélice ce qui crée une interaction entre les nuages électroniques de noyaux délocalisés.
28
Comment les influences hydrophiles/hydrophobes stabilisent-elles la double hélice?
La dualité entre le squelette sucre-phosphate polaire et les bases non-polaires créé une influence stabilisatrice. Les forces hydrostatiques créent une forte pression qui colle les 2 brins.
29
Pourquoi est-il impossible d'apparier une cytosine à une adénine?
Puisque deux atomes accepteurs se font face, il n'y a aucune place pour introduire une molécule d'eau qui est nécéssaire à la liaison.
30
Dans le pivotement des bases, les bases retournées peuvent servir de ligand à des enzymes participant à quels processus?
-La méthylation des bases
-La réparation de l'ADN
-La recombinaison homologue
31
Vrai ou faux.
Le pivotement des bases est un processus gourmand en énergie.
Faux, car les bases sont retournées une à la fois.
32
Comment se nomme ce processus: certaines bases peuvent ressortir de la double hélice
connu sous le nom de pivotement de base
33
Comment se nomment les enzymes retrouvées dans le processus de méthylation des bases?
ce sont des méthylases
34
Quel est le modèle expérimental de Gregor Mendel et en quoi consiste-t-il?
Les pois. Ils pouvaient être de 2 couleurs: Verts (V) ou Jaunes (J). Cela permet de déduire que les facteurs qui définissent la couleur (ces facteurs seront ultérieurement désignés par le terme de 'gène') se transmettent aux générations suivantes. Il démontre aussi qu'il existe 2 versions du gène de la couleur chez les pois. VV: vert; JJ:jaune; JV:jaune. Cela permet de définir les notions de 'dominant' vs 'récéssif'.
35
Quelle est l'origine du mot gène?
Remonte à 1909 (Wilhelm Johannsen); dérivé de 'pangène', qui signifie 'organites intracellulaires présents dans toutes les cellules'.
36
Quelle est l'oeuvre majeure de Darwin et de quoi traite-elle?
L'origine des espèces. Explique le mécanisme présidant, selon lui, à l'évolution graduelle des espèces vivantes dans la nature. Fondateur de la théorie de l'évolution moderne.
37
Résumez en une phrase la théorie de l'évolution selon Darwin.
Les variations héréditaires qui confèrent un avantage sélectif seront davantage transmises à la génération suivante que les variations moins avantageuses.
38
Comment les victoriens appliquèrent-ils la logique darwinienne aux humains?
Cette possibilité de transmettre des variations positives dépend de la capacité de reproduction de chaque espèce. Pour les victoriens, les honnêtes représentants des classes moyennes, humbles, moraux et travailleurs devenaient minoritaires face aux classes inférieures. Or, puisqu'on croyait alors que les vertus comme les vices tenaient de famille; et que les classe inférieures se multipliaient + rapidement, on pensait que l'immoralité allait finir par dominer et que l'espèce humaine serait condamnée.
39
Quel est le mouvement créé par Francis Galton et en quoi consiste-il?
L'Eugénisme. Se réfère à l'ensemble des méthodes et pratiques visant à transformer le patrimoine génétique de l'espèce humaine dans le but de le faire tendre vers un idéal déterminé.
40
Qui a été influencé par l'oeuvre de Grant?
Hitler. L'ouvrage de Grant séduit les nazis; il est devenu la bible d'Hitler. Mein Kampf: L'état doit déclarer que tout individu notoirement malade ou atteint de tare héréditaires, donc transmissibles à ses rejetons, n'a pas le droit de se reproduire et doit lui enlever matériellement la faculté. En 33, les nazis votèrent une loi de stérilisation de portée générale: la loi de la prévention de la transmission des maladies héréditaires: En 39, les nazis introduisent l'euthanasie (la stérilisation devient trop compliquée/considéré comme gaspillage) par les chambres à gaz Holocauste: apogée de l'eugénisme nazi
41
Qu’advint-il de l'eugénisme?
Disparu de lui-même au milieu du 20e s. Science légitime de la génétique humaine se trouve confrontée à un problème de relations publiques.
42
À l'époque de Watson, la plupart des biologistes pensaient qu'on finirait par prouver que les principaux supports de l'information génétique étaient...
Les protéines.
43
Quelle découverte a été faite concernant l'ADN en 1930? Qu'ignorait-on encore à ce moment au sujet de l'ADN?
Il a été établit que l'ADN était une longue molécule composée de 4 bases différentes. On ignorait toutefois comment les sous-unités de la molécule (désoxynucléotides) étaient reliés chimiquement et si les séquences que formaient les 4 bases pouvaient varier.
44
Sur quoi le premier modèle de Watson et Crick était-il basé?
Sur la théorie de Wilkins qui était convaincu que l'ADN était une hélice formée de plusieurs brins. W&C construisent alors un 1er modèle de la molécule d'ADN à trois hélices à armature centrale (bases orientées vers l'extérieur).
45
Qui détruisit la théorie de l'hélice à 3 brins et à armature centrale? Comment justifia-t-elle sa nouvelle théorie?
Rosalind Franklin. Le contenu en eau de l'ADN cristallisé rend impossible un modèle avec armature centrale. Il favorise plutôt une armature externe.
46
Wilkins montre un cliché aux rayons X obtenu par un étudiant de Rosalind Franklin de ce qu'il appelait la forme B du cristal d'ADN. Qu'est-ce que ce cliché permet de comprendre?
Le cliché de diffraction montre une croix suggérant une structure de type hélicoïdal. Watson s’aperçoit que les données issues des mesures de densité de l'ADN privilégiaient une structure constituée de 2 chaines et non 3. Il sait également que les bases AT GC s'associent entre-elles probablement par la formation de liaisons hydrogènes, possibles seulement si les bases sont au centre et l'armature à l'extérieur.
47
Le matin du 28 février 1953...
Le modèle de la molécule d'ADN à double hélice est finalement conçu et sa validité éprouvée.
48
En 1962, Watson, Crick et Wilkins reçoivent le prix Nobel de physiologie et de médecine pour avoir élucidé la structure de l'ADN. Qu'est-ce qui cloche?
Franklin n'a pas reçu la reconnaissance qui aurait dû lui être accordée pour ses idées et ses travaux.
49
Quelle est la réaction menant à la formation d'un nucléotide? Quelles molécules et quels liens impliquent-t-elle?
Deux réactions de condensation. 1: Lien phosphoester entre un Phosphate et un alcool (OH) du sucre. 2: Lien glycosyle entre une Base (Adénine) et un alcool (OH) du sucre. Libération de 2 molécules d'eau
50
1 tour d'hélice correspond à...
3,4mm ou 10,5 pb
51
Les liaisons H+ entre les bases assurent... (2)
1: Stabilité thermodynamique de l'hélice
2: Spécificité d'appariement des paires de bases
52
Décrivez comment s'effectue l'empilement des bases.
Les bases azotées sont plane et relativement hydrophobes. Il y a interactions entre les nuages électroniques délocalisés des noyaux aromatiques (pi-pi): les paires de bases s'attirent l'une l'autre par les forces de Van der Waals (2 à 4 kj/mol)
53
La double hélice comporte 2 sillons de taille différente. Pourquoi?
Les angles séparant les 2 sucres de chaque paires sont de 120 et 240°. Ainsi, dans un empilement des bases, le petit angle d'un bord de la paire produit le petit sillon, tandis que le grand angle produit le grand sillon.
54
Nommez un exemple d'enzyme de restriction qui fait pivoter les bases.
HaeIII. Méthyltransférase liée à l'ADN. Elle retourne les bases une à une jusqu'à ce qu'elle trouve la base à méthyler.
55
Le pas de la double hélice (type B) est habituellement à...
Droite. Conséquence de la nature hélicoïdale de l'ADN.
56
Qu'est-ce qui explique que le grand sillon est plus riche en information que le petit?
C'est en raison des groupements chimiques des bases exposés au solvant dans la double hélice. Les protéines sont capables de distinguer, dans le grand sillon, les A des T et les C des G, car les codes sont plus spécifiques.
57
Quels sont les groupements chimiques des bases exposés au solvant dans la double hélice?
A: Atome accepteur d'H
D: Donneur d'H
M: Surface hydrophobe
H: Atome non-polaire
58
Quelles sont les 3 conformations de l'ADN?
ADN-A
ADN-B
ADN-Z
59
Nommez les caractéristiques de l'ADN-B
10 pb/tour, grand et petit sillon, + près des conditions physiologiques
60
Nommez les caractéristiques de l'ADN-A
11 pb/tour, grand sillon + étroit, petit sillon + large et - profond, solutions pauvres en eau
61
Nommez les caractéristiques de l'ADN-Z
12 pb/tour, grand sillon aplatie à la surface de l'hélice, petit sillon très étroit et + profond, répétitions purines-pyrimidines (d(GC)n)
62
Vrai ou Faux: La réalité physiologique de l'ADN-Z est discutable.
Vrai. Si les hélices gauches existent dans la cellule, il s'agit de très faible parties de l'ADN cellulaire.
63
Quelle forme de l'ADN Wilkins-a-t-il découverte? Quelle forme Franklin-a-t-elle découverte?
ADN-B
64
L'image de diffraction des rayons X par l'ADN observée par Rosalind Franklin montre une structure en croix de Malte. Qu'a-t-elle permis de mesurer?
Elle a permis de mesurer la périodicité de l'hélice d'ADN (3,4 nm)
65
Vrai ou Faux: L'ADN physiologique ne présente pas de variation structurale d'une paire de base à l'autre.
Faux. Il peut y avoir vrillage des paires de bases dans une hélice. On se retrouve alors avec un arrangement en "hélice d'avion".
66
Quelles sont les conséquences d'un vrillage des paires de bases? (2)
1: Modifie localement le nombre de paires de bases par tour.
2: Grands et petits sillons ont des largeurs différentes.
67
Vrai ou Faux. L'ADN peut adopter une configuration en hélice à gauche. Expliquez
Vrai. Il peut s'enrouler avec un pas d'hélice aussi bien à droite qu'à gauche. Surtout lorsqu'il y a plusieurs résidus GC. Cela est possible grâce au lien glycosyle.
68
La liaison glycosyle qui relie la base au désoxyribose peut adopter 2 configurations. Lesquelles?
Syn (cis) ou anti (trans)
69
La liaison glycosyle reliant la base au désoxyribose se lie où sur le désoxyribose?
sommet C1
70
Avec un ADN à hélice à droite, le lien glycosyle est toujours en configuration...
Anti
71
Avec un ADN à hélice à gauche, la configuration du lien glycosyle...
Dépend de l'unité de base répétée (double purine-pyrimidine)
Anti: si résidus pyrimidiques TC
Syn: si résidus puriques AG
72
Qu'est-ce qui donne l'allure en zigzag au squelette d'ADN?
L'alternance entre les configurations anti et syn.
73
Concernant l'ADN-Z. En solution, l'hélice d'ADN avec unités purine-pyrimidine répétées n'est gauche qu'en présence d'une....?
d'une concentration élevée en ions positifs (tel Na+)
74
Dans quelles régions y a-t-il un potentiel à former des structures ADN-Z?
Il y aurait une corrélation avec les régions activement transcrites du génome. Plus facile d'aller chercher l'info dans la forme Z car sillon plus large.
75
Dans quelles conditions les brins d'ADN peuvent-ils se séparer et se réassocier?
À T° élevée et à pH élevé.
76
Que permet la séparation et la réassociation des brins d'ADN? Grâce à quoi?
La dénaturation et l'hybridation de l'ADN.
Grâce à: PCR, Southern, biopuces
77
L'ADN absorbe les UV de quelle fréquence?
260 nm
78
Quel effet a l'augmentation de la température sur l'absorbance de l'ADN?
Elle augmente également.
79
Définissez ce qu'est l'hyperchromicité.
Propriété de l'ADN de voir son absorption dans l'UV augmenter lorsqu'il subit une dénaturation (ex: augmentation de température).
80
La température de fusion de l'ADN (Tm) dépend de... (2)
1: Contenu en GC
2: Force ionique de la solution
81
Pourquoi la dénaturation de l'ADN dépend de son contenu en GC et de la concentration saline?
À cause du squelette des 2 brins d'ADN. Celui-ci contient des groupements phosphates chargé négativement. Les charges négatives d'un brin sont alors très près de celles du brin complémentaire et, sans contre-ions, elles se repousseraient l'une l'autre. Bref, les contre-ions neutralisent les charges négatives du squelette, ce qui réduit la répulsion.
82
Vrai ou Faux.: Avec l'ADN linéaire à 2 extrémités, le nombre de tours d'un brin autour de l'autre peut varier.
Vrai
83
Vrai ou Faux.: Avec l'ADN circulaire (extrémités liées covalemment (ADNccc)), le nombre absolue de tours est illimité.
Faux, il est limité
84
Les 2 brins d'un ADNccc ne peuvent être séparés sans que...
Une liaison covalente ne soit rompue.
85
Définissez ce qu'est l'enlacement (Lk: linking number).
Le nombre d'enlacement correspond à la somme de deux composantes géométriques:
1: Nombre de torsions (Tw: twist)
2: Nombre de supertours (Wr: writhe)
86
Le nombre de fois qu'un brin d'ADNccc doit passer à travers l'autre pour que les 2 brins soient séparés correspond au nombre...
d'enlacements
87
Définissez ce que sont les torsions.
Tours d'hélice d'un brin autour de l'autre (valeur + dans ADN droite)
88
Définissez ce que sont les supertours.
Lorsque l'axe longitudinal de la double hélice s'entrecroise sur lui-même un certain nombre de fois. Explique que l'ADN ne soit pas complètement à plat la majorité du temps.
89
Vrai ou Faux. L'ADN peut subir des déformations qui vont convertir certaines torsions en supertours ou l'inverse.
Vrai. Sert à diminuer la tension. Seule contrainte = d'ordre mathématique. Lk = Tw + Wr Lk° = Nb d'enlacements ADN complètement relaxé = Nb pb (10,5)
90
Qu'arrive-t-il lorsque l'on traite l'ADNccc avec l'enzyme DnaseI en conditions douces?
Cela élimine le surenroulement et relâche l'ADN. Les 2 brins peuvent tourner l'un autour de l'autre grâce à un point pivot (où il y a eu cassure).
91
Définissez ce qu'est le surenroulement négatif.
Forme d'emmagasinage d'énergie libre disponible pour faciliter les processus biologiques que nécessite la séparation des 2 brins de la double hélice (réplication, transcription).
92
Vrai ou Faux: Certaines régions ont tendance à se désenrouler partiellement.
vrai
93
Comment se nomment les petites structures particulières dans lesquelles l'ADN des cellules eucaryotes est compacté?
Nucléosomes
94
La double hélice s'enroule 2 fois (146pb) autour du...
coeur protéique: les histones
95
Le pas de l'enroulement de la double hélice autour du coeur protéique tourne à...
Gauche. Cela équivaut à un surenroulement négatif. L'enroulement de l'ADN autour des nucléosomes introduit donc une densité de super hélicité négative.
96
Quel sont les rôles généraux des topoisomérases sur l'ADN?
Elle peuvent relâcher l'ADN surenroulé. Elles jouent un rôle essentiel lors de nombreuses étapes de la vie cellulaire (réplication, transcription, séparation des chromosomes, etc).
97
Quelles sont les caractéristiques de la topoisomérase I? (3)
- Modifie la valeur du nbr d'enlacement d'un facteur 1
- Catalyse la coupure transitoire d'UN SEUL BRIN
- N'utilise pas d'ATP ou d'énergie
98
Quelles sont les caractéristiques (3) de la topoisomérase II?
- Elle modifie la valeur du nombre d'enlacements d'un facteur 2 (+/- 2)
- Elle coupe transitoirement les 2 brins de l'ADN, passe la partie intacte de l'ADN à travers la brèche et referme la coupure derrière en reformant 2 liens phosphodiesters.
- Elle utilise l'énergie chimique obtenue de l'hydrolyse de l'ATP.
99
Les topoisomérases désenchaînent, démêlent et éliminent les nœuds de l'ADN. Nommez 3 exemples.
- Réplication de l'ADN plasmidique: Caténation et Décaténation par la topoisomérase II. La topoisomérase I peut elle aussi, mais seulement s'il y a une cassure dans l'ADN.
- Séparation des chromatides soeurs: par la topoisomérase II.
- Des noeuds peuvent apparaître durant la recombinaison site-spécifique.: la topoisomérase II les défait.
100
Comment les topoisomérases peuvent-elles couper l'ADN?
En formant un intermédiaire covalent entre un résidu tyrosine et l'ADN.
101
Nommez les 5 étapes de coupage de l'ADN par les topoisomérases
1: Attaque d'un lien phosphodiester par un résidu tyrosine du site actif de la topoisomérase.
2: La topoisomérase est liée covalemment à l'une des 2 extrémités de l'ADN coupé.
3: Le groupement phosphotyrosyle conserve l'énergie chimique de la liaison phosphodiester clivée.
4: Cela permet de ressouder les 2 extrémités coupées de l'ADN.
5: La topoisomérase est alors libérée. Répétition du cycle ailleurs.
102
Comment les topoisomérases font-elles pour passer les segments d'ADN un à travers l'autre?
En formant un pont enzymatique.
103
Nommez les étapes (4) des topoisomérases pour faire le passage d'un segments d'ADN à travers un autre
1: Coupure et ouverture de la porte
2: Transfert du brin non coupé
3: Refermeture du brin coupé par des jonctions
4: Dissociation de l'ADN
104
Comment migrera (dans le gel d'agarose) l'ADNccc en fonction du nombre de supertours qu'il présente?
Plus il y a de supertours dans l'ADNccc, plus il migrera loin.
105
Quel effet a l'ion éthidium sur l'ADN?
Il déroule l'ADN en s'intercalant entre les paires de base. Il détord localement l'ADN d'environ 26°. Cela réduit la rotation d'un paire de base à l'autre de 36° à 10° environ. Cela diminue l'enroulement de l'ADN et relâche les ADNccc. Sur l'ADNccc l'enlacement ne change pas. Si on pouvait insérer un ion éthidium entre chacune des paires de base, la périodicité passerait à 36pb/tr.
106
En quoi l'ARN diffère-t-il de l'ADN? (3 façons)
1: Squelette des ARN contient du ribose au lieu du 2'-désoxyribose: fonction OH en position 2'. L'ARN est d'ailleurs plus facile à dégrader que l'ADN en raison de la présence de ce groupement OH
2: Contient de l'uracile à la place de la thymine.
3: Généralement monocaténaire.
107
Nommez les différents types d'ARN
- ARNm
- ARNt
- ARNr
- miARN
108
À quoi servent les ARN messagers (ARNm)?
Ce sont des intermédiaires entre le gène et la machinerie cellulaire de synthèse des protéines
109
À quoi servent les ARN de transfert (ARNt)?
Ce sont des adaptateurs entre les codons des ARNm et les acides aminés correspondants
110
À quoi servent les ARN ribosomaux (ARNr)?
Jouent un rôle structural et composent les ribosomes
111
À quoi servent les petits ARN (miARN)?
Jouent un rôle de régulation
112
Vrai ou faux: les ARN peuvent catalyser des réactions essentielles dans les cellules?
Vrai, les ARN peuvent jouer un rôle d'enzyme
113
La chaîne d'ARN se replie sur elle-même localement pour former des double hélices à enroulement similaire à l'ADN. Quels types de structures peuvent-elles former?
- Épingle à cheveux
- Hernies
- Simples boucles
114
Comment les structures d'ARN repliées peuvent-elles être stabilisées?
La stabilité des structures d'ARN repliées peut être accrue par les propriétés spéciales de certaines boucles. La séquence C(UUCG)G permet la formation d'une structure secondaire, la tétra-boucle, très stable. Dans la tétra-boucle, il y a des interactions très particulières d'empilement des bases; entre les nuages électroniques délocalisés des noyaux aromatiques, il y a des interaction pi-pi Cela stabilise les structures secondaire et tertiaire de l'ARN
115
Qu'est-ce qu'un pseudo-noeud?
Structure secondaire complexe créée par l'appariement de bases en des régions éloignées. Interaction hélicoïdale entre 3 segments complémentaires non-contigus du même ARN.
116
Quelle est la particularité des ARN qui explique leur capacité à former des structures en double hélice?
L'existence d'une paire de bases additionnelle qui n'est pas de type Watson-Crick. Base GU: azote N3 de l'U et carbonyle C6 de laG reliés par un lien H. 2e lien H relie carbonyle C2 de l'U à l'azote N1 de la G. Donc, les chaines d'ARN ont une forte tendance à l'auto-appariement.
117
Qu'est-ce qui explique que l'ARN peut se replier et former des structures tertiaires complexes?
L'ARN étant débarrassé des contraintes liées aux longues double hélices, il peut adopter une grande variété de structures tertiaires. Les ARN incorporent fréquemment des paires de bases non-conventionnelles (triplets UAU)
118
Quelles sont les caractéristiques de la Rnase P?
Ribonucléase impliquée dans la production des ARNt à partir d'un ARN précurseur. Seule la partie ARN catalyse la réaction. La partie protéique facilite l'association du substrat à la partie ARN en neutralisant les charges négatives du squelettes sucre-phosphate.
119
Qu'est-ce que le ribozyme à tête de marteau?
Ribonucléase séquence-spécifique de certains agents infectieux des plantes, les viroïdes. Requiert leur autoclivage pour se propager
120
Définissez ce que sont les viroïdes.
Agents subviraux qui existent à l'intérieur des cellules en tant que particules d'ARN uniquement, sans capsule ni enveloppe. Un seul ARN circulaire qui contient très peu de nucléotides (250-400): génome organisé en bâtonnet. ARN ne code aucune protéine. Quand il est répliqué dans la cellule, il produit plusieurs copies de lui-même sous forme d'un long ARN unique.
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Qu'arrive-t-il au ribozyme à tête de marteau à pH élevé?
Groupements 2'-OH des ARN progressivement déprotonés. Atomes d'O en 2' portent alors une charge négative. Effectue une attaque nucléophile du phosphate 3' adjacent. Réaction coupe la chaine de l'ARN en produisant: un groupement 2',3'-phosphate cyclique sur une des extrémités + un groupement 5'-OH libre sur l'autre Ribozyme à tête de marteau produit également groupements 2',3'-phosphates cycliques mais selon un mécanisme encore mal connu.
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Que veut dire ADNccc ?
ADN circulaire fermé covalemment "Covalently closed circular DNA"
