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C Biologie cellulaire et moléculaire > 1. Le noyau > Flashcards

1. Le noyau Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que la chromatine ?

A

Une substance formée d’ADN et de protéines, présente sous forme de granules dans le noyau.

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Q

Dans quelle organite de la cellule se trouve la chromatine ?

A

Dans le noyau

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3
Q

Quelles sont les deux phases principales du cycle cellulaire ?

A

Interphase

Mitose

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4
Q

Quelles sont les 3 phases de l’interphase

A

G1
S
G2
(G0 -> plus de réplication)

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Q

Que se passe-t-il dans la phase S de l’interphase ?

A

L’ADN est répliqué

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6
Q

Quelles sont les 4 phases de la mitose ?

A

Prophase
Métaphase
Anaphase
Télophase

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7
Q

Qu’est-ce qui est caractéristique du début de la prophase ?

A

Les chromosomes sont condensés et visibles en microscopie optique.

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8
Q

Que se passe-t-il durant la métaphase ?

A

Alignement des chromosomes au niveau de la plaque équatoriale.

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9
Q

Que se passe-t-il durant l’anaphase ?

A

Les chromosomes homologues se séparent.

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10
Q

Que se passe-t-il durant la télophase de la mitose ?

A

La cellule se divise en deux cellules soeurs

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11
Q

Est-ce que les mitochondries ont un génome ?

A

Oui

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12
Q

Quelles sont les caractéristiques de l’enveloppe nucléaire ?

A

Elle est constituée d’une double bicouche phospholipidique. La membrane externe est en continuité avec le réticulum endoplasmique.
Elle possède de nombreux pores nucléaires.
La partie interne est tapissée par la lamina nucléaire.

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13
Q

Qu’est-ce que l’espace périnucléaire ?

A

L’espace qui se trouve entre les deux bicouches lipidiques du noyau.

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14
Q

Que se passe-t-il avec le noyau durant la mitose ?

A

Il se désagrège entre la prophase et la métaphase puis se reforme une fois les deux cellules sœurs formées.

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15
Q

Quels sont les rôles du noyau ?

A

Produit les ribosomes
Stock le génome
Régule les interactions génome-cytoplasme

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16
Q

Quelles organites contiennent de l’ADN dans une cellule de plante ?

A

Mitochondrie
Noyau
Chloroplastes

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17
Q

Qu’est-ce que la lamina ?

A

Un maillage fibrillaire dense bordant l’intérieur de l’enveloppe nucléaire.

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18
Q

Que fait le réticulum endoplasmique ?

A

Il produit des molécules et les exportent vers l’appareil de Golgi via des vésicules.

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19
Q

Quels sont les particularités du noyau des plaquettes et des globules rouges ?

A

Ces différentes “cellules” n’ont pas de noyau

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20
Q

Quel est le rôle de la lamina ?

A

Elle charpente le noyau, lui donne sa forme et sa structure.
Organise la chromatine
Interagit avec des protéines qui sont sur la couche intérieur de l’enveloppe nucléaire

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21
Q

Comment s’appel le petit corps sphérique qui est le plus visible dans le noyau ?

A

Le nucléole

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22
Q

Quel type de colorant se fixe sur la chromatine ?

A

Les colorants basiques

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23
Q

Quels sont les principaux éléments du noyau ?

A

L’enveloppe nucléaire
Le nucléole
La chromatine
(La lamina)

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24
Q

Quelles sont les fonctions de l’enveloppe nucléaire ?

A

Compartimente le génome, la transcription, la maturation des ARN.
Participe à la traduction

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25
Q

Qu’est ce qui est attaché à la surface de la couche externe de l’enveloppe nucléaire ?

A

Des ribosomes

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26
Q

Qu’est-ce que la cryofracture ?

A

Une méthode qui permet l’observation d’une coupe cellulaire formée à partir d’un échantillon congelé.

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27
Q

Combien y’a-t-il de pores dans un noyau de cellule de mammifère ?

A

3000 - 4000

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28
Q

Quelles sont les principales molécules qui vont du noyau au cytoplasme ?

A

ARNm
ARNt
particules pré-ribosomiques

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29
Q

Quelles sont les principales molécules qui vont du cytoplasme au noyau ?

A

Histones
Lamines
Facteurs de régulation de la transcription
ADN et ARN polymérases

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30
Q

Qu’est-ce qu’un histone ?

A

Protéine localisées dans le noyau. Elles sont les principaux composants protéiques des chromosomes

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31
Q

Qu’est-ce que la lamine ?

A

Une protéine fibreuse qui forme la lamina.

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32
Q

Quels complexes enzymatiques aident à synthétiser l’ADN ? et l’ARN ?

A

L’ADN et l’ARN polymérase

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33
Q

Quelle molécule s’occupent d’amener les acides aminés aux ribosomes ?

A

ARNt

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34
Q

On quoi consiste la traduction ?

A

Synthèse de protéine à partir d’ARN.

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35
Q

Dans quelle partie de la cellule a lieu la traduction

A

Dans le cytoplasme

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36
Q

Quelle est la structure d’un pore nucléaire ?

A

C’est un complexe protéique formé de 8 parties semblables disposées en cercle. Chacune de ces parties est composée de plusieurs protéines.

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37
Q

Qu’est-ce qu’une nucléoprotéine ?

A

Une protéine associée à des acides nucléiques (ADN, ARN)

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38
Q

Qu’est-ce qu’une nucléoporine ?

A

Protéine qui compose le port nucléaire

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39
Q

Quel est le rôle des fibrilles dans les pores nucléaires ?

A

Ce sont les premiers points d’interaction avec les molécules qui entrent dans le noyau, elles rendent le transport plus efficace

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40
Q

Est-ce qu’un pore nucléaire peut faire de l’import et de l’export ?

A

Oui, tous les pores peuvent faire de l’import export.

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41
Q

Quelle est la distance entre les deux membranes du noyau ?

A

20 - 40nm

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42
Q

Quelle est le diamètre d’un pore nucléaire ?

A 
45nm (intérieur)
150 nm (toute la structure)
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43
Q

Comment s’appel le regroupement de fibrilles nucléaire du pore ?

A

La cage nucléaire

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44
Q

Comment est le passage à l’intérieur du pore ?

A

Il est obstrué par des fibrilles composés de nucléoprotéines avec des motifs répétés phénylalanine-glycine.

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45
Q

Comment font des protéines d’importation pour franchir les pores nucléaire ?

A

Elles se lient aux fibrilles qui ont un motifs répétés phénylalanine-glycine.

46
Q

Qu’est-ce qu’une karyophérine ?

A

Une protéine qui assure le passage des molécules à travers le pore nucléaire (importine/exportine)

47
Q

Est-ce que les fibrilles qui se trouvent au milieu du pore nucléaire sont hydrophiles ?

A

Non, hydrophobes

48
Q

Comment est-ce qu’une protéine de 20kD passe à travers un pore nucléaire ?

A

Par diffusion passive lente

49
Q

A partir de quelle taille, une protéine passe les pores nucléaires uniquement par transport actif ?

A

50kD

50
Q

Quelle taille de protéine typique diffuse passivement à travers les pores nucléaires ?

A

5kD

51
Q

Donner un synonyme à “Daltons” ?

A

Unité de masse atomique

52
Q

Comment est défini un Dalton ?

A

C’est un douzième de la masse d’un atome de carbone 12.

Ce qui correspond approximativement au poids d’un hydrogène, d’un proton ou d’un neutron.

53
Q

Est-ce que le transport actif demande de l’énergie ? Quel avantage présente-t-il ?

A

Oui, contrairement au transport passif. Mais l’avantage est que le transport actif peut aller contre le gradient de concentration.

54
Q

Que signifie l’acronyme NLS ?

A

Nuclear Localization Signal

55
Q

Que signifie l’acronyme NES ?

A

Nuclear Export Signal

56
Q

De quoi a besoin une protéine avec un signal de localisation nucléaire pour franchir un pore ?

A

Un récepteur d’importation nucléaire. (Importine)

57
Q

Est-ce que les récepteurs d’importation nucléaire sont hydrophiles ?

A

Non, ils sont hydrophobes

58
Q

L’antigène T est une protéine qui contient un signal d’importation. Où la trouve-t-on généralement la plus concentrée ? Ou la trouve-t-on la plus concentrée dans le cas où ce signal serait rendu inopérant par une mutation ?

A

Dans le noyau.

Dans le cytoplasme.

59
Q

Que signifie l’acronyme GFP ? (une protéine utilisée en microscopie)

A

Green Fluorecent Protein

60
Q

Certaines protéines ne peuvent pas se fixer directement sur des récepteur d’importation. Comment font-elles donc pour palier à ce problème ?

A

Elles utilisent des adaptateurs d’importation

61
Q

Que signifie l’acronyme (Ran) GAP ?

A

GTPase activating protein

62
Q

Que signifie l’acronyme (Ran) GEF ?

A

Guanine exchange factor

63
Q

Quel est le rôle d’une Ran GAP dans l’import export de protéine entre le noyau et le cytoplasme ?

A

Les Ran GAP interagissent avec des Ran-GTP, ce qui a pour effet d’hydrolyser un groupement phosphate et de détacher le Ran-GTP de l’importin. (Lorsqu’elle revient dans le cytoplasme)

64
Q

Que veut dire hydrolyser ?

A

Rompre une liaison covalente par action d’une molécule d’eau

65
Q

Quel est le rôle du Ran GEF dans l’import export de protéine entre le noyau et le cytoplasme ? (Dans le noyau)

A

Stimule le remplacement du GDP par du GTP sur la molécule Ran.

66
Q

Quel est le rôle du GTP et GDP dans l’import export de protéine entre le noyau et le cytoplasme ?

A

Cela permet de donner de l’énergie au transport actif

67
Q

Est-ce que les NLS sont constitués d’acides aminés acides ou basiques ?

A

Basiques

68
Q

Comment s’appellent les protéines qui peuvent se lier au GTP et GDP ?

A

Protéine Ran, une GTPase.

Une fois liées, elles s’appellent Ran-GTP et Ran-GDP.

69
Q

De quel côté de la membrane nucléaire trouve-t-on du Ran GAP ?

A

Dans le cytoplasme

70
Q

De quel côté de la membrane nucléaire trouve-t-on du Ran GEF ?

A

Dans le noyau

71
Q

Que se passe-t-il une fois l’importine et sa cargaison arrivé dans le noyau ?

A

Une Ran-GTP s’accroche à l’importine, ce qui détache la cargaison. Ensuite, l’importine et la Ran-GTP retournent dans le cytoplasme

72
Q

Qu’est-ce qui stimule l’hydrolyse du GTP en GDP une fois l’importine et la Ran-GTP de retour dans le cytoplasme ?

A

Une Ran GAP

73
Q

Qu’est-ce qui permet aux Ran-GDP de retourner dans le noyau ?

A

Une protéine appelée NTF2

74
Q

Qu’est-ce qui permet au Ran-GDP de remplacer son GDP par un GTP ?

A

Une Ran GEF

75
Q

Comment s’appellent les protéines qui ont pour rôle de faire sortir d’autres protéines du noyau ?

A

Des exportines

76
Q

De quels éléments est composé le complexe qui exporte les protéines hors du noyau ?

A

Une Ran-GTP, une exportine, la cargaison

77
Q

Qu’est-ce qui casse le complexe formé d’une Ran-GTP, une exportine et sa cargaison une fois arrivés dans le cytoplasme ?

A

Une Ran-GAP

78
Q

Quels sont les éléments qui sont attachés à l’exportine lorsqu’elle revient dans le noyau ?

A

Une NTF2 et une Ran-GDP

79
Q

Pourquoi est-ce que les ARN n’utilisent pas le système Ran-GTP pour sortir du noyau ?

A

Car elles sont en concentration plus élevée dans le noyau, c’est donc une augmentation de l’entropie de les faire sortir. (Pas besoin d’énergie)

80
Q

Le syndrome de Swyer est un maladie où un individu de phénotype féminin possède un caryotype avec des chromosomes sexuels XY. Expliquer quelle en est la cause.

A

Le gène SRY est muté, ce qui produit une protéine qui n’a pas de signal de localisation. Cette protéine ne peut donc pas entrer dans le noyau pour exprimer les gènes qui induisent l’expression des gonades en testicules.

81
Q

Quel est l’effet du virus Ebola sur l’import export nucléaire ?

A

Il bloque l’importation nucléaire de la protéine PY-STAT1

82
Q

Quels sont les différents éléments qui sont associés à la membrane nucléaire interne ?

A

Lamina
Protéines
Chromatine

83
Q

Est-ce que toute l’ADN se trouve dans le nucléole ?

A

Non, seulement une partie.

84
Q

Que signifie l’abréviation MNI ?

A

Membrane nucléaire interne

85
Q

Que signifie l’abréviation MNE ?

A

Membrane nucléaire externe

86
Q

Est-ce qu’on trouve de la lamine chez les eucaryotes unicellulaire ? Chez les mammifère ? Chez les végétaux ?

A

Non
Oui
Non

Chez les organismes où il n’y a pas de lamine, il y a généralement une autre protéine équivalente.

87
Q

Est-ce que la lamina fait partie du cytosquelette ?

A

Oui

88
Q

La lamina fait partie du cytosquelette, dans quel catégorie est-il ?

A

Filaments intermédiaires

89
Q

Quels sont les 3 gènes qui codent pour produire la lamina ?

A

LMNA
LMAB1
LMAB2

90
Q

Quelles lamines sont produites à partir du gène LMNA ?

A

A
A delta 10
C
C2

91
Q

Quelles lamines sont produites à partir du gène LMNB1 ?

A

B1

92
Q

Quelles lamines sont produites à partir du gène LMNB2 ?

A

B2-3

93
Q

Qu’est-ce qu’une cytokine ?

A

Une molécule de signalisation cellulaire qui est sécrétée dans l’espace extracellulaire et qui permet de réguler l’activité ou la fonction d’une autre cellule. (Les hormones sont beaucoup plus spécialisées)

94
Q

A partir de quand est-ce que le gène LMNA est exprimé ?

A

Après la gastrulation

95
Q

Quelle est la structure des filaments de lamina ?

A

Deux polymères de lamine sont associés. Ces dimères sont ensuite associés à la queue leu leu pour former des polymères. Ces polymères sont associés côte à côte pour former des filaments.

96
Q

Pourquoi dit-on que la lamina est dynamique ?

A

Lorsque le noyau est dissocié, il y a une phosphorylation de la lima sous l’action de kinases. Lorsqu’il est régénéré, il y a une déphosphorylation sous l’action de phosphatases.

97
Q

Qu’est-ce qu’une kinase ?

A

Une enzyme qui catalyse les réactions de phosphorylation.

98
Q

Est-ce que l’ATP est une kinase ?

A

Non, les kinases sont des protéines

99
Q

Que fait l’ATP dans une réaction de phosphorylation ?

A

Elle cède un groupe phosphate à la protéine qui est phosphorylée.

100
Q

Quelle réaction est une déphosphorylation ?

A

Une réaction d’hydrolyse.

Liaison covalente rompue par action d’une molécule d’eau

101
Q

Qu’est-ce que l’épissage ?

A

Processus qui consiste à supprimer certains segment d’un ARN. (Passage d’un pré-ARNm à un ARNm mature)

102
Q

Qu’est-ce qu’un exon ?

A

C’est un segment d’un précurseur ARN qui est conservé après épissage

103
Q

Comment appel-t-on une maladie causée par des mutation dans les gènes codant pour les lamines ?

A

Une laminopathie

104
Q

La progeria est une maladie génétique qui ressemble à une sénescence programmée. Elle a pour origine la mutation du gène LMNA. Expliquer son impacte au niveau cellulaire.

A

La lamine A est modifiée et devient une progérine qui ne peut pas migrer dans le noyau. Elle reste attachée à la membrane nucléaire, entraînant sa déformation et l’adhésion de la chromatine à la membrane.
La lamine B1 est aussi affectée.

105
Q

Est-ce que le noyau contient beaucoup d’élément différents ? Comment sont-ils appelés ? Ont-ils des membranes ?

A

Oui, le noyau contient un certain nombre de corps nucléaires qui sont dépourvus de membranes. Ce sont des amas des molécules.

106
Q

Quelle est la taille du nucléole ?

A

0.5 à 5um

107
Q

Quels sont les fonctions du nucléole ?

A

Transcription d’ARNr et ARNt

Assemblage de particules ribonucléoprotéiques (Ex : Ribosomes, complexes d’épissage)

108
Q

Quels sont les principaux éléments du nucléoles visibles en microscopie électronique ?

A

Composante fibrillaire dense
Composante granuleuse
Centre fibrillaire

109
Q

Qu’est-ce qui se trouve dans les composantes fibrillaires dense du nucléole ?

A

De l’ADN et de l’ARN transcrite

110
Q

Qu’est-ce qui se trouve dans les composantes granuleuses du nucléole ?

A

Des pré-ribosomes et leur lieu d’assemblage

111
Q

Comment appel-t-on les protéines qui composent les pores nucléaires ?

A

Des nucléoporines

112
Q

Qu’est-ce qui se trouve dans les centres fibrillaires du nucléole

A

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