1. Kolokvij Flashcards

1
Q

Opišite kako su računala postala sveprisutna i prožimajuća

A

Računala su postala sveprisutna i prožimajuća zahvaljujući raznim tehnološkim inovacijama i razvoju same tehnologije uključujući razvoj softverskih aplikacija i samog interneta

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Navedite tri primjera uređaja koje danas smatramo računalima (osim osobnog računala)

A

Mobitel, automobil i hladnjak

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Objasnite što je računarstvo

A

Skup disciplina koje izučavaju procese koji djeluju na podatke i koji se sami mogu prikazati kao podaci u obliku programa.
Grana znanosti koja istražuje kako računala i računalni sustavi funkcioniraju, kako se izrađuju i programiraju te kako se koriste za riješavanje različitih problema.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Navedite dvije discipline računarstva i objasnite čime se bave

A

Teoretske - bave se prirodom informacija, algoritama i matematičkih računa koje provodi neki sustav te njihovim unaprijeđenjem
Praktične - bave se obradom podataka (slika, grafičkih prikaza, zvuka i sl.) koji dolaze do promatrača određenog sustava

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Objasnite zašto kažemo da računarstvo nije (isključivo) znanost o računalima

A

Računarstvo obuhvaća bilo kakve procese koji koriste algoritme za izvođenje računanja (npr. kalkulator, abakus)
Postojalo je prije računala
Uključuje matematiku, inžinjering, komunikaciju i jezik te se koristi i u znanstvenim istraživanjima, medicini umjetnosti i drugim aspektima koja nisu direktno povezani s računalima

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Dajte primjer problema kakav neka disciplina računarstva rješava

A

Grafički prikaz molekula (ili ljudske kože) i njegovo poboljšanje
Poboljšanje i prilagodbe računalnih igara

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Objasnite što je informatika

A

Znanost o obradi i prijenosu podataka i informacija.
Bavi se još i prikupljanjem, skladištenjem, obradom, prijenosom i analizom informacija. Fokusira se na razumijevanje kako se informacije generiraju, obrađuju i koriste kako bi se donosile odluke, rješavale probleme i podržavala učinkovita komunikacija.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Opišite ulogu matične ploče računala

A

Osnovna ploča u računalu koja omogućuje komunikaciju između komponenata računalnog sustava (hardvera i softvera)
Hardver - miš, tipkovnica, monitor (vanjski dijelovi)
Softver - unutrašnji program koji pokreće neku radnju na računalu (pretraživanje na internetu)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Objasnite razliku između osnovnog i grafičkog procesora

A

Osnovni procesor je elektronički krug u računalu koji izvodi instrukcije programa kao što su aritmetika, logika, upravljačke i ulazno-izlazne operacije dok grafički stvara slike u međuspremniku okvira namijenjene za prikaz na zaslonu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Navedite dijelove koje osnovni procesor u računalu može imati

A

Aritmetičko-logičku jedinica
Registri

ove imaju u zadnje vrijeme

Jedinica za operacije s pomičnim zarezom
Nekoliko nivoa priručne memorije
Memorijski kontroler za upravljanje glavnom memorijom i dio ulazno-izlaznih kontrolera
Grafički procesor

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Objasnite razliku između (glavne) memorije i pohrane podataka

A

Glavna memorija je jedina memorija izravno dostupna osnovnom procesoru
U njoj se nalaze programi koje procesor dohvaća i izvršava
Pohrana podataka je memorija koja nije izravno dostupna osnovnom procesoru, ali se može doseći putem ulazno-izlaznih kanala
Programi i podaci iz pohrane podataka prvo idu u glavnu memoriju, a tek se onda koriste

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Navedite dva primjera izvršnog softvera

A

Znanstveni softveri, 3D modeliranje i animacija, pregledavanje weba…

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Objasnite razliku između izvršnog i sustavnog softvera

A

Sustavni softver služi kao platforma za neke izvršne sustave.
Djeluje kao baza za neke izvršne softvere te ne podržava svaki izvršni već samo neke.
Izvršni softver izvodi posebne funkcije koje nisu dio osnovnog rada računala

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Navedite dva primjera sustavnog softvera

A

Manjaro, macOS, Microsoft Windows

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Navedite dvije grane razvoja Unixa i objasnite njihovu razliku

A

AT&T grana - komercijalizira Unix te izdaje nekoliko UNIX Systema od kojih su samo 2 iskorištena, poslovna okruženja

BSD grana - u akademskoj zajednici na Sveučilištu u Berkeleyu na bazi AT&T-evog Unixa nastaje Berkeley Software Distribution (kraće BSD) i širi se na druga sveučilišta, akademska zajednica

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Opišite početak Unixa

A

Ken Thompson i Dennis Ritchie koji su radili u AT&T Bell Labs započinju razvoj operacijskog sustava Multics 1960-tih godina - bio je prekompleksan
Videoigra Space Travel ima problema s performansama na tom OS-u pa razvijaju Unics kao zamjenu za Multics, cilj je da bude bitno jednostavniji pa zbog toga boljih performansi od Multicsa
Unics postaje Unix 1970-tih godina

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Navedite dva komercijalna Unixa i tvrtke koje su ih prodavale (osim AT&T-a)

A

AIX izdaje IBM
IRIX izdaje Silicon graphics (SGI)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Opišite početak BSD-a

A

Operacijski sustav koji nastaje krajem 1970-tih i tijekom 1980-tih godina po uzoru na AT&T-ev Unix, začetnik je Bill Joy koji je studirao na Berkeleyu
BSD brzo postaje popularan na sveučilištima i institutima, zaslužan za popularizaciju Unixa na sveučilištima u SAD-u
Prvo su radili na unaprijeđenju Unixa (modifikacije) pa su na kraju razvili svoj novi operacijski sustav
Bio je i vrlo je važan za razvoj tehnologija na kojima se zasniva internet jer ranih 1980-ih godina DARPA financira razvoj tehnologija interneta u okviru BSD Unixa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Opišite nastanak FreeBSD-a

A

Započinje kada 1989. godine Keith Bostic predlaže zamjenu čitavog preostalog AT&T-evog koda Unixa otvorenim kodom
Do 1991. ostaje šest datoteka za zamjenu
1992. William i Lynne Jolitz pišu zamjene za šest datoteka, a na temelju njihovog rada od 1993. nadalje razvija se FreeBSD

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Objasnite zašto kažemo da je BSD značajan za razvoj interneta

A

Vrlo je važan za razvoj tehnologija na kojima se zasniva internet; ranih 1980-ih godina DARPA financira razvoj tehnologija interneta u okviru BSD Unixa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Navedite dva proizvoda koji se temelje na FreeBSD-u

A

Netflix i playstation 3, playstation 4

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Objasnite zašto Apple macOS specifično vežemo uz BSD i općenito uz Unix

A

Određeni djelovi FreeBSD-a nalaze se u jezgri macOS
neznam??
Jezgra koja pokreće macOS izgrađena je na otvorenom kodu i ima korijene u BDS operativnom sustsavu. Također sadrži mnoge alate koji su standardni za Unix i podržava Unix specifične sustave.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Objasnite što je slobodni softver

A

Softver koji možete prilagođavati svojim potrebama i dijeliti prilagođene (promijenjene) verzije

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Navedite dva primjera slobodnog softvera (osim GNU-a)

A

BSD i Windows

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Opišite kako je Richard Stallman pokrenuo GNU i FSF
Prvo je sam modificirao softver starog printera na MIT kako bi mogao koristiti novom i javljati kada se papir zaglavi pošto je bio na katu ispod njegovog ureda 1983. osniva GNU, neovisni slobodni softver koji nema veze s Unixom 1985. osniva FSF, Free Software Foundation kako bi financiro razvoj slobodnog softwera
24
Navedite četiri slobode kojima Richard Stallman definira slobodni softver
1. Sloboda pokretanja programa kako želite, u bilo koje svrhe 2. Sloboda proučavanja rada i prilagodba programa kako bi vršio računalne aktivnosti koje želite 3. Sloboda distribucije kopijâ kako biste pomogli bližnjemu 4. Sloboda distribucije izmijenjenih inačica programa čime vaše izmjene koriste cijeloj zajednici
25
Objasnite pojam copylefta i navedite ime najpoznatije copyleft licence
Copyleft je općenita metoda za oslobođenje programa koja zahtijeva da sve izmijenjene i proširene inačice programa budu isto tako slobodne. Osigurava da softver bude slobodan Najpoznatija je GPL licenca
26
Opišite početak Linuxa
Linux je operativni sustav otvorenog koda koji je započeo kao operativni sustav Linusa Torvaldsa. Linus Torvalds je bio student računalnih znanosti na Sveučilištu u Helsinkiju. Kao student, imao je priliku raditi s Minixom, malim Unix-sličnim operativnim sustavom koji je služio kao obrazovni alat. Torvalds je smatrao da Minix ima određena ograničenja i htio je stvoriti vlastiti operativni sustav koji bi bio fleksibilniji i omogućio bolju podršku za hardver. 1991. godine, Torvalds je objavio poruku u kojoj je najavio početak razvoja svog operativnog sustava. Jezgra Linuxa je bila ključni dio operativnog sustava koji upravlja hardverskim resursima. Torvalds je od početka odlučio raditi na otvoren način, omogućavajući drugim programerima da sudjeluju u razvoju. To je privuklo zajednicu programera koji su doprinosili kodu, ispravljali greške i dodavali nove značajke. Torvalds ipak nije razvio čitav operacijski sustav, već "samo" njegovu jezgru.
27
Objasnite značaj GNU/Linuxa
Kombinacija jezgre Linuxa i GNU korisničke okoline koji zajedno tvore cjelovit operacijski sustav
28
Opišite pojam distribucije Linuxa
Uključuje sve komponente koje su potrebne da bi korisnik mogao koristiti operacijski sustav softver i hardver
29
Navedite dvije distribucije Linuxa i njihovu ciljanu skupinu korisnika
Ubuntu - namijenjena krajnim korisnicima Fedora - namijenjena poslovnim korisnicima Arch Linux - namijenjena igračima računalnih igara na Linuxu
30
Opišite ulogu upravitelja paketa
u svijetu Windowsa: korisnik sam nabavlja softver negdje na internetu i instalira ga u svijetu operacijskih sustava sličnim Unixu: svaki distributer pakira softver za svoju distribuciju u takozvane pakete, a korisnik zatraži instalaciju softvera koji želi, sve ostalo rješava upravitelj paketima. Upravitelj paketa je softverski alat koji olakšava instalaciju, ažuriranje, uklanjanje i upravljanje softverskim paketima na računalnom sustavu. Paketi su zapakirane verzije softvera koje uključuju resurse potrebne za ispravno funkcioniranje aplikacije
31
Objasnite čemu služe GNOME i KDE
Oni su korisnička sučelja. Imaju web preglednik, mail klijent, klijent za trenutačno poručavanje, tekst editor, kalkulator, audio svirač, preglednik slika, preglednik videa... Prvo je nastao KDE - Matthias Ettrich želi napraviti grafičko sučelje dovoljno atraktivno da ga njegova cura želi koristititi. GNOME je grafičko sučelje nastalo kao alternativa KDE. GNOME aplikacije više se fokusiraju na jednostavnost i lakoću korištenja, dok KDE nudi naprednije značajke i funkcionalnosti
31
Objasnite razliku programa otvorenog koda i besplatnog programa
Program otvorenog koda ima izvorni kod koji je dostupan svakome tko ga želi izmjeniti i poboljšati, a besplatni program je samo besplatan za preuzimanje i korištenje, ali njegov kod se ne može mijenjati
32
Navedite dva projekta velikih kompanija koja su postali slobodni softveri.
Netscape: Mozilla Red Hat: Fedora
33
Opišite kako je Netscape pokrenuo projekt Mozilla
U ožujku 1998. Netscape je objavio izvorni kod Communicatora na mozilla.org, a plan razvoja Mozille počinje u listopadu iste godine. Godinu dana od objavljivanja koda, Netscape je prodan AOL-u (America Online). 2002. nastaje Mozilla 1.0, a sljedeće godine se u plan razvoja Mozille uključuju Firefox i Thunderbird. 2004. nastaje Firefox 1.0, a 2005. ima 100 milijuna preuzimanja.
34
Opišite kako je StarOffice postao OpenOffice.org
StarOffice je početkom 1990-ih bio komercijalni uredski paket koji je razvila tvrtka StarDivision. 1999. godine druga tvrtka je kupila StarDivision i odlučila je otvoriti izvorni kod StarOffice-a. Otvoreni izvorni kod verzija StarOffice-a dobila je ime "OpenOffice.org. OpenOffice.org je postao popularan kao alternativa komercijalnim uredskim paketima poput Microsoft Office-a.
35
Opišite probleme zatvorenih formata i objasnite kako ih OpenDocument rješava
Ako su informacije objavljene unutar zatvorenog formata, to može uzrokovati značajne prepreke u korištenju tih informacija, te natjerati pojedince koji žele koristiti te podatke da kupe potrebni softver. Primjenom OpenDocument-a nije važno kakva računala obje strane rabe, niti koji softver upotrebljavaju, jer obje mogu bez poteškoća razmjenjivati dokumente. Također, primjenom ovog standarda osigurava se dugovječnost arhiviranih dokumenata, znači primjenom ovog otvorenog standarda bit će moguće čitati arhivirane datoteke i nakon dugog niza godina.
36
Objasnite što je znanstveni softver
Znanstveni softver je vrsta izvršnog softvera koja se razvija kako bi riješila probleme u raznim granama znanosti
37
Navedite dva primjera znanstvenog softvera
GEOS-5 – za simulaciju klime Zemlje GROMACS – simulacija molekularne dinamike
38
Objasnite pojam paralelizacije izvođenja
Paralelizacija omogućuje da se više radnji, operacija ili proračuna izvodi istovremeno. Radnje, operacije ili proračuni moraju biti takvi da je paralelizacija moguća.  Paralelizacija se može izvesti na tri razine: 1) procesi 2) procesne niti  3) koprogrami, vlakna ili zelene niti  Tri zakona govore o mogućnosti kraćenja vremena izvođenja korištenjem paralelizacije: 1) Littleov zakon 2) Amdahlov zakon 3) Gustafsonov zakon.
39
Objasnite koju ulogu na superračunalima ima MPI i na kojem dijelu Bure se koristi
MPI (Message passing interface) omogućuje paralelizaciju aplikacija zasnovanu na razmjeni poruka. Procesi komuniciraju putem cijevi te nema dijeljene memorije. Koristi se na Cluster dijelu Bure. To je primjer distribuiranog sustava sastavljenog od više računala povezanih mrežom.
39
Objasnite što tvrdi Amdahlov zakon
Amdahlov zakon je formula koja daje teoretsko ubrzanje latencije (vremensko kašnjenje između uzroka i posljedice neke fizičke promjene u promatranom sustavu) izvršenja zadatka pri fiksnom opterećenju koje se  može očekivati ​​od sustava čiji su resursi poboljšani. Često se koristi u paralelnom računanju za predviđanje teorijskog ubrzanja pri korištenju više procesora. Ako povećamo broj procesora doći će do ograničenja ubrzanja zbog onog dijela programa koji se ne može paralizirati.
39
Objasnite što tvrdi Gustafsonov zakon
Gustafsonov zakon je suprotnost Amdahlovom zakonu u kontekstu paralelnog računarstva. Formulirao ga je John Gustafson 1988. godine kako bi istaknuo da, umjesto da se fokusira na ograničenja serijskih dijelova programa kao što to čini Amdahlov zakon, trebali bismo razmišljati o povećanju efikasnosti paralelnog izvođenja. Gustafsonov zakon tvrdi da povećanjem broja procesora, a ne ograničavajući serijske dijelove, možemo rješavati veće probleme u istom vremenskom okviru. Ne fokusira se na smanjenje vremena izvođenja već povećanja veličine problema koji moramo riješiti.
40
Opišite način mjerenja performansi superračunala i ulogu liste TOP500 superračunala
Performanse superračunala mjere se u broju operacija s pomičnim zarezom po sekundi. TOP500 održava top listu 500 najjačih superračunala na svijetu.
40
Objasnite što je heterogeno kod heterogenog računarstva
Heterogeno računalo ima dva dijela: domaćin – osnovni procesor i uređaj – grafički procesor. Osnvoni procesor je dobar za serijsku obradu, a grafički procesor je dobar za masivnu paralelnu obradu podataka. Heterogeni sustav kombinira oba.
40
Objasnite koje računalo je superračunalo i gdje možemo takva računala pronaći
Superračunalo je računalo koje ima visoke performanse u odnosu na uobičajeno osobno računalo. Takve se performanse najčešće postižu povezivanjem velikog broja odvojenih računala donekle sličnih osobnim računalima korištenjem brze komunikacijske mreže. Pronalazimo ih u podatkovnim centrima. Gustim pakiranjem istih osnovnih komponenata koje nalazimo u suvremenim osobnim računalima dobivamo sklopovsku opremu za računala koja se koriste u podatkovnim centrima. Takav i slični poslužitelji se zatim stavljaju u ormare. Slaganjem više ormara u jednoj ili više prostorija zajedno s umrežavanjem, uređajima za pohranu podataka, napajanjem, hlađenjem, rezervnim baterijama i drugom opremom dobivamo podatkovni centar.
40
Objasnite zašto kažemo da razvoj osobnih računala pomaže razvoju superračunala
Osobna računala su zadnjih 20--30 godina izrazito brzo napredovala u performansama, dijelom zahvaljujući igračima računalnih igara koji žele igrati fotorealistične igre doma na računalu i na konzoli. Gustim pakiranjem istih osnovnih komponenata koje nalazimo u suvremenim osobnim računalima dobivamo sklopovsku opremu za računala koja se koriste u podatkovnim centrima -superračunala.
41
Navedite dvije države koje dominiraju TOP500 superračunala
SAD i Kina
42
Navedite resurse koje možemo zakupiti kod kupovanja računalnih resursa u oblaku
računalne (osnovni i grafički procesori s pripadnom memorijom) skladišne (tvrdi diskovi, pogoni čvrstog stanja i drugi mediji te pripadni kontroleri) mrežne (mrežni adapteri, komunikacijski mediji i prijenosnici)
43
Navedite tri pružatelja usluga računarstva u oblaku
Amazon AWS Microsoft Azure Google Cloud
44
Objasnite što je intelektualno vlasništvo
To je vlasništvo nad neopipljivim intelektualnim stvarima Pravno priznato pravo koje se odnosi na kreativne i intelektualne radove. Ovo pravo omogućuje autorima i vlasnicima da kontroliraju upotrebu, distribuciju i reprodukciju svojih stvaralačkih djela
45
Navedite dvije vrste prava koje intelektualno vlasništvo poznaje
Postoje dvije vrste: industrijsko vlasništvo (patent, zaštitni znak) i autorsko pravo
46
Objasnite način funkcioniranja autorskog prava na softver
Svaki napisan softver automatski je vlasništvo autora i autor ga može licencirati drugima pod uvjetima kojima želi. Znači da drugi ljudi ne mogu mijenjati ništa. Ali, autor se može odreći vlasništva i staviti softver u javnu domenu. To znači da je tada softver dostupan svim ljudima i nije ničije vlasništvo
47
Objasnite zašto se koristi akademsko licenciranje kod vlasničkog (znanstvenog) softvera
Vlasnički softveri razvijeni za komercijalne svrhe često imaju nižu cijenu za akademsku upotrebu. Razlog tome može biti poticanje razvoja znanosti, omogućavanje korištenja tog softvera studentima ili možda promoviranje softvera kako bi se koristio na realnim problemima i da bi se omogućilo njegovo poboljšanje Kod vlasničkog softvera razvijenog u akademskom okruženju često se sreće shema licenciranja koja definira različite uvjete korištenja u neprofitne (npr. akademska istraživanja) i profitne svrhe (npr. primjena u istraživanja u korporacijama).
48
Opišite licencu vlasničkog (znanstvenog) softvera po želji
VMD-ova licenca (Visual Molecular Dynamics): softver je intelektualno vlasništvo sveučilišta Illinois i njemu ostaju sva prava. Korisnik licence mora ugovorom prihvatiti ograničenu, neprenosivu licencu za korištenje softvera samo u akademske i istraživačke svrhe, npr. ne smije se koristiti za komercijalne potrebe.
49
Opišite licencu slobodnog (znanstvenog) softvera po želji
Licenca Open-Source PyMOL-a: softver je autorsko pravo tvrtke Schrodinger LCC. Korisnici imaju dozvolu za slobodnu upotrebu, distribuciju i modifikaciju softvera pod uvjetom da se poštuju određeni uvjeti. Korisnik mora osigurati da se autorsko pravo pojavljuje u svim kopijama softvera i ne smije se koristiti ime Schrodinger LCC u reklamaciji softvera bez odobrenja te tvrtke.
50
Objasnite način funkcioniranja softverskog patenta
Patent je oblik intelektualnog vlasništa koji vlasniku daje zakonsko pravo da ostalima zabrani stvaranje, korištenje, prodaju i uvoz izuma u zamjenu za javnu objavu izuma. Znači softverski patent bi vlasniku softvera davao pravo da ostalima zabrani korištenje, stvaranje i prodaju tog softvera
51
Objasnite način funkcioniranja zaštitnog znaka softvera
Zaštitni znak je prepoznatljiv znak, dizajn ili izraz koji razlikuje neki proizvod od ostalih. U zajednici slobodnog softvera otvorenog koda postoji nepisano pravilo da se postojeća imena softvera ne dupliciraju, bila registrirana kao zaštitni znak ili ne. Npr. Mozillin web preglednik, je bio nazvan Firebird i postao je Firefox kako bi se razlikovao od sustava za upravljanje bazom podataka Firebird
52
Navedite dvije licence koje se koriste za podatke i navedite za koje podatke se koriste
Open Publication Licence -  javna licenca za autorska prava za dokumente, znači za sadržaj a ne za softver Creative Commons – licenca koja omogućuje besplatnu distribuciju djela koje je inače zaštićeno autorskim pravima
53
Navedite osnovno specifičnost autorskog prava kod znanstvenih radova
Autorsko pravo nad znanstvenim radom štiti autora od neovlaštenog korištenja, krađe, mijenjanja i javnog objavljivanja njegovog rada. Samo on može odlučivati što želi sa svojim radom i to pravo mu omogućuje da on bude priznat kao tvorac tog rada, a ne netko drugi
54
Objasnite temeljnu razliku po pitanju autorskog prava kod znanstvenih radova u otvorenom pristupu u odnosu na uobičajeni pristup objavljivanju
Kod objavljivanja se autorska prava prenose na izdavača, a kod radova u otvorenom pristupu nema prebacivanja autorskih prava na izdavača
55
Navedite dva izdavača koji svoja izdanja temelje na otvorenom pristupu
MDPI – molecular diversity preservation international i PLOS – public library of science
56
Opišite situaciju u kojoj se našao Aaron Swartz nakon preuzimanja radova na MIT-u
Aaron Swartz je 2011. godine iskoristio svoj pristup radovima na MIT-u da sistematski preuzme velik broj radova s ciljem da ih učini dostupnim javnosti zbog čega je bio uhićen od strane MIT-eve policije i optužen od strane Federalne vlade SAD-a. 2013. godine je počinio samoubojstvo, ali je ostao jedna od značajnih ličnosti u borbi za otvoreni pristup znanstvenim radovima.
57
Navedite tri varijante otvorenog pristupa
Zlatni (pravi otvoreni pristup), zeleni (pravo na vlastito arhiviranje), hibridni (dio radova u otvorenom pristupu, dio ne)
58
Objasnite značaj Sci-Huba
Sci-Hub je web stranica knjižnice u sjeni (prikriveni su da bi mogli pristupit radovima) koja pruža besplatan pristup milijunima istraživačkih radova , bez obzira na autorska prava, zaobilazeći paywall izdavača na razne načine. Sci-Hub je 2011. u Kazahstanu osnovala Alexandra Elbakyan, kao odgovor na visoke cijene istraživačkih radova iza paywalla. Osim svoje intenzivne upotrebe, Sci-Hub se ističe među ostalim bibliotekama u sjeni zbog svoje jednostavne upotrebe i pouzdanosti i zbog goleme veličine svoje kolekcije: studija iz 2021. procjenjuje da Sci-Hub omogućuje pristup do 95% svih znanstvenih publikacija s izdanim DOI brojevima
59
Opišite situaciju u kojoj se nalazi Alexandra Elbakayan povodom Elsevierove tužbe
Okružni sud u New Yorku presudio je da Sci-Hub krši američki zakon o autorskim pravima. Sud je presudio u korist akademskog izdavača Elsevier, koji je podnio tužbu protiv te stranice zbog nezakonitog pristupa i distribucije njegovih radova zaštićenih autorskim pravima. Okružni sud u New Yorku dodijelio je Elsevieru odštetu od 15 milijuna američkih dolara, ali pošto Alexandra ne živi, niti ima imovine u SAD-u vlada nema neki način da naplati tu kaznu
60
Opišite značenje pojma model u kolokvijalnom, fizikualnom i konceptualnom značenju
Model u kolokvijalnom značenju je osoba kojoj je modeliranje posao, djevojke u modnoj industriji – ugl atraktivna osoba. U fizici se koristi za opisivanje pojednostavljene reprezentacije stvarnosti ili nekog fizičkog sustava. Fizički model može biti matematički ili konkretni objekt koji se koristi kako bismo bolje razumjeli ili predviđali ponašanje stvarnog sustava. Na primjer, u meteorologiji, korišteni su numerički modeli kako bi se predvidjelo buduće vrijeme. Ti modeli koriste matematičke jednadžbe i podatke o trenutnim uvjetima kako bi stvorili prognoze. Pojam konceptualni model odnosi se na svaki model koji je formiran nakon procesa konceptualizacije ili generalizacije. Model se koristi kako bi se opisala pojednostavljena reprezentacija nečega kompleksnijeg. To može uključivati ​​apstraktne koncepte, teorije ili strukture koje pomažu u razumijevanju ili analizi nekog složenog sustava.
61
Objasnite pojam skale u fizici
U fizici, pojam "skala" se odnosi na omjer između stvarne veličine objekta ili pojava i njenog prikaza ili modela. Skala se koristi kako bi se olakšalo proučavanje i razumijevanje pojava koje se događaju na različitim razinama veličine, bilo da se radi o mikroskopskim strukturama na atomskoj razini ili o ogromnim astronomskim objektima u svemiru
62
Navedite koji se modeli i metode koriste na milimetarskoj i mikrometarskoj skali
milimetri: modeli kontinuuma i metoda konačnih elemenata (diferencijalne jednadžbe) mikrometri: grubozrnato modeliranje (simulacija ponašanja složenih sustava korištenjem njihove grube (pojednostavljene) reprezentacije) i disipativna dinamika čestica (kretanje čestica)
63
Opišite čime se bavi molekularno modeliranje
Molekularno modeliranje je skup teorijskih i računskih metoda za oponašanje molekula. To je grana znanosti koja se bavi proučavanjem strukture, svojstava i ponašanja molekula, kao i njihovih međudjelovanja. Ova disciplina koristi računalne tehnike i matematičke modele kako bi simulirala i analizirala ponašanje molekula na razini atoma i veza među njima
64
Opišite čime se bavi kemoinformatika
Kemoinformatika je interdisciplinarno područje znanosti koje se bavi razvojem metoda i softvera za rješavanje kemijskih problema. Kombinacijaje fizikalne kemije i računalne znanosti. Stvara baze kemijskih podataka i definira kemijske formate datoteka
65
Opišite čime se bavi molekularna mehanika
Molekularna mehanika koristi klasičnu mehaniku za modeliranje molekularnih sustava. Pretpostavlja se da je Born - Oppenheimerova aproksimacija važeća i potencijalna energija svih sustava izračunava se kao funkcija nuklearnih koordinata pomoću polja sila Koristi Newtnove zakone
66
Opišite čime se bavi kvantna kemija
Primjenjuje kvantnu mehaniku za modeliranje kemijskih sustava (npr. atomi, molekule, kemijske reakcije). Izračunava elektronsku strukturu rješavanjem Schrodingerove jednadžbe
67
Objasnite za što je dodijeljena Nobelova nagrada za kemiju 1998. godine
Nobelova nagrada za kemiju 1998. godine dodijeljena je za otkriće i razvoj katalitičkih funkcija enzima. Nagrada je podijeljena između tri znanstvenika: 1. John B. Fenn: zajedno s kolegama razvio je tehniku zvanu elektrosprej ionizacija (ESI). Ova tehnika omogućuje pretvaranje molekula u ionski oblik kako bi se mogli analizirati masenom spektrometrijom. Fennova inovacija bila je ključna za razvoj moderne analize proteina i drugih bioloških makromolekula. 2. Koichi Tanaka: također je radio na razvoju metoda za analizu proteina. Tanaka je razvio tehniku poznatu kao laserska desorpcijska/ionizacijska spektrometrija (LD/IMS). Ova tehnika omogućuje analizu velikih biomolekula kao što su proteini. 3. Kurt Wüthrich: razvio je nuklearnu magnetsku rezonancu u otopini (NMR) za određivanje trodimenzionalne strukture biomolekula u otopini. Ova tehnika je ključna za razumijevanje kako proteini i druge molekule funkcioniraju na molekularnoj razini. Ova trojica znanstvenika su kroz svoje inovacije u analizi proteina i biomolekula značajno doprinijeli razumijevanju strukture i funkcije bioloških molekula.
68
Objasnite za što je dodijeljena Nobelova nagrada za kemiju 2013. godine
Nobelova nagrada za kemiju 2013. godine dodijeljena je za razvoj teorija i metoda računalne kemije. Nagrada je podijeljena između trojice znanstvenika: 1. Martin Karplus: doprinio je razvoju kvantno-kemijskih računalnih modela. Karplus je bio pionir u razvoju metoda koje omogućuju simuliranje kemijskih reakcija na računalu. 2. Michael Levitt: također je radio na razvoju računalnih metoda za modeliranje bioloških makromolekula, poput proteina i nukleinskih kiselina. Levitt je posebno poznat po radu na razvoju programa za predviđanje strukture proteina. 3. Arieh Warshel: surađivao je s Levittom na razvoju računalnih metoda za proučavanje bioloških sistema. Warshel je specijaliziran za razvoj metoda kvantno-mehaničke simulacije, koje omogućuju proučavanje reakcija na atomskoj razini. Njihov rad u području računalne kemije imao je značajan utjecaj na način na koji kemičari i biokemičari pristupaju proučavanju kemijskih reakcija i struktura. Razvoj kvantno-kemijskih modela i računalnih simulacija omogućio je detaljnije razumijevanje kemijskih procesa na molekularnoj razini
69
Navedite dva softvera u području računalne kemije
ABINIT - besplatni Gaussian – komercijalni
70
Opišite čime se bavi bioinformatika
Bioinformatika je interdisciplinarno područje znanosti koje se bavi razvojem metoda i softvera za razumijevanje bioloških podataka. Razvoj softverskih alata za razumijevanje bioloških podataka, koji su često veliki i kompleksni
71
Navedite dva softvera u području bioinformatike
NCBI Blast - program za usporedbu informacija o primarnim biološkim sekvencama, kao što su sekvence aminokiselina proteina ili nukleotidi sekvenci DNA EMBOSS - omogućuje znanstvenicima da analiziraju genomske i proteinske podatke