1 Flashcards

0
Q

Transposons chez les eucaryotes?

A

SE déplacent sous forme d’ADN Avec ou sans réplication.

Codent pour la transposase.

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1
Q

Retrotransposons?

A

Transposons eucaryotes se déplaçant par l’intermédiaire d’ARN, rétro-transcrit en suite en ADN double brin. Codent pour la transcriptase inverse.

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2
Q

Famille multigenique?

A

Ensemble de gènes identiques ou très semblables.

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3
Q

Cause de l’évolution du génome?

3 types?

A

Échec des mécanismes de réplication, recombinaison et réparation.

  • mutations intra-géniques
  • duplications
  • réarrangements.
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4
Q

Causes de la duplication de segments chromosomiques?

A
  • crossing-over inégaux
  • éléments transposables causant des crossing-over sur des chromatides non sœurs
  • patinage de l’ADN-polymerase sur une séquence du brin de la matrice, => relecture 2x ou plus
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5
Q

Gènes homologues, paralogues, orthologues?

A

Genes homologues: qui ont une séquence très similaire due à une origine commune
Orthologues: homologues ds la même espèce
Paralogues: homologues dans espèces différentes

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6
Q

Évolutions du génome par duplication d’exons?

Exemple?

A

Génèrent des gènes qui codent pour des protéines aux domaines répétitifs.
Ex.: immunoglobuline

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7
Q

Variation de l’énergie interne lors d’une réaction dans un calorimètre?

A

= (Qchim)v/n

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8
Q

Rôle des éléments transposables dans l’évolution du génome?

A

Facilitent les recombinaisons, ce sont des éléments mutagènes, déplacent des segments du génome.

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9
Q

Cellules totipotentes?

A

Cellules somatiques adultes pouvant se dédifférencier pour donner naissance à des cellules spécialisées de l’organisme adulte

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10
Q

Cellule-souche?

A

Cellule peu spécialisée (indifférenciée) avec capacité d’auto renouvellement et de se différencier.

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11
Q

Loi de faraday?

A

La quantité de produit formé ou de réactif consommé par un courant électrique est stœchiométriquement équivalente à la quantité d’électrons fournis.

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12
Q

Relation entre ΔG° et E°pile?

A

ΔG° = -n.F.E°pile

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13
Q

Constante d’équilibre d’une pile?

A

=e^((n.F.E°pile)/(R.T))

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14
Q

Équation de Nernst?

A

Epile = E°pile - ((R.T)/(n.F)).lnQ

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15
Q

Mécanisme de régulation de l’expression génique lors de l’initiation de la traduction?

A

Fixation deroteines au niveau des séquences UTR de l’ARNm.
Sur 5’ UTR: empêche l’ARNm de se fixer,
Sur 3’ UTR: empêche les interactions entre coiffe et queue poly-A

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16
Q

siRNA?

A

= small interfering RNA.
Générés àpd de longs ARN db de différentes sources. Forment un complexe Risc ou un brin est dégradé. Plus spécifiques que miRNA car conçus pour dégrader des ARN spécifiques.

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17
Q

miRNA?

A

Vient des introns et exons de l’ARN prémessager, dans des séquences formant des épingles à cheveux.
Rôle d’inhibiteur de gènes différents de ceux dont ils dérivent.
Précurseurs = pri-miRNA
-> clivés en pré-miRNA
-> clivés en miRNA
-> association avec protéines
-> dissociation de l’un des brins.

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18
Q

Terminaison de la transcription chez les eucaryotes?

A

Signal de polyadénilation

-> coupure et polyadénilation du pré-ARNm après 10 a 30 nucléarises et libération du fragment d’ARN.

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19
Q

Modes d’action des inhibiteurs?

A
  • compétition pour la liaison a l’ADN
  • masquage de la surface d’activation
  • interaction directe avec les facteurs de transcription
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20
Q

Priorités pour de développement de la santé?

A
  • changer notre paradigme de solutions simples et efficaces.
  • favorise un développement homogène
  • favoriser les interventions systémiques, à Long terme.
  • interventions centrées sur les besoins et attentes des bénéficiaires et prestataires
  • interventions favorisant l’éthique
21
Q

Dégradation par ubiquitination?

A

Ajout de molécules d’ubiquitine par des enzymes du cytosol a la protéine à dégrader
-> séquestration par les proteasomes et dégradation en peptides de 7-8 a.a.

22
Q

Désavantage des approches partielles?

A

Effets déstabilisateurs sur la santé des individus et systèmes de santé.

  • inégalités
  • activités orientées selon les budgets dispo
  • fuite des cerveaux
  • cours d’organisation
  • contrecarre l’approche sectorielle
  • concurrence entre programmes
  • affaiblit le ministère de la santé
23
Q

Terminaison de la traduction?

A
2 facteurs de terminaison: eRF1/eRF3.
Lecture du codon d'arrêt, -> liaison d'eRF3 en A et recrutement d'eRF1 -> induction d'une molécule d'h2o plutôt qu'un a.a.
Hydrolyse de GTP par eRF3
-> relâchement des RF 
-> autre hydrolyse, dissociation du tout
24
Q

ARNr 5s?

A

Synthétisé par ARN polymerase III
Ne subit aucune maturation, protégé contée la dégradation par sa structure secondaire.
S’associe aur ARNr 28s et 5.8s pour former les grosses sous-unités des ribosomes.

25
Q

Découverte des éléments transposables eucaryote?

A

Barbara McClintock en 1940

26
Q

Transduction localisée?

A

Par phages tempérés.
Excision anormale du prophage,
Entraîne un fragment de chromosome bactérien adjacent au site d’intégration.

27
Q

Energie d’un photon?

A
E = h.f
h = constante de planck
F= fréquence
28
Q

Théorie chromosomique de l’hérédité? Date?

A

En 1902

  • gènes organises linéairement le long de chromosomes
  • répartition aléatoire des chromosomes lors de la méiose -> répartition des allèles dans chaque gamète.
29
Q

Acétyl-CoA?

Équation?

A

Pyruvate + NAD+ + CoA -> CO2 + Acetyl-CoA + H+ + NADH

stockage d’énergie + production d’ATP

30
Q

Nitrile?

A

-CΞN

31
Q

Plasmide recombinant?

A

Plasmide avec ADN ajouté artificiellement.

32
Q

Melting temperature?

Facteurs ?

A

=tm
=T° a laquelle la moitié es molécules d’ADN sont sb (dénaturées).
Fonction de la composition nucleotidique, de la taille des fragments, du milieu.

33
Q

Graphique logarithmique?

A

Graphique dans lequel on remplace x et y par logx et logy

34
Q

Étapes des l’ajout d’un fragment d’ADN dans un plasmide?

A
  • clivage de l’ADN par enzymes de restriction
  • ajout de l’ADN clivé et association par appariement des bases
  • réunion des brins par ligases
35
Q

ARN interférence? 2 types?

A

Inhibition et l’expression génique par petits ARN.

siRNA + miRNA

36
Q

Régulation de l’expression déni que par la structure de la chromatine chez les eucaryotes?

A
  • acetylation des histones:
    Augmente l’accessibilité de l’ADN
  • methylation des CpG:
    Condensation en heterochromatine
37
Q

Méthode d’équilibrage d’oxyde red en milieu acide ou basique?

A
  • calcul de l’état d’oxydation et équilibrage stœchiométrique des atomes qui changent d’e.o.
  • faire les demi réactions d’oxydation et réduction
  • équilibrage des charges avec H+ et OH-
  • multiplier les demi réactions pour avoir un même nombre d’électrons de chaque côté
  • faire la somme des 2 demi réactions
38
Q

Îlots CpG?

A

Regroupements de dinucleotides CpG

Présents dans les régions promotrices et régulatrices.

39
Q

E°pile?

A

= E°oxydant - E°réducteur

40
Q

Facteurs généraux de transcription?

A

Permettent le recrutement d’ARN polymerase II + complexe d’initiation de la transcription.
Peu efficaces.

41
Q

Facteurs de transcription spécifiques?

A

=protéines régulatrices.

Activés par signaux extra cellulaires, contrôlent la transcription en se fixant sur les protéines régulatrices.

42
Q

Séquences régulatrices enhancer?

A

Lient un facteur de transcription activateur spécifique.
-> transcription de haut niveau.
Situées à distance du gène ou dans les introns.
Fonctionnement indépendant de la position et de l’orientation.
Possibilité d’en avoir plusieurs par gène.

43
Q

Facteurs activateurs de la transcription?

A

Facilitent l’assemblage de complexes d’initiation de la traduction.

44
Q

Séquences silencer?

A

Lient des facteurs de transcription inhibiteurs spécifiques.
Indépendantes du type cellulaire, situées à distance ou dans un intron.
En général 1 seule par gene, fonctionnement indépendant du sens et orientation

45
Q

Opérateur? (Dans operon)

A

Situé dans le promoteur, exerce un contrôle négatif par la liaison de répresseurs qui bloquent le passage de l’ADN polymerase.

46
Q

Initiation de la traduction chez les eucaryotes?

A
  • Fixation d’ARNt d’initiation au site P
  • recrutement d’ARNm par la coiffe
  • défilement de l’ARN dans le sens 5’ -> 3’ jusqu’au codon initiateur
  • fixation de la grosse sous-unité
  • initiation
47
Q

Condensines?

A

Grosses complexes multiprotéiques impliqués dans le compactage final des chromosomes métaphysiques.
Formés de protéines dîme roques -> SMC

48
Q

Initiation de la traduction chez les bactéries?

A

ARNt d’initiation: N-formyl-methionine.

  • liaison de l’ARNt et ARNm a la petite sous-unité
  • appariement d’ARNr 16S avec AUG
  • fixation de la grosse sous unité
  • initiation
49
Q

ADN glycosilase?

A

Enzyme de réparation de l’ADN.

Catalyse l’hydrolyse de liaison entre le desoxyribose et la base endommagée.

50
Q

Production et maturation de l’ARNt?

A
Synthétisé par ARN polymerase III, promoteur interne.
Maturation:
- clivage en 5' et 3'
- ajout d'extensions CCA
- excision de l'intron
- modification de 10% des nucleotides
51
Q

ADN polymerase III?

A

Allonge l’amorce d’ARN dans le sens 5’->3’