מעגל האוריאה Flashcards
מהו השלב קובע המהירות במעגל האוריאה
קרבומיל פוספט סינטתז 1 שמחבר אמין שמקורו בגלוטמין/גלוטמט לפוספט ליצירת קרבומיל פוספט
מה מבצע האנזים AST
(אספרטט אמינו טרנספראז)
מזרז את העברת האמין ממולקולת גלוטמט לאוקסלואצטט ליצירת אספרטט
מי המולקולות שתורמות את החנקנים שיומרו בסוף למולקלת האוריאה?
קרבומיל פוספט ואספרטט (שהומר מגלוטמט)
היכן מתבצע מעגל האוריאה
במיטוכונדריה של תאי כבד
מיהו האנזים היחידי שיכול להשתמש גם ב NAD וגם ב NADP כמקבל אלקטרונים סופי?
גלוטמט דה הידרוגנאז
גלוטמט- גם וגם
מהי הפעילות של האנזים גלוטמט דה הידרוגנאז
מבצע דה אמינציה אוקסידטיבית. אפשר להתייחס לזה כאל מנגנון משלים של הטרנסאמינציות שבסופו מקבלים אמין/אמוניום חופשיים.
למה מתייחס המושג טרנס דהאמינציה
התהליך הכולל של אמינוטראנספראזות+גלוטמט דה הידרוגנז
איפה מתרחש מעגל האוריאה?
בהפטוציטים (חלקית במיטוכונדריה וחלקית בציטוזול)
מהי הפעילות של האנזים גלוטמינאז
הופך גלוטמין לגלוטמט על ידי הסרת האמין
איזה אנזים מסיר חנקן מגלוטמט ליצירת אלפא קטו גלוטראט?
גלוטמאט דה הידרוגנאז
כיצד גלוטמט נכנסת מהציטוזול בתאי הכבד למיטוכונדריה
שאטל מלאט אספרטט
איך גלוטמין נכנסת למיטוכונדריה מהציטוזול בתאי הכבד
יש לה טרנספורטר מיוחד
מה קורה לחנקן האמידי שמוסר מגלוטמין על ידי האנזים גלוטמינאז במיטוכונדריה של תאי כבד?
הוא משתחרר בתור אמוניום
אילו שני מסלולים אפשריים יש לגלוטמט במיטוכונדריה של תאי כבד?
- גלוטמט פוגשת את האנזים AST שלוקח את הקבוצה האמינית מגלוטמט ומעביר אותה לאוקסלואצטט ליצירת החומצה האמינית אספרטט (אוקסלואצטט נמצאת בריכוז גבוה ואספרטט יוצאת דרך שאטל מלאט אספרטט ולכן זו הריאקציה המועדפת)
- גלוטמט יכול לפגוש גם את האנזים גלוטמט דה הידרוגנאז- ולעבור דה הידרוגנציה (חמצון) ליצירת אמוניום חופשי וa קטו גלוטרט שיכול לשמש למעגל קרבס.
היכן ניתן למצוא את האנזים AST
גם במיטוכונדריה וגם בציטוזול של הפטוציטים
וגם בתאי שריר לב ושריר מחוספס
קבוצת אמין שיצאה מגלוטמט בתאי כבד יכולה להימצא ב2 מצבים
- להתחבר לאוקסלואצטט ליצירת אספרטט
2. אמוניום חופשי (יכול להגיע גם מגלוטמין)
מיהו האנזים הראשון שהאמוניה החופשית פוגשת בתאי כבד, מהי פעילותו והאם הוא משתמש באנרגיה
האנזים הוא קרבומיל פוספט סינטתאז 1 שמשתמש ב:
2 מולקולות של ATP
מולקולת ביקרבונט
ודוחס אותן יחד עם האמוניה ליצירת—- קרבומיל פוספט
איזה קשר יש במולקולה קרבומיל פוספט ומה מקור הפחמן שנמצא בה ומה מקור החנקן שנמצא בה
קשר בין פחמן לפוספט שנקרא פוספוקרבואנהידרידי.
הפחמן מקורו בביקרבונט שמקורו בפחמן דו חמצני שנוצר במעגל קרבס ומפירובט דה הידרוגנאז.
החנקן מקורו באמוניום החופשי
האם המולקולה קרבומיל פוספט טעונה חיובית?
לא!
בגלל שיש לנו קשר אמידי הוא יוצר רזוננס והוא לא רוצה לקבל על עצמו מטען חיובי שיהרוס את הרזוננס ויהפוך לפחות יציב
מהם שלושת השימושים האפשריים לATP בתגובות ביוכימיות?
- זרחון
2 יצירת קשר שדורש אנרגיה - שינוי מבנה מרחבי
למה משמשות כל אחת משתי מולקולות הATP שהאנזים קרבומיל פוספט סינטתאז 1 משתמש בהן? מה נפלט בתגובה זו?
- מולקולת ATP אחת משמשת לאנרגיה ליצירת הקשר האנרגטי בין הפחמן לחנקן
- זרחון הקרבומיל ליצירת קרבומיל פוספט
- התוצרים הם שתי מולקולות של
ADP
ורק פוספט אחד
מיהו מקבל האלקטרונים שבו משתמש גלוטמט דה הידרוגנאז
גם NAD וגם NADP
*היחיד שמשתמש בשניהם!!
איזו ריאקציה מבצעות הרקמות כדי לייצר גלוטמין שיישלח בהמשך לכבד ומי האנזים האחראי על ריאקציה זו?
מה מטרת ריאקציה זו?
האנזים הוא גלוטמין סינטתאז שמבצע שני שלבים על ידי שני אתרים שונים
שלו:
- בשלב הראשון משתמשים ב
ATP
ומזרחנים זמנית את הפחמן הקרבוקסילי של שייר ה
R
של גלוטמט (בשביל שפעול של הקבוצה הקרבוקסילית)
- חיבור של חנקן (אמוניום) ליצירת קשר אמידי תוך שחרור הפוספט שהוסף בשלב 1. שבירת הקשר האנהידרידי מאפשרת את חיבור החנקן
* מטרת הריאקציה היא להיפטר מאמוניום חופשי שהוא רעיל
תיאור הריאקציה של גלוטמט דה הידרוגנאז על גלוטמט?
- בשלב הראשון יהיה חמצון של פחמן אלפא של גלוטמט
- יווצר מצב ביניים של קשר כפול בין הפחמן לחנקן- מבנה לא כל כך יציב
- בשלב השני האנזים יזרז כניסת מולקולת מים ויציאת האמין ויווצר אלפא קטו גלוטראט (פחמן אלפא הוא עכשיו קטון)
כמה תתי יחידות יש לאנזים גלוטמט דה הידרוגנאז והאם הן זהות או שונות
6 תתי יחידות זהות
אילו אלוסטרנטים פועלים על גלוטמט דה הידרוגנאז (2)
- ADP - מודלטור חיובי
- GTP - מודולטור
שלילי
*** לא התגלה היגיון לא להתייחס כסמני אנרגיה גבוה /נמוכה
במצבים נורמליים, איזו חומצה אמינית תהיה בריכוז גבוה יותר בדם מאדר חומצות אמיניות אחרות?
גלוטמין (כיוון שהיא משמשת כגרסא לא רעילה של אמוניה שמובלת בזרם הדם)
איזה אנזים מצוי בכל האורגניזמים ותמיד בעל תפקיד חשוב במטבוליזם של חנקן?
גלוטמין סינטתאז
*במיקרואורגניזמים משמש כנקודת מעבר באסימליציה של חנקן
היכן (באילו רקמות) נמצא את האנזים גלוטמינאז
במיטוכונדריה של תאי כבד
האם יש יצירת אוריאה בכליה, הפרשת אמוניה חופשית בשתן או זרימת אמוניה חופשית בדם בבני אדם?
כן אבל בכמויות זניחות!!
אמוניה תופרש ישירות לדם למשל מהכליה ומהמעי ותגיע ישירות לכבד ולא למוח
מה יקרה במצב של עודף אמוניה בדם?
אמוניה חוצה BBB ולכן תגרום לפגיעה מוחית שיכולה להוביל לקומה
אילו שני אנזימים נמצאים במוח בעודף במטרה למנוע עליה בריכוז האמוניה?
- גלוטמין סינטאז שלוקח אמוניה ודוחס אותה לגלוטמט ליצירת גלוטמין
2 גלוטמט דה הידרוגנאז שיבצע פעולה הפוכה מהפעולה המוכרת לנו בכבד ויחזר אלפא קטו גלוטרט ליצירת גלוטמט
פעילות ביתר של גלוטמין סינטתאז במוח תגרום ל - (2)
- עליה בייצור גלוטמין שמשמש כאוסמוליט פעיל באסטרוציטים של מערכת העצבים המרכזית מה שיגרום להתנפחותם ולקומה
- ירידה בגלוטמט שמשמש כפרקורסור לGABA שהינו נוירוטרנסמיטר איהיביטורי במוח
שיטה לזכור את מעגל האוריאה + אילו שלבים נעשים במיטוכונדריה ואילו שלבים נעשים בציטוזול
Orange colored cats always ask for awesome umbrella
- אורניטין וקרבומיל פוספט הופכות לציטרולין (על ידי האנזים אורניטין טרנס קרבמוליאז)
- ציטרולין יוצאת לציטוזול פוגשת את אספרטט והופכת לארגנינוסוקסינט על ידי האנזים ארגנינוסוקסינאט
סיתטאז ודרך שלב ביניים בו
Amp
קשור לציטרולין - ארגנינוסוקסינאז מפרק את ארגנינוסוקסינאז לפומראט וארגנין (פומראט תומר למלאט ותכנס למיטוכונדריה שם תמשיך למעגל קרבס)
- ארגניאז יזרז הידרוליזה של ארגנין בשייר
הR
ליצירת אוריאה ואורניטין (אורניטין ייכנס למיטוכונדריה לעוד מעגל)
איזה שלב ממעגל האוריאה מתרחש במיטוכונדריה?
השלב שמבצע אורניטין טרנס קרבומילאז
אמוניה שמייצרים חיידקים במעי ונספגת לדם תגיע חכבד דרך …
הוריד הפורטלי. (במצבי חולי אמוניה זו תקבל משמעות יותר גדולה)
מאיזו חומצה אמינית מייצרים אורניטין
גלוטמט
התפקיד של אורניטין במעגל האוריאה מזכיר את התפקיד של
אוקסלואצטט במעגל קרבס (מקבלת קבוצה שנוצרה מראש- קרבומיל פוספט ומעבירה אותה הלאה)
כיצד ציטרולין יוצאת מהמיטוכונדריה לאחר הייצור שלה?
בטרנספורטר שמוציא ציטרולין ומכניס אורניטין
מהן שני שלבי הריאקציה המבוצעים על ידי ארגנינוסוקסינאט סינטתאז?
- פירוק
ATP-Amp
כאשר תוצר הביניים הוא ציטרולין שנקשר ל
AMP - שימוש בחומצה אמינית אספרטט (שנוצרה בשלב המקדים) וחיבורה לציטרולין דרך החנקן האמיני שלה במקום ה
AMP
שמשתחרר.
התוצר המתקבל- ארגנינוסוקסינאט
מהי הריאקציה שמזרז האנזים ארגינז ?
הידרוליזה של ארגנין בשייר הR ליצירת אוריאה ואורניטין (האורניטין ייכנס שוב למיטוכונדריה למחזור נוסף)
האם במעגל האוריאה מתקיים העיקרון של
Substrate chanelling
כן
מה ההבדל המרכזי בין ציטרולין לארגנין
לארגנין יש קבוצה אמינית נוספת (סהכ 3) יותר מציטרולין
איפה נוצרת האוריאה
בציטוזול של ההפטוציטים
מהיכן מגיעים הפחמנים של האוריאה (2 פחמנים)
- קרבומיל פוספט -
הגיעו לפני כן מביקרבונט או מאמוניה חופשית
אמוניה חופשית מקורה או בגלוטמט על ידי גלוטמט דה הידרוגנז או בגלוטמין. - חא אספרטט-
שמקורה מקבוצה אמינית שהגיעה מגלוטמט והצטרפה לאוקסלואצטט על ידי אספרטט אמינו טרנספראז
AST
מהו שלב הביניים בריאקציה שמבצע ארגנינוסוקסינט סינתטאז
Citrullyl-amp
מהו שלב הביניים בריאקציה המזורזת על ידי קרבומיל פוספט 1
יצירת קרבוניק-פוספט אסיד אנהידריד - מביקרבונט ו
ATP
ולאחר מכן יצירת קרבמאט (הסרת הפוספט וחיבור חנקן)
בסוף יתחבר פוספט נוסף על ידי שימוש ב
ATP
נוסף
מיהם האנזימים GPT ו GOT
ולמה משמשת מדידה שלהם בדם?
GPT=ALT
GOT=AST
רמתם עולה בדם כשיש נזק רקמתי.
בהתקף לב שניהם נשפכים לסרום יחד עם עוד אנזימים וחלבונים רבים וחלבונים רבים
רמתם של איזו אנזימים תעלה לאחר התקף לב
AST
ALT
LDH
CK
האם מלאט יודעת להכנס למיטוכונדריה?
כן
האם פומראז יודעת להכנס למיטוכונדריה מהציטוזול?
לא! קודם הופכת למלאט על ידי פומראז ציטוזולי
האם מעגל הקרבס ומעגל האוריאה יכולים לעבוד באופן בלתי תלוי אחד בשני
כן
באילו טרנספורטרים תלוי הקישור בין מעגל קרבס למעגל האוריאה (3)
- מלאט אלפאקטוגלוטראט טרנספורטר
- אספרטט גלוטמט טרנספורטר
- גלוטמט-
OH
טרנספורטר
מהו תהליך ה
Malate argininosucinate shunt
יציאת אספרטט שנוצרה במיטוכונדריה אל הציטוזול דרך הטרנספורטר לטובת המשך ריאקציות של מעגל האוריאה
3 תפקידים של שאטל מלאט אספרטט
- ניצול מיטוכונדרילי של פקטורים מחזרים שנוצרו בציטוזול -
תיאור התהליך:
NADH
שנוצר בציטוזול בתהליכים שונים מחזר אוקסלואצטט למלאט בציטוזול, המלאט נכנס למיטוכונדריה דרך מלאט אלפאקטוגלוטרט ( צד אחד של שאטל מלאט אספרטט) ושם הופך חזרה לאוקסלואצטט תוך יצירת
NADH
כחלק ממעגל קרבס. בהמשך האוקסלואצטט הופך לאספרטט ויוצא דרך הטרנספורטר אספרטט גלוטמט (צד שני של שאטל מלאט אספרטט)
- גלוקונאוגנזה- שם יעבוד לכיוון ההפוך
- הוצאת אספרטט החוצה כדי לשמש בשלב הציטוזולי של מעגל האוריאה וכניסת מלאט פנימה כדי לייצר אוקסלואצטט בקרבס שהיא הסובסטרט לייצור אספרטט (תהליך שמגביר את עצמו)
- פומראט בציטוזול הופכת למלאט בתהליך דה הידרציה ומלאט תכנס פנימה תוך יציאת אלפאקטוגלוטרט שתשמש בציטוזול כמקבלת קבוצות אמינו מפעילותן של כל הטרנסאמינזות בציטוזול.
כמה מולקולות ATP נדרשות למעגל האוריאה
3 מולקולות ATP
4 קשרי פוספט
- קרבומואיל פוספט סינטתאז השתמש בשתי מולקולות
- ארגנינוסוקסינט סינטתאז השתמש באחת נוספת שהפכה ל
Amp
כמה שווה כל NADH שנוצר במיטוכונדריה?
2.5
ATP