מיקרוביולוגיה Flashcards
המיקרואורגניזמים מקוטלגים לפי אינטראקציה זו עם בני אדם בשתי קבוצות עיקריות
- קומונסליים (או ספרופיטיים)= אלה מיקרואורגניזמים שלא בהכרח גורמים למחלות
- פטוגניים
קומנסלים
מיקרואורגניזמים שבד”כ חיים בגוף האדם הבריא או על פני השטח שלו מבלי שיגרמו נזק או מחלה כל שיהא. (פלורה רגילה)
פטוגניים
מיקרואורגניזמים שגורמים נזק למאכסן (האדם) באחת משתי הדרכים-1. פלישה ונזק ישיר
2. ע”י רעלים
באיזה צורה מיקרואורגניזם עלול לעשות נזק לגוף?
*כוכבית של ראול
- ע”י פקטור פנימי בתוך החיידק -אם הוא מייצר רעלן
2. המצב הבריאותי של החולה- מערכת חיסונית בריאה או מערכת חיסונית מדוכאת.
מבנה התא החיידקי
אין להם גרעין, יש להם מעטפת מיוחדת שבתועה צף כרומוזום שהוא בצורה עגולה ומכופפת.
שרשרת אחת של DNA שאין לה התחלה ואין לה סוף. בתוך הציטופלסמה יש נוקלואיד. הפלסמה היא ממברנה העשויה מ2 שכבות פוספט-ליפיד. ומבחוץ יש מעטפת שנקראת דופן התא או cell wall.
מאפיינים נוספים של מבנה תא החיידק
לחיידק יש צורה מוגדרת וברורה.
דופן התא- מגן על התא מקרינה וכל גורם אחר. והוא עשוי מחומר הנקרא פפטידו-גליקן (מולקולה מרב סוכרים וחלבונים)
שרשרת הרב סוכרים משמשת כלבני בניה. אשר עוטפת את הממברנה הרגילה. (יש הרבה שרשראות) בין השרשראות יש שורה של 4 חומצות אמינו אשר קשורות לסוכרים בקשר קוולנטי
דופן התא- cell wall
קיר רגידי קשיח המגן על התא ומקנה לו צורה קבועה.
כדי לפרק חיידק יש צורך בחומר שיפרק את דופן התא.
צביעת גראם gram stain
התהליך:
- צביעה ראשונית בצבע סגול
- קיבוע- ע”י תמיסת יוד
- דקולריזציה- שטיפה עם אציטון
- צביעה נגדית- צבע ורוד.
צביעת גראם- מה קורה לגראם חיובי ולגראם שלילי
- חיובי ושלילי נצבעים בסגול
- שניהם עדיין סגולים.
- חיובי- הצבע נשאר ברובו. שלילי- הצבע נמחק לגמרי בגלל הדופן הדקה.
- הגראם השלילי נצבע בורוד. והגרם החיובי עדיין סגול.
* החומר הניגודי בגלל שאינו נשטף נותן רקע ובעזרתו אפשר להתמקד עם מיקרסקופ אלקטרוני.
נרתיק- Capsula
עשוי מפולזאכרידים המופרשים ע”י החיידק.
תפקיד- עמידות בתוך המקרופאגים= פולשנות
מקנה אלימות.
הקפסולה לא מופיעה בצביעת גראם.
צובעים אותם או בדיו או בכסף ומצלמים כתמונת נגטיב.
המקרופאגים נושאים אותם ממקום למקום.
דוג’: klebsiella, haemophilus, pneumococcus.
שוטון Flagellum
אברון נוסף שיש לחיידקים (לא לכולם)
מבנה חלבוני סיבי ארוך, שתפקידו להסתובב במהירות ומקנה תנועה. השוטון מקבל אנרגיה מתוך התא.
שעריות Pili= Fimbriate
תפקידי השעריות:
1. הצמדות- המאפשרת התמקמות, המבנים החלבוניים אשר מתאימים באופן מושלם לתאי הגוף שלנו.
2. העברת חומר גנטי- sexpili-בהזדווגות הם מעבירים חומר גנטי.
בנוסף מעבירים מידע בין החיידקים אשר עוזר להם להמשיך להתקיים.
האינפורמציה נמצאת בתוך טבעות דנ”א קטנות הנמצאות בתוך הציטופלסמה של החיידק.
Spores=נבגים
שרידים של חיידקים שיכולים לשרוד לאורך זמן בתנאים לא טובים.
קיימים רק 2 משפחות של גראם חיובי היודעים לעשות ספרולציה.
הציטופלסמה נעלמת ונשאר רק נבג.
עמידים בטמפ’ גבוהות (מתים רק ב 121 מעלות)
ספרולציה
יצירת נבגים
משפחות הגראם היודעות לעשות ספרולציה
Clostridium
bacillus
גורמים ליצירת נבגים
- כליה של חומרים חיוניים בסביבת גידול
2. עליה של חומרי פסולת המופרשים ע”י החיידק עצמו בסביבת הגידול.
נקדים (cocci)
נקדים גראם חיוביים- staphylococcus-בצורת אשכול streptococcus- בצורת שרשרת נקדים גראם שליליים- diplococcus- צמד נקדים (קיים גם בחיובי) כוכבית של ראול- אין בטבע נקד בודד הם מסתובבים מינימום בזוגות.
מתגים- (rods, bacillus)
נראים כמו מתג של חשמלי ולכן נקראים כך.
נראים כמו מקלונים.
זמן דור
זמן חלוקה הקבוע אצל כל חיידק כאשר נמצא בתנאים אופטימליים.
דור=התחלקות ל 2) N=2^n (n= כמה חלוקות
גורמים המשפיעים על צמיחת חיידקים
(תנאים אוסמולרים (ריכוז מלח רמת PH לחות טמפרטורה חמצן
טמפרטורה
termophiles- אוהבי חום
mesophilmes- טמפ’ ביניים
psychrophiles- אוהבי קור
אל אווירניים מוחלטים
חיידקים אשר יש להם אינפורמציה בדנ”א לתסיסה (מסוגלים להפוך סוכר לאנרגיה)
מתים במגע עם חמצן.
אוורניים (אארוביים
כמו בני האדם- חייבים חמצן.
אל אווירניים פקולטטיביים
חיידקים אשר יכולים לחיות גם עם חמצן וגם יכולים לשרוד בלעדיו כי יש להם אינפורמציה לתסיסה= הפיכת סוכר לאנרגיה.
מתן שמות לחיידקים
שם החיידק יופיע בספרות בכתב נטוי ושם המשפחה יתחיל באות גדולה.
ת.ז. של החיידק תציין באותיות גדולות אם יש קפסולה, ממברנה וזנב. ואת מספר החיידק.
קונטמינציה
זיהום שנוצר בזמן לקיחת הדגימה ואין להתייחס לדגימה.
קולוניציה
התיישבות
אינפקציה
זיהום חיידקי.
אבחון ראשוני- משטח ישיר
משטח גראם ישירות מהדגימה
לא עושים לכל הדגימות משטח גראם כי צריך לפחות 10,000 חיידקים פעילים למיליליטר של דגימה.
CFU -Colony Foming Units
כמה מושבות צמחו.
האם עושים משטח ישיר לזיהוי זיהום בדם
לא!!!!
תרבית
בידוד חיידקים.
מינימום 18 שעות
זיהוי חיידקים ע”י פנוטיפ
לחיידק יש פנוטיפ שנוצר ע”י החלבונים שלו.
עושים לחיידק בדיקה ביוכימית ומגלים עם איזה חומר הוא ממשיך לצמוח
(לילה נוסף של דגירה)
אנטיביוגרמה antimicrobial resistance testing
בדיקה למציאת סוג האנטיביוטיקה שהחיידק רגיש אליי
מטרתה- 1. לתקן את הטיפול במידה והוא לא צלח
2. כדי לצבור מידע כדי לתת טיפולים אמפיריים
MIC- minimal inhibitory concentration
הריכוז המנימאלי המעכב.
הריכוז המינימאלי של אנטיביוטיקה שצריך על מנת לעכב את צמיחת החיידק
disk diffusion test
שיטה לבדיקת עמידות החיידק לאנטיביוטיקה
התהליך: לוקחים את החיידק ושמים אותו בצלוחית ומורחים אותו. ומעליו שמים דיסקיות המכילות אנטיביוטיקה בריכוז מסוים.
לפי מרחק הגדילה של החיידק מהדיסקיות אפשר לדעת
mic מהו ה.
(הקוטר מצביע על כמות האנטיביוטיקה)
Etest
שיטה נוספת לבדיקת אנטיביוגרמה.
זהו פס נייר מיוחד שיש עליו ריכוזים של אנטיביוטיקה ומניחים אותו בתוך הצלחת ורואים עד איזה נקודה החיידק מתרבה.
*יותר מדויקת מבדיקת הדיסק
פטריות
חד תאיות= שמרים
רב תאיות= עובשים ופטריות כובע.(תמיד נמצאות במושבות)
רק 10-15 סוגים שהם פטוגנים שכיחים.
השמרים תמיד נצבעים כגראם חיובי.
שמרים Yeasts
מתרבים בחלוקה פשוטה budding= הנצה הכי שכיח- Candida albicans candida sp- כל הקנדידות cryptococcus neoformans- שמר שיש לו תפקיד חשוב (במדוכאי חיסון כמו חולי איידס)
עובשים moulds
מתרבים באמצעות ספורות (conidia
עם נבגים שחלקם מתחילים להתפזר
ישנה התמיינות של תאים. תאים פטרייתיים שכל תא שלו מחובר ע”י היפי. מההיפי יש צמיחה, נוצר משהו דמוי פרח, מן איבר שמצמיח נבגים. לאחר מכן זה יכול לעוף ושם תהיה שוב פעם צמיחה.
• CONIDIA
לכל משפחה של עובשים ישנה קונידיה שמאפיינת אותו. ע”פ הצורה ניתן לזהות פטריות.
כמו טרמיל עם חלוקה שבכל “תא” ישנו נבג.
מחלות פטרייתיות
Mycoses
פטרת חיצונית superficial mycoses
קולוניזציה חיצונית, לא פולשנית, יורד בשטיפה עם מים וסבון
-מעל העור, יורדת בשטפיה עם מים וסבון, נוצרת עקב חוסר היגיינה ( אפילו קנדידה לבנה יכולה להופיע על פני העור).
Dermatomycoses :
תוקפים רק את ה
- epidermis
או רקמות המכילות
keratin ( שיער וציפורניים). הגורמים: בערך 30 סוגים של עובשים ושמרים תחת שם כולל של
Dermatophytes
רוב המקרים של פטרת בבני אדם ( כ-95%).
כוכבית למבחן: גם שמרים גורמים ל-DERMATOMYCOSIS.(=Tinea)
אבחון מעבדתי של פטריות
- דגימות רקמה: tissue scrapings, שערות, ציפורניים, נוזלים ורקמות
- בדיקה מיקרוסקופית ישירה: נראו או לא נראו Hyphae
- תרביות של אותן הדגימות: תוצאה בין יום לשלושה שבועות!
- זיהוי: על פי קונידיות, MALDI-TOF
- מבחני רגישות: Etest
הדיווח: נראו או לא נראו היפי*
פרזיטים = טפילים
אנו משתמשים במונח זה, לכל יצור חי שגורם למחלה מדבקת, שהוא לא חיידק, פטריה או נגיף.
Protozoa
– כמו אבמות חד תאיים, מאוד פרימיטיביים ,.
Platyhelmints
תולעים שטוחות
• Nematodes
תולעים עגולות
• Arthropods (סוג של חרקים
לדוג’- “פרוק רגליים” – אלו סוגים של חרקים שונים, כמו: כינים, פרעושים וכ’ו.
אבחון מעבדתי:
איבחון מעבדתי במקרוסקופ – ע”פ מדריך מיוחד של טפילים. למשל בדיקות צואה לגילוי תולעים. חיפוש אחר הביצים שלהם (הנבגים). דרך הביצים ניתן להבחין בין הטפילים, לכל כאחד צורה אחרת של ביצים. בנוסף לבדיקות צואה, יש טפילים בדם (מלריה), בשתן ועוד.
Tape test” for Enterobius (Oxiurus) vermicularis
זהו סוג התולעים השכיח ביותר באוכלוסיה, בעיקר אצל ילדים בגיל הגן. ניתן למצוא אותם בפירות, ירקות, ובמים.
התולעים עגולות בערך 1-2 מ”מ, מתרבים במעי של הילדים
הבדיקה: לוקחים 3 שפדלים ופסי זכוכית ומחברים אותם יחדיו ועל הזכוכית מדביקים סלוטיפ הפוך. במשך שלושה לילות כל לילה
Viruses = נגיפים
הנגיפים נוצרים עם מינימום על מנת לחיות
DNA או RNA
מסביב מבנה חלבוני שעוטף את החומר הגנטי, הוא מקנה לו יכולת הישרדות ומתכונות המאפשרות לו לחדור לייצורים אחרים.המטרה לחדור לתאים בכדי לשרוד
העטיפה החלבונית נקראת קפסיד
יש נגיפים שבמהלך האבולוציה נעשו יותר מתוחכמים פתחו envelope מעטפת חיצונית יותר הנקראת
rna כאשר לנגיף יש
יש שלב אחד נוסף, זה מצב הפוך מהרגיל, היחידי בטבע
DNA יוצר את ה RNA
מיון וירוסים
RNA או DNA 1)
2) יש מעטפת או שאין
ולכן 4 סוגים.
הנגיפים המתוחכמים ביותר הם אלו עם ה-דנ”א עם המעטפת, שנותת להם הגנה וחדירות יותר טובה לתא המטרה. לדוגמא הנגיפים ממשפחת ההרפס.
?למה הנגיף הורג את התא בוא הוא חי
הנגיפים המשוכללים אכן יכולים גם להיכנס לתא מבלי להרוג אותו וגם לצאת ולהרוג תאים אחרים, יתרה מכך יש נגיפים משוכללים אף יותר המדביקים תאים
אבחון מעבדתי של נגיפים
1) תרביות רקמה: תרבות הנגיף מדגימת החולה בתאים אוקריוטים
2) אימונופלואורסנציה : גילוי אנטיגנים של הנגיף בדגימת תאים מהחולה בעזרת נוגנים הקשורים לחומר פלואורסצנטי (זורח).
3) אבחון סרולוגי: מציאת נוגדנים בנסיוב החולה ( אגלוטינציה (=הצמתה), אימונופלואורסנציה בלתי-ישירה, ELISA)
4) שיטות מלוקולאריות- מציאת נוגדנים בנסיוב החולה.
מציאת רצף גנטי ספציפי של הנגיף בדגימת החולה.
לדוג- PCR- אשר נותנת תוצאה מהירה ביותר*
איגלוטינציה= הצמתה
בשיטה הנקראת אגלוטינציה פסיבית, ניתן לקשור בשיטות כימיות אנטיגנים על פני תאי דם אדומים או חלקיקים סינתטיים כדי להדגים את הנוכחות של נוגדנים ייחודיים לאנטיגנים אלה.
זו שיטה חצי כמותית.
Titer כייל הנוגדנים או
כמה בערך נוגדנים יש, הכוונה למיהול האחרון, זהו מספר המכנה הגדול ביותר (כמו בתמונה 160).
אימונופלואורסנציה בלתי - ישירה
Indirect Immunofluorescence
זוהי שיטה שבה בעצם נוגדן נדבק לנוגדן של החולה אשר נמצא בנסיוב.
ELISA – Enzyme Linked Immuno-sorbent Assay
זוהי גם דוגמא לשיטה ה”סנדוויץ’”. שיטה שמגלה האם ישנם נוגדנים= שיטה סרולוגית. מגלה האם יש אנזים הקשורים לנוגדנים. יש בה חיסרון, מפני שעד שמגלים האם ישנם נוגדנים לפעמים זה מאוחר מידי ( נוגדנים נוצרים שבוע- שבועיים לאחר החשיפה לנגיף).
זוהי שיטה ספציפית, רגישה וכמותית