מושגים Flashcards
מהו שיווי משקל הרדי ויינברג ?
כאשר תדירות האללים וגם תדירות הגנוטיפים נשמרים בש”מ
מהי פליאוטרופיה?
השפעה של גן אחד על מספר פנוטיפים
דומיננטיות חלקית
ההטרוזיגוטים מקבלים מופע ביניים
יחסים גנוטיפים= יחסים פנוטיפיים 1:2:1
מבחינה מולקולרית- עותק אחד מתפקד אך לא בצורה מלאה
אללים מרובים
באוכלוסיה יש הרבה אללים שונים ולא רק Aa
באורגניזם דיפלואידי יהיו 2 אללים מתוך כל סוגי האללים באוכלוסייה.
קודומיננטיות
במצב הטרוזיגוט- שני האללים באים לידי ביטוי בפנוטיפ
לדוג’ סוג דם
אללים לטליים
יחסים 2:1 במקום 3:1 בצאצאי הטרוזיגוטים
לא ניתן להגיע לקו טהור באלל מסוים (בדרך כלל לטליות רצסיבית בהומוזיגוט)
האללים aa מתים
פליאוטרופיה- גם שרידות וגם תכונה
מתי תוכל להיות לטליות דומיננטית ?
כאשר הלטליות מגיעה בגיל מאוחר כמו במחלת ההאנטינטון
מהו אפיסטזיס?
מצב שבו הביטוי הפנוטיפי של גנוטיפים בלוקוס אחד מושפע מגנוטיפ בלוקוס אחר.
סימנים:
הופעת פנוטיפ חדש בהכלאה בין קוים טהורים .
פחות קבוצות בF2
הקבוצות הן “סכומים” של קבוצות פנוטיפיות קלאסיות
גנים משלימים
מ= מסלול/מנגנון
צריך אחד אחד תקין לפחות מכל גן כדי ליצור את תרכובת ג
יחסי 9:7
מתי עושים מבחני אלליות?
כשרוצים לראות אם המוטציה החדשה נמצאת באותו אלל של המוטציה הישנה , או שמדובר במוטציה בגן שונה ?
איך עושים מבחן אלליות?
מכליאים הומוזיגוט רצסיבי עם המוטציה החדשה עם הומוזיגוט רצסיבי עם המוטציה הישנה
אם יש קומפלימנטציה - מדובר במוטציה בגנים שונים
אפיסטאזיס רצסיבי
מיסוך- אם יש aa אז לא משנה מה B וC הם לא מתבטאים
9:3:4
אפיסטזיס דומיננטי
מיסוך- אם יש A אחד לפחות- שאר הגנים לא מתבטאים
1:3:12
גנים כפולים
פעמיים אותו גן או גן דומה
מספיק אלל אחד דומיננטי כדי שתכונה תתבטא מתוך 4 אללים
1:15
מהם תכונות החיידקים ? פרוקריוטים
- כרומוזום מעגלי פשוט שאינו כלוא בגרעין
- מונופלואידים- בעלי עותק אחד של הגנום (תמיד במצב הפלואידי)
- אין מיוזה
- כדי שתקרה רקומבינציה, דרוש מצב זמני של דיפלואידיות, לפחות חלקית.
מהם חיידקים פרוטוטרופים ?
חיידקים שמסוגלים לחיות ולהתרבות על מצע מינימלי
?מהם חיידקים אוקסוטרופים
חיידקים שצריכים תוספת מסוימת למצע שלהם כדי להתרבות למשל : HIS-
מהי קוניוגציה ?
חיבור בין 2 תאים שבמהלכו מועבר חומר גנטי מהתורם למקבל.
פקטור F ?
פקטור F - היחידה הגנטית שמקנה לחיידק יכולת להיות תורם.
F+ : חיידקים שמכילים את פקטור F (תורמים-דונור)
F- : חיידקים שאינם מכילים את F (מקבלים)
F הוא פלסמיד !! (יכול להתרבות באופן עצמאי בחיידק)
כיצד מתבצעת העברת פקטור F ?
F מקודד לסינתזה של פילוס (PILUS) - חוט שיוצר מגע פיזי עם התא המקבל ומושך אותו אליו. נוצר גשר שהוא למעשה חור ודרכו עובר גדיל אחד של F . הגדיל השני נוצר ע”י הכפלה גם בתורם וגם במקבל.
תוצאה : F- הופך לF+ והתורם לא מאבד את התכונה שלו לתרום !!
מי שנותן אהבה מקבל אהבה בחזרה
מהו חיידק hfr?
חיידק בו הפלסמיד F נכנס לתוך הגנום ע”י שחלוף (רקומבינציה) וכעת יש כרומוזום מעגלי אחד גדול שמכיל גם את הגנום וגם את הםלסמיד.
קוניוגציה בין חיידק hfr לF- ?
הF סוחב איתו חלק מהכרומוזום החיידקי. יש שבירה אקראית שקוטעת את התהליך לפני מעבר כל הכרומוזום, ולכן בדרך כלל המקבל לא יהפוך לתורם (פקטור F לא יועבר).
במצב של קוניוגציה יש דיפלואידיות חלקית בחיידק המקבל .
מהו מריזיגוט ??
מצב של דיפלואידיות חלקית כמו בקוניוגציה בין חיידק Hfr לחיידק F-
המקטע החוץ כרומוזומלי אינו יכול לעבור הכפלה ולכן יאבד אלא אם כן תתרחש רקומבינציה כפולה בינו לבין הכרומוזום החיידקי.
מיפוי באמצעות זיווגים מקוטעים
כאשר יש מעבר מחיידק hfr לחיידק F- :
קוטעים את התהליך בזמנים שונים.
חיידק HFR תורם יהיה רגיש לאנטיביוטיקה ולכן במצע נשאר רק עם חיידק מקבל .
ORIGIN- אמצע מקטע F : הנקודה ממנה מתחיל המעבר
לכן רק לאחר שעתיים במקרים נדירים כל מקטע F יעבור
מהו פלסמיד F’?
פלסמיד מכיל חלק מהכרומוזום החיידקי כאשר יוצר בצורה לא תקינה מכרומוזום מעגלי בhfr.
F’ שיעבור לחיידק F- יגרום למצב של דיפלואידיות חלקית בחלק מהגנים על הכרומוזום.
מהו מבחן AMES?
מבחן שבודק את המטוגניות (תדירות המוטציות הנוצרות) בחומר מסוים
נעשה בחיידקים
מספר המושבות הפרוטוטרופיות שגדלות לאחר חשיפה לחומר הנבדק מעיד על מספר המוטציות המחזירות.
מוטציה מחזירה ?
מתקנת מוטציה מקורית ע”י מוטציה נוספת באותו הגן
חומר גנוטוקסי ?
חומר מוטגני= שגורם למוטציות
פרגמנט כרומוזומלי
רסיסי דנ”א
מונוזום
חסר עותק אחד של כרומוזום מסוים
אם יש גן נוסף בין גנים ידועים המרחק הגנטי יגדל/ יקטן או לא ישתנה ?
יגדל !
מהו צימוד?
כאשר האללים הדומיננטים מעדיפים ללכת יחד והרציסיבים מעדיפים ללכת יחד
מהי דחייה ?
כאשר השילוב הנפוץ הוא דומיננטי עם רצסיבי
מהי תאחיזה מלאה ?
כאשר אין טיפוסים רקומביננטיים כלל והצאצאים הם רק טיפוסי ההורים.
תאחיזה מלאה - מרחק גנטי 0
הכלאה רציפרוקלית
הכלאה שבה הופכים בין זכר לנקבה
הכלאת מבחן
הכלאה עם קו טהור רצסיבי בדרך כלל
הכלאה מונוהיברידית
הכלאה שמטפלת בתכונה אחת בלבד
אלל
אחד מהטיפוסים של גן מסוים
לוקוס
מיקום פיזי של גן, תכונה או רצף דנא על גבי הכרומוזום.
החוק הראשון של מנדל
האללים נפרדים זה מזה ומתפצלים באופן שווה בין הגמטות
מהו גנום?
סך כל החומר הגנטי. באורגניזם דיפלואידי יש 2 גנומים, שני סטים של החומר הגנטי
c- value
כמות הדנא בגנום אחד
אינטרפאזה
השלבים שאינם החלוקה : G1+G2+S
גמטה
תא מין בשל
חצי ממספר הכרומוזומים של תא סומטי (הפלואידי)
מיוזה 1
נקראת חלוקת ההפחתה
מתפצלים כרומוזומים הומולוגים
בפרופאזה של מיוזה 1 מתרחשים שחלופים
כרומוזום פוליטני
בדרוזופילה.
כרומוזום מיוחד שנוצר כתוצאה מהרבה מחזורי הכפלה של כרומטידות ללא חלוקת הגרעין.
התוצאה- כרומוזום ענק שניתן לראותו ביתר קלות.
המיזיגוט
בעל עותק אחד מהגן
למשל: הזכרים הם המיזיגוטים לגנים שנמצאים על כרומוזום הX
כרומוזום אוטוזומלי
כרומוזום שאינו כרומוזום מין
מין הטרומורפי
מין שבו הכרומוזומים שונים זה מזה. למשל: XY
מין הומומורפי
מין שבו הכרומוזומים דומים למשל XX
פסאודו אוטוזומליים
אזורים הומולוגיים על כרומוזומי X וY (בקצוות) אשר אחראיים על הצמדות במיוזה
סקטור
קבוצת תאים שמוצאה מתא משותף והוא בעל פנוטיפ משותף- השונה מזה של סקטור שכן
חדירות penetrance
אחוז הפרטים בעלי גנוטיפ מסוים שמראים את הפנוטיפ המתאים
אקספרסיביות expresivity
עוצמת הביטוי של גנוטיפ מסוים בפנוטיפ.
חדירות ואקספרסיביות נמוכה מקשות על האנליזה הגנטית
החוק השני של מנדל
התפצלות בלתי תלויה של גנים הנמצאים על גבי כרומוזומים שונים
הפרעה I
מדד לתלות שחלופים סמוכים זה לזה
what is Terminal deletion?
חסר בקצה הכרומוזום
what is Interstitial deletion?
מחיקה באמצע הכרומוזום- נפוצה יותר מטרמינל דלישן
מה המנגנונים שיכולים להביא למחיקה בכרומוזום?
- breakage and rejoining - שבר דו גדילי בכרומוזום:
נקבל 2 מולקולות- כרומוזום עם חסר ומולקולה שמכילה את החומר הגנטי שחסר. המולקולה שיצאה היא בלי צנטרומר ולכן המקטע הזה יאבד. - crossover between repetitive DNA- שחלוף בין אזורים דומים בכרומוזום:
מולקולת הדנא מתקפלת ונוצר שחלוף בחלק שהתקפל- נקבל מולקולה מעגלית סגורה שתלך לאיבוד (ללא צנטרומר) וכרומוזום עם חסר. - unequal crossover - שחלוף של אזורים שונים אך דומים במיוזה של כרומטידות אחיות. נקבל 2 כרומוזומים שעברו שינוי . כרומוזום אחד עם חסר וכרומוזום אחד שמכיל את אותו מקטע שמופיע פעמיים.
הומוזיגוט לחסר
2 הכרומוזומים ההומולוגים מכילים את החסר
הומוזיגוט לחסר גדול בדרך כלל לטלי
הטרוזיגוט לחסר
כרומוזום אחד עם חסר והשני תקין
הטרוזיגוט לחסר גדול יכול להוביל לפגיעה בשל הפרת האיזון
הטרוזיגוט לחסר קטן יכול ליצור דומיננטיות מדומה
מה גורם ללולאת חסר?
deletion loop - נוצרת בהצמדות כרומוזומים במיוזה רק במצב של הטרוזיגוט לחסר !!
יש ירידה בתדירות הרקומבינציה כיוון שהמקטעים בתוך הלולאה לא יוכלו ליצור רקומבינציה.
tandem duplication
ABCBCD
Reverse duplication
ABCCBD
מנגנונים ליצירת דופליקציות
- unequal crossover
2. replication slippage- החלקת הרפליקציה
השפעות דופליקציות
- דופליקציות בדרך כלל פחות חריפות מחסרים
- חוסר איזון
- לולאות במיוזה - לולאות רברס יותר מסובכות
- כשיש דופליקציה אחת יש יותר סיכוי לעוד דופליקציות
אינברסיה פאראצנטרית
אינברסיה שלא כוללת את הצנטרומר
הטרוזיגוט לאינברסיה פאראצנטרית שעובר שחלוף בתוך הלולאה- כרומוזום אחד עם 2 צנטרומרים (שיקרע) וכרומוזום ללא צנטורמר שיאבד- 50% גמטות לטליות
אינברסיה פריצנטרית
- אינברסיה שכוללת את הצנטרומר (שכוללת את הפרי)
הטרוזיגוט לאינברסיה פריצנטרית שעובר שחלוף בתוך הלולאה- 2 כרומוזומים עם צנטרומר אחד לכל כרומוזום אבל יש שינוי גדול בתוכן הגנטי ולכן יהיו גמטות לטליות 50%
השפעות אינברסיות
אם אין שחלוף בתוך לולאת האינברסיה, הגן /הבקרה לא נחתכה באמצע- הכל תקין ! כרגיל
אם יש שחלוף בתוך לולאת האינברסיה - 50% מהגמטות יהיו לטליות
מנגנונים ליצירת אינברסיות
- שבר דו גדילי
2. unequal crossover במיוזה
טרנסלוקציה מסוג INSRTIONAL
מקטע מכרומוזום אחד עובר לכרומוזום אחר
טרנסלוקציה רציפרוקלית
שני כרומוזומים מחליפים ביניהם קטע גנטי
מהם המנגנונים ליצירת טרנסלוקציה ?
- שבר דו גדילי ותיקון
2. unequal crossover בין שני כרומוזומים שאינם הומולוגיים במיוזה ! שגורם לטרנסלוקציה רציפרוקלית
השפעות של טרנסלוקציה
הומוזיגוט לטרנסלוקציה- אין השפעה
הטרוזיגוט- יצירת צלב טרנסלוקציה
איזה גמטות ישרדו בהפרדות מצלב טרנסלוקציה
- !הפרדת סירוגין - תיצור 2 גמטות: אחת עם 2 כרומוזומים תקינים ואחת עם 2 טרנסלוקציות אבל שיכילו את כל התוכן הגנטי.- ישרדו
לעומת זאת בהפרדת שכנים הגמטות לא ישרדו !!
לכן אורגניזם הטרוזיגוט לטרנסלוקציה יהיה חצי עקר (רק חצי מהגמטות ישרדו).
מה קורה בשחלוף בתוך צלב הטרנסלוקציה?
לא יקרה כלום ! אין השפעה
מהי טרנסלוקציה רוברטסונית?
טרנסלוקציה רציפרוקלית שקורית קרוב מאוד לתחילת הכרומוזום
יווצר כרומוזום אחד ענק שמכיל את רוב המטען הגנטי
וכרומוזום קצר מאוד שמכיל רק את תחילת הכרומוזום - הכרומוזום הקצר יאבד.
קריוטיפ
מערכת כרומוזומים של אורגניזם
סמן גנטי
סמן דנא או סמן מולקולרי הוא מיקום מסוים בדנא שיכול להבדיל בין פרטים או בין אוכלוסיות
סמן גנטי הוא תכונה גנטית , לרוב בלי פנוטיפ
פולימורפיזם מולקולרי
קיום שונות באזור מסוים של דנא באוכלוסייה
סוגים של סמנים גנטים
- סניפ (SNP)- שינוי בבסיס אחד (סינגל נוקלאוטיד פולימורפיזם)
2. INDEL - חסר או תוספת של בסיס אחד או יותר (INSERTION DELETION)
ssr?
סוג של INDEL - רצף חוזרני באורך משתנה . simple repetitive sequence * סוגים ספציפיים של SSR: STR/VNTR- שורט טנדם רפיטס : 5-7 נוקלאוטידים שחוזרים מה שמבדיל בין הפרטים הוא הקטע החוזרני
איך מזהים פולימוריזם?
- caps marker- סמן המובסס על שוני בתבנית החיתוך= לזיהוי של סניפים
pcr+ חיתוך והרצה בגל. הWT יחתך והמוטציה לא- “נחתכתי מהכוס הזאת!” - sslp marker - (זיהוי מקטעים חוזרניים) PCR ואז ישר הרצה בג’ל כי המקטעים כבר באורכים שונים (אין צורך בחיתוך)- “אתה יכול לישון. לא צריך לחתוך”.
- snp arrays - שיטה לזיהוי כמה סניפים בבת אחת: מדפיסים מקטעי דנא ידועים והם מתחלקים על גבי התבנית עם סמן פלוריסנטי. כל מקטע נקשר לרצף המשלים שלו.
- ריצוף
מהם היחסים בין אללים של סמנים מולקולריים ?
קו דומיננטיות
הכלאה מחזירה
back cross
הכלאה לאחד ההורים הטהורים המקוריים
למה רוצים ליצור הכלאה עם שני זנים שונים בסמנים מולקולריים ?
כדי שנוכל להבדיל בין הפרטים- פולימורפיזם