מדורים תוך-תאיים ומיון חלבונים Flashcards

1
Q

מה יכולה להיות סיבה אבולוציונית ליצירת ממברנות תוך תאיות?

A

ניתן להתייחס להתפתחות ממברנות האברונים בתא כאל התאמה לעלייה בגודלו
לתא יוקריוטי יש יחס קטן בין שטח הפנים לנפח
מערכת הממברנות הפנימיות מפצה על כך ונותנת מענה לצורך.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

מה מקור הממברנות התוך-תאיות?

לפי תיאוריה מסוימת

A

יש תיאוריה שלפיה בממברנות הפנימיות התפתחו מאינוגינציות ושקיעות פנימה של
,ER) הממברנה החיצונית. לפי זה, פנים האברונים מקביל טופולוגית לסביבה החיצונית לתא
גולג’י, אנדוזומים, ליזוזומים, פרוקסיזומים).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

מה זה

Sorting Signal?

A

יעדם של חלבונים חדשים נקבע עפ”י רצף ח”א שלהם
שהם
Sorting Signal

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

מה הוא

Gated Transport

A
חלבונים ורנ"א נעים דרך
NPC
שערים סלקטיביים והמעבר הוא אקטיבי. שערים אלו מאפשרים מעבר חופשי של
מול' קטנות
40 קילודלתון
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

מה מאפיין של חלבון שעובר בעזרת טרנסלוקטור?

A

חייב
קודם כל להיפתח לצורת נחש (למשל: חלבונים העוברים מהציטוזול
למיטו’ או ל-
ER

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

איך עובר
חלבון שלא חצה ממברנה, שיטה זו אפשרית רק
להעברת חלבונים בין מדורים מקבילים מבחינה טופולוגית?

A

Vesicular Transport

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

אילו סוגי
Signal Sequences
ישנם?

A

העברה לעיבוד ב-ER
עיכוב קבוע ב-ER
מיטו’
פרוקסיזום

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

איך מעבירים חלבון לעיבוד ב-ER?

A

5-10 ח”א הידרופוביות
בקצה N
רמז:
lumeN

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

איך מעכבים חלבון ב-
ER
באופן קבוע?

A
רצף
KDEL
בקצה C
רמז:
Cdel-C
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

מה רצף הובלה למיטוכונדריה?

A

ח”א חיוביות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

מה רצף הובלה לפרוקסיזום?

A

3 ח”א
בקצה
C

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

מה מאפיין את הממברנה הפנימית של מעטפת הגרעין?

הגרעין עטוף בממברנה כפולה

A

הממברנה הפנימית מכילה
חלבונים קושרי -כרומוזומים
וגם
.Nuclear Lamina

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

מה מאפיין את הממברנה החיצונית של מעטפת הגרעין?

הגרעין עטוף בממברנה כפולה

A

הממברנה החיצונית מצופה ריבוזומים
שמסנתזים חלבונים.
העברת מולקולות בין הגרעין לציטוזול היא סלקטיבית,
ולעתים מורכבת:
חלבוני הריבוזום, למשל, נוצרים בציטוזול, נכנסים לגרעין, ובתוכו מתחברים ל-
rRNA
יחידות מורכבות אלה יוצאות לציטוזול, שבו הן מתחברות לריבוזום.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

מה הוא סיגנל כניסה לגרעין?

A

NLS
אחראי לסלקטיביות של הכניסה לגרעין. הסיגנל מורכב מרצף קצר (או שניים) עשיר
בליזין וארגינין
ניתן למצוא אותו כמעט בכל מקום ברצף חומצות האמינו, והוא נוטה ליצור
לולאות בחלבון

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

מה מיקום רצף הכניסה לגרעין?

A

ניתן למצוא אותו כמעט בכל מקום ברצף חומצות האמינו, והוא נוטה ליצור
לולאות בחלבון

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

איזה חלבונים ניתן למצוא בפנים ה-
NPC
ובאיזה ח”א הם עשירים?

A

מלא בסבך חלבונים עשירים בפנילאלנין וגליצין.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

מי מזהה סיגנל
NLS
בחלבון?

A

מזוהה ע”י רצפטורים בשם
Importins
לעתים הם אינם קושרים את החלבון
ישירות, אלא ע”י חלבון מתווך.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

מה הוא מבנה הרצפטור

Importins?

A

הרצפטור הוא חלבון ציטוזולי מסיס שנקשר מצד
אחד לרצף NLS
ומצד שני לח”א
FG שבפורות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

מה מטרת רצפי ה-
FG
שממלאים את הפורות?

A

א. חסימה
הם באינטראקציה חלשה ביניהם, וכך יוצרים סבך -חוסם.

ב. אתרי עגינה
לרצפטורי האימפורטין
כאשר הרצפטורים אימפורטין עוברות בפורות הם 
נקשרים> מתנתקים> נקשרים שוב לרצפי ה-
FG
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

מה קורה לרצפטור אימפורטין לאחר שנכנס לגרעין?

A

הם

וחוזרים לציטוזול. (GTP- מתנתקים מהחלבון שנשאו (ע”י חיבור ל

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

איזה חלבון אחראי על המעבר בין בגרעין והציטוזול?

A
תלוי בחלבון RAN
הציטוזול עשיר ב-
GAP + GDP
הגרעין עשיר ב-
GEF + GTP
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

מה קורה ל

? רצפטורי אימפורטין בציטוזול

A

NPC- ונכנסים ל RanGDP- רצפטורי אימפורטין בציטוזול נקשרים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

מה קורה לרצפטורי אימפורטין עם הכניסה לגרעין?

A

הם נקשרים ל-
RAN-GTP
הקישור גורם לשחרור החלבון

ואז הרצפטור ריק וקשור ל-
RAN-GTP
חוזר לציטוזול

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

למה קשור הרצפטור אימפורטין כאשר הוא בגרעין?

A

RanGTP

כאשר הרצפטור נכנס לגרעין הוא נקשר ל-
RanGTP
זה גורם לשחרור החלבון

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
למה קשור הרצפטור אימפורטין כאשר הוא בציטוזול?
RanGDP ואז נכנס ל- NPC
26
מה הסדר של מצבי הזרחון של האימפורטין?
רצפטור ריק קשור ל- RanGTP חוזר לציטוזול עובר הידרוליזה הרצפטור הקשור ל- RanGDP מוכן לסבב ייבוא חזק
27
מה מסלול האקספורטין?
RanGTP בגרעין מעודד את אקספורטין לקשור חלבון, שיוצא לציטוזול. בציטוזול ה GTP עובר הידרוליזה החלבון משתחרר והאקספורטין חוזר לגרעין.
28
האם יש חלבונים שיש להם | NLS וגם NES?
כן | ותפקידם לנוע בין הגרעין לציטוזול, הלוך ושוב.
29
איך מייצאים את | (tRNA ,miRNA ,snRNA)?
מנגנון | RanGTP
30
איך מייצאים את | mRNA?
יוצאת מהגרעין במנגנון שונה, המשתמש בהידרוליזת | ATP
31
מה הסיגנל כניסה למיטוכונדריה?
חלבונים המיועדים להיכנס למיטוכונדריה, מתורגם תחילה במלואם בציטוזול, ורק אז מיובאים למיטוכונדריה כוללים סיגנל N בקצה שלהם בד"כ מקוצצים לאחר הכניסה למיטו'
32
מה המבנה של הסיגנל כניסה למיטוכונדריה?
מבנה אלפא הליקס אמפיפילי בצד אחד שיירים חיוביים ובצד אחר שיירים הידרופוביים לא טעונים
33
מה עושה קומפלקס | TOM?
מעביר חלבונים דרך הממברנה החיצונית של המיטוכונדריה
34
איך מועברים חלבוני beta barrel במיטוכונדריה?
מועברים לקיפול ע"י | SAM
35
מה עושה קומפלקס | TIM?
מעביר חלבונים דרך הממברנה הפנימית
36
מה קשור לקופמלקס | TIM23?
``` קשור אליו השאפרון HSP70 שמשתמש ב ATP כדי למשוך חלבונים פנימה ```
37
מה ההבדל בין מיטוכונדריה לכלורופלסט בתהליך הכנסת החלבונים?
מיטוכונדריה רותמת את גרדיאנט הפרוטונים שלאורך הממברנה הפנימית כדי להניע מעבר חלבון. כלורופלסט, אשר יש לו גרדיינט פרוטונים לאורך ממברנת התילקואיד (ולא לאורך הממברנה הפנימית) משתמש בהידרוליזת GTP+ATP כדי לייבא חלבונים
38
מה הכוח שמניע קשירה ושחרור חלבונים מהשאפרונים?
הידרוליזת ATP
39
איך נכנס חלבון למיטוכונדריה?
חלבון שנכנס דרך TOM גורם להידרוליזה ראשונה של ATP גרדיאנט הפרוטונים מחוץ לממברנה הפנימית מסייע לו להיכנס ``` הידרוליזת ATP שנייה ע"י HSP70 גורמת למשיכה מלאה של החלבון וייבואו למיטו' ```
40
מה קורה ברוב הטרנסלוקציות של חלבונים למיטו'?
רצף סיגנל בקצה N טרמינלי נכנס למטריקס ולאחריו יש רצף STOP TRANSFER
41
מה מבנה הפרוקסיזום ואיפה הוא נמצא?
אברון מוקף ממברנה חד שכבתית נמצא בכל התאים האאו' הם מכילים אנזימים מחמצנים כמו קטלאז ואוקסידאז
42
איזה תהליך חמצון מיוחד מתרחש בפרוקסיזום?
פרוקסיזום מחמצן חומצות שומן מסועפות או ארוכות מאוד, חומצה פורמית ואלכוהול. החימצון חשוב בעיקר בכבד ובכליות, שבהם יש לנטרל רעלים מזיקים שעלולים להיכנס לזרם הדם.
43
איך הפרוקסיזום בתא מתרבה?
מתחלק מאברונים קיימים FISSION או נוצר מה-ER כנראה 2 הטענות נכונות.
44
מה מתרחש בפרוקסיזום הצמחי?
מתבצע מעגל הגליאוקסילט, שבו חומצת שומן מפורקת לשני acetyl coA כדי ליצור סוקסינט שעוברת לציטוזול ומומרת לגלוקוז.
45
מה סיגנל כניסה לפרוקסיזום? היכן נמצא?
``` רצף של 3 ח"א SKL סרין-ליזין-לאוצין בקצה C אך ייתכן שגם בקצה N ``` וחלבוני פרוקסינים עוזרים לו להיכנס פנימה
46
מהו סינדרום זלווגר?
היא מחלה תורשתית שבה לא מיוצרים פראוקסיזומים, או שהפראוקסינים דפוקים, ולכן הפרוקסיזומים של החולה ריקים. זה גורם ללקויות במח, בכבד, בכליות, ולמוות זמן קצר לאחר הלידה.
47
מה ההבדל בייבוא חלבונים ל- ER או למיטו'\ כלורופלסט\פרוקסיזום?
ב-ER אפשר להעביר (co-translational) תו"כ סינתזה והשאר רק בתום התרגום .(post-translational)
48
איזה אברון יש בכמות ניכרת בתאי כבד?
sER שם מיוצר ליפופרוטאינים הנושא ליפידים במחזור הדם לחלקי הגוף
49
מה עושים אנזימים | P450?
אנזים המזרז סדרת תגובות שבהן חומרים בלתי-מסיסים שעלולים להצטבר לרמות רעילות, הופכים למסיסים כך שניתן לסלקם בשתן.
50
מה זה מיקרוזומים?
``` כאשר רקמות או תאים עוברים הומוגניזציה ה-ER עובר הומוגנציה נשבר לחלקים שנסגרים על עצמם מחדש לואזיקולות (שאותם קל להפריד בקולונת שיווי -משקל) ``` מבחינה ביוכימית, ER- המיקרוזומים מייצגים גרסאות מוקטנות של ה ומסוגלים לבצע את תפקידיו.
51
מה מבנה ה- | SRP?
קומפלקס גדול המורכב מ-6 פוליפפטידים שונים הקשורים למול' רנ"א קטנה זרוע אחת קושרת את רצף ה- ER עם הגחתו מהריבוזום והזרוע השניה חוסמת את התארכות הפפטיד מייד לאחר הגחתו ``` כאשר SRP קושר חלבון לסיגנל שלו הוא עובר שינוי קונפורמציה שחושף אתר קישור ל- SRP ב- ER ```
52
מה מבנה ה- Signal Sequence של ה-ER?
8 ח"א לא פולאריות במרכזו
53
אילו ח"א נמצאות באתר הקשירה של | SRP לריבוזום?
רצף עשיר במתיונין.
54
האם הכנסת חלבונים ל ER דורשת שאפרונים?
אין צורך בצ'פרונים שיפתחו וישטחו אותם כי החלבונים נכנסים ישר ל- ER מהריבוזום
55
מה מבנה הטרנסלוקון?
זוהי פורה להכנסת חלבונים ל- ER קומפלקס בן 4 יח' של Sec61 באאו' יש סליל אלפא הליקס שמסייע בפתיחתו או סגירתו השער הזה נפתח זמנית רק כאשר פפטיד אמור להיכנס דרכו ``` בשער יש גם תפר צדדי seam) שיש לו 2 תפקידים: - מסייע לשחרר את הסיגנל פפטיד שקוצץ - מסייע להכניס חלבונים טרנסממברנליים דרך דו-שכבת הממברנה ```
56
האם חלבונים יכולים להכנס לאחר תרגום ל-ER?
כן ``` באאו' - השאפרון BIP יושב בצד הלומן בכל הידרוליזה של ATP הוא מושך ומשחרר את החלבון דרך Sec61 ``` בבקטריה - החלבון SecA יושב על הצד הציטוזולי ודוחף חלבון החוצה בכל הידרוליזה של ATP
57
מי זה החלבון | BIP?
``` שאפרון באאו' יושב בצד הלומן ומכניס חלבון ל- ER תו"כ הידרוליזה של ATP ```
58
SecA | מה זה?
חלבון בבקטריה | מכניס חלבון לאחר תרגום דרך הממברנה
59
כמה פעמים מזובב רף הכניסה ל- | ER?
פעמיים ``` פעם אחת בציטוזול ע"י SRP פעם שנייה ע"י הטרנסלוקטור בממברנת ה- ER שם הוא משמש כסיגנל start-transfer signal שפותח את הפורה ``` זיהוי כפול כדי לוודא שנכנסים רק חלבונים מתאימים
60
כמה פתחים יש לטרנסלוקטור?
שניים פורה אחת מבעד לממברנה פורה אחת לרוחב הממברנה כדי לאפשר לחלקים ההידרופוביים להכנס לדו שכבה
61
מה הכיווניות של חלבון עם ח"א חיוביות לפני ה- start-transfer sequence?
``` החלבון יכנס ל- ER כאשר קצה N בציטוזול ``` לסיכום: הציטוזול לוכד ח"א חיוביות.
62
מה הכיווניות של חלבון עם ח"א חיוביות אחרי ה- start-transfer sequence?
``` החלבון יכנס ל- ER כאשר קצה C (החיובי) בציטוזול ``` לסיכום: הציטוזול לוכד ח"א חיוביות.
63
מה מחפש | SRP
הוא סורק את הפוליפפטיד אמין לקרבוקסיל ומחפש רצף הידרופובי הרצף הראשון שיפגוש יהיה START TRANSFER הבא יהיה STOP TRANSFER הפונקציה שימלא רצף הידרופובי תלויה במקומו בפפטיד, והיא יכולה להשתנות ע"י שיטות רקומבינציה. ההבחנה בין תלויה במיקומם היחסי בפפטיד הצומח. stop- ל start
64
מה עושה חלבון PDI ואיפה נמצא?
``` נמצא ב- ER הוא מחמצן שיירי SH ויוצר קשרי S-S ```
65
מה עושה | Olygosaccharyl Transferase
שם עץ סוכרים על חלבונים ב- ER אתר פעיל בלומן ולכן חלבונים ציטוזוליים אינם מקבלים אוליגוסכרידים על שייר NH2 באספרג'ין
66
מה העוגן הליפידי של עץ הסוכרים שנכנס ל- | ER?
דוליכול
67
מה קורה לחלבון ושייר הסוכר | ב- ER?
מוסרים 3 גלוקוזים ומאנוז (תהליך הקיצוץ נמשך בגולג'י).