גלובינים Flashcards
מבנה שניוני נפוץ בגלובינים
78% מהגלובינים באלפא הליקס
מבנה טבעתי של heme
טבעת protoporphyrin IX
מורכבת מארבע טבעות פירול
חומצה אמינית איתה אטום הברזל נקשר לגלובין
היסטידין
מה מאפשר מבנה הגלובין ל heme (שתי תשובות)
- מונעת קישור בין 2 מול׳ הם
2. מסייעת בהפחתת אפיניות ל CO
מיוגלובין - מבנה
שרשרת אחת של גלובין, בעלת הם בודד
מיוגלובין - אפיניות לחמצן וגרף קשירת ליגנד
אפיניות גבוהה מאוד ויחזיק בו גם בסביבת הרקמות - תפקידו לאחסן חמצן בשריר.
גרף היפרבולי
המוגלובין - מבנה וקנופרומציות
מורכב מ 2 יחידות בטא ושתי יחידות אלפא. כל יחידה קושרת הם.
שתי קונפורמציות:
מצב T בו ההמוגלובין יציב ולא פנוי לקשור חמצן
מצב R בו ההמוגלובין משוחרר וזמין לקשור חמצן (אפיניות גבוהה יותר לחמצן ב R)
מה קורה במעבר של המוגלובין בין מצב T למצב R?
קשר יוני בין היסטידין בקצה הקרבוקסילי של תת יחידה בטא עם ליזין מתת יחידה אחרת נשבר
F helix
Alpha helix that changes its position when heme is connected to oxygen
קבוע היל.
מהו ובאילו טווחים הוא נמצא? מה כל טווח אומר?
קבוע היל מסומן כ n
הוא משמש כתיאור כמותי של קישור קואופרטיבי.
אם n=1 אין שיתופיות בקישור.
אם n>1 יש קואופרטיבית חיובית (שיתופיות חיובית)
אם n<1 יש שיתופיות שלילית
מהו ערכו המקסימלי של קבוע היל?
מספר האתרים הזמינים בחלבון לקשירת ליגנד
אינטראקציה הומוטרופית והטרוטרופית
הומוטרופית - הליגנד הוא גם חלבון הבקרה האלוסטרית
איך 2,3-BPG משפיע על המוגלובין?
עליה בריכוזו גורמת לזיקה פחותה לחמצן. מול׳ אחת שלו נקשרת להמוגלובין שלם ומייצבת את מצב T
מה שונה בהמוגלובין עוברי ןכיצד זה משפיע על התפקוד
המוגלובין עוברי מכיל תת יחידה גמא במקום בטא.
זה גורם ל אפיניות נמוכה ל 2,3BPG, שמביא לזיקה גבוהה יותר של העובר לחמצן
מה יעשה CO שנקשר לתת יחידה אחת בהמוגלובין
יגרום לזיקה גבוהה מדי לחמצן וחוסר יכולת לשחרר אותו