ביוכימיה Flashcards
ממה בנויים החלבונים
מ-100-700 יח’ של חומצות אמינו
מונומר
יח’ אחת של חומצת אמינו
פולימר
אוסף יח’ של חומצות אמינו המחוברות זו לזו
למשל- חלבון
פפטיד
זהו לא חלבון שלם אלא שלב ביניים
נוצר חיבור בין פחמן מהקבוצה הקרבוקסילית לבין אטום חנקן מהקבוצה האמינית של חומצה אחרת ונפלט מים
הקבוצה האמינית
ph=7 \+קולטת פרוטון ולכן ב ph=1 \+הפרוטון נשאר ולכן ב ph=14 היא פולטת את ה+ ונשאר נייטרלית
הקבוצה הקרבוקסילית
ph=7 -מאבדת פרוטון ולכן היא ב ph=1 היא לא משחררת פרוטון ולכן נייטרלית ph=14 -מאבדת פרוטון ולכן ב
מבנה מרחבי ראשוני של החלבון
נקבע ע”י הדנ”א, רצף החומצות האמינו והסדר בו הן מחוברות.
OCNH ארבעת האטומים שבאזור הקשר הפפטידי
מצויים במישור קשיח ומהווים את הלוחיות.
בין הלוחיות מחבר פחמן מרכזי.
מבנה מרחבי שניוני של החלבון
שתי צורות צורות ארגון- אלפא=אליקס, בטא=שיט
בחלבון אחד יכולים להתקיים מבנים משני הסוגים או רק מסוג אחד.
בנוסף, קיימים מקטעים שאינם במבנה מאורגן.
אלפא אליקס
מיוצב באמצעות קשרי מימן.
R קבוצות ה
מופנות כלפי מטה והחוצה.
קבוצות אשר במטען חשמלי שונה (+/-) וגדולות יכולות להשתלב במבנה אלפא
חומצות עם שייר בעל תכונה מיוחדת אשר לא מאפשרות השתלבות בסליל אלפא
פולין (טבעת
R גליאצין (מימן במקום קבוצת
ציסטאין (יוצר קשר דו-גופרי אשר גורם לקיפולים בחלבון
בטא שיט
הלוחיות נוטות זו ביחס לזו כל פעם בכיוון מנוגד.
קבוצות ה- ר, נמצאות בסירוגין מעל ומתחת השרשרת.
ואלה הן קבוצות ר קטנות והידרופוביות
מבנה שלישוני
תלוי במבנה הראשוני והשניוני.
SS =מושפע מקשרי (ציסטאין
מושפע מקשר מימן, קשרי ואנדר ואלס, אינטרקציות הידרופוביות וקשרים יונים
מבנה רביעוני
מבנה שנוצר מחיבור תת יחידות (שרשרת חומצת אמינו נפרדת)
כל תתי היחידות יחד יהוו חלבון שיתפקד בצורה עצמאית וטובה.
הקשרים בין תתי היחידות הם קשרי מימן, ואנדר ואלס וקשרים יונים.
חומצה הידרופובית
קבוצת ה-ר לא מסיסה במים. בנויה מפחמנים ומימנים בלבד.
חומצה הידרופילית
קבוצות ה-ר בעלות מטען חשמלי או שיכולות ליצור קשרי מימן.
אנמיה חרמשית
יש פגם במבנה של ההמוגלובין אשר גורם לחומצת הגלו להתחלף עם קבוצת הואלין אשר היא הידרופובית ולא מאפשרת קשירה של יוני מימן.
(הגלו היא הידרופילית)
דנטורציה (denaturation)
שינוי המבנה המרחבי של החלבון ולכן גם פגיעה בפעילותו הביולוגית.
הגורמים לדנטורציה:
1. ריאגנטים שפוגעים בחלבון (אוריאה – קשרי מימן, מרקפתואתאנול – קשרי דו גפרית) .
2. שינוי בטמפרטורה
3. שינוי pH.
אנזים טרפסין
מפרק קשר פפטידי של חלבונים במערכת העיכול, אחראי על חומצות בסיסיות.
אנזים כימוטרפסין
מפרק קשרים פפטידים של חלבונים במערכת העיכול
אחראי על חומצות ארומטיות
מעגל אוריאה
החלק אמיני של החומצה האמינית הוא רעיל והכבד הופך אותו לאוריאה שמגיע לכליות ומופרש בשתן.
אנזים
הוא זרז ביולוגי לתגובה אנבולית או קטבולית
האנזים לא עובר שינוי במהלך התגובה עם הסובסטרט ולכן הוא זמין לביצוע תהליך נוסף.
סובסטרט
המצע עליו מתרחש תהליך
הוא מתחבר לאנזים אשר גורם לו לעבור שינוי מרחבי בעזרת אנרגיית השפעול.
בשביל שהמגיבים יגיבו הם צריכים רמת אנרגיה גבוהה
בשביל שהתוצרים ישארו הם צריכים רמת אנרגיה נמוכה
אנרגית שפעול
האנרגיה הדרושה על מנת שתגובה מסוימת תתקיים
פירוק גלוקוז בגוף
ללא אנזים פירוק הגלוקוז יכול להתבצע רק בטמפ’ של 100 מעלות.
בעזרת האנזים פירוק הגלוקוז מתבצע ב 37 מעלות.
קפקטור או קואנזים
תוספת לא חלבונית הנדרשתלעיתים כדי שהתהליך האנזימתי יוכל להתרחש
פרואנזים הוא אנזים לא פעיל שזקוק לקופקטור
ניתן לבדוק את פעילות האנזים ב 2 דרכים:
(P) לבדוק את כמות התוצר שנוצר
(S) לבדוק את כמות הסובסטרט
ככל שרמת הסובסטרט יורדת כך כמות התוצר עולה
גורמים המשפיעים על פעילות האנזים
ph, טמפ’, ריכוז אנזים, ריכוז מצע, מעכבים
נקודת רוויה X
נקודה שממנה והלאה למרות העלייה בריכוז האנזים, פעילותו תישאר קבועה. בגלל שריכוז הסובסטרט הוא קבוע.
מעכב תחרותי
מתחרה עם הסובסטרט על האתר הפעיל של האנזים. העיכוב הוא הפיך ותלוי בריכוז הסובסטרט וריכוז המעכב.
בדר”כ בעל מבנה מרחבי דומה למבנה הסובסטרט
מעכב לא תחרותי
נקשר לאנזים באתר הלא פעיל ומונע את פעילותו. העיכוב הוא הפיך וריכוז הסובסטרט הוא פחות משמעותי.
ליפידים
תרכובות פחמן, שמסיסותן במים נמוכה (הידרופוביות), אך הן )מסיסות בממסים אורגניים (כמו: בנזין,אתר.
הליפידים הם חומצות שומן, גליצרידים, פוספו ליפידים וסטרולים.
הלפידים יוצרים ביניהם קשרי ואן דר ואלס
תפקידים פיזיולוגיים של שומנים
מאגר אנרגיה, רכיבי מפתח בממברנת התא, שכבת מגן על האורגניזם, חומר מוצא לבניית תרכובות (הורמונים), נשיאת ויטמינים שומניים
חומצות שומן
חומצות שומן הן תרכובות המכילות שרשרת פחמימנית (בד”כ יותר מ-9) וקבוצה קרבוקסילית באחד מהקצוות.
מתחלקות ל-2 חומצות רוויות ולא רוויות