אנזימולוגיה: קישור וקטליזה

Question 1

זימוגן

Answer 1

קדם חלבון של אנזים פרוטאוליטי. זימוגנים עוברים חיתוך של קשר פפטידי ולאחר מכן הופכים לאנזימים פעלים.

Question 2

דהידרוגנאז

Answer 2

אנזים המזרז תגובת דהידרוגנציה

Question 3

אנזים

Answer 3

חלבון או RNA שמזרז ריאקציה מוגדרת ע”י הורדת אנרגיית האקטיבציה והגברת קצב התגובה (מבלי להשפיע על מדדים תרמודנמיים)

Question 4

דאמינציה

Answer 4

התגובה המזורזת ע”י אנזים שבה מוסרת קבוצת אמינו מביומולקולה

Question 5

איזואנזימים/ איזוזים

Answer 5

שני אנזימים או יותר המזרזים את אותה הריאקציה ומקודדים בגנים שונים

Question 6

ליאז

Answer 6

אנזים המזרז הסרה של קבוצה ממולקולה שמובילה ליצירה של קשר כפול.

Question 7

דסטוראז

Answer 7

אנזים שמזרז היווצרות של קשרים כפולים

Question 8

מאפנן אלוסטרי

Answer 8

מולקולה שנקשרת לאתר אלוסטרי באנזים ולאחר קשירתה חל שינוי בפעילות הקטליטית של האנזים

Question 9

סובסטרט

Answer 9

מולקולה/ קבוצה כימית שהיא מגיב בריאקציה המזורזת ע”י אנזים.

Question 10

אפואנזים

Answer 10

החלק החלבוני בלבד מתוך ההולואנזים (האנזים השלם).

Question 11

פפטידאז

Answer 11

אנזים שמזרז הידרוליזה של קשר פפטידי

Question 12

אנזים רגולטורי

Answer 12

אנזים שפעולתו הקטליתי מבוקרת בדרך כלשהי

Question 13

האתר הפעיל של אנזים

Answer 13

האתר באאנזיים הקושר את הסובסטרט ומזרז את מעברו לתוצר

Question 14

קואנזים

Answer 14

קופקטור אורגני שנדרש לפעילתו של אנזים

Question 15

פוספטאז (של חלבון)

Answer 15

אנזים המזרז הידרוליזה (הסרה) של קבוצת פוספוריל משייר חומצה אמינית בחלבון

Question 16

הידרולאז

Answer 16

אנזים שמזרז את תגובת ההידרוליזה

Question 17

קרבניון

Answer 17

אטום פחמן בעל מטען שלילי

Question 18

אוקסירדוקטאז

Answer 18

אנזים המזרז תגובת חמצון-חיזור (חמזור)

Question 19

שלישיה (טריאדה) קטליטית

Answer 19

שלושה שיירים של חומצות אמינו הנמצאים באתר הפעיל של אנזים מסויים. שלושת השיירים נמצאים באינטרקציה שמזייעת ביצירת סביבה כימית מתאימה לקשירת הסובסטרט

Question 20

קטליזת אטום ברזל

Answer 20

מנגנון תגובה המבוסס על אטום מתכת (המתכת יכולה לסייע באיזון מטען חשמלי למשל)

Question 21

קדם חלבון/קדם אנזים

Answer 21

פרקורסור של חלבון. ע”מ להפוך לצורתו הפעילה יש לבצע בו חיתוך פרוטאוליטי

Question 22

אוקסידאז

Answer 22

אנזים שמזרז ריאקציות חמצון, בריאקציות אלה חמצן מולקולרי משמש כמקבל אלקטרוינם אבל אטומי החמצן אינם משתלבים במולקולות התוצר

Question 23

ATPase

Answer 23

אנזים המזרז את ההידרוליזה של ATP לADP

Question 24

קינטיקה אנזימתית

Answer 24

גישה לחקר קצב התגובה של מנגנון אנזימי

Question 25

קופקטור

Answer 25

קבוצה (אורגנית או אנאורגנית) שנדרשת לפעילותו של אנזים

Question 26

סרין פרוטאז

Answer 26

אחד מתוך ארבע סוגים מרכזיים של פרוטאזות. במנגנון זה קיים שייר סרין באתר הפעיל המשמש כזרז קוולנטי.

Question 27

אוקסיגזנאז

Answer 27

אנזים שמזרז ריאקציות שבהן אטומי חמצן משתלבים במולקולת תוצר, כך שנוצרת קבוצת הידרוקסיל או קרבוקסיל.

Question 28

קינאז

Answer 28

אנזים המזרז הוספה של קבוצת פוספוריל לשייר של חומצה אמינית בחלבון. התורם של קבוצת הפוספוריל הוא נוקלאוזיד טריפוספט, קבוצת הפוספוריל יכולה להתחבר לשיירים סירין, תראונין, טירוזין, והיסטידין בחלבון המטרה.

Question 29

קטליזה קוולנטית

Answer 29

מנגנון זירוז תגובה המבוסס על יצירת קשר קוולנטי זמני בין האנזים לסובסטרט

Question 30

סטראוספציפי

Answer 30

מתאר אינטרקציה בין ביומולקולות. ע”מ שהאינטרקציה תתרחש נדרש מבנה מרחבי ספציפי

Question 31

קטליזת חומצה בסיס

Answer 31

מנגנון זירוז תגובה המבוסס על מסירה וקבלת פרוטונים באתר הפעיל של האנזים. בקטליזה חומצה בסיס כללית העברת הפרוטונים אינה כוללת מולקולת מים, לעומת קטליזת חומצה בסיס ספציפית שמערבת מולקולת מים.

Question 32

דיאוקסיגנאז

Answer 32

סוג של אוקסיגנאז, התוצר של הריאקציה המזורזת כולל שני אטומי חמצן חדשים שהשתלבו בו

Question 33

הולואנזים/אנזים שלם

Answer 33

המבנה השלם של האנזים שמכיל את כל תת היחידות והקופקטורים הנדרשים לפיעולותו.

Question 34

אנזים אלוסטרי

Answer 34

אנזים רגולטורי שפעולתו הקטליטית מבוקרת ע”י מטבוליט שנקשר לאור באנזים שאינו האתר הפעיל

Question 35

מצב מעורר

Answer 35

מולקולה או אטום הנמצאים במצב עשיר באנרגיה כתוצאה מספיגת אנרגיה

Question 36

דהידרוגנציה

Answer 36

סוג של תגובת חמצון שזה מולקולתה מאבדת אלקטרונים וגם מימנים.

Question 37

מונואוקסיגנאז

Answer 37

סוג של אוקסיגנאז, התוצר של הריאקציה המזורזת כולל אטומם חמצן חדשאחד שהשתלב בו, אטום החמצן השני עובר חיזור למולקולת מים.

Question 38

פרוטאז

Answer 38

אנזים שמזרז את תגובת הפירוק ההידרוליטי של הקשר הפפטידי.

Question 39

ליפאז

Answer 39

אנזים שמזרז את ההידרוליזה של חומצות שומן מטריגליצריד

Question 40

איזומראז

Answer 40

אנזים שמזרז טרנספורמציה של מולקולה לאחד האיזומרים שלה

Question 41

pH אופטימלי

Answer 41

ערך הpH שבו המתקבלת פעילות החלבון המקסימלית

Question 42

סינטטאז

Answer 42

ליגאז שמשתמש בנוקלאוזיד טריפוספט כקופקטור

Question 43

אפימראז

Answer 43

אנזים שמזרז מעבר של מולקולה בין שני אפימרים

Question 44

סינטאז

Answer 44

ליגאז שאינו משתמש בנוקלאוזיד טריפוספט כקופקטור (ATP/CTP/GTP)

Question 45

פוספורוליזה

Answer 45

תגובת פירוק של מולקולה שבה זרחה היא הקבוצה התוקפת. התגבוה המקבילה להידרוליזה.

Question 46

קרבוקטיון

Answer 46

אטום פחמן בעל מטען חיובי

Question 47

התאמה מושרת

Answer 47

מודל המתאר את תהליך ההיקשרות של הליגנד לאתר הקשירה, לפי מודל זה, מגע בין הליגנד לאתר הקשירה גורם לשינויים מבניים באתר הקשירה. שינויים אלה מגדילים את ההתאמה בען האתר לליגנד.

Question 48

מוטאז

Answer 48

אנזים השייך למשפחת האיזומראזות שמזרז העברה של קבוצות בתוך מולקולה.

Question 49

ליגאז

Answer 49

אנזים המזרז ריאקציות דחיסה (חיבור שני אטומים בקשר קוולנטי חדש) תוך שימוש במקור אנרגיה

Question 50

אנרגיית קשירה

Answer 50

השינוי באנרגיה החופשית המתרחש כאשר מגיב נקשר לאתר הקטלטי באנזים. השינוי באנרגיה החופשית מסייע בהפחתת אנרגיית האקטיבציה (הסיבה לכך היא אינטרקציות מולקולריות שמקיים האתר הפעיל באנזים עם הסובסטרט שלו ובכך מייצב את מצב המעבר).

Question 51

פוספוליראז

Answer 51

אנזים שמזרז הסרת קבוצת זרחה