Virologie_Général et diagnostique Flashcards
Combien de % d’augmentation du nombre total d’espèces virales répertoriées dans les 3 dernières années?
38%
Quelle méthode est utilisé pour identifier de nouveaux virus et faire la surveillance de maladies virales?
Biologie moléculaire: PCR, séquençage de Sanger et séquençage à haut débit (la pref)
Comment se produit une infection mixte?
Destruction et/ou modulation des cellules de l’hôte par le premier pathogène, donnant l’avantage au second pathogène.
Ex de moyen de faciliter la vie au 2e pathogène:
1) Immunomodulation (régulation de l’expression de cytokines)
2) Destruction des cellules du syst immunitaire, épithéliale des voies respiratoires…
*Parfois, on peut avoir des surprises et des bactéries peuvent s’avérer anti-virale
Pourquoi l’étude des virus est nécessaire?
1) Démontrer l’origine virale d’une infection et donc procéder à son diagnostique (4 façons: Identification directe du virus, Isolement du virus en l’inoculant à un syst biologiue favorable, identification du virus isolé, mesure des anticorps dirigés contre le virus)
2) Prophylaxie et préparation d’un vaccin
Comment fait-on la détection des pathogènes vs des anticorps?
Pathogènes: PCR
Anticorps: ELISA
Donnez des exemples de virus ciblés par les industries de production animale pour faire un suivi épidémiologique moléculaire:
- Virus du syndrome reproducteur et respiratoire porcin
- Influenzavirus porcin
- Réovirus aviaire
- Virus de la bronchite infectieuse aviaire (IBV)
Quels sont les avantages du séquençage à au débit vs le séquençage de Sanger
Plus efficace (10^7- 10^9 nt) Moins coûteux (300USD/échantillon) Temps d'exécution (moins d'une semaine)
Quelle est la principale difficulté lors de l’extraction du génome virale pour le séquençage à haut débit?
Séparer les acides nucléiques viraux des autres sources d’acides nucléiques
Quelles sont les facteurs à faire attention lors de l’isolement virale?
Conserver les échantillons à -70C
Milieu de transport adéquat
Envoyer au laboratoire diagnostique le plus rapidement possible
L’isolement viral peut se faire à partir de 3 types d’inoculations, nommez les:
Inoculation à des animaux de laboratoires
Inoculation In Ovo
Inoculation dans des cultures cellulaires (cellules embryonnaires = les best)
Comment évalue-t-on la réponse d’anticorps contre un virus?
Par sérologie, titrage d’anticorps, à l’aide de sérums pairés. Si la quantité d’anticorps a augmenté lors de la 2e prise de sang, il s’agit d’une infection récente. Si des IgM sont présents, c’est une infection récente.
À quoi faut-il faire attention lorsqu’on envoie un échantillon au laboratoire pour ISOLEMENT VIRAL?
1) Envoyer le plus rapidement possible
2) Échantillon devrait être gelé ou réfrigérer le plus rapidement possible après la collection (meilleur= glace sèche)
3) Envoyer dans un milieu de transport souhaitable (ex: lait écrèmé stérile, milieu de transport à base de charbon…_
4) Tissus (séparer les pièces d’intestins des autres pour évtier la contamination)
À quoi faut-il faire attention lorsqu’on envoie des spécimens pour TESTS SÉROLOGIQUES?
1) Meilleure façon de procéder= sérums pairés
2) Laisser l’échantillon se coaguler à température pièce
3) Centrifuger l’échantillon et transférer le sérum dans des tubes stériles le plus aseptiquement possible
4) Réfrigérer l’échantillon et l’envoyer au lab sur la glace
À quoi faire attention lorsqu’on envoie des spécimens pour HISTOPATHOLOGIE?
1) Ne pas geler le tissus
2) Des petites sections de 2-3 cm de tissus devraient être placées de 10% de formaline
3) On peut maintenant effectuer le diagnostique sur du tissu congelé comme la PCR qui est plus sensible sur du tissu congelé que formolé
