Vårt mikrobiom

Question 1

Ge exempel på en behandlingsmetod som är hyfsat modern inom just mikrobiom

Answer 1

• Fekal mikrobiota transplantation vid Clostridium dificille – fungerar bättre än antibiotika
  
  • Undersöks om det skulle fungera vid inflammatorisk tarmsjukdom

Question 2

• Summan av genetiskt information från både värd och mikrobiota

Answer 2

Hologenom

Question 3

• Organismen med alla dess associerade symbiotiska mikrober

Answer 3

Holobiont

Question 4

Hologenom teori om evolution

Vilka “bevis” finns för detta?

Answer 4

• Bevis för detta genom mitokondrier och kloroplast som troligen kommer av intracellulära bakterier
• Stora delar av vårt genom har mikrobiellt ursprung
• 3 ggr fler bakterier i kroppen än celler
  
  • 1 000 000 gener i mikrobiomet och bara 22 000 i våra celler

Question 5

Karaktärisering av mikrobiomet

Hur kan detta göras?

Answer 5

• 16s-sekvensering
  
  • 16s-genen hos bakterien (dess ribosom) – ribosomen, mkt konserverad
  • Kopieras upp genom PCR – kan då skilja på olika bakterier
• Vilka gener som uttrycks på RNA-nivå
• Masspektromi – vilka proteiner som uttrycks
• Metaboliter

Question 6

Stora olikheter av mikrobiom

• Beroende på lokalisation – ex hud, olika delar av tarm osv

Mkt av kunskapen vi har baseras på sammansättning i?

Answer 6

Avföringsprover

Question 7

Ge ett par exempel på brister som uppkommer hos djur som fötts upp steril

Answer 7

• Dåligt utvecklat immunsystem lokalt och perifert
  
  • Ökad känslighet för patogener
• Mindre antimikrobiella substanser
• Mindre mukus
• Tunnare tarmvägg
• Mindre intestinal yta
• Förstorad cecum
  
  • Fibrer brukar brytas ned av tarmfloran där men nu ansamlas
• Kräver vit-K och vit-B
  
  • Produceras av normalflora
• Sämre energiupptag (kan inte bryta ned ex fibrer) och ökad retentionstid (allt tar längre tid i GI-tract)

Question 8

Vilken åldersrelaterad skillnad kan ses i mikrobiomet?

Answer 8

• Låg mångfald och stabilitet hos spädbarn och äldre

Question 9

När sker de första kontakterna med mikrobiom?

Answer 9

• I magen genom IgG som kan ha mikrobiella komponenter bundet
• Vid förlossning vaginalflora och tarmflora från moder
  
  • Kejsarsnitt gör att detta uteblir – blir mer utsatt för hudbakterier och delar inte lika mkt av mikrobiomet med sin mamma
    
    • Många bacteroides uteblir, finns här många med immunomodullerande effekter
• Bröstmjölk som innehåller mikrobiom liksom IgA-antikroppar