Variants génétiques Flashcards

1
Q

Quel type de lien lie les brins d’ADN?

A

Liens hydrogènes (lien faible afin que les brins puissent se défaire facilement)

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Q

Quelle molécule est à l’extrémité 3’ ?

A

OH terminal

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3
Q

Quelles sont les lettres correspondant au bras court et au bras long du chromosome?

A

bras court = p

bras long = q

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4
Q

Quelle est l’organisation des brins d’ADN?

A

Déployés dans sens contraires
3’-GATT-5’
5’-AATC-3’

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5
Q

Que représente les parties suivantes du gène :

  • Exon?
  • Intron?
  • Promoteur?
A
  • Exon = portion codante du gène
  • Intron = portion non codante du gène
  • Promoteur = séquences sur lesquelles se fixe les facteurs de transcription
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6
Q

Combien y a-t-il de combinaisons possibles de codons?

A

64 combinaisons

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7
Q

Combien y a-t-il de bases pour chaque codon?

A

3 bases (lettres)

ex : AUG

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8
Q

Qu’est-ce qui différencie l’ARN de l’ADN?

A
  • Ribose (OH)
  • Base U (uracile)
  • Simple brin
  • Court
  • Moins stable
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9
Q

En quoi consiste la nomenclature de la position d’un gène?

ex : 7q12.3

A
7 = # du chromosome (1 à 23)
q = bras long
1 = région
2 = bande
3 = sous-bande
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10
Q

Qu’est-ce qu’un polymorphisme (SNPs) ?

A

Modification d’un nucléotide dans génome d’un individu

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11
Q

À quel moment un variant génétique est considéré comme une mutation?

A

Lorsque cette variation génétique est présente chez moins de 1% de la population

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12
Q

Sur quelles parties d’un gène les polymorphismes peuvent-ils se retrouver?

A

Sur région codante (exon) et non codante (intron)

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13
Q

Quels sont les types de polymorphismes sur la région codante du gène?

A

-Synonyme (ne change pas séquence protéique)

-Non-synonyme (change la séquence protéique)
= faux-sens (un autre a.a.)
= non-sens (codon stop)

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14
Q

Que se passe-t-il lorsqu’un polymorphisme affecte une région non codante d’un gène?

A

Affecte régulations (épissage, etc.)

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15
Q

Qu’est-ce qu’une maladie somatique?

A

Maladie non transmissible puisqu’elle a été acquise dans le génome d’une cellule à la suite d’une agression

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16
Q

Quelles sont les 2 méthodes d’identification des polymorphismes qui ne sont pas à grand débit?

A
  • Séquençage

- Génotypage

17
Q

Quelle méthode d’identification des polymorphismes doit être utilisée lorsque le loci (section précise du gène) est CONNU?

A

Génotypage

18
Q

Quelle méthode d’identification des polymorphismes doit être utilisée lorsque le loci (section précise du gène) est INCONNU?

A

Séquençage

19
Q

Qu’est-ce qui différencie les méthodes d’identification de polymorphisme à haut débit des 2 autres méthodes?

A

Haut débit
= grande quté
= génome au complet

20
Q

Lors d’analyses de données, que représente le risque relatif?

A

Rapport entre risque groupe traité et risque groupe témoin
–> risque < 1 signifie que :
risque groupe témoin > risque groupe traité

21
Q

Lors d’analyses de données, que représente le rapport de cotes?

A

Risque de développer maladie (pas le fait d’avoir la maladie)
–> Cote de 1 = absence d’effet

22
Q

Quelles sont les 3 isoformes de l’ApoE?

A

ApoE2
ApoE3
ApoE4

23
Q

Quelle isoforme d’ApoE est la plus courante et considérée comme ‘‘normale’’?

A

ApoE3

24
Q

Concernant les risque de maladies cardiovasculaires, quels sont les effets de l’ApoE4 et de l’ApoE2?

A

E4
= haute [LDL-cholestérol]
= risque cardiovasculaire accru

E2
= faible [LDL-cholestérol]
= haute [Triglycérides]
= risque cardiovasculaire accru pour gens ayant E2/E2

25
Q

Concernant le risque de développer de l’Alzheimer, quels sont les effets de l’ApoE4 et de l’ApoE2?

A

E4
= risque accru

E2
= risque moindre