Unidad 5: Análisis genómicos. Flashcards
Definición de muestra biológica.
Colección de muestras humanas y datos con fines de investigación
Comprenden la ciencia de la biospecimen
- Protocolos y prácticas involucradas en la recolección, procesamiento y almacenamiento de muestras.
Cosas importantes a saber de las muestras
- Objetivo del estudios
- tipo de muestra
- Análisis que se va a hacer
- cuántos especímenes se necesitan.
- Tamaño de la muestra
- protocolo de recolección
- almacenamiento
- envío de la muestra
Es lo más importante para tomar una muestra
Objetivo del estudio
Es el método de recolección de muestra de sangre más aceptado.
Vacutainer
Es importante saber esto en toma de muestra de especímenes de autopsia
Intervalo de tiempo entre la muerte, toma de muestra y procesamiento de la misma.
Las muestras se procesan de acuerdo al ___.
Diseño del estudio y los métodos más apropiados para preservar los analitos de interés
Es la forma más rentable de preservar los linfocitos viables para recuperación de AND
Crioconservación
La crío conservación implica el uso de un crioprotector como ___.
Dimetilsulfóxido
Una consideración especial en el procesamiento de ADN en saliva es ___, que requiere cuantificación por medio de __.
El alto porcentaje de DNA bacteriano, PCR tiempo real.
La relación ______ es una medida aproximada de ma pureza del DNA y la contaminación de proteínas
A260 / A280
Otra forma de medir la pureza del adn es ___.
Electroforesis en gel
El _____ es menos estable que el ADN y es más dificil de extraer.
ARN
Se usa para cuantificar mRNA en una célula.
Northern Blot y RT-PCR
Método de cuantificación de mRNA donde una sinda radioactiva se une al RNAm fijo.
Northern blot
Método de cuantificación de RNAm donde se genera una cadena de cDNA y se amplifica con PCR
TR-PCR
En los métodos de cuantificación de RNAm el principio fundamental es ___ pero su debilidad es ___.
La hibridación de RNA / la detección
Método de cuantificación de RNAm quw incorpora fluoróforos a la doble cadena naciente.
RT-PCR
¿Qué son los microarreglos?
Formas de analizar matrices de proyectos para tener análisis y registros de datos.
Elementos de los microarreglos:(2)
- Target: Molécula libre.
- Sonda: Fija al chip
¿Qué nos permiten analizar los microarreglos?(3)
- citologías
- proteínas
- Ac.nucleicos
Porqué no hay problema con el tamaño de la muestra en loa microarreglos?
Hace cortes tan pequeñitos que no importa el tamaño
El el gold standar para cuantificar RNA y DNA
PCR tiempo real
Nos permite cuantificar DNA amplificado.
PCR tiempo real
Seguda vetaja de la PCR tiempo real despues de cuantificar ADN
Precisión y sensibilidad
Es indispensable que el la porción del gen inmovilizada del microarreglovtwbga ___.
Su cédula de identificación
Las sondas son produxidas por amplificación de cDNA por PCR
Microarray de ac.nucleicos
Las sondas son porciones de DNA sintéticas de cadena simple.
Microarrays de oligonucleotidos
Las sondas son anticuerpos fijados a portaobjetos.
Microarrays de proteínas
Esta técnica trata de resolver el problema del tamaño limitado de la muestra.
Microarrays de tejidos
PCR que se usa principalmente para amplificar ADN específico, clonación y biología molecular
Tiempo real
PCR que mide la cantidad de ADN
Tiempo real
Pasos de la PCR tiempo real (1)
Desnaturalización
Anneling: Tm, para hibridar la secuencia complementaria.
Extension: 70-72 grados, polimerasa
Es uno de los ñrincipales factores que afectan el rendimiento de la PCR
Que la polimerasa Taq tiene actividad resudual a bajas temperaturas
Al diseñar un primer el amplicon debe medir _____pb
50-150
Al diseñar un primer, el primer debe medir ____nucleoticos.
18-24
