tumor Flashcards
nonsense mutation
若nucleic acid的突變影響轉譯出的 amino acid 序
homozygous deletion
double strand deletion
Relationship of DNA insertion with poxvirus
Retrovirus 會把自己的基因隨機插入 host DNA。如果病毒 promoter 位置剛好接近 host 的 encode gene,就會造成這個 encode gene 被大量表現。由於不是細胞自主表現因此無法有效調節,也會造成 host 製造出異常蛋白質或產物夾雜病毒蛋白質。例如 Papillomavirus 造成乳突瘤、Poxvirus 造成皮膚腫瘤 (參見 ppt P.7 圖表)
Frameshift mutation
當插入、缺失的核苷酸不是 3 的倍數時,會導致後續轉譯整個亂掉、製造出異常蛋白質,也可能會發生新切割位出現、stop codons 提前出現等問題。
Aneuploidy
- 定義:細胞 mitosis 時染色體沒有正常分裂,造成 monosomy(單套染色體)和 trisomy(三套染色體)出現。
- 和胞器(尤其是中心粒)異常有關。
- 看切片時會發現 atypical mitosis。
- 染色體不穩定 Chromosomal instability
- 定義:當 DNA defect 無法正確修復、端粒功能異常或長度不足時,會導致基因容易突變。
- 若細胞的端粒異常(太短),polymerase 會無法黏著,影響 DNA 合成,錯誤率上升。Atypical Karyotype (human♂)
- 核型(karyotype):指細胞的染色體組成。核型異常可能是因為重複、缺失、異位(比如勾到別人、斷掉、長度不對等等)。
- 舉例:human chronic myeloid leukemia 病患往往都有 9 號和 22 號染色體互換(translocation)的情形。
human chronic myeloid leukemia
human chronic myeloid leukemia 病患往往都有 9 號和 22 號染色體互換(translocation)的情形。
Euchromatin
纏繞較鬆散而容易被表現。
BHD gene of German Sheperd, what disease??
- BHD gene:在德國牧羊犬造成 Hereditary multifocal renal cystadenocarcinoma (遺傳性多發腎臟囊狀上皮癌)以及 nodular dermatofibrosis(皮膚上的 fibrosis nodule)。
CpG island
- 在基因前段的 promoter 前通常會有一段 CpG island(含大量 continuous CG sequence),Methylation通常接在此處的 cytosine 上。
- 當一段基因過度甲基化(hypermethylation)時,便不易被 DNA polymerase 接上,因此不被表現。
- 腫瘤細胞中常見 hypomethylation,因此會有很多基因過度表現;但也有不少基因的 promoter 和 first exon 是 hypermethylation 狀態。若 hypermethylation 的部分剛好是抑制腫瘤的基因就可能導致腫瘤產生。
biallelic expression
- 一個細胞中的兩套 chromosome 不一定會同時表現,通常只表現其中一套而另一套休止。
- 當 imprinting 出現異常時會產生 biallelic expression(兩套基因同時表現)導致基因過度表現。
- 若這個基因與 growth factor 或 encode gene 相關時便容易引發腫瘤)
miRNA
MicroRNA(miRNA)是一段 18~25 bps 的 RNA,在核內產出/切割後來到核外和mRNA 結合干擾 ribosome 運作,進而抑制 mRNA 轉譯,甚至使 mRNA 降解。除了noncoding region 外,miRNA 的序列也會出現在部分 encoding region 中並在裁切 mRNA 時被釋出。被 miRNA 調控的基因大多和細胞生長、凋亡等活動有關。
miRNA 的形成:Noncoding DNA
(黃/橙色片段)轉錄後會在核內和核外經過裁切形成 miRNA。
miRNA 可以和 mRNA 形成互補, 讓 ribosome 卡住而無法繼續合成蛋白質。
1 條 miRNA 可以同時調控近 200
條 target mRNA(人類的數據)
有 約 1/3 的 mRNA 受 miRNA 調控。
miRNA 異常會導致腫瘤產生。
Driver mutation
突變出現在 oncogene、tumor suppressor gene、modifier gene 或影響 DNA修復時就稱為 driver mutation。是決定細胞轉換成腫瘤細胞與否的關鍵
how EGFR dysfunction cause tumorgenesis
- EGFR 的活化機制:
- Growth factor 接上 EGFR
- RAS 上的 GDP 磷酸化,具有活性。
- 接上 RAF-1 並活化 MAPK pathway
- 促使細胞進入 cell cycle 進行分裂
- RAS 活化後若接上 GAP,則活化 GTPase 來水解 GTP 以解除活化。
- GTPase 失去活性會造成 MAPK 不斷被活化,使細胞一直分裂 ,最終變成腫瘤細胞。a
Haploinsufficiency
有些蛋白質只要有一半出現異常,就可能因為無法維持生理平衡而會引發腫瘤。
P53
DNA-binding protein, DNA 受損時能暫停細胞機能、協助細胞修復,甚至在無法修復的情況下引起細胞凋亡。若 p53 異常,無法正確修復 DNA 或停止細胞分裂, mutation 便會不停堆積最後導致腫瘤產生。