tumor Flashcards

1
Q

nonsense mutation

A

若nucleic acid的突變影響轉譯出的 amino acid 序

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2
Q

homozygous deletion

A

double strand deletion

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3
Q

Relationship of DNA insertion with poxvirus

A

Retrovirus 會把自己的基因隨機插入 host DNA。如果病毒 promoter 位置剛好接近 host 的 encode gene,就會造成這個 encode gene 被大量表現。由於不是細胞自主表現因此無法有效調節,也會造成 host 製造出異常蛋白質或產物夾雜病毒蛋白質。例如 Papillomavirus 造成乳突瘤、Poxvirus 造成皮膚腫瘤 (參見 ppt P.7 圖表)

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4
Q

Frameshift mutation

A

當插入、缺失的核苷酸不是 3 的倍數時,會導致後續轉譯整個亂掉、製造出異常蛋白質,也可能會發生新切割位出現、stop codons 提前出現等問題。

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5
Q

Aneuploidy

A
  1. 定義:細胞 mitosis 時染色體沒有正常分裂,造成 monosomy(單套染色體)和 trisomy(三套染色體)出現。
  2. 和胞器(尤其是中心粒)異常有關。
  3. 看切片時會發現 atypical mitosis。
  4. 染色體不穩定 Chromosomal instability
    1. 定義:當 DNA defect 無法正確修復、端粒功能異常或長度不足時,會導致基因容易突變。
    2. 若細胞的端粒異常(太短),polymerase 會無法黏著,影響 DNA 合成,錯誤率上升。Atypical Karyotype (human♂)
  5. 核型(karyotype):指細胞的染色體組成。核型異常可能是因為重複、缺失、異位(比如勾到別人、斷掉、長度不對等等)。
  6. 舉例:human chronic myeloid leukemia 病患往往都有 9 號和 22 號染色體互換(translocation)的情形。
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6
Q

human chronic myeloid leukemia

A

human chronic myeloid leukemia 病患往往都有 9 號和 22 號染色體互換(translocation)的情形。

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7
Q

Euchromatin

A

纏繞較鬆散而容易被表現。

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8
Q

BHD gene of German Sheperd, what disease??

A
  1. BHD gene:在德國牧羊犬造成 Hereditary multifocal renal cystadenocarcinoma (遺傳性多發腎臟囊狀上皮癌)以及 nodular dermatofibrosis(皮膚上的 fibrosis nodule)。
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9
Q

CpG island

A
  1. 在基因前段的 promoter 前通常會有一段 CpG island(含大量 continuous CG sequence),Methylation通常接在此處的 cytosine 上。
  2. 當一段基因過度甲基化(hypermethylation)時,便不易被 DNA polymerase 接上,因此不被表現。
  3. 腫瘤細胞中常見 hypomethylation,因此會有很多基因過度表現;但也有不少基因的 promoter 和 first exon 是 hypermethylation 狀態。若 hypermethylation 的部分剛好是抑制腫瘤的基因就可能導致腫瘤產生。
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10
Q

biallelic expression

A
  1. 一個細胞中的兩套 chromosome 不一定會同時表現,通常只表現其中一套而另一套休止。
  2. 當 imprinting 出現異常時會產生 biallelic expression(兩套基因同時表現)導致基因過度表現。
  3. 若這個基因與 growth factor 或 encode gene 相關時便容易引發腫瘤)
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11
Q

miRNA

A

MicroRNA(miRNA)是一段 18~25 bps 的 RNA,在核內產出/切割後來到核外和mRNA 結合干擾 ribosome 運作,進而抑制 mRNA 轉譯,甚至使 mRNA 降解。除了noncoding region 外,miRNA 的序列也會出現在部分 encoding region 中並在裁切 mRNA 時被釋出。被 miRNA 調控的基因大多和細胞生長、凋亡等活動有關。

miRNA 的形成:Noncoding DNA

(黃/橙色片段)轉錄後會在核內和核外經過裁切形成 miRNA。

miRNA 可以和 mRNA 形成互補, 讓 ribosome 卡住而無法繼續合成蛋白質。

1 條 miRNA 可以同時調控近 200

條 target mRNA(人類的數據)

有 約 1/3 的 mRNA 受 miRNA 調控。

miRNA 異常會導致腫瘤產生。

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12
Q

Driver mutation

A

突變出現在 oncogene、tumor suppressor gene、modifier gene 或影響 DNA修復時就稱為 driver mutation。是決定細胞轉換成腫瘤細胞與否的關鍵

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13
Q

how EGFR dysfunction cause tumorgenesis

A
  1. EGFR 的活化機制:
    1. Growth factor 接上 EGFR
    2. RAS 上的 GDP 磷酸化,具有活性。
    3. 接上 RAF-1 並活化 MAPK pathway
    4. 促使細胞進入 cell cycle 進行分裂
  2. RAS 活化後若接上 GAP,則活化 GTPase 來水解 GTP 以解除活化。
  3. GTPase 失去活性會造成 MAPK 不斷被活化,使細胞一直分裂 ,最終變成腫瘤細胞。a
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14
Q

Haploinsufficiency

A

有些蛋白質只要有一半出現異常,就可能因為無法維持生理平衡而會引發腫瘤。

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15
Q

P53

A

DNA-binding protein, DNA 受損時能暫停細胞機能、協助細胞修復,甚至在無法修復的情況下引起細胞凋亡。若 p53 異常,無法正確修復 DNA 或停止細胞分裂, mutation 便會不停堆積最後導致腫瘤產生。

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16
Q

MLH1 和 MSH2

A
  1. 不只外來因素(UV、化學物質)會引發修復功能異常。因為 DNA 在合成時本來就會有一定的出錯率,正常細胞內會有 MLH1 和 MSH2 負責修復 mismatched DNA pair。若這兩個 protein 異常無法好好更正錯誤,會造成 mutation fixation,當累積到一定程度便可能會有腫瘤產生。
17
Q

Ptaquiloside

  1. 羊齒蕨內的 Ptaquiloside 經牛食入、代謝後的產物會引起血尿,也會累積在膀胱引起腫瘤。
  2. 在 Indirect-acting carcinogens 還沒有被代謝以前都稱 Procarcinogen。
  3. 大多 carcinogen 都是 procarcinogen,所以大多數的 carcinogen 屬於 indirect- acting carcinogen。
  4. 大多與 DNA 形成covalent bond而造成 DNA 異常,repair 較困難
A
18
Q

Insertional mutagenesis mechanism of virus and list an example

A
  1. 病毒將自己的 DNA 隨機插入宿主 DNA,造成鄰近病毒 promoter 的基因不當活化或引發 frameshift mutation。
  2. e.g. avian leucosis virus
19
Q

Hit-and-run mechanism of virus and list example

A
  1. 細胞本身即具有 oncogene,當病毒感染細胞後 oncogene 會被活化而致癌, but then the virusu run away
  2. e.g. bovine papilloma virus
  3. Dominant oncogene mechanism 和 Insertional mutagenesis mechanism 發生時可以在細胞內發現病毒抗原,但 Hit-and-run 發生時細胞內找不到抗原!
20
Q

Marek’s disease causing tumor

A
  1. Herpesvirus 感染鳥類時會先殺死宿主的 B cell 和 T cell,導致宿主免疫系統失效無法清除腫瘤細胞,最終造成 T cell lymphoma。
  2. Marek’s disease 臨床上分三型:
    1. 內臟型:內臟白色斑塊
    2. 神經型:臨床上出現劈腿的現象,坐骨神經變粗。
    3. 眼型:眼部出現腫瘤
  3. 組織切片可見大量 lymphocyte 狀的腫瘤細胞浸潤(於肌肉、神經等部位)
21
Q

Shope fibroma virus with cancer formation

A
  1. Shope fibroma virus 感染兔子後會產生和 epidermal growth factor (EGF)相關的蛋白,導致上皮過度增生、角化等等症狀。
22
Q

Xenografts in animal model

A

將外來腫瘤細胞移植到免疫缺陷老鼠(immunodeficient mouse)身上。

23
Q

transgene

A

將其他動物的基因轉殖到老鼠身上進行研究。

24
Q

knockout in animal model

A

將老鼠原本的基因去除,讓老鼠不帶特定基因。可以研究某些特定基因對於腫瘤發展的重要性。

25
Q

Wright’s stain 或 Diff-Quik stains

A

屬於常規檢查方式, 細胞學判斷腫瘤來源以利治療

  1. 多用 Wright’s stain 或 Diff-Quik stains 協助檢測。
  2. 多使用針頭取樣,用於評估腫瘤團塊的組成
26
Q

What cytokeratin indicates in immunohistochemistry?

A
  1. carcinoma 或上皮來源的腫瘤會呈現陽性。
27
Q

what vimentin indicates in immunohistochemistry?

A
  1. mesenchymal 來源的腫瘤會呈現陽性。
  2. 特例:Mesotheliomas 和 synovial cell sarcomas 和 EMT (epithelial mesenchymal transition carcinoma)會呈現雙陽性
28
Q

Teratomas

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A
  • Teratomas (benign) and teratocarcinomas (malignant)
    (1) 定義:要看到兩種胚層以上的腫瘤細胞
    (2) 全分化性(totipotential) 的germ cell

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29
Q

if now both cytokeratin and vimentin are positive in imuunohistochemistry, what tumor most probable?

A

Mesotheliomas 和 synovial cell sarcomas 和 EMT (epithelial mesenchymal transition carcinoma)會呈現雙陽性

30
Q

clonality assay

A
  1. 用來分辨腫瘤屬於 lymphoid hyperplasia 還是 lymphoma。因為除了以上兩種通常是 polyclonal,其他腫瘤幾乎都是 monoclonal。
  2. 可以用 PCR 鑑定 receptor rearrangement 來分辨是 polyclonal 或 monoclonal。
  3. 特例:狗感染艾利希體會導致 monoclonal lymphocyte population
31
Q

cytogenetic analysis

A
  1. 分辨 leukemia 和 lymphoma。
  2. 檢查 tumor lymphocyte 在染色體上的異常或異位,並可藉判讀結果給病人分級或對症下藥。
32
Q

Predigree analysis

A

類似族譜分析,用來分析某個個體是否容易產生遺傳性腫瘤。

33
Q

Molecular diagnostic technique

A
  1. 直接定序腫瘤細胞的基因組,可以直接看出 DNA上出的問題。
34
Q

mitotic index

A

在高倍率(400x)下,計算視野中可看到幾個 mitosis(計算十個視野並求平均),在 grading system 中是一個很重要的 criteria。

35
Q

TNM system

A

最廣泛使用的量表。T 為腫瘤大小(T0~4);N 指淋巴結是否有腫瘤轉移及轉移遠近(N0~3);M 指腫瘤是否有轉移到其他臟器(M0~2)。根據不同狀況給予分數。但不同單位可能有不太一樣的判別標準。

36
Q
A
37
Q

Hemartomas

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A

Hemartomas缺陷瘤

不正常的(長得醜的)組織型態長在normal anatomic location。不代表是腫瘤細胞,只是細胞型態較怪異。

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38
Q

Choristomas

A

迷離瘤

正常分化良好的組織長在不正確的位置(ectopic site、長錯位置了)

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