Trascrizione eucariotica Flashcards

1
Q

quali sono i tipi di RNA polimerasi eucariotiche e che tipo di RNA trascrivono?

A

89

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Q

come è costituita la RNA polimerasi II eucariotica?

A

90

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3
Q

da cosa sono costituiti i promotori dei geni trascritti da RNA polimerasi II?

A

90 91

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4
Q

dove si trova rispetto alla regione da trascrivere la TATA box e che tipo di fattori di trascrizione lega?

A

91

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Q

dove si trova il box BRE nel promotore eucariotico rispetto alla regione da trascrivere e che tipo di fattori di trascrizione lega?

A

91

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6
Q

in che cosa consiste la sequenza initiator vicina al sito di trascrizione?

A

91

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7
Q

dove si trova l’elemento DPE rispetto alla sequenza da trascrivere negli eucarioti?

A

91

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8
Q

che cosa si intende con sequenze in Cis e sequenze in trans parlando di geni nella trascrizione?

A

91

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9
Q

come vengono definiti i fattori di trascrizione che si legano al copromoter nella trascrizione eucariotica?

A

92

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10
Q

come avviene la formazione del complesso di inizio trascrizione nel caso di RNA polimerasi II?

A

92 93

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11
Q

cosa sono i trascritti abortivi?

A

93

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12
Q

quale è il significato di geni housekeeping?

A

93

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13
Q

a che tipo di fattori di trascrizione si lega il promotore della RNA polimerasi I?

A

93 94

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14
Q

Da quali fattori è costituito il complesso di inizio trascrizione della RNA polimerasi I?

A

94

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15
Q

dove si trova il promotore nel caso dei geni trascritti da RNA polimerasi III, e che tipo di fattori di trascrizione recluta?

A

94

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16
Q

quali sono le differenze nella regolazione dell’ espressione genica tra eucarioti e procarioti?

A

95

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17
Q

quale è la differenza tra geni housekeeping e geni tessuto specifici?

A

95

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18
Q

oltre ai fattori di trascrizione, quali sono le altre regioni regolatorie che legano la trascrizione?

A

95

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19
Q

a cosa si legano enhancers e silcencers?

A

95

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20
Q

quale è l’ azione dei mediatori nella regolazione dell’ espressione genica?

A

96

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21
Q

cosa sono i geni reporter?

A

96

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22
Q

quale è l’azione degli enhancers multipli che regolano lo stesso gene?

A

96

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23
Q

quali sono le differenze tra regolazione spazio-specifica e regolazione tempo-specifica nel caso degli enhancers?

A

96 97

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24
Q

cosa sono gli homeotic genes?

A

97

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25
Q

perché sono importanti i fattori di trascrizione e in cosa consiste il loro effetto combinatorio?

A

97

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26
Q

in cosa consiste il dominio attivatore e il dominio di legame con il DNA dei fattori di trascrizione?

A

98

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27
Q

quali sono le 4 grandi famiglie in cui si possono dividere i fattori di trascrizione a seconda della conformazione del loro dominio di legame col DNA?

A

98

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28
Q

in cosa consiste il DNA footprinting?

A

99

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29
Q

in cosa consiste il metodo del gel mobility shift assay?

A

99

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30
Q

oltre alla formazione del complesso di inizio trascrizione negli eucarioti, di cosa bisogna tenere conto per l’inizio della trascrizione?

A

100

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31
Q

quale è l’enzima che provvede ad acetilare gli istoni e sciogliere i nucleosomi, e quale invece si occupa di deacetilare gli istoni?

A

100

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32
Q

in quali modi può essere rimodellata la posizione degli istoni funzionale all’inizio della trascrizione?

A

100

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33
Q

quali sono i tipi di modificazioni a cui gli istoni possono andare incontro?

A

100

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34
Q

quale è l’azione dell’ enzima HAT?

A

101

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35
Q

quali sono le regioni che provvedono a risolvere il problema della possibile attivazione di geni adiacenti nel processo di inizio trascrizione (dovuto alla presenza di cromatina ancora compatta)?

A

102

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36
Q

come viene liberata la TATA box dalla cromatina grazie agli ormoni nei vari step?

A

102 103

37
Q

che tipo di enzimi vengono reclutati dai silencers nei corepressori per ricompattare la cromatina?

A

103

38
Q

perché sono importanti le modificazioni post trascrizionali e perché contraddistinguono le cellule eucariotiche da quelle procariotiche?

A

103

39
Q

quali sono le modificazioni post trascrizionali che vengono fatte su un trascritto di RNA messaggero?

A

104

40
Q

in cosa consiste il capping?

A

105

41
Q

quali sono le funzioni del capping?

A

105

42
Q

quali sono gli enzimi coinvolti nella formazione del cap in 5’ in ordine?

A

105

43
Q

in cosa consiste il tailing del trascritto di mRNA?

A

106

44
Q

da quale enzima vengono aggiunte le A a formare la coda di poliA?

A

106

45
Q

cosa sono le sequenze senza senso e quando vengono trascritte (tailing)

A

106

46
Q

quali sono le funzioni del tailing?

A

106

47
Q

come si forma il complesso necessario alla poliadenilazione?

A

107

48
Q

quali sono le caratteristiche degli introni?

A

107 108

49
Q

come sono stati scoperti gli introni?

A

108

50
Q

cosa sono le sequenze consensus

A

108

51
Q

Quali sono i complessi che fanno avvenire il processo di splicing?

A

108

52
Q

da cosa sono costituiti gli spliceosomi?

A

108

53
Q

da cosa sono costituiti i complessi snRNP?

A

108

54
Q

quali sono gli specifici snRNA coinvolti nel processo di splicing?

A

108

55
Q

come si chiamano le sequenze che presentano i punti di giunzione tra introne ed esone?

A

108 109

56
Q

quali sono le tre sequenze consenso che riconoscono gli specifici complessi snRNP?

A

109

57
Q

Come avviene il processo di splicing passando per complesso E, A, B C?

A

109

58
Q

cosa prevede lo splicing alternativo e perché è un meccanismo importante?

A

110

59
Q

quali sono alcuni esempi nel genoma umano in cui avviene splicing alternativo?

A

110

60
Q

quali sono le diverse modalità di splicing convenzionale?

A

110

61
Q

Come avviene la regolazione dello splicing su esoni ed introni per mezzo di enhancers e silencers?

A

111

62
Q

quali attivatori e repressori si legano rispettivamente ad ESE, ISE e ESS, ISS

A

111

63
Q

quali sono esempi di mutazioni a carico dello splicing?

A

111

64
Q

a cosa è dovuta la talassemia in relazione allo splicing?

A

112

65
Q

a cosa è dovuta la fibrosi cistica in relazione allo splicing?

A

112

66
Q

a cosa è dovuta la fibrosi cistica in relazione allo splicing?

A

112

67
Q

in cosa consiste il processo di splicing non convenzionale per mezzo di spliceosoma minore?

A

112

68
Q

in cosa consiste il processo di trans-splicing?

A

112

69
Q

in cosa consiste il processo non convenzionale di self splicing?

A

113

70
Q

come viene eseguito self splicing per introni del gruppo I?

A

113

71
Q

come viene eseguito self splicing per introni del gruppo II?

A

113

72
Q

in cosa consiste il vantaggio di tipo funzionale dello splicing?

A

113

73
Q

in cosa consiste il vantaggio di tipo evolutivo del splicing?

A

113

74
Q

quali sono i 4 punti della teoria di rimescolamento degli introni?

A

114

75
Q

su che base poggiano la teoria dell’ origina antica e dell’ origine moderna/esonica degli introni?

A

114

76
Q

è possibile che nei procarioti siano presenti degli introni?

A

115

77
Q

che tipo di modificazioni sono alla base del processo di editing dell’ RNA?

A

115

78
Q

quali sono le tipologie di editing possibili a livello dell’ RNA?

A

115

79
Q

in cosa è suddiviso l’editing per sostituzione?

A

115 116

80
Q

in cosa consiste l’ editing A to I catalizzato da ADAR?

A

116

81
Q

in cosa consiste l’editing C to U catalizzato da APOBEC-1

A

116

82
Q

come è coinvolto il processo dell’ editing per la trascrizione del gene che codifica per il recettore AMPA?

A

116

83
Q

come è coinvolto l’editing per il gene che trascrive per apolipoproteina B?

A

116

84
Q

in cosa consiste l’editing per inserzione o delezione?

A

116

85
Q

quali sono le strutture presenti nell’ mRNA maturo e che servono a contraddistinguerlo dall’ mRNA primario?

A

117

86
Q

quali strutture rimangono nell’mRNA e quali no dopo che esso fuoriesce dal nucleo?

A

117

87
Q

a cosa servono le sequenze non tradotte che si trovano all’ inizio e alla fine dell’ mRNA?

A

118

88
Q

cosa sono le scienze omiche?

A

117