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Biochimie 2 > Réplication et répartition de l’ADN > Flashcards

Réplication et répartition de l’ADN Flashcards

1
Q

Quels sont les 3 postulats de réplication d’ADN ?

A

Semi-conservative: brin parent+nv brin
Conservative: les 2 positions d’ADN sur les 2 brins sont répliqué~>cell fille identique à parent
Dispersive: section discontinue d’ADN utilisé pour réplication, contient partie de brin parent et partie nouvelle

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2
Q

Par quoi est catalysé la synthèse d’ADN ?
Que requiert cette synthèse ?

A

Par ADN polymérase
Nécessite desoxynucleoside 5’-triP
Nucleoside~>ATC ou G
Need amorce avant de commencer ARN

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3
Q

Les origines de réplication sont des régions riches en…

A

AT

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4
Q

Rôle de l’hélicase ?

A

Sépare le double brin d’ADN en en 2 brins-matrices

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5
Q

Que possède l’E coli ?

A

Une protéine, produit du gène dnaE

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6
Q

Rôle de la protéine d’E coli ?

A

S’attache à l’origine de réplication (séquence AT) et dénature l’hélice ADN à cet endroit pour que 2 replicateurs s’attachent à ce site et débutent la réplication du chromosomes dans les 2 sens

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7
Q

De quoi est composé l’origine de réplication chez procaryotes ?

A

3 répétitions de 13 paires bases+4 répétitions de 9pb
Déclenchent le déroulement de l’ADN par hélicase

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8
Q

Qu’est-ce que le complexe de reconnaissance d’origine de réplication ?
Son rôle ?

A

Complexe protéique composé de 6 sous-unité
Se lie à d’autres protéines pour recruter l’hélicase
Lié les origines de réplication

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9
Q

Quelle est la différence entre la réplication d’ADN chez E coli et eucaryotes ?

A

E. coli: un seul site d’origine de réplication
Eucaryotes: plusieurs sites d’amorce de réplication ADN chromosomique

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10
Q

Quelle réplication d’ADN est la plus rapide entre eucaryotes et procaryotes ?

A

Procaryotes car info génétique moins massive

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11
Q

Que possède le réplicateur ?

A

Plusieurs protéines qui catalysent des réactions nécessaire à une réplication rapide et précise
Possède machinerie capable de procéder à rx de polymérisation

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12
Q

Que requiert la synthèse du brin avancé ?

A

Amorce d’ARN (primase)
Synthétiser à l’origine de réplication

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13
Q

Avantages de l’amorce ?

A

Ajouté sans contrôle qualité
ARN peut facilement être dégradé car non ADN
Conservation de l’ADN seulement (dupliqué très fidèlement et pas d’erreurs)

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14
Q

En quoi consiste la synthèse de nouveau brin d’ADN ?

A

Adjonction de nucleotide à l’extrémité 3’ d’une chaîne préformée

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15
Q

Quels sont les 3 types d’ADN polymerase chez E. coli ?

A

ADN polymerase 1: répare ADN et prend part à synthèse d’un des brin pendant réplication
ADN polymerase II: collabore à réparation d’ADN
ADN polymerase III: composant clé du replicateur et enzyme principale de réplication ADN, assure élongation de la chaîne pdnt réplication

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16
Q

Combien d’ADN polymerase ont les eucaryotes ? Humain ?

A

Au moins 4 (alpha, bêta, gamma, delta)
14 chez humains

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17
Q

À quoi sert l’ADN polymerase gamma ?

A

À répliquer l’ADN mitochondrial

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18
Q

À quoi servent ADN polymerase alpha et delta?

A

Allonger et répliquer l’ADN

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19
Q

À quoi sert l’ADN polymerase beta ?

A

Enzyme de réparation située dans noyau

20
Q

Par quel transfert se fait l’élongation de la chaîne ADN !

A

Groupement nucleotidyl

21
Q

D’où proviennent les longues molécule ? Les courtes ?

A

Synthèse continue de brin avancé
Synthèse discontinu du brin retardé

22
Q

Rôle de primase ? Par quoi est-elle produite ?

A

Synthèse d’amorce d’ARN
Produite par l’expression génique dnaG de E coli

23
Q

Role de Rnase H ?

A

Dégrade les amorces d’ARN, replacé par ADN

24
Q

Rôle de ADN polymerase I (E coli) ou delta ? Rôle d’ADN ligase ?

A

Remplace l’amorce ARN par ADN
Fragment Okazaki reliés ensemble par ligase

25
Q

Quels sont les domaines de Rnase H ?

A

Domaine HBD (hybrid binding domain)
Domaine catalytique (H-domain)

26
Q

Comment section fait la dégradation d’amorce d ARN ?

A

Hydrolyse de l’ARN dans 2x brin hybride ADN-ARN
Libère extrémités 5’ P et 3’ OH

27
Q

Comment se fait le contrôle qualité ?

A

Polymerase ajoute un nouveau nucleotide seulement si le précédent est complémentaire au brin-matrice

28
Q

Comment section produit la fin de réplication chez les eucaryotes ?

A

Quand 2 replisome de 2 origines différentes se rencontrent

29
Q

Ou se produit la fin de la réplication de lADN chez les procaryotes ?

A

Site de terminaison
Cette zone d’ADN porte des séquences ADN de servant au site de liaison aux protéines tus, protéine de fixation au terminateur

30
Q

Rôle de protéine tus ?

A

Inhibe helicase pour que la fourche ne dépasse pas cette région
Site terminateur possède aussi séquence ADN nécessaire pour séparation des chromosome-fils suivant la réplication

31
Q

Différence entre réplication ADN procaryote et eucaryote ?

A

Taille plus grande des génome
ADN eucaryote entassé en chromatine
Plusieurs origines de réplication

32
Q

Qu’est-ce qui cause la lenteur du glissement de la couche de réplication (eucaryote) ?

A

Fixation d’histoire autour de ADN et son empaquetage en nucleosome

33
Q

Quel type d’erreur peut faire l’ADN polymerase ?

A

Mésappariement de paire base

34
Q

Comment peut-on corriger une cassure double brin ?

A

Jonction des extrémités (non-homologue)

35
Q

Comment sont réparés les molécules ADN cassées ?

A

Par recombinaison homologue

36
Q

Quelle est la réparation des lésion les + fréquente d’ADN ?

A

Excision de base

37
Q

Que font les enzyme de réparation ?

A

Corrigent certaines altération de l’ADN

38
Q

Effet d’un dimère de thymine sur la réplication d’ADN ?

A

Empêche la réplication car distordent le brin d’ADN bicatenaire

39
Q

Que provoquent les rayons UV ?

A

Créent des dimeres de thymine empilées dans l’ADN bicaténaire

40
Q

Comment résoudre le problème de dimérisation de thymine ?

A

Enzyme photoréactivatrice se fixe sur l’ADN en face du dimère de thymine et attend que la lumière active ce complexe ADN-enzyme pour inverser la dimerisation

41
Q

Rôle de l’ADN glycosylase ?

A

Catalyse l’élimination de la base altérée (dépôt d’appariement) en hydrolysant la liaison N-glycosidique

42
Q

Rôle de l’endonucléase ?

A

Reconnaît le site abasique et casse le sqeuelette de phosphate à l’endroit qui n’a pas de base azotée

43
Q

Comment la cytosine se transforme en uracile ?

A

Par desamination hydrolitique (en présence d’eau)

44
Q

Pour quels types de réparation sont utilisés les excision de nucléotide ?

A

Lumière UV et radicaux libre
Similaire à BER

45
Q

Que se passe-t-il pendant la réparation par excision de nucleotide ?

A

Hélicase reconnaît le nucléotide endommagé
Ouvre l’ADN (crée bulle)
Endonucleosome reconnaît cette ouverture et coupe le nucléotide damaged et ses voisins
ADN polymerase rajoute des nucléotide pour combler le trou et l’ADN ligase les relie

46
Q

Que causent les radicaux libres et les radiations ?

A

Cassures de la 2x hélice de l’ADN

47
Q

Rôle du Ku lorsqu’il y’a une cassure de la 2x hélice ?

A

Recrute des exonucléase et polymérase qui font le rognage et allongement des brins

Biochimie 2 (10 decks)

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