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Biologia Molecular > Replicación > Flashcards

Replicación Flashcards

1
Q

¿Qué es la replicación?

A

Es el proceso mediante el cual a partir de una molécula de DNA progenitora o parental se sintetiza una nueva, originándose así dos moléculas de DNA hijas de secuencia idéntica a la original.

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2
Q

¿Cuáles son los procesos relacionados con la replicación?

A

Recombinación, mutación y reparación

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3
Q

¿Cómo es el mecanismo de replicación semiconservadora?

A

Las dos hebras del DNA progenitor sirve de molde para la síntesis de sus respectivas hebras complementarias. Cada molécula hija de DNA está formada por una hebra progenitora y otra hija que está recién sintetizada. El mecanismo se repite en sucesivas generaciones de células. El nombre alude a que siempre se conserva la mitad de la molécula original.

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4
Q

¿Cuáles son las características principales del proceso de replicación?

A

A. Son de carácter semiconservador
B. Se realiza de maneras simultáneas en ambas hebras
C. De una forma secuencial
D. Con un carácter bidireccional
E. Origen: monofocal en procariotas y multifocal en eucariotas

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5
Q

¿Cuáles son los requerimientos de la síntesis de DNA?

A

A. Sustratos
B. Cofactores
C. Molde o plantilla
D. Cebador

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6
Q

¿Qué sustratos se utilizan en la reacción de síntesis de DNA?

A

Conjunto de los cuatro desoxinucleósidos - trifosfato:dATP, dGTP, dCTP, y dTTP. Cada uno de ellos se quedan incorporados en el DNA dNMP de la molécula.

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7
Q

¿Cuáles moléculas no sirven como sustratos en la replicación?

A

dNMP y dNDP

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8
Q

¿Cuáles son los factores asociados a la dNTP y ala polimerasa en la síntesis de DNA? Especifique in vivo e in visto

A

In vivo: Mg2+

In vitro Mn2+ y Mg2+

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9
Q

¿Cuál es la principal característica de la reacción de síntesis de DNA y cómo funciona?

A

Molde o plantilla y es el orden correcto de incorporación de los nt y viene determinado por su complementariedad de las bases con secuencia de cada hebra de DNA

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10
Q

¿Qué es un cebador?

A

Es un fragmento monicatenario que requiere la síntesis de una nueva hebra de DNA para comenzar

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11
Q

¿Qué aporta el cebador?

A

Un grupo 3’ - OH libre que es un oligonucleótiso por común RNA

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12
Q

¿Se utilizan moléculas de RNA en la replicación?

A

Si, ya que se utiliza generalmente el RNA como cebador debido a que aporta un 3’ -OH para poder comenzar la síntesis de una nueva hebra de DNA

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13
Q

¿Quién cataliza la reacción de hidrolisis del PPi a 2Pi?

A

Pirofosfatasa

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14
Q

¿Cuáles son las enzimas que actúan en la catálisis del DNA?

A

DNA polimerasas (polimerasas de DNA dirigidas por DNA).

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15
Q

¿Cómo transcurre la síntesis?

A

En dirección 5’ a 3’

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16
Q

¿Cuáles son las etapas del proceso de replicación?

A

Iniciación
Elongación
Terminación

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17
Q

¿Cuáles son las dos regiones de las cuales dependen los puntos de inicio?

A

Replicador y origen

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18
Q

¿Qué es un replicador?

A

Es la zona donde se determina la apertura inicial de la doble hebra.

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19
Q

¿Qué pasa en el origen?

A

Punto en el que se comienza la síntesis de la hebra molde de la molécula abierta

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20
Q

Explica la elongación:

A

Es la etapa de la replicación en donde se debe de continuar con el desenrollamiento de la doble hélice para así continuar con ,a síntesis de la hebra molde, este proceso que comienza en la iniciación por las proteínas iniciadoras continúa por dela de la polimerasa, que lo encabeza una horquilla de replicación. Después de que las nuevas hebras se vayan sintetizando, la doble hélice debe de volver a su estado compacto otra vez, mediante proteínas especializadas. Para todo este proceso que conlleva desenrollamiento y después su enrollamiento se necesita un como,eje de proteínas llamado replisoma.

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21
Q

¿Qué es el replisoma?

A

Es un conjunto proteícoque ayudan en la etapa de elongación para el desenrollamiento y enrollamiento subsecuente de la doble hélice de DNA

22
Q

¿¿Cuáles son las proteínas que conforman el replisoma? (Son 5)

A 
DNA polimerasa
Helicasas
Proteínas ligantes de DNA monocatenario
Topoisomerasas
Primasa
23
Q

¿Qué hacen las helicasas?

A

CuNdo el DNA se abre en el origen, estas propagan la separacion de ambas hebras, mediante una hidrolisis en donde se utiliza ATP de manera simultánea, cuando ya están creadas las dos horquillas de replicación las helicasas van por delante de las demás proteínas que conforman el replisoma y avanzan en sentidos opuestos.

24
Q

¿Qué hacen las proteínas ligantes de DNA monocatenario?

A

Evitan el re emparejamiento de las hebras

25
Q

¿Qué hacen las topoisomerasas?

A

A. Son enzimas que alteran el estado del superenrollamiento del DNA sin modificar su estructura. Inter invierten los isómeros modificando el número de vueltas de una hebra respecto a la otra (número de enlace).
B. Intervienen en los procesos de reconbinación y en la transposición, así constituyen un mecanismo básico general de modificación topológica de ,a molécula de DNA.

26
Q

¿De acuerdo a su modo de acción, cuáles son las dos familias de topoisomerasas?

A

Topoisomerasas tipo I y topoisomerasas tipo II

27
Q

¿Qué hacen las topoisomerasas tipo I?

A

Escinden de manera transitoria una hebra de DNA mientras dejan pasar la otra por la brecha abierta y vuelven a ligar la primera hebra. Se puede controlar el grado de tensión liberando debido a que durante este proceso se hace en una reacción a través de un intermediario covalente entre uno de los extremos del corte y un residuo de tirosina de la enzima.

28
Q

¿Qué hacen las topoisomerasas de tipo II?

A

Un ejemplo es la girada procariotica y lo que hacen es que cortan de manera transitoria las dos hebras y permite el paso de otra doble hebra, intacta, por la brecha abierta y finalizan resellando los cortes. Inducen el superenrollamiento negativo para facilitar el posterior desempareja miento local. Se hidroliza utilizando 1 ATP por cada corte en la cadena.

29
Q

¿Qué hace la primasa?

A

Produce cadena cortas de RNA complementarias de cada una de las hebras desemparejadas en el origen de la replicación. Sintetiza el cebador

30
Q

¿Qué tipo de polimerasa es la primasa?

A

Polimerasa de RNA dirigida por DNA

31
Q

¿Cuáles son las consecuencias de las acciones de las topoisomerasas?

A

El aumento o disminución del número de enlaces

32
Q

¿Cuáles son las hebras adelantadas?

A

Ambas hebras no se copian de manera simultánea, una al abrirse la horquilla de las hebras se va en sentido correcto de 3’ a 5’ por consecuencia de la síntesis complementaria, transcurre el avance de la polimerasa a lo largo del molde a la par de la horquilla, su hebra molde puede recibir el mismo nombre.

33
Q

¿Cuáles son las hebras retardadas?

A

Las que requieren los fragmentos de Okazaki

34
Q

¿Qué son los fragmentos de Okazaki?

A

Cada fragmento de Okazaki corresponde a una fracción de la hebra retardar, y su síntesis solo comienza cuando el avance de la horquilla libera suficiente longitud de DNA monocatenario para que la polimerasa lo utilice como hebra molde, de 3’ a 5’.

35
Q

¿ Cómo es la síntesis semidiscontinua?

A

Síntesis de las hebras adelantadas y retardada de forma discontinua por sendas moléculas de DNA polimerasa.

36
Q

Explica los pasos para la síntesis de la hebra retardada:

A

Inicio: la síntesis comienza cuando el avance de la horquilla libera suficiente longitud de DNA monocatenario para que la polimerasa lo utilice como hebra molde de 3’ a 5’
Maduración: se deben de unir los fragmentos de Okazaki. Se requiere la eliminación de los cebadores, elongación del fragmento adyacente para que se rellenen los huecos que dejó el RNA cebador con DNA, seguido con la unión o el empalme de los extremos resultantes para dar una hebra continua. Este proceso puede tener lugar cerca de la horquilla o muy lejos de ella.
Última etapa: la unión de los fragmentos que lo cataliza la DNA ligasa. Forman un en,ace fosforescer faltante entre el extremo 3’ -OH de un fragmento de Okazaki con un extremo 5’ del siguiente

37
Q

¿Qué pasa con los telómeros en cada replicación?

A

La parte de la hebra es decir su origen, donde se encuentran los telómeros no se replica en cada repetición lo que provoca que las hebras en cada repetición se hagan más pequeñas.

38
Q

¿Que son las telomerasas?

A

Son enzimas de tipo DNA polimerasas ( polimerasa de DNA dirigida por RNA), es una transcriptasa inversa con características especiales ya que es una ribonucleoproteína que es capaz de sintetizar una secuencia determinada de DNA.

39
Q

¿Cuáles son los componentes que conforman a la telomerasas?

A

Componente ribonucleico y componente proteico

40
Q

¿En qué células está presente la actividad de telomerasas?

A

Células de la línea germinal, tejidos fetales, células troncales y las células somáticas que tienen muy poca de esta actividad.

41
Q

¿Cuál es la polimerasa que sintetiza el DNA mitocondrial?

A

DNA pol/ gamma

42
Q

¿En qué año y quién identificó el DNA mitocondrial?

A

Marginal Nashville y Sylvan Nashville en 1963

43
Q

¿En qué año se publicó la estructura como,eta del mtDNA?

A

1981

44
Q

¿Cuál es la estructura del mtDNA?

A

Es una molécula circular de DNA de cadena doble. No tiene histonas y tiene un ancho de 5 no. Tiene una densidad variables de G + T. Tiene una cadena pesada (H) rica en G y una ligera rica en c, tiene una longitud variable pero en humanos es de 16,569 pb, es multicodependiente de los requerimientos de energía de las células. Tiene 37 genes 28 en H y 9 en L

45
Q

¿Cómo son los genes del mtDNA?

A

Carecen de intrones y algunos están superpuestos MTATP6 y MTATP8, son contiguos, separados por uno o dos pb no codificantes, el promotor HSP1 transcribe los dos RNA y HSP2 el resto de la cadena como un transcrito policistrónico. La cadena ligera es transcrita por LSP el mtDNA contiene solo una región no codificante significativa: D Loop

46
Q

¿Qué contiene D- loop?

A

El sitio de inicio de la replicación y también el sitio para los promotores de transcripción de la cadena H

47
Q

¿Qué pasa en el desplazamiento de D-loop?

A

Se forma una triple hélice. Cadena corta de 7s DNA

48
Q

¿Cómo difiere el genoma mitocondrial del nuclear?

A

DNAmt usa solo dos coso a de paro: AGA Y AGG y ADNn usa UAA, UGA (codificación de triptófano) y UAG
AUA codifica Mario una en ADNmt

49
Q

¿Qué se afirmó en 1963?

A

La herencia es estrictamente materna

50
Q

¿En 2002, cómo fue reportada la herencia paterna en ADNmt?

A

Entra familias, usando secuenciación de genomas completos
I. Genes nucleares (dominantes) involucrados en la inhibición de la destrucción del ADNmt paterno
II. Replicación selectiva de ADNmt va ADNm materno
III. Deleción de 2 pb en ND2, involucrada en la función de los genes nucleares.

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