MultiOmics Flashcards
Was versteht man unter Multi-OMICS-Analytik?
Multi-OMICS-Analytik bezeichnet die gesamtheitliche Analyse des Genoms, des Transkriptoms, des Proteoms und anderer Molekülklassen
Welche Ebenen des biochemischen Informationsflusses werden in der systembiologischen Vermessung von Zellen betrachtet?
Es werden Daten zu mehreren Ebenen im biochemischen Informationsfluss erzeugt und analysiert, darunter Genotypen und komplexe Phänotypen
Was sind die Hauptaufgaben der Transkriptionsfaktoren bei der Genexpression?
ranskriptionsfaktoren sind Proteine, die die RNA-Polymerase an die DNA binden und die Transkription initiieren
Welche Rolle spielen nicht-kodierende RNAs bei der Genregulation?
Nicht-kodierende RNAs regulieren die Genexpression durch Interaktionen mit mRNA oder anderen RNAs und verhindern beispielsweise die Weiterverarbeitung der mRNA
Was ist die Funktion von Mikro-RNAs (miRNAs) in der posttranskriptionellen Regulation?
Mikro-RNAs regulieren die Translation der mRNA in Proteine, indem sie an das 3‘-Ende der mRNA binden und die Proteinsynthese blockieren
Wie verläuft der Reifungsprozess von Mikro-RNAs (miRNAs)?
Der Reifungsprozess umfasst mehrere Vorstufen, bis die reife miRNA entsteht, die gemeinsam mit Proteinen den RNA-induzierten Silencing-Komplex (RISC) bildet
Was sind die wichtigsten Schritte in der bioinformatischen Analyse von miRNA-Daten?
Die Analyse umfasst das Scoring der Reads, wobei reife miRNA-Sequenzen häufiger vorkommen und nicht-miRNA-Vorläufer weniger kompatibel mit der Referenzsequenz sind
Wie sind miRNAs an kardiovaskulären Erkrankungen beteiligt?
Veränderungen in der Expression von miRNAs sind bei vielen kardiovaskulären Erkrankungen wie kardialer Hypertrophie und Atherosklerose bekannt
Welche Kriterien werden bei der miRNA-Zielgenvorhersage berücksichtigt?
Kriterien umfassen die Position der Bindestelle im 3‘ UTR des Zielgens, Sequenzhomologie der Seed-Sequenz und starke evolutionäre Konservierung der Sequenz
Was ist das Epigenom und welche Bedeutung hat es?
Das Epigenom umfasst alle epigenetischen Modifikationen des genetischen Materials in einer Zelle, die die Genexpression beeinflussen, ohne die DNA-Sequenz zu verändern
Was ist Chromatin-Immunopräzipitation mit Hochdurchsatz-Sequenzierung (ChIP-Seq)?
ChIP-Seq ist eine Methode zur Analyse von Protein-DNA-Interaktionen, bei der DNA-Sequenzen mit gebundenen Proteinen durch Antikörper angereichert und quantifiziert werden
