Exercices - enzymes de modification de l'ADN Flashcards

1
Q

Quelle est l’origine des enzymes de restriction?

A

Bactérienne

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2
Q

Endonucléase :

A

Enzyme qui coupe à l’intérieur de la chaîne d’ADN.

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3
Q

Exonucléase :

A

Enzyme qui coupe à partir des extrémités de la chaîne d’ADN.

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4
Q

Qu’est-ce qu’un palindrome?

A

Une séquence de nucléotides identiques de 5’ en 3’ sur les deux brins.

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5
Q

Que sont les isoschizomères?

A

Deux enzymes différentes qui reconnaissent le même site de restriction.

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6
Q

Qu’est-ce que l’activité étoile?

A

Phénomène par lequel une enzyme de restriction, dans des conditions non optimales, effectuera des digestions de l’ADN à des sites différents de son site de reconnaissance normal (non spécifique).

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7
Q

Quelle précaution est essentielle avec les enzymes de restriction en biologie moléculaire?

A

Manipulation sur glace.

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8
Q

Comment agis la ligase sur deux brins d’ADN digérés par une enzyme de restriction?

A

Elle reconstitue la liaison phosphodiester entre le groupement phosphate d’un carbone 5’ et le groupement hydroxyle d’un carbone 3’ de deux nucléotides adjacents des brins d’ADN.

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9
Q

À quoi sert la phosphorylation de l’ADN en biologie moléculaire?

A

Elle permet le marquage radioactif de l’ADN grâce à la polynucléotide kinase du phage 4.

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10
Q

À quoi sert la déphosphorylation de l’ADN en biologie moléculaire?

A

Elle prévient la légation d’ADN au cours de constructions de molécules d’ADN.

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11
Q

Quelle est l’enzyme utilisée lors de la phosphorylation ou la déphosphorylation?

A

Polynucléotide kinase du phage 4.

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12
Q

Quelle est l’utilité du magnésium dans certains tampons de réaction en biologie moléculaire?

A

Il agit comme cofacteur des enzymes de restriction.

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13
Q

À quoi peut-on généralement attribuer une digestion enzymatique incomplète?

A
Mauvais entreposage de l'enzyme
Mauvais tampon
Temps de digestion trop court
Impuretés dans l'ADN
Température de digestion incorrecte
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14
Q

En quoi le glycérol peut-il influencer l’activité de l’enzyme de restriction?

A

Il inhibe l’activité spécifique de l’enzyme de restriction.

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15
Q

Comment peut-on remédier à l’influence du glycérol?

A

En s’assurant que le volume d’enzymes ne dépasse pas 1/10 du volume total de réaction.

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16
Q

Quelles sont les conditions habituelles d’activité de l’enzyme de restriction en biologie moléculaire?

A

37 degrés Celsius pendant une heure.

17
Q

Déterminer le type d’extrémité que produira la digestion de l’ADN par l’enzyme EcoRI :

A

Cohésives (saillantes)

18
Q

Déterminer le type d’extrémité que produira la digestion de l’ADN par l’enzyme HaeIII :

A

Franches

19
Q

Déterminer le type d’extrémité que produira la digestion de l’ADN par l’enzyme SmaI :

A

Franches

20
Q

Déterminer le type d’extrémité que produira la digestion de l’ADN par l’enzyme PstI :

A

Cohésives (saillantes)