Cycle de krebs Flashcards
Décrire le cycle de l’acide citrique.
Voie oxydative pour tous les métabolites avec un potentiel énergétique. Il fournit l’énergie nécessaire pour la production d’ATP.
Où se déroule le cycle de l’acide citrique?
Mitochondries
Qu’est ce que la voie amphibolique?
Certains métabolites peuvent être utilisés dans des réaction anabolique et d’autre pour des réaction catabolique.
Comment est transporté le pyruvate dans la mitochondrie?
Par un transport actif: translocase et transport spécialisé (MPC)
Quel sont les deux espace de la mitochondries?
Matrice et espace intermembranaire
Comment se déplace la mitochondries dans la cellule?
Grace au micro squelette
Que contient la matrice?
Enzyme
Qu’est ce qui se découle dans la membrane interne?
Chaine repiratoire
Quel est la fonction principale de la mitochondries?
- Production d’énergie, c’est une centrale énergétique
- Réaction d’oxydation cellulaire
- Production de protéine
Décrire la théorie du symbiote.
Les mitochondries serait issus de l’ingestion de bactéries par les cellules eucaryotes. La digestion ayant été incomplète, les mitochondries aurait profité du cytosol et les cellules de la capacité à produire de l’énergie
D’où provienne la majorité des protéine de la mitochondries?
Noyau
Décrire le génome des mitochondries humaine.
- ADN circulaire
- Distribution plus serrée des gènes
- Utilisation des codon simples
- Code génétique différent de l’ADN nucléaire
Quel réaction ne fait pas partie du cycle mais est essentiel à celui-ci?
Formation d’acétyl-CoA à partir du pyruvate
Par quel complexe est catalysé la formation d’acétyl-CoA à partir du pyruvate?
Complexe pyruvate déshydrogénase
Par quel enzyme est catalysé la condensation de l’acétyl-CoA et l’oxaloacétate?
Enzyme citrate synthase
Par quoi est inhibé la citrate synthase?
Son propre produit: la citrate.
Quel est le produit de l’isomérisation du citrate?
Isocitrate
Par quoi est catalysé l’isomérisation du citrate?
Aconitase
L’isomérisation du citrate se fait en deux temps, quel sont les deux étapes?
- Le cis-aconitate devient intermédiaire
- Transfert de OH du C3 au C2
Quel groupement est nécessaire à l’activité de l’aconitase?
Fer-soufre (4Fe-4S)
Comment se nomme la réaction clé su cycle de krebs?
Oxydation et décarboxylation de l’isocitrate
Quel enzyme catalyse l’oxydation et décarboxylation de l’isocitrate?
Isocitrate déshydrogénase
Qu’est ce qui régule l’oxydation et décarboxylation de l’isocitrate?
- Activation allostérique par l’ADP et Ca2+
- Inhibition allostérique par l’ATP et le NADH
Par quoi est catalysé la décarboxylation oxydative de alfa-cétoglutarate?
Complexe alfa-cétoglutarate déshydrogénase
Que produit la décarboxylation oxydative de alfa-cétoglutarate?
La deuxième molécule de CO2 et de NADH
Par quoi est régulé le complexe enzymatique alfa-cétoglutarate déshydrogénase?
- Inhibé par ces produits: NADH et succinyl-CoA
- Activé par ion Ca2+
Par quoi est catalysé le clivage du succinyl-CoA?
Succinyl-CoA synthase
Quel lien est cliver dans le clivage du succinyl-CoA??
Lien thioester
Qu’est ce qui est couplé au clivage du succinyl-CoA?
La phosphorylation d’un GDP pour former GTP.
En quoi est oxydé le succinate?
Fumarate
Quel enzyme du cycle de Krebs est la seul qui est intégrées à la membrane interne de la mitochondries?
Succinate déshydrogénase
Qu’est ce qui est aussi produit dans l’oxydation du succinate?
Le FAD est réduit pour former du FADH2
Que produit l’hydratation du fumarate?
L-Malate
Par quoi est catalysé l’hydratation du fumarate?
Fumarase
Que produit l’oxydation du malate?
- Oxaloacétate (réutiliser à la première étape)
- 3e et dernier NADH
Quel enzyme est utilisé lors de l’oxydation du malate?
Malate déshydrogénase
Quel est le bilan énergétique du cycle de Krebs pour une molécule d’acétyl-CoA?
- 3 molécules de NADH produit: environ 3 ATP/NADH
- 1 molécule de FADH2 produit: environ 2 ATP/FADH2
- 1 Molécule de GTP convertie en ATP
- Total de 12 ATP/Acétyl-CoA
Par quoi est régulé le cycle de l’acide citrique?
- Disponibilité des substrats
- Production/utilisation des intermédiaires pour d’autres voie métabolique
- Besoins en ATP de l’organisme
Qu’est ce qui régule le complexe de pyruvate déshydrogénase?
- NADH et acétyl-CoA inhibe complexe
- Kinase le phosphoryle et l’inactive
- Phosphatase le déphosphoryle et l’active
Quel sont les trois points de contrôle du cycle de l’acide citrique?
- Complexe alfa-cétoglutarate déshydrogénase
- Isocitrate déshydrogénase
- Citrate synthase
Comment varie l’activité de la citrate synthase?
Selon la disponibilité des substrats
Qu’est ce qui régule la citrate synthase?
- Augmenter concentration OAA l’active
- Augmenter concentration citrate l’inhibe
Qu’est ce qui régule isocitrate déshydrogénase?
- Inhibé par ATP et NADH
- Activé par ADP et l’ion Ca2+
Qu’est ce qui régule le complexe alfa-cétoglutarate déshydrogénase?
- Activé par ion Ca2+
- Inhiber par augmentation concentration NADH et succinyl-CoA
Décrire la voir cataplétorique
Voies métabolique à l’extérieur du cycle de l’acide citrique qui utilisent ses intermédiaires métabolique.
Décrire la voie anaplérotique.
Voies métabolique qui fournissent des intermédiaires au cycle de l’acide citrique.
Donner des exemple de réaction cataplérotique.
- Synthèse de glucose
- Synthèse de l’acide gras
- Synthèse de l’acide aminés
Donner des exemple de réaction anaplérotique.
- Oxydation des acides gras
- Dégradation des acides aminés
- Transamination de certains acides aminés
- Pyruvates est le produit de la glycolyse mais aussi le substrat du cycle de Krebs
