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Détection épidémiologique d'agent infectieux > Cours 6 > Flashcards

Cours 6 Flashcards

1
Q

Qu’est ce qui se détecte par PCR (2)?

A

Amibe (e.histolytica et e. dispar)

Toxoplasma gondii

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2
Q

Qu’est ce qui se détecte par PCR-séquence(5)?

A
  1. VIH: résistance aux antirétroviraux
  2. VHB: résistance aux antiviraux
  3. VHB génotypage
  4. Identification des mycètes
  5. VHC génotypage
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3
Q

Qu’est ce qui se détecte par RT-PCR(4)?

A
  1. VHC: charge virale
  2. coronavirus: cov associé au SRAS et MERS
  3. Novovirus et autres virus entériques
  4. virus du nil occidental
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4
Q

Qu’est ce qui se détecte par RT-PCR-séquence(1)?

A

Virus respi (influenza et autres)

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5
Q

Quels sont les virus pathogènes respiratoires les plus fréquents (10)?

A
  1. influenza a et b
  2. virus respi synctial
  3. metapneumovirus humain
  4. virus parainfluenza (1-4)
  5. coronavirus communs
  6. Rhinovirus/entérovirus
  7. adénovirus
  8. virus des oreillons
  9. virus de la rougeole
  10. virus de la rubéole
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6
Q

Quels sont les bactéries pathogènes respiratoires les plus fréquents (5)?

A
  1. mycobacterium tuberulosis
  2. strepto pneumoniae
  3. staph aureus
  4. hemophilius influenza
  5. legionella pneumo
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7
Q

Quels sont les traitements préventifs/curatifs pour l’influenza (4)?

A

Vaccin annuel
oseltamivir
zanamivir
amantidine

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8
Q

Quel est le traitement préventif/curatif pour les virus de la rougeole, rubéole, oreillons?

A

Vaccin RRO

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9
Q

Quel est le traitement pour le virus respi syncytial

A

palivizumab

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10
Q

quel est le traitement pour les coronavirus communs?

A

Aucun, de même pour tous les autres virus de la liste des patho fréquents (5 au total)

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11
Q

Quels sont les coronavirus communs?

A

OC43, 229E, HKU1, NL63

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12
Q

Combien de sérotype et d’espèce pour les rhinovirus et entérovirus?

A

300 sérotypes, 12 espèces

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13
Q

Combien de sous groupes et de sérotypes pour les adéovirus?

A

7 sous-groupes et plus de 50 sérotypes

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14
Q

Quels sont les modes de transmission de la grippe?

A

Goutelettes
Coontact directs et indirects
aérosols?

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15
Q

Combien de temps pour
A) l’incubation de la grippe
B) la contagiosité

A

A) 1-3 jours

B) -1 à 7 jours

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16
Q

Le virus de l’influenza:

Quel est le nom de l’agent étiologique et son genre?

A

Agent: orthomyxoviridae
Genre:influenza virus

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17
Q

Le virus de l’influenza:

Quelles sont ses caractéristiques “physiques” et son arn?

A

Enveloppé, pléomorphe

génome arn négatif en 8 (type A et B) ou 7 segments (C ou D)

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18
Q

Le virus de l’influenza type A, qu’est ce qu’il infecte?

A

Plusieurs espèces animales: oiseaux sauvages (reservoir), poulet, baleines, cochons, chevaux, phoques, humains

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19
Q

Le virus de l’influenza type B,
A) qu’infecte-il
B) quelles sont les deux lignées
C) Reconnue depuis quand?

A

A) humains, chevaux, phoques
B) Yamagata et victoria
C) depuis les années 70

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20
Q

Le virus de l’influenza type C et D, qu’infectent-ils?

A

Les humains?, les porcs, les bovins, les chiens

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21
Q

Le virus de l’influenza type A: quels sont les sérotypes des ag de surface?

A

Hémagglutinine (H1-H18; H1 à H3 chez l’humain)

Neuraminidase (N1-N11, N1 et N2 chez l’humain)

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22
Q

Le virus de l’influenza type A quels sont les sous-types transmissibles entre les humains et les porcs?

A

H1N1, H1N2, H2N2, H3N2

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23
Q

Le virus de l’influenza type A quels sont les sous-types transmissibles de l’oiseau à l’humain?

A

H5N1, H9N2, H7N7, H7N2, H7N3, H7N9

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24
Q

Nomenclature pour AFujian4112002H3N2-like

A 
A: type
Fujian: lieu de l'isolement
411: ID original
2002: année de l'isolement
H3N2-like: sous type de l'influenza
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25
Q

Quelles sont les 2 manières d’acquérir de nouveaux caractères antigéniques?

A
  1. dérive ou glissement antigénique (drift)

2. cassure ou sauts antigéniques (shift)

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26
Q

Que peut-on dire sur les drift (3)?

A
  • mutations ponctuelles: erreur dans le processus de réplication, changement graduel des gènes codant pour l’HA et la NA
  • responsable des réinfections par le même sous-type au cours d’une vie
  • responsable des épidémies annuelles
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27
Q

Qu peut-on dire sur les shifts (3)?

A
  • changement majeurs ou remplacement complet des gènes codants pour HA et NA
  • abrupte, relativement peu fréquent et imprévisible
  • peut causer une pandémie
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28
Q 
Quelles étaient et en quelles années
A) la grippe espagnole
B) la grippe russe
C) la grippe asiatiques
D) grippes aviaires
A

A) H1N1: 1918-1957
B) H1N1: 1977-2017
C) H3N2: 1968-2017
D) H5, H9, H5

29
Q

Quelles sont les 3 étapes d’une pandémie de grippe?

A
  1. Émergence d’un nouveau variant antigéniquement distinct pour l’humain
  2. réplication du virus chez l’humain, créant une maladie grave
  3. transmission interhumaine
30
Q

Quels sont les types d’échantillons respi (7)?

A 
Nasal
Sécretions NP
Asp NP
Écouv NP
Écouv gorge
Séc endotrachéale
Lavage broncho alvéolaire
31
Q

quelles sont les techniques de dx directes(3) et inndirecte (1)?

A
  1. Culture virale
  2. Détection d’Ag par immunofluo et test rapide
  3. TAAN
  4. Sérodiagnostic
32
Q

Quel est le temps de réponse d’une culture virale?

A

2-10 jours

33
Q

Vrai ou faux. La culture virale doit être confirmée par des tests complémentaires.

A

Vrai

34
Q

Quel ets l’avantage de la culture virale?

A
  • isolement pour caractérisation du sous-type par IH

- et de la sensibilité aux antiviraux par épreuves phénotypiques

35
Q

Quels sont les 3 désavantages de la culture virale?

A
  1. long
  2. requiert infrastructure et expertise
  3. NC3 pour les nouveaux patients
36
Q

Vrai ou faux. Dans l’immunofluorescence, on peut détecter l’ag en introduisant un fluorophore, en découpant la cellule pour ensuite observer au spectrophotomètre.

A

Faux. on détecte l’ag à l’intérieur de la cellule

37
Q

L’immunofluorescence est détectable sur quel type d’échantillon?

A

Respiratoire

38
Q

Quel est le temps de réponse de l’immunofluorescence?

A

2 heures

39
Q

quels sont les deux avantages de l’immunofluorescence?

A
  1. rapide

2. évalue la qualité du spécimen

40
Q

quels sont les 3 désavantages de l’immunofluo

A
  1. moins sensible que la culture
  2. requiert du personnel expérimenté
  3. pas de sous typage (routine)
41
Q

Qu’est ce qu’un test rapide?

A

Détection de l’ag du virus dans un lysat préparé à partir de l’échantillon clinique

42
Q

quel est le temps de réponse d’un test rapide?

A

20-30 min

43
Q

Quels sont les 2 avantages d’un test rapide?

A
  1. Très rapide

2. execution simple

44
Q

Quels sont les 2 désavantages d’un test rapide?

A
  1. sensible et spécificité variable

2. pas de sous-typage

45
Q

Quel est le temps de réponse d’un TAAN

A

2-5heures

46
Q

Quels sont les 2 avantages d’un TAAN?

A
  1. très sensible et spécifique

2. permet l’identification des sous-types

47
Q

Quel est le désavantage d’un TAAN?

A

nécessite équipement et expertise spécialisée

48
Q

Quel est l’effet du TAAN sur le VPP et VPN?

A

Présumé augmenté

49
Q 
À propos de la caractérisation phénotypique par hémagglutination:
A)Temps de réponse
B) Précautions?
C) Spécialisé?
D) Pré-requis?
A

A) 7 jours
B) NC3 (souche haut. patho)
C) Haut. spécialisée, réactifs précieux
D) Isolement de la souche néc.

50
Q

À propos de la caractérisation génotypique par séquençage:
A) Temps de réponse
B) spécialisé?
C) Équivalent à IH?

A

A) 2-3 jours
B) Haut. spécial
C) Nope

51
Q

Quels réactifs faut-ils pour avoir une hémagglutination inhibée?

A

virus + RBCs + Ac

52
Q

Quels sont les deux méthodes de détermination de la résistance aux antiviraux?

A

phénotypique et génotypique par séquençage

53
Q

Quels sont les deux sous type de détermination de la résistance aux antiviraux par phénotypie?

A
  1. en présence d’antiviraux

2. par test d’inhibition aux antiviraux

54
Q

Quel est le désavatage ou la particularité par rapport à la détermination de la résistance aux antiviraux par génotypie?

A

Ne recherche que les mutations connues de resistance aux antiviraux

55
Q

Quels sont les 4 choses à faire pour la surveillance de l’influenza?

A
  1. vaccin et traitement disponible
  2. informer les reponsables de la sélection des souches vaccinales (OMS)
  3. Informer sur le succès du programme coûts vs efficacité
  4. surveillance et réponse aux virus émergents ou pandémiques
56
Q

Quels sont les 2 actions en matière d’épidémiologie quant à la surveillance de l’influenza?

A
  • évauation de l’impact sur la population

- décrire les populations affectées et groupes à risque

57
Q

Quels sont les deux actions en matière de laboratoire quant à la surveillance de l’influenza?

A
  • caractérisation des souches circulantes

- suivi de l’activité grippale

58
Q

Quel est l’action qui ne fait partie d’aucune catégorie quant à la surveillance de l’influenza?

A

maladie respi sévères en émergence

59
Q

Quelles sont les mesures d’efficacité vaccinale (avant et mtn)?

A
  • mesure la diminution des s/s d’allure grippale
  • avant: pas de considération des composantes spécifiques au trivalent, contribution de l’immun croisée
  • dépend du degré d’identité de chaque composé par rapport aux souches circulantes et de la population relatives des différents sous-types
60
Q

Entres quels % se trouve l’efficacité vacc?

A

0-80%

61
Q

Quels sont les objectifs du programme VE

A
  • informer les acteurs de SP de l’utilisation relative du vacc influenza en temps opportuns
  • mesurer l’efficacité relative de chaque composante de la formulation annuelle du vacc trivalent par la surveillance de labo
  • régionaliser l’estimation de l’efficacité vacc
62
Q 
Le virus de l'influenza H1N1:
A) d'ou provient-il
B) Contagion
C) Virulence
D) Dispersion
A

A) Nord américaine
B) +++
C) peu
D) mondiale

63
Q

Comment diagnostiquer la H1N1 (4)?

et leurs caractéristiques

A
  1. culture virale: eff inconnue; long, NC3
  2. DFA: eff inconn
  3. Tests rapides: eff inconn, sensibilité faible
  4. TAAN: sensible, facilement adaptable
64
Q

Quel était le changement (mutation) chez le H3N2 d’origine porcine?

A

drift majeur

65
Q 
H3N2
A) Animal?
B) Similarité avec autres souches
C) Transmission interhumaine
D) Groupe à risque
A

A) Porc
B) M du H1N1
C) limitée
D) Enfant

66
Q

H5N1
A) Ou?
B) Létalité

A

A) asie et moyen orient

B) 53%

67
Q 
H7N9
A) Ou et quand
B) Animal
C) Transmission interhumaine
D) Marqueurs?
A

A) chine, 2013
B) Aviaire
C) Nope
D) virulence et résistance

68
Q 
MERS-CoV
A) Ou
B) Quand
C) Transmission interhum
D) Animal
E) Similarité avec d'autres souches
F) Groupe touché
G) Létalité
A 
A) Moyen orient
B) 2012
C) Oui
D) Chameau/dromadaire
E) ressemble au sras-cov
F) Adulte
G) 36%

Détection épidémiologique d'agent infectieux (6 decks)

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