Cours 3 Flashcards

1
Q

Que représente les noeuds dans un arbre phylogénétique ?

A

Les ancêtres communs avant un évènement de spéciation

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Q

Pourquoi les espèces ne sont pas directement comparable ?

A

Parce que certaines sont plus proches que d’autres d’un point de vue évolutif

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3
Q

Vrai ou faux ?

Les espèces sont des entités dépendantes

A

Vrai !
–> toutes les espèces sont reliées entre elles par une ascendance commune
c’est d’ailleurs pourquoi on ne peut pas comparer toutes les espèces entre elles

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4
Q

comment on compare les espèces dans un arbre phylogénétique ?

A

On utilise des comparaisons indépendantes soit la comparaison des traits entre les taxons frères depuis un ancêtre commun
(on utilise chaque branche une seule fois)

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5
Q

Qu’est-ce que permet la méthode des contrastes indépendants ?

A

elle permet de déterminer si le changement au niveau des caractères se fait de façon indépendante des relations historiques
–> logique : si deux traits sont corrélés, ils évolueront selon la même trajectoire pour les taxons frères depuis un ancêtre commun

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6
Q

Dans la méthode des contrastes indépendants, si on obtient un graphique présentant une corrélation, qu’est-ce que cela signifie ?

A

Que les traits qu’on compare co-évolue et proviennent d’un ancêtre commun

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7
Q

à quoi sert l’horloge moléculaire?

A

à savoir le temps qui est passé en terme de mutation depuis un ancêtre commun
il faut l’utiliser avec des organismes comparables (ex : on ne peut pas comparer humain avec bactérie)

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8
Q

Quelle est la formule de l’horloge moléculaire ?

A

temps de divergence = nombre de mutations/ 2(taux de mutation de la région génomique étudiée)

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9
Q

comment peut-on dater la perte de la fourrure uniforme chez les humains ?

A

On peut utiliser le génome d’espèces associées à la pilosité des primates qui se compare à celles qui sont associées à l’humain.
Par exemple, en comparant le génome chez les poux humains et les poux de chimpanzé et en comparant le génome des morpions et des poux de gorilles, on trouve que les humains auraient perdu leur fourrure uniforme il y a 3 millions d’années.
Donc, la présence sur notre corps de 2 espèces de parasite témoigne de la séparation de notre pilosité en 2 régions.

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10
Q

Pourquoi avons-nous perdu notre fourrure ?

A

Ce serait par une acclimatation à la température chaude en Afrique
Meilleure évacuation de la chaleur en remplaçant la fourrure par des glandes sudoripares

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11
Q

Qu’est-ce qui se traduit par une reproduction et une mortalité différentielle des individus selon l’aptitude de leur phénotype face à leur milieu ?

A

La sélection

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12
Q

Pourquoi est-il nécessaire que la variation qui confère un avantage au phénotype soit héritable ?

A

Parce que l’évolution par sélection implique plusieurs génération, on veut une amélioration de la valeur adaptative de la population à long terme

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13
Q

Que représente l’héritabilité ?

A

La portion de la variation phénotypique expliquée par la variation génétique et donc transmissible aux génération suivantes

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14
Q

Que représente le phénotype et le phénotype étendu d’un organisme ?

A

Le phénotype représente tous les caractères découlant du génotype d’un organisme tant au niveau moléculaire que comportemental
–> le phénotype étendu prend en compte les réalisations spécifiques de l’organisme dans son environnement (nid, toile..)

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15
Q

Quelle est la cible de la sélection?

A

La variation phénotypique (mais attention ça ne découle pas entièrement de la génétique)

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16
Q

Quelle sont les 3 sources de variations phénotypiques ?

A
  • Génétique
  • Épigénétique
  • Environnement
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17
Q

D’où vient l’effet génétique sur la variation phénotypique ?

A

De mutations entrainant un changement :
1- au niveau de la séquence modifiant les propriétés de l’ARN ou de la protéine produite
2- au niveau des séquences régulatrices des gènes en modifiant la quantité d’ARNs ou de protéines produites

18
Q

Qu’est-ce qu’on désigne comme étant la source pure de la variation génétique ?

A

Les mutations

19
Q

Qu’est-ce qu’entraine une modification épigénétique ?

A

un changement au niveau de l’expression des gènes

20
Q

Quelles sont les modifications épigénétiques et où se font-elles?

A

Acétylation et méthylation qui se font notamment au niveau des histones dans le but de remodeler la chromatine pour la rendre + ou - accessible pour la transcription

21
Q

comment appelle-t-on une modification épigénétique :
1- qui arrive par accident
2- qui arrive en interaction avec l’environnement

A

1- épimutation

2- plasticité

22
Q

Qu’est-ce que l’effet épigénétique pure

A

Les épimutations comme la méthylation accidentelle de cytosine qui entraine des changements imprévus au niveau de l’expression des gènes

23
Q

D’où provient l’effet pur de l’environnement sur la variation des caractères ?

A

de la limitation du temps, des ressources ou de l’énergie nécessaire à la réalisation du phénotype

24
Q

Faites le contraste entre la plasticité passive et la plasticité active

A

La plasticité passive s’agit d’une simple conséquence de l’environnement qui vient affecter plusieurs processus de l’organisme. Le changement du phénotype est généralement proportionnel au niveau d’intensité de la variable environnementale

La plasticité active est une ADAPTATION permettant au génotype de développer des phénotypes distincts en fonction de l’environnement. C’est généralement des modifications dans la régulation des gènes et dans le patron du développement qui cause les variations phénotypiques. L’intensité du changement n’est pas forcément proportionnel à l’intensité du changement dans l’environnement

25
Q

Que permet le changement phénotypique dans la plasticité active ?

A

anticiper de nouvelles conditions de l’environnement, et ce, en réponse à un signal fiable prédisant ce changement

26
Q

Quel est un exemple classique de la plasticité active ?

A

La détermination du sexe chez les reptiles qui dépend de la température extérieure

27
Q

comment appelle-t-on la relation entre les phénotypes produits par un génotype en fonction de l’environnement (genre le graphique entre le trait et l’environnement)

A

La norme de réaction

28
Q

sur quel type de caractères est basée la génétique :
1- Mendélienne
2- Quantitative

A

1- qualitatifs = monogéniques, sont en catégorie discrètes
2- quantitatifs = plusieurs gènes affectent le phénotype et interagissent entre eux, présentent une gradation (ex : taille)

29
Q

Quel est le seul facteur confondant dans la génétique mendélienne ?

A

la dominance

30
Q

Pourquoi dans la génétique quantitative la variation phénotypique n’exprime que partiellement la variation génétique ?

A
Parce qu'il y a plusieurs facteur confondant : 
- épistasie 
- Épigénétique 
- Environnement 
- dominance 
donc héritabilité entre 0 et 1
31
Q

Qu’est-ce qu’un trait quantitatif discret ou méristique ?

A

ce sont des caractères quantitatifs qui sont déterminés par un nombre entier, donc pas un nombre infini de phénotypes
ex : nombre de vertèbres

32
Q

De quoi est composé la diversité génétique ?

A

le nombre d’allèle pour chaque gène

le nombre de gènes

33
Q

vrai ou faux ?
Dans le cas de la génétique mendélienne, il est possible de calculer le nombre de génotype possible selon le nombre d’allèles (pour organisme diploïde)

A
vrai ! 
avec k(k+1)/2
34
Q

Pourquoi ça devient compliqué de calculer le nombre de génotypes dans un système polygénique (=qualitatif)?

A

parce que le nombre de génotype devient vraiment rapidement beaucoup trop grand

35
Q

Que faut-il considérer en plus des effets purs dans la variation phénotypique?

A

toute les interactions entre la génétique, l’épigénétique et l’environnement en plus de la stochasticité

36
Q

Les effets génétique proviennent de 2 types d’effets quels sont-ils ?

A
  • Additif

- Non-additif ( Dominance et épistasie)

37
Q

Vrai ou faux ?

Les effets additifs sont les seuls effets génétiques héritable

A

Vrai

38
Q

Qu’est-ce que l’effet additif ?

A

Quand les 2 allèles d’un gène (ou de pls gènes) contribuent quantitativement à la réalisation du phénotype (exemple avec les doses selon les le nombre d’allèles qui est une lettre maj)

39
Q

Comment l’effet additif influence la distribution des phénotypes ?

A

Un phénotype affecté par plusieurs gènes va suivre une distribution normale (donc avec des extrêmes et un phénotype moyen)

40
Q

Pourquoi les effets non-additifs ne sont pas héritable ?

A

parce que ce sont des effets qui dépendent d’interactions selon la composition génétique de l’individu et que ce n’est pas le génotype qui est transmis mais les allèles

41
Q

Vrai ou faux ?

Avec la dominance on perd l’effet de l’additivité

A

Vrai ! il n’y a pas de gradation dans le phénotype parce que même si organisme est hétérozygote c’est le caractère dominant qui ressort

42
Q

qu’est-ce qui peut rendre l’effet de la dominance sur le phénotype un peu plus compliqué

A
  • La codominance

- s’il y a une hiérarchie dans le degré de la dominance (comme avec les lapins )