Cours 2 - Enzymologie

Question 1

explique la formule de Gibbs et ses paramètres

Answer 1

C’est le k=lien entre l’énergie libre du système et le chaos.
delta G = delta H - T * delta S
-delta G = Énergie disponible pour le travail
-delta H = enthalpie, somme de l’énergie cinétique et potentielle
-température
-delta S entropie

Question 2

état stationnaire

Answer 2

vitrasse d’apparition d’un composé est égale à la vitesse de sa disparition

Question 3

Équilibre

Answer 3

réaction réversible que la concentration n’évolue plus

Question 4

S ou P contient plus d’énergie

Answer 4

S

Question 5

exergonique

Answer 5

s->p delta g -

Question 6

endergonique

Answer 6

p->s delta g +
La réaction nécessite de l’énergie

Question 7

Qu’est-ce qu’une réaction spontanée

Answer 7

delta G négatif et libère de la chaleur.
réaction exergonique

Question 8

calcul constante d’équilibre

Answer 8

k= produits / réactifs

Question 9

Équation qui fait le lien entre la constante d’équilibre et la variation d’énergie libre (deltaG)

Answer 9

deltaG = - RT InK

Question 10

comment ajuster le delta G dans un sytème ouvert

Answer 10

On calcul la constatante d’équilibre au moment précis
deltaG = deltaG + RT In * réactifs / produits

Question 11

Pourquoi on a besoin de calculer un système ouvert?

Answer 11

systèmes biochimiques

Question 12

comment avoir plus d’énergie en biochimie

Answer 12

réactions couplés

Question 13

Quelle est l’avantage des composés phosphatés

Answer 13

peuvent se coupler pour la formation d’ATP

Question 14

Substance réductrice

Answer 14

donne des électrons

Question 15

substance oxydant

Answer 15

reçoit des électrons

Question 16

Avantage acétyl-coa

Answer 16

Libère OH ce qui libère beaucoup d’énergie

Question 17

façon de transférer de l’énergie

Answer 17

transfert d’électrons :
briser, crée des liaisons, libérer de l’énergie de liaisons et désordonner le système

Question 18

potentielle de réduction standard mesure quoi

Answer 18

mesure l’affinité de l’accepteur d’électrons

Question 19

Quel est le couple redox conjugué de référence

Answer 19

hydrogène

Question 20

Les électrons passent ensuite de receveur en receveur de plus en plus forts jusqu’à aboutir à quoi?

Answer 20

L’oxygène

Question 21

que sont :
NAD NADP
FMN
FAD
Quinones
Cytochromes

Answer 21

des accepteurs d’électrons

Question 22

Que sont les 2 types de cofacteurs

Answer 22

ion inorganique
coenzyme

Question 23

quesqu’un groupement prosthétique

Answer 23

un coenzyme ou un ion métallique lié de façon covalente à la protéine enzymatique

Question 24

a quoi servent les cofacteurs

Answer 24

activer des enzymes

Question 25

Quelle est la composition de l’enzyme fonctionnelle

Answer 25

1- Apoenzyme (partie protéique)
2- coenzyme
3-ion métalliques
4-groupement prosthétique

Question 26

holoenzyme

Answer 26

enzyme fonctionnelle

Question 27

structure de l’apoenzyme

Answer 27

1- sites de fixation des coenzymes ou des cofacteurs ioniques
2- site actif (zone d’accueil de la molécule de substrat (molécule qui est transformé par l’enzyme) )
3- site de régulation
4- site de fixation aux structures cellulaires

Question 28

Pourquoi les réactions non catalysés sont lentes?

Answer 28

molécules stables
événement chimiques peu favorables

Question 29

a quoi sert l’enzyme

Answer 29

offre un environnement spécifique au sein duquel une réaction est favorisé au point de vu énergétique

Question 30

énergie d’activation

Answer 30

énergie nécessaire pour porter toutes les molécules d’un réactif à l’état activé ou complexe activé.
Moment transitoire entre les réactifs deviennent des produits (état de transition).

Question 31

Quel est le rôle de l’enzyme

Answer 31

réduire l’énergie d’activation.
Pour accélérer l’atteinte de l’équilibre.
(ne modifie pas les paramètres d’équilibre ni de l’énergie libre -> ne modifie pas l’équilibre thermodynamique

Question 32

Qu’est-ce que l’étape limitante

Answer 32

Quand une réaction comporte plusieurs étapes, la vitesse globale est déterminée par l’étape possédant la plus haute énergie d’activation

Question 33

comment calculer la vitesse de réaction

Answer 33

La quantité de substrat qui réagit par unité de temps :
V=k[s]

K=constante de vitesse qui peut être calculer avec l’énergie d’activation
énergie activation haute = k bas
énergie activation basse = k haut

k haut = plus rapide

Question 34

interactions faibles énergie enzyme - substrat

Answer 34

-liaison H
-intéractions hydrophobes
-liaisons ioniques
-forces de van der Walls

Question 35

Qu’est-ce qui explique le pouvoir catalytique et la spécificité des enzymes? (comment elles abaissent l’énergie d’activation des réactions)

Answer 35

• l’énergie libre libérée en formant les liaisons de faible énergie
• les interactions entre enzyme et son substrat

Question 36

Comment peut-on résumer l’efficacité de la catalyse enzymatique par les quelques utilisations possibles de l’énergie de liaison

Answer 36

-diminution de l’entropie (ordonne le système, facilite les rencontres)
-désolubilisation des substrats
-compensation des contraintes électrostatiques ou structurales
-adaptation induite de l’enzyme

Question 37

Les interactions faibles entre E et S sont optimisés où?

Answer 37

dans l’état de transition

Question 38

comment l’enzyme optimise les interactions faibles

Answer 38

-L’enzyme stabilise le substrat
-L’enzyme est complémentaire à l’état de transition, déstabilise le substrat

Question 39

cinétique enzymatique

Answer 39

vitesse de réaction et sa modification selon les conditions expérimentales

Question 40

vitesse de réaction de catalyse enzymatique

Answer 40

capacité à l’enzyme à convertir une quantité de substrat en un produit sur un laps de temps

Question 41

état de saturation

Answer 41

l’enzyme est saturée

Question 42

Équation Michaelis-Menten

Answer 42

permet de calculer la vitesse initiale (V0) en fonction de la combinaison de l’enzyme avec son substrat
V0= Vmax *S / Km +S
où km = (K-1 + K2) / k1

Question 43

Équation Lineweaver-Burk

Answer 43

version linéaire de la courbe Michaelis-Menten

Question 44

constante catalytique

Answer 44

nbre de molécules de substrat converties en produit par unité de temps et par molécule d’enzyme

Question 45

Rapport Kcat/Km

Answer 45

compare l’efficacité catalytique avec la capacité catalytique et de l’affinité des enzymes