Cours 10 Flashcards

1
Q

une mutation c quoi?

A

englobent tous les changements de séquence de l’ADN. Les mutations peuvent être
néfastes, bénéfiques ou nulles.

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2
Q

Les mutations sont à la base de…?

A

À la base du polymorphisme, des allèles, de
l’évolution et de certaines maladies.

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3
Q

Mutation ponctuelle vs modification profondes?

A

-Mutations ponctuelles
Substitution de nucléotides.
 Pendant la réplication
 Modification de la structure chimique d’un
nucléotide déjà présent.
o Indels: insertion ou délétion d’une paire de
nucléotides.

-Modification profondes
Large insertion ou délétion
o Réarrangement chromosomique:
modification de l’organisation de large région d’un chromosome (change l’ordre des gènes)o Amplification génétique: répétitions
anormales de régions de l’ADN suite à la
réplication. Augmente la taille du génome.
o Anomalies chromosomiques.

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4
Q

Une substitution c quoi?

A

: le remplacement d’un nucléotide. La réplication suivante assure ensuite d’intégrer la modification de manière permanente sur les deux brins.

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5
Q

Quels sont les deux classes de substitutions?

A

-La transition
d’une pyrimidine à une autre (C à T) ou d’une
purine pour une autre (A à G)

o La transversion
d’une pyrimidine pour une purine (T pour A
ou G) ou le contraire

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6
Q

Indels c quoi?

A

Les Indels comprennent les insertions et les délétions de paires de nucléotides.
Induisent un changement du cadre de lecture
(type de mutation ponctuelle)

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7
Q

Les indels sont causées par quoi?

A

Souvent causé par un glissement
de la polymérase lors de la
réplication.

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8
Q

Quest ce qui se passe si une mutation ou un indélibérées ne sont pas réparés?

A

Si une base erronée ou un indel n’est pas réparé, la mutation sera intégrée au génome de manière permanente dès la réplication suivante.

CAR LA CELLULE CROIT QUE C’EST LE BON GÉNOME

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9
Q

Que ce passe t-il si la modification a lieu au niveau des cellules germinales??

A

cette modification sera transmise aux prochaines générations(car elle va se retrouver dans les gamètes) : Mutation fixe
(si elle est au niveau des cellules somatiques, pas grave tout va bien)

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10
Q

Quels sont les différents effets possibles selon la position de la mutations sur le gène?

A

Plusieurs effets selon la position des mutations:
1- Un changement dans la séquence codant une protéine (traduction)
 une protéine différente dont la forme, l’activité ou l’association à d’autres protéines a été changée.
2- Un changement dans la région régulatrice de l’expression génique (transcription)
 la protéine n’est pas modifiée, mais elle n’est plus produite au moment adéquat ou n’est plus
produite du tout.
3-Un changement dans la structure de l’ADN qui empêche la réplication et la transcription

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11
Q

Un changement dans la séquence codant une protéine… transcription ou traduction?

A

traduction

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12
Q

Quel sont les deux résultats d’une mutation sur une région codante

A

1-Mutants complets
Les mutations qui touchent le site actif de la protéine ou
en sont proches aboutiront probablement à la perte de
fonction de cette protéine.
2-Mutants partiels
Les mutations touchant des zones moins essentielles
d’une protéine auront probablement un effet moins
néfaste

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13
Q

Dans les mutations qui sont dans région codante, quels sont les 4 types de substitutions?

A

1-Protéine de type sauvage
Séquence d’ARN attendue (sans mutation)
2-Silencieuse
Sans effet sur la séquence en acides aminés
3-Substitution faux-sens
Modification de la protéine finale
4-Substitution non-sens
Création d’un codon-stop

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14
Q

Les mutations silencieuses sont dues à…

A

Les mutations silencieuses sont dues à la redondance (ou dégénérescence) du code génétique qui fait en sorte que l’acide aminé codé sera le même, malgré la modification.

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15
Q

une mutation faux sens, c’est quoi?

A

changent un codon spécifiant un acide aminé en un autre codon ne spécifiant pas le même acide aminé.  La séquence de la protéine est modifiée.

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16
Q

2 types de mutation faux sens?

A

1-Mutations faux-sens conservatives : due à une substitution qui est sans
effet sur la fonction de la protéine.
 un acide aminé hydrophile changé pour un autre acide aminé
hydrophile également. Valeur adaptative neutre.
2-Mutations faux-sens non conservatives : la substitution d’une paire de
nucléotides entraîne la mise en place d’un acide aminé fonctionnellement
différent
 substitution de CAT à CCT, ce qui change l’histidine (basique) pour la
proline (non-polaire). Généralement néfaste, mais peut être bénéfique…

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17
Q

Mutation non-sens c quoi?

A

la substitution modifie un codon codant un acide aminé en un codonSTOP qui arrête prématurément la synthèse de la protéine.  La protéine plus courte que normalement sera probablement non
fonctionnelle. Cela dépend de l’endroit où a eu lieu la mutation nonsens : au début de l’ARNm ou vers la fin.

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18
Q

Les Indels c quoi?

A

≡insertion ou délétion d’une ou de plusieurs paires de bases.

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19
Q

Que se passe-t-il dans ce cas si le nb de nucléotides enlevés ou insérés N’EST PAS un multiple de 3?

A

Si le nombre de nucléotides enlevés ou insérés n’est pas un multiple de 3,il y a décalage du cadre de lecture.  L’impact sur la fonction de la protéine dépend de la région affectée.

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20
Q

Quels sont les 3 types de décalage du cadre de lecture?

A

1-Décalage du cadre de lecture provoquant un long faux-sens
Protéine finale différente, modification des acides aminés(même effet qu’une mutation faux-sens, mais les acides aminés des codons suivant aussi seront changer(LONG FAUX SENS))
2-Décalage du cadre de lecture provoquant un non-sens immédiat
Création d’un codon stop(même effet qu’une mutation non-sens)
3-Décalage du cadre de lecture restreint
Ajout ou perte d’un codon, mais le reste de la protéine finale reste le même. (LES ACIDES AMINÉS RESTENT TOUS PAREILS)

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21
Q

Décalage du cadre de lecture avec faux-sens EN DÉTAIL?

A

Tous les nucléotides en aval de la mutation sont regroupés différemmentet codent ainsi de nouveaux acides aminés. La traduction se poursuitainsi jusqu’à un non-sens (codon-STOP). La protéine pourra êtrefonctionnelle ou non selon le site où débute le décalage de la lecture :plus il est loin, plus la protéine a de chances d’être fonctionnelle.

22
Q

Décalage du cadre de lecture avec un non-sens immédiat en détail?

A

Le décalage de lecture provoque très tôt au début de la traduction un codon-STOP qui met fin à la synthèse de la protéine. Celle-ci n’estgénéralement pas fonctionnelle.

23
Q

Décalage du cadre de lecture restreint en détail?

A

Lorsque les bases enlevées ou insérées représentent un triplet ouplusieurs triplets, il y a perte ou addition d’un ou plusieurs acidesaminés, mais le reste de la protéine est adéquatement traduite. Laprotéine pourra être fonctionnelle ou non.

24
Q

Les mutations dans les région non-codante affectent t-ils la séquence en acide aminé des prots comme celles dans les régions condantes?

A

Les mutations dans les régions non codantes d’un gène n’affecteront pas la séquence en acides
aminés de la protéine, mais peuvent avoir des impacts importants sur la régulation de l’expression
des gènes ou de la maturation et, ainsi, sur le fonctionnement de la protéine.

25
Q

Quest ce qu’une mutation des séquences régulatrices?

A

Les séquences régulatrices sont reconnues par des activateurs (ou répresseurs), si elles sont modifiées, la reconnaissance exercée par les molécules régulatrices est moins efficace, le gène sera donc moins bien régulé et il y aura perturbation dans la quantité de la protéine. On verra une augmentation ou une diminution de la quantité.

26
Q

un promoteur basale c quoi?

A

Promoteur basal = séquence reconnue par l’ARN polymérase

Il est essentiel pour que le gène soit bien transcrit

27
Q

une mutation sur la séquence promotrice basale c quoi?

A

Promoteur basal = séquence reconnue par l’ARN polymérase. Il est essentiel pour que le gène soit bien transcrit. Si sa séquence est modifiée, l’accrochage de l’ARN polymérase est détérioré et il y aura perturbation dans la quantité de la protéine.

28
Q

Mutation du 5’UTR et du site d’initiation de la traduction c quoi?

A

Les quelques nucléotides entourant la séquence AUG(au niveau du 5’UTR) sont essentiels pour identifier le site d’initiation de la traduction et le début de la protéine. Une mutation avant l’AUG rendra difficile la reconnaissance du site d’initiation de la traduction. Le 5’UTR possède aussi des sites de régulation importants.

29
Q

Mutation à la jonction intron-exon c quoi?

A

Les séquences des jonctions délimitant les introns et les exons sont partiellement conservées et elles sont nécessaires à la reconnaissance de ces régions par la machinerie d’épissage.
Une mutation en périphérie des introns perturbe donc l’épissage de l’ARNm.

30
Q

Mutation au codon-stop ou site de coupure du transcrit primaire c quoi?

A

Ce sont les séquences qui arrêtent la traduction et la transcription. La traduction et la transcription peuvent être modifiées.
Si la séquence de polyadénylation est modifiée, le transcrit peut ne pas être adéquatement terminé: ne pas avoir de queue polyA ou être instable.

31
Q

Une mutation spontanées c quoi?

A

Les mutations spontanées impliquent les mécanismes de réplication de l’ADN :
o une erreur est introduite pendant la réplication et qui n’est pas réparée.
o une modification de la structure chimique d’un nucléotide déjà présent induit une erreur de lecture de la polymérase qui associe la mauvaise base azotée.

32
Q

Quels sont les deux types de mutations spontanées et leur sous-types?

A

1-Des erreurs dans la réplication de l’ADN :
*Tautomérie
*Glissement de la machinerie de réplication (décalage du cadre de lecture)
2-Des lésions spontanées (+ induites) :
*Dépurination
*Désamination
*Endommagement des bases par oxydation ou alkylation

33
Q

Les tautomères c quoi?

A

Chacune des bases de l’ADN peut exister sous plusieurs formes alternatives, appelées tautomères. Ce sont des isomères qui diffèrent par la position de leurs atomes, ainsi que par les liaisons de ces atomes.

34
Q

C quoi la tautomérie?

A

L’insertion d’un mauvais tautomère d’une base
standard peut mener à un mésappariement, susceptible de créer une mutation au cours de
la réplication de l’ADN.
Ces mésappariements sont des exemples
de mutations par substitution.

35
Q

Quelle capacité possède la machinerie de réplication?

A

La machinerie de réplication (ADN polymérase) possède la capacité
de se relire, ce qui diminue drastiquement les erreurs maintenues lors
de la réplication.

36
Q

C’est quoi un glissement?

A

Arrive lorsqu’il y a plusieurs répétition s ex: G-G-G-G

Ces répétitions permettent de faire des boucles, ce qui va amener au dérapage de la polymérase

Résultat: va augmenter ou diminuer le nm de répétions présentes

37
Q
A
38
Q

Quest ce qui est particulièrement susceptibles au glissement?

A

Les microsatellites
 Plusieurs pathologies associées aux microsatellites

39
Q

Lésions spontanées c quoi?

A

modifications chimiques des bases surviennent spontanément et peuvent
entraîner des altérations dans la séquence d’ADN.
 Facteurs environnementaux (radiations, les agents mutagènes, agents chimiques…)
 L’action de l’eau (altérations hydrolytiques)

40
Q

Lésion induites c quoi?

A

être provoquées par les FACTEURS ENVIRONNEMENTAUX

41
Q

Substance mutagène c quoi?

A

agents chimiques qui augmentent le taux de mutations

42
Q

Quelle sont les 4 types de mécanismes des mutagènes?

A

1-Alkylation: ajout de gr. chimiques sur les bases
Résultat: mésappariement/pas d’appariement.
2-Oxydation: ajout d’un “O” ou perte d’un “H”.
Résultat: un mésappariement.
3-Analogue de base: une autre molécule remplace une base et
l’appariement se fait selon la molécule ajoutée.
4-Agent intercalant : une molécule s’insère entre les bases
(intervient dans réplication/transcription).

43
Q

Que cause la lumière proche de 260nm(rayons UV)?

A

fortement absorbée par les bases. Cela cause la fusion photochimique de deux pyrimidines adjacentes sur le même brin (formation d’anneau cyclobutane entre T et T).
 Ces dimères sont impossibles à apparier et provoquent l’arrêt de la polymérase.

44
Q

Que cause les radiations ionisantes comme dommage sur l’ADN?

A

-directement, en s’attaquant au sucre (désoxyribose) : cassure double
brin de l’ADN (DSB),
-Indirectement en favorisant l’apparition des radicaux libres (agents
oxydants: O2-, H2O2, OH*).

45
Q

Réparation est basée sur quoi?(2 critères)

A

1-Réparation basée sur l’information du brin complémentaire: On regarde sur l’autre brin de la double hélice
2-Réparation basée sur le chromosome homologue
On regarde sur un chromatide soeurs

46
Q

Quels sont les Trois types de conséquences sur la valeur adaptative des mutations?

A
  1. Peuvent être nuisibles (réduisant la probabilité de survie et de reproduction de leurs porteurs).
  2. Peuvent n’avoir aucun effet sur la valeur adaptative et maintenir constante les probabilités de survie et de reproduction (mutations neutres).
  3. Peuvent accroître la valeur adaptative en augmentant l’efficacité ou en élargissant la gamme des conditions environnementales dans lesquelles l’espèce peut vivre, ou en permettant à l’organisme de s’adapter aux changements dans l’environnement
47
Q

Quest ce qui peut augmenter la fréquence des mutations ponctuelles?et est-ce que celle-ci sont communes?

A

agents mutagènes
Non, sont rares

48
Q

le plus souvent l’erreur est réparée, mais qu’est ce qui arrive si elle ne l’est pas?

A

l’erreur restera dans le génome de la cellule et reproduite au cour des cycles cellulaires suivants et devient héréditaire si elle touche les cellules germinales

49
Q

La dépurination c quoi?

A

-(coupure du lien glycosidique reliant purine-sucre) Résultat: un site apurique(AP)

50
Q
A